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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2561 - 2580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2561 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics reveals a regulatory and exhausted T-cell landscape in CLL and identifies galectin-9 as an immunotherapy target
2025-Aug-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61822-x
PMID:40775219
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病中T细胞的调控和耗竭状态，并鉴定galectin-9作为免疫治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和组织成像技术，系统揭示CLL淋巴结中T细胞的独特特征，并发现galectin-9作为新的免疫治疗靶点 | 研究样本来源有限，主要基于患者样本和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索慢性淋巴细胞白血病中T细胞耗竭的机制并寻找免疫治疗新靶点 | CLL患者的血液、骨髓和淋巴结T细胞，以及CLL小鼠模型 | 单细胞多组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 组织成像, T细胞受体测序 | predicTCR分类器 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | CLL患者多个组织部位样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2562 | 2025-10-06 |
Multi-omics data reveal that SAA1 + fibroblasts exacerbate periodontitis by regulating macrophage inflammation and chemotaxis
2025-Aug-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06925-1
PMID:40775345
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研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SAA1+成纤维细胞通过调节巨噬细胞炎症和趋化作用加剧牙周炎的机制 | 首次系统鉴定SAA1+成纤维细胞亚群在牙周炎中的关键作用，阐明其通过分泌趋化因子介导巨噬细胞浸润并促进炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验，在人类临床样本中的验证仍需进一步开展 | 探究牙周微环境中细胞间相互作用的调控网络，寻找牙周炎治疗新靶点 | 牙周组织细胞、小鼠牙周炎模型、L929细胞、RAW264.7巨噬细胞 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 生物信息学分析, 动物实验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 65,979个牙周组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2563 | 2025-10-06 |
scTail: precise polyadenylation site detection and its alternative usage analysis from reads 1 preserved 3' scRNA-seq data
2025-Aug-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03710-7
PMID:40775355
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研究论文 | 开发了一种名为scTail的计算方法，利用3'单细胞RNA测序数据中的第一链reads精确检测polyA位点并分析其替代使用 | 首次利用3' scRNA-seq中常被忽略的第一链reads进行PAS检测，并结合第二链reads实现替代PAS使用的量化分析 | NA | 开发精确检测polyA位点及其替代使用的计算方法 | 3'单细胞RNA测序数据中的第一链和第二链reads | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 测序reads | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |
| 2564 | 2025-10-06 |
A comparative study of manifold learning methods for scRNA-seq with a trajectory-aware metric
2025-Aug-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14301-8
PMID:40775450
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研究论文 | 比较四种降维方法在单细胞RNA测序数据上的表现，并引入新的轨迹感知评估指标 | 提出了新的轨迹感知嵌入评分(TAES)，同时评估聚类准确性和发育轨迹保持能力 | 仅使用了三个基准数据集进行评估，可能无法代表所有单细胞RNA测序数据场景 | 比较不同流形学习方法在单细胞RNA测序数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, t-SNE, UMAP, Diffusion Maps | 基因表达数据 | 三个基准数据集(PBMC3k, Pancreas, BAT) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2565 | 2025-10-06 |
Integrated bulk and single cell sequencing with experimental validation identifies type 2 diabetes biomarkers
2025-Aug-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14915-y
PMID:40775456
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研究论文 | 通过整合批量测序和单细胞测序技术结合实验验证，识别2型糖尿病生物标志物SLC2A2 | 首次结合批量测序、单细胞测序和实验验证综合识别T2D生物标志物，并分析免疫细胞浸润特征 | 仅使用GSE76895数据集，样本来源有限，需要更多独立队列验证 | 识别2型糖尿病生物标志物并分析胰岛免疫细胞浸润 | 2型糖尿病和非糖尿病患者胰岛样本 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT算法 | 基因表达数据 | GSE76895数据集中的T2D和ND胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2566 | 2025-10-06 |
Multi-omics dissection of CPNE1 reveals its prognostic value and immune-regulatory function in liver cancer
2025-Aug-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03366-6
PMID:40775545
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CPNE1在肝癌中的预后价值和免疫调节功能 | 首次系统阐明了CPNE1在肝癌中的预后价值，发现了SNHG6-hsa-miR-101-3p-CPNE1调控轴，并揭示了CPNE1通过MIF和PPIA-BSG信号通路调节肝癌免疫微环境的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；数据来源于公共数据库，样本代表性可能存在局限 | 阐明CPNE1在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 基于TCGA和GEO数据库的肝癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2567 | 2025-10-06 |
Integrative multiomics analysis reveals the subtypes and key mechanisms of platinum resistance in gastric cancer: identification of KLF9 as a promising therapeutic target
2025-Aug-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06725-7
PMID:40775648
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示了胃癌铂类耐药亚型及关键机制，鉴定KLF9作为潜在治疗靶点 | 首次使用相似性网络融合算法结合多组学数据对胃癌铂类耐药进行分子分型，并在单细胞和空间转录组层面验证耐药基因空间分布 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 阐明胃癌铂类耐药机制并寻找有效治疗靶点 | 胃腺癌患者及AGS胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序，空间转录组学，机器学习 | 相似性网络融合算法，机器学习预测模型 | 基因表达数据，甲基化数据，体细胞突变数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 胃腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 2568 | 2025-10-06 |
Comparative single-cell lineage tracing identifies distinct adipocyte precursor dynamics in skin and inguinal fat
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.07.004
PMID:40744015
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研究论文 | 通过单细胞谱系追踪比较皮肤和腹股沟脂肪中脂肪前体细胞的动态差异 | 识别了未表征的未成熟前脂肪细胞群体，揭示了脂肪前体细胞的不同分化潜能，并发现Sox9是祖细胞增殖和脂肪生成分化的关键调节因子 | NA | 研究皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态差异和分子机制 | 脂肪前体细胞（包括祖细胞和前脂肪细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪，跨组织移植 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2569 | 2025-10-06 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2025-Aug-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62495-2
PMID:40769980
|
研究论文 | 本研究揭示了天疱疮患者IgG自身抗体通过MyD88依赖性途径诱导角质形成细胞产生促炎症反应的新机制 | 首次系统阐明自身抗体直接作用于角质形成细胞并通过MyD88信号通路引发促炎症和蛋白水解反应的分子机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步验证在人体内的实际病理作用 | 探究天疱疮中自身抗体对角质形成细胞的直接作用及其在疾病病理中的贡献 | 原代角质形成细胞、天疱疮患者皮肤样本、临床前小鼠模型 | 皮肤病学 | 天疱疮 | 多重免疫分析、RNA-seq、空间转录组学、单细胞RNA-seq | Krt14特异性Myd88敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2570 | 2025-10-06 |
Fibro-NPC: a pathogenic subtype identified at single-cell resolution with secreted SFRP4 as a biomarker in intervertebral disc degeneration
2025-Aug-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06798-4
PMID:40770348
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定椎间盘退变中的致病性纤维化髓核细胞亚型Fibro-NPC，并发现分泌蛋白SFRP4可作为诊断和治疗靶点 | 首次在单细胞水平识别出椎间盘退变中的致病性FibroPC亚型，并确定SFRP4作为关键致病蛋白和生物标志物 | 样本量较小（仅5个退变椎间盘），需要更大规模研究验证 | 探究椎间盘退变的分子机制并寻找诊断治疗靶点 | 退变椎间盘组织中的髓核细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序,质谱分析,机器学习 | CellChat算法,WGCNA,机器学习 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 5个退变椎间盘的髓核组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2571 | 2025-10-06 |
Mitochondrial subtypes in renal ischemia reperfusion injury guide delayed graft function and Long-Term graft prediction
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14595-8
PMID:40770395
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研究论文 | 本研究通过分析线粒体相关基因识别了肾缺血再灌注损伤的两种亚型，并建立了延迟移植功能和长期移植存活的预测模型 | 首次基于线粒体相关基因对肾缺血再灌注损伤进行亚型分类，并开发了针对延迟移植功能和长期移植存活的预测模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 建立基于线粒体相关基因的肾移植术后并发症预测模型 | 肾移植患者的缺血再灌注损伤样本 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2572 | 2025-10-06 |
Meta_B cells: a computationally identified candidate immunosuppressive driver of gastric cancer metastasis revealed by single-cell analysis and machine learning
2025-Aug-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03356-8
PMID:40770460
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研究论文 | 通过单细胞分析和机器学习识别出一种名为meta_B细胞的候选免疫抑制性B细胞亚群，该亚群与胃癌转移相关 | 计算识别出一种新的转移富集B细胞亚群meta_B细胞，并揭示其通过BTLA-TNFRSF14通路发挥免疫抑制作用的潜在机制 | 研究主要基于计算分析和公共数据库数据，需要实验验证meta_B细胞的功能机制 | 探索胃癌转移过程中肿瘤微环境的免疫细胞动态变化 | 胃癌患者的单细胞RNA-seq数据和TCGA-STAD队列的批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 机器学习 | hdWGCNA, LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库(GSE163558)和TCGA-STAD队列的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2573 | 2025-10-06 |
Interpretable and integrative analysis of single-cell multiomics with scMKL
2025-Aug-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08533-7
PMID:40770488
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研究论文 | 提出一种基于多核学习的单细胞多组学分析方法scMKL，能够同时保持预测能力和结果可解释性 | 将复杂模型的预测能力与线性方法的可解释性相结合，首次在多癌种单细胞多组学数据中实现可解释的整合分析 | NA | 开发能够同时保持高预测精度和结果可解释性的单细胞多组学整合分析方法 | 健康细胞和癌细胞群体 | 机器学习 | 乳腺癌,淋巴癌,前列腺癌,肺癌 | 多核学习 | Multiple Kernel Learning | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq,single-cell ATAC-seq,single-cell multi-omics | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞多组学平台 |
| 2574 | 2025-10-06 |
Identification of cell-type-specific, transcriptionally active transposable elements using long-read RNA-sequencing data-based comprehensive annotation
2025-Aug-06, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00048-1
PMID:40770674
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研究论文 | 利用长读长RNA测序数据构建转座元件衍生转录本的综合注释，并识别细胞类型特异性的活跃转座元件 | 首次基于大规模人类长读长RNA测序数据构建转录组水平的转座元件注释，相比现有注释工具具有更好的检测准确性 | 研究主要依赖公共数据集，可能受限于数据质量和覆盖度 | 开发转座元件衍生转录本的检测和注释方法，研究其在细胞类型特异性表达中的功能 | 人类21个器官和71种细胞系的长读长RNA测序数据，以及GTEx单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2596个长读长RNA测序数据集，覆盖21个器官和71种细胞系 | NA | 长读长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2575 | 2025-10-06 |
Thor: a platform for cell-level investigation of spatial transcriptomics and histology
2025-Aug-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62593-1
PMID:40764306
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研究论文 | 介绍Thor平台，用于空间转录组学和组织学图像的细胞水平综合分析 | 开发抗收缩马尔可夫扩散方法从spot水平数据推断单细胞空间转录组，整合基因表达和细胞形态分析 | NA | 开发集成空间转录组学和组织学图像分析的平台 | 心脏衰竭再生特征、乳腺癌标志物、小鼠嗅球精细分层、纤维化心脏组织 | 空间生物学 | 心脏病,乳腺癌 | 空间转录组学 | 抗收缩马尔可夫扩散方法 | 空间转录组数据,组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | ISH, MERFISH, Xenium, Stereo-seq, Visium HD |
| 2576 | 2025-10-06 |
Role of T cell exhaustion and tissue-resident memory T cells in the expression and prognosis of colorectal cancer
2025-Aug-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14409-x
PMID:40764738
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研究论文 | 通过单细胞测序分析结直肠癌患者T细胞亚型的动态变化及其预后价值 | 首次系统揭示衰竭T细胞和预衰竭组织驻留记忆T细胞在结直肠癌不同临床阶段的功能演变规律 | 样本量有限，需要更大规模队列验证 | 探究T细胞衰竭和组织驻留记忆T细胞在结直肠癌中的表达特征和预后意义 | 结直肠癌患者肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, 功能富集分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 临床预后数据 | 结直肠癌患者队列（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2577 | 2025-10-06 |
Epithelial characteristics of ovarian clear cell carcinoma at single-cell resolution
2025-Aug-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08617-4
PMID:40764744
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢透明细胞癌上皮细胞特征及其调控机制 | 首次在单细胞分辨率下建立OCCC转录图谱，识别恶性上皮细胞亚群并发现173个候选因子 | 样本类型有限，仅包含正常卵巢、卵巢子宫内膜异位症和OCCC组织 | 探究卵巢透明细胞癌恶性上皮细胞的识别、起源和分子特征 | 正常卵巢、卵巢子宫内膜异位症、原发性和复发性卵巢透明细胞癌组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2578 | 2025-10-06 |
PTEN restrains SHH medulloblastma growth through cell autonomous and nonautonomous mechanisms
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667996
PMID:40766638
|
研究论文 | 本研究探讨PTEN基因通过细胞自主和非自主机制抑制SHH亚型髓母细胞瘤生长的机制 | 首次揭示PTEN缺失通过影响肿瘤细胞分化和免疫微环境（巨噬细胞浸润减少）双重机制加速髓母细胞瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明PTEN基因在SHH亚型髓母细胞瘤进展中的生物学功能和作用机制 | 小鼠髓母细胞瘤模型和小脑颗粒细胞前体细胞(GCPs) | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2579 | 2025-10-06 |
Adverse prognosis gene expression patterns in metastatic castration-resistant prostate cancer
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70001
PMID:39985777
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研究论文 | 本研究通过分析1012个mCRPC组织样本，识别了与不良预后相关的基因表达通路 | 首次在大型mCRPC队列中系统分析预后基因表达通路，并揭示了AR信号丢失、高增殖和糖酵解表型作为独立不良预后因素 | 仅272名患者可获得生存数据，样本量相对有限 | 探索转移性去势抵抗性前列腺癌的预后基因表达模式 | 769名患者的1012个mCRPC组织样本 | 癌症基因组学 | 前列腺癌 | 基因集变异分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 1012个组织样本来自769名患者，其中272名有生存数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2580 | 2025-10-06 |
Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03032-2
PMID:40410274
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研究论文 | 本研究探讨头颈鳞状细胞癌患者外周血单核细胞中DNA损伤反应信号和氧化应激状态与纳武利尤单抗疗效的关联 | 首次在HNSCC患者中发现PBMCs中的氧化应激水平和DDR信号与免疫检查点抑制剂疗效相关，并利用空间转录组学分析组织微环境中DNA修复通路的分布特征 | 样本量较小（50例患者），需进一步验证，空间转录组学分析仅涵盖部分重叠病例 | 评估DDR信号和氧化应激状态作为纳武利尤单抗疗效预测生物标志物的潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者（50例）和健康对照（26例）的外周血单核细胞及部分患者的组织活检样本 | 数字病理 | 头颈鳞癌 | 空间转录组学，DNA损伤检测，氧化应激评估 | NA | 转录组数据，细胞功能检测数据 | 50例复发/转移性HNSCC患者和26例健康对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |