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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2561 | 2025-10-06 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术因丢失空间信息而存在的局限性,并提出整合空间转录组学数据的解决方案 | 提出通过空间信息指导单细胞分析的新思路,强调多技术整合的协同价值 | 当前单细胞分析流程无法完全恢复空间信息 | 分析单细胞RNA测序技术的局限性并探索空间信息整合方法 | 植物细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交 | NA | RNA测序数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2562 | 2025-10-06 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
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研究论文 | 本研究揭示了Epsins通过调控主调控因子KLF4和OCT4来监督平滑肌细胞重编程的机制 | 首次发现Epsins通过不同方式调控OCT4和KLF4来引导平滑肌细胞向有益细胞类型重编程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其与冠状动脉疾病的关系 | 小鼠和人体的平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2563 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
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研究论文 | 本研究通过开发CPA-Perturb-seq多路复用单细胞扰动筛选技术,系统解析了42种切割加尾调控因子对多聚腺苷酸化位点选择的调控机制 | 首次将多路复用单细胞扰动筛选与3'单细胞RNA测序相结合,开发了APARENT-Perturb深度神经网络模型解析串联多聚腺苷酸化位点的顺式调控机制 | 研究仅针对42种已知的CPA调控因子,可能未涵盖所有相关调控因子 | 深入理解切割加尾机制调控多聚腺苷酸化位点选择的分子机制 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化位点及其调控因子 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 多路复用扰动筛选, 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42种CPA调控因子的扰动数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 3' scRNA-seq | NA | 3'单细胞RNA测序 |
2564 | 2025-10-06 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
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研究论文 | 利用空间转录组学研究番茄愈伤组织芽再生过程中不同细胞的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术研究植物芽再生过程,揭示不同细胞类型的分子特征 | NA | 提高对植物芽再生机制的理解 | 番茄愈伤组织中的芽原基和绿色组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2565 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通过调控R2逆转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2逆转座子的主要抑制因子,并阐明其通过整合rDNA拷贝数监测与环境感知来调控生殖系基因组稳定性 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性尚需验证 | 探究生殖系rDNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2566 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据,揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接,并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性,需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病(精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症)及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序 | 富集分析,功能连接分析 | 基因组数据,转录组数据,fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq,功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
2567 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
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研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调,可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠),样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2568 | 2025-10-06 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
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综述 | 回顾四十年来关于成人神经发生的研究进展,重点关注海马体神经发生在成年和老年人类大脑中的持续性问题 | 系统梳理了成人神经发生研究领域的关键里程碑、方法学进展和争议焦点 | 成人海马体神经发生的存在性和功能贡献仍需通过大规模单细胞测序等技术验证 | 探讨成人神经发生的证据、机制及其在神经系统疾病中的作用 | 人类海马体神经发生过程 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2569 | 2025-10-06 |
Identification and validation of key biomarkers and potential therapeutic targets for primary open-angle glaucoma
2023-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2344-5
PMID:37610681
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别原发性开角型青光眼的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合多个基因表达数据集,结合单细胞RNA测序技术筛选并验证POAG关键基因 | 需要进一步研究揭示这些基因表达变化的具体机制 | 识别POAG的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 原发性开角型青光眼相关基因表达数据 | 生物信息学 | 青光眼 | mRNA表达微阵列,单细胞RNA测序,功能富集分析,蛋白质相互作用网络分析,加权基因共表达网络分析,免疫荧光,实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 三个数据集(GSE27276,GSE138125,GSE148371) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
2570 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating B cells produce tumor-specific antibodies and may contribute to suppressing tumor in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2543019
PMID:40778950
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示头颈部鳞状细胞癌中肿瘤浸润B细胞通过产生肿瘤特异性抗体激活抗肿瘤免疫 | 首次证实肿瘤浸润B细胞在HNSCC中产生抗体并通过激活巨噬细胞和NK细胞增强抗肿瘤免疫 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 阐明肿瘤浸润B细胞在头颈部鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,B细胞受体谱分析,多重免疫荧光染色,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像,空间转录组数据 | 68例头颈部鳞状细胞癌切除标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2571 | 2025-10-06 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2025-Aug-08, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
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研究论文 | 本研究探讨了S100A8/A9在医源性喉气管狭窄纤维化过程中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现S100A8/A9在iLTS中表达升高,并在小鼠模型中证实其促进纤维化的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类iLTS标本和iLTS诱导的小鼠模型 | 单细胞生物学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,基因表达分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 人类iLTS标本和对照气管组织,iLTS诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2572 | 2025-10-06 |
Targeting SPATS2 in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and immune-based therapy
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03179-7
PMID:40779087
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研究论文 | 本研究探讨SPATS2在肺腺癌中的表达模式及其与预后和免疫治疗的关系 | 首次系统评估SPATS2在肺腺癌中的多功能作用,包括其与基因组变异、免疫浸润和线粒体功能的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,需要更多体内实验验证 | 阐明SPATS2在肺腺癌发生发展中的作用机制及其临床意义 | 肺腺癌患者组织样本和A549细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, siRNA干扰, 线粒体功能检测 | 生物信息学分析模型, 细胞模型 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和TISCH数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
2573 | 2025-10-06 |
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Aug-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417129
PMID:40779122
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研究论文 | 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,缓解脓毒症引起的多器官损伤 | 首次发现BCL-10是脓毒症中NETosis的关键调控因子,并证实大黄素通过靶向BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路 | NA | 探究大黄素对脓毒症多器官损伤的保护作用机制 | 中性粒细胞和NETosis过程 | 分子药理学 | 脓毒症 | 蛋白芯片、表面等离子共振、pull-down实验、分子对接、单细胞测序 | NA | 实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
2574 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals the therapeutic effect of nitazoxanide in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03372-8
PMID:40779144
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学相结合研究硝唑尼特在HNSCC中的作用,并发现其通过调控NKX2-3、PINK1、BIRC5和CDKN2A基因影响自噬过程 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内实验和临床数据支持 | 探索硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗潜力及其作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC) | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异表达分析,功能富集分析,风险预后模型,WGCNA,突变分析,L1000FWD分析 | 风险预后模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2575 | 2025-10-06 |
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-Aug-08, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-025-02040-1
PMID:40779286
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,揭示了神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET成像阴性结果与CREBBP基因突变的关联 | 首次发现CREBBP突变与神经内分泌肿瘤SSTR2表达降低及PET成像阴性结果相关 | 回顾性研究设计,样本量较小(18例患者) | 阐明导致神经内分泌肿瘤68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子和遗传因素 | 肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理 | 神经内分泌肿瘤 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, PET/CT成像 | NA | 基因组测序数据, 基因表达数据, 医学影像数据 | 18例神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
2576 | 2025-10-06 |
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-Aug-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333638
PMID:40122596
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新型内皮样癌症相关成纤维细胞亚型,并揭示其通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移的机制 | 首次发现FAPα+CD144+内皮样CAFs亚型,阐明其通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴发挥双重促癌作用,并开发了靶向该亚型的siRNA递送纳米系统 | NA | 鉴定胰腺导管腺癌中具有血管生成拟态功能的新型促癌CAF亚型及其作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、细胞系、类器官、原位肿瘤模型和KPC转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,细胞因子阵列,RNA测序,IP质谱,ChIP,荧光素酶分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,多重免疫组化图像,分子生物学实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2577 | 2025-10-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Aug-07, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
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研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱,揭示了染色质可及性通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型来驱动皮层细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探究皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层祖细胞,包括放射状胶质细胞、中间神经元祖细胞和中间胶质祖细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞RNA测序数据,单细胞核ATAC测序数据 | 小鼠皮层祖细胞在胚胎期和出生后多个阶段的样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
2578 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the sphingolipid metabolism pathway plays an important role in leaf senescence in tobacco
2025-Aug-06, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07051-2
PMID:40764913
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟草叶片衰老过程中鞘脂代谢通路的重要作用 | 首次在衰老烟草叶片中构建单细胞转录组图谱,发现鞘脂代谢通路基因在衰老过程中显著上调 | 研究仅基于转录组数据,需要进一步实验验证SPT等基因在叶片衰老中的具体调控机制 | 阐明烟草叶片衰老过程的分子机制 | 烟草叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,100个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2579 | 2025-10-06 |
β-Sitosterol improves murine ulcerative colitis by inhibiting the expression of ribosomal proteins and the attempted polarization of type 1 macrophages
2025-Aug-05, International journal of colorectal disease
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s00384-025-04974-y
PMID:40762728
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研究论文 | 本研究证实β-谷甾醇通过抑制核糖体信号通路关键基因表达和MΦ1巨噬细胞极化,改善小鼠溃疡性结肠炎症状 | 首次揭示β-谷甾醇通过调控核糖体蛋白表达抑制MΦ1巨噬细胞极化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探究β-谷甾醇对溃疡性结肠炎的治疗作用及分子机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, KEGG分析, 流式细胞术, ELISA, Western blotting, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞因子数据 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2580 | 2025-10-06 |
Clock pathway inhibitor overcomes tumor immune-exclusion via regulation of fibrocyte differentiation
2025-Aug-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01066-6
PMID:40764393
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研究论文 | 本研究通过时钟通路抑制剂调控纤维细胞分化,克服肿瘤免疫排斥并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现时钟通路调控纤维细胞向αSMA癌症相关成纤维细胞分化,并证明时钟抑制剂可将免疫排斥型肿瘤转化为免疫活跃型肿瘤 | 研究主要基于肺腺癌模型,在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探索克服肿瘤免疫排斥的新策略,提高免疫检查点抑制剂治疗效果 | 肺腺癌组织、肿瘤微环境中的纤维细胞和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |