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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2561 | 2025-10-06 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.638196
PMID:40027653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗅鞘细胞和雪旺细胞的共同起源及遗传差异,并探讨了Yap和Taz缺失对这两种细胞发育的不同影响 | 首次发现Yap和Taz缺失对嗅鞘细胞和雪旺细胞发育产生不同影响,同时证明GnRH-1神经元迁移不受这些变化影响 | 研究仅限于小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究Hippo通路在嗅鞘细胞发育中的作用及其对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎鼻组织中的嗅鞘细胞、雪旺细胞、黑色素细胞和GnRH-1神经元 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 小鼠胚胎鼻组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2562 | 2025-10-06 |
Comparison of CD30L and OX40L Reveals CD30L as a Promising Therapeutic Target in Atopic Dermatitis
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16412
PMID:39589186
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研究论文 | 比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,发现CD30L是一个有前景的治疗靶点 | 首次系统比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,证明CD30L阻断具有与IL-13和OX40L阻断相似的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床效果需要进一步验证 | 评估CD30L作为特应性皮炎治疗靶点的潜力 | 人类AD皮肤病变样本和小鼠AD模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个AD患者皮肤病变的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2563 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55611-1
PMID:39755698
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组图谱,识别精神疾病相关的关键脑细胞类型和脑区 | 首次将基因组关联研究结果与成人脑单细胞转录组图谱及功能磁共振连接性数据相结合,揭示精神疾病的细胞类型和脑区特异性 | 研究基于现有基因组关联研究数据,可能受样本量和人群特异性的限制 | 识别精神疾病和脑功能特征相关的关键脑细胞类型和脑区 | 精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症患者及智力、教育程度、神经质相关人群 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序, 功能磁共振成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 功能磁共振成像 | NA | NA |
2564 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55725-6
PMID:39755735
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通路通过调控R2逆转录转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2表达的主要抑制因子,并阐明胰岛素通路整合rDNA拷贝数监测与环境感知的新机制 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性仍需验证 | 探究生殖细胞中核糖体DNA拷贝数维持的调控机制 | 黑腹果蝇雄性生殖干细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2565 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related genes in psoriasis and targeted gene editing of CASP1 and CASP5 using lipid nanoparticles to alleviate skin inflammation
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1639869
PMID:40771724
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研究论文 | 通过生物信息学分析焦亡相关基因在银屑病中的作用,并利用脂质纳米颗粒递送CRISPR-Cas9靶向编辑CASP1和CASP5基因以缓解皮肤炎症 | 首次系统分析焦亡相关基因在银屑病中的表达特征,并开发基于脂质纳米颗粒的基因编辑治疗策略 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要进一步临床验证 | 探讨焦亡在银屑病发病机制中的作用并开发基因治疗新策略 | 银屑病患者数据、IMQ诱导的银屑病小鼠模型、角质形成细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑、生物信息学分析 | 机器学习算法、风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据集中的银屑病患者样本、IMQ诱导的银屑病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2566 | 2025-10-06 |
WISP1 drives esophageal squamous cell carcinoma progression via modulation of cancer-associated fibroblasts and immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586790
PMID:40771797
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研究论文 | 本研究探讨WISP1通过调控癌症相关成纤维细胞和免疫微环境促进食管鳞状细胞癌进展的机制 | 首次深入揭示WISP1在ESCC中通过调控CAFs功能和ECM重塑影响肿瘤进展的多重作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究WISP1在食管鳞状细胞癌中的表达特征、临床意义及其作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者数据、癌症相关成纤维细胞和癌细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 从公共数据库获取的ESCC患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2567 | 2025-10-06 |
Autonomic nervous system development-related signature as a novel predictive biomarker for immunotherapy in pan-cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1611890
PMID:40771813
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研究论文 | 开发基于自主神经系统发育相关特征的泛癌免疫治疗预测模型 | 首次将自主神经系统发育相关特征作为免疫治疗预测生物标志物,构建了跨癌种的预测模型 | 需要进一步临床验证,样本来源多样可能影响模型泛化能力 | 开发新的免疫治疗预测生物标志物以提高治疗反应预测准确性 | 多种癌症类型的单细胞和批量RNA测序数据,临床样本 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RT-PCR,免疫组化 | 随机森林,多种机器学习方法 | RNA测序数据,基因表达数据 | 34个单细胞RNA测序数据集和8个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
2568 | 2025-10-06 |
Machine learning analysis of ARVC informed by sodium channel protein-based interactome networks
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1611342
PMID:40771922
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析结合钠通道蛋白互作网络,识别并验证了山柰酚作为治疗致心律失常性右室心肌病的潜在化合物 | 首次将机器学习模型与基于单细胞RNA测序的蛋白质互作网络相结合,用于预测ARVC治疗化合物 | 研究主要基于大鼠模型和心脏类器官验证,尚未进行临床前动物模型或临床试验 | 识别治疗致心律失常性右室心肌病的新型化合物 | ARVC大鼠模型、心脏类器官、钠通道蛋白SCN5A | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, ELISA, MEA, Masson染色 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作网络数据 | ARVC大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2569 | 2025-10-06 |
Deciphering the tumor ecosystem dynamics undergoing immunochemotherapy therapy across multiple cancer types unveils the immunosuppressive role of S100A4 in fibroblasts by promoting PD-L1 expression in tumor cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1613296
PMID:40772225
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研究论文 | 通过跨癌种单细胞测序揭示S100A4在成纤维细胞中通过促进肿瘤细胞PD-L1表达介导免疫抑制和治疗抵抗的作用机制 | 构建首个跨癌种单细胞图谱,发现CAFs分泌的S100A4是驱动PD-L1上调的保守介质 | 需要在更大队列和机制研究中进一步验证 | 解析新辅助治疗期间肿瘤生态系统动态变化,识别免疫抑制和治疗抵抗的关键介质 | 五种实体瘤(食管鳞癌、食管胃结合部癌、结直肠癌、宫颈癌、三阴性乳腺癌) | 数字病理 | 多癌种 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Western blot | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 五种癌症类型的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2570 | 2025-10-06 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-12, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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综述 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的应用与优势 | 首次系统评述单细胞和空间转录组学在植物-微生物共生研究中的创新应用,突破了传统RNA-seq技术的细胞分辨率限制 | 当前技术难以在同一细胞中同时捕获植物和微生物的转录本 | 研究植物与微生物之间的共生关系建立机制 | 植物-微生物共生体系 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
2571 | 2025-10-06 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术因丢失空间信息而存在的局限性,并提出整合空间转录组学数据的解决方案 | 提出通过空间信息指导单细胞分析的新思路,强调多技术整合的协同价值 | 当前单细胞分析流程无法完全恢复空间信息 | 分析单细胞RNA测序技术的局限性并探索空间信息整合方法 | 植物细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交 | NA | RNA测序数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2572 | 2025-10-06 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
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研究论文 | 本研究揭示了Epsins通过调控主调控因子KLF4和OCT4来监督平滑肌细胞重编程的机制 | 首次发现Epsins通过不同方式调控OCT4和KLF4来引导平滑肌细胞向有益细胞类型重编程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其与冠状动脉疾病的关系 | 小鼠和人体的平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2573 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
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研究论文 | 本研究通过开发CPA-Perturb-seq多路复用单细胞扰动筛选技术,系统解析了42种切割加尾调控因子对多聚腺苷酸化位点选择的调控机制 | 首次将多路复用单细胞扰动筛选与3'单细胞RNA测序相结合,开发了APARENT-Perturb深度神经网络模型解析串联多聚腺苷酸化位点的顺式调控机制 | 研究仅针对42种已知的CPA调控因子,可能未涵盖所有相关调控因子 | 深入理解切割加尾机制调控多聚腺苷酸化位点选择的分子机制 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化位点及其调控因子 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 多路复用扰动筛选, 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42种CPA调控因子的扰动数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 3' scRNA-seq | NA | 3'单细胞RNA测序 |
2574 | 2025-10-06 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
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研究论文 | 利用空间转录组学研究番茄愈伤组织芽再生过程中不同细胞的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术研究植物芽再生过程,揭示不同细胞类型的分子特征 | NA | 提高对植物芽再生机制的理解 | 番茄愈伤组织中的芽原基和绿色组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2575 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通过调控R2逆转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2逆转座子的主要抑制因子,并阐明其通过整合rDNA拷贝数监测与环境感知来调控生殖系基因组稳定性 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性尚需验证 | 探究生殖系rDNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2576 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据,揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接,并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性,需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病(精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症)及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序 | 富集分析,功能连接分析 | 基因组数据,转录组数据,fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq,功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
2577 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
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研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调,可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠),样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2578 | 2025-10-06 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
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综述 | 回顾四十年来关于成人神经发生的研究进展,重点关注海马体神经发生在成年和老年人类大脑中的持续性问题 | 系统梳理了成人神经发生研究领域的关键里程碑、方法学进展和争议焦点 | 成人海马体神经发生的存在性和功能贡献仍需通过大规模单细胞测序等技术验证 | 探讨成人神经发生的证据、机制及其在神经系统疾病中的作用 | 人类海马体神经发生过程 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2579 | 2025-10-06 |
Identification and validation of key biomarkers and potential therapeutic targets for primary open-angle glaucoma
2023-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2344-5
PMID:37610681
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别原发性开角型青光眼的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合多个基因表达数据集,结合单细胞RNA测序技术筛选并验证POAG关键基因 | 需要进一步研究揭示这些基因表达变化的具体机制 | 识别POAG的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 原发性开角型青光眼相关基因表达数据 | 生物信息学 | 青光眼 | mRNA表达微阵列,单细胞RNA测序,功能富集分析,蛋白质相互作用网络分析,加权基因共表达网络分析,免疫荧光,实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 三个数据集(GSE27276,GSE138125,GSE148371) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
2580 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating B cells produce tumor-specific antibodies and may contribute to suppressing tumor in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2543019
PMID:40778950
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示头颈部鳞状细胞癌中肿瘤浸润B细胞通过产生肿瘤特异性抗体激活抗肿瘤免疫 | 首次证实肿瘤浸润B细胞在HNSCC中产生抗体并通过激活巨噬细胞和NK细胞增强抗肿瘤免疫 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 阐明肿瘤浸润B细胞在头颈部鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,B细胞受体谱分析,多重免疫荧光染色,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像,空间转录组数据 | 68例头颈部鳞状细胞癌切除标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |