单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 25761 - 25780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25761 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Foxp1-Driven Mechanisms Essential for Striatal Development
2020-03-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.030
PMID:32130906
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research paper | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了Foxp1转录因子在小鼠纹状体发育中的细胞类型特异性调控机制 | 首次揭示了Foxp1在单细胞水平上调控纹状体细胞组成、神经化学结构和连接性的机制，并关联到FOXP1功能缺失突变患者的表型 | NA | 探究Foxp1在纹状体发育中的转录调控机制及其对功能和行为的影响 | 小鼠纹状体的单细胞和Foxp1调控的靶基因 | digital pathology | autism | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 25762 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2113-3
PMID:32132714
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25763 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis software providers scramble to offer solutions
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0449-8
PMID:32152578
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25764 | 2024-08-09 |
[Application of Single-cell RNA Sequencing in Research on Tumor Immune Microenvironment]
2020-Feb-28, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.11194
PMID:32131950
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够在单细胞水平上检测细胞的转录组，描述其功能状态，从而加深对肿瘤免疫微环境中不同细胞群组成和功能的理解 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境的组成和功能 | 肿瘤免疫微环境中的细胞群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25765 | 2024-08-09 |
A Synthesis Concerning Conservation and Divergence of Cell Types across Epithelia
2020-11-02, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a035733
PMID:32122885
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研究论文 | 本文通过比较两种发育相关的鼠类上皮组织——气道上皮和小肠上皮，探讨了细胞类型的共性和特异性及其在组织功能中的作用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和计算分析方法，揭示了细胞类型在不同组织中的分布、起源和功能，以及细胞更新和分化的动态过程 | NA | 研究细胞类型在不同上皮组织中的保守性和差异性 | 鼠类气道上皮和小肠上皮组织 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及两种鼠类上皮组织 |
| 25766 | 2024-08-09 |
Targeted Apoptosis of Ductular Reactive Cells Reduces Hepatic Fibrosis in a Mouse Model of Cholestasis
2020-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31211
PMID:32128842
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研究论文 | 本文研究了胆汁淤积性肝病中，通过靶向诱导胆管反应性细胞（DR细胞）凋亡来减少肝纤维化的方法。 | 使用MCL1抑制剂S63845，一种促凋亡BH3模拟疗法，显著降低了DKO和Mdr2-/- ERC的生存能力，并减少了DR细胞的数量以及炎症和肝纤维化的标志物。 | NA | 研究胆汁淤积性肝病中DR细胞的作用及其通过药物靶向MCL1来减少肝纤维化的效果。 | 胆管反应性细胞（DR细胞）及其在肝纤维化中的作用。 | NA | 肝病 | 单细胞转录组学，免疫染色，高分辨率质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 野生型（WT），Tr-/-，Mdr2-/-和DKO小鼠的胆管反应性细胞（ERCs） |
| 25767 | 2024-08-09 |
The Long Journey from Diagnosis to Therapy
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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评论 | 作者回顾了自己在遗传学领域的40年科研生涯，特别是在杜氏肌营养不良症从诊断到治疗方面的贡献 | 介绍了单细胞测序和体细胞CRISPR编辑等新技术在精准医学中的应用前景 | NA | 回顾遗传学领域的发展，特别是从诊断到治疗的过程 | 杜氏肌营养不良症及其他单基因疾病 | 遗传学 | 肌肉疾病 | 单细胞测序, CRISPR编辑 | NA | NA | NA |
| 25768 | 2024-08-09 |
Advanced Cell Mapping Visualizations for Single Cell Functional Proteomics Enabling Patient Stratification
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900270
PMID:32108428
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微芯片的高通量单细胞功能蛋白质组学技术，用于识别与患者治疗反应相关的多功能细胞亚群，并开发了3D UMAP和t-SNE可视化工具来分析这些数据 | 本文首次定义了多功能强度指数（PSI），并开发了先进的3D UMAP和t-SNE可视化工具，以更直观地展示数据 | NA | 深入理解细胞功能异质性，并开发新的分析工具以促进个性化治疗的发展 | 单细胞功能蛋白质组学数据和患者对CAR-T细胞疗法的反应 | 数字病理学 | NA | 微芯片技术 | UMAP和t-SNE | 蛋白质组学数据 | 涉及32-plex IsoCode芯片技术定义的CAR-T产品 |
| 25769 | 2024-08-09 |
Ensemble learning for classifying single-cell data and projection across reference atlases
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa137
PMID:32105316
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research paper | 本文开发了一种提升学习器，用于分类单细胞数据并跨单细胞图谱进行投影，解决了现有分类器低敏感性的问题，尤其是在处理稀有细胞类型时 | 开发了一种提升学习器，提高了分类器的敏感性，并能在不同平台间保持细胞类型标签的一致性 | NA | 解决如何最佳地跨单细胞图谱投影数据的问题 | 单细胞数据分类及跨平台数据映射 | machine learning | NA | scRNA-seq | boosted learner | single-cell data | 涉及来自相同组织的不同scRNA-seq模式的新数据和已发表数据 |
| 25770 | 2024-08-09 |
2DImpute: imputation in single-cell RNA-seq data from correlations in two dimensions
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa148
PMID:32108864
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研究论文 | 开发了一种名为2DImpute的插补方法，用于修正单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的假零值（即dropouts） | 2DImpute通过利用表达矩阵中基因和细胞之间的相互关系来预测假零值并插补其值，从而防止过度修正 | NA | 开发和验证一种新的插补方法，用于改进单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据中的假零值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 表达矩阵 | 涉及多种scRNA-seq协议的数据集 |
| 25771 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq clustering: datasets, models, and algorithms
2020-06, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2020.1728961
PMID:32116127
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的聚类分析，包括相关数据集和分析工具 | 比较了七种先进的scRNA-seq聚类方法，并使用调整兰德指数（ARI）和标准化互信息（NMI）进行评估 | 尽管无监督模型能有效聚类scRNA-seq数据，但这些方法仍面临挑战 | 揭示单细胞RNA测序数据中的细胞间异质性和细胞亚群 | scRNA-seq数据集和聚类模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | K均值聚类、层次聚类、共识聚类等 | 基因表达数据 | 五个公开可用的数据集 |
| 25772 | 2024-08-09 |
V-SVA: an R Shiny application for detecting and annotating hidden sources of variation in single-cell RNA-seq data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa128
PMID:32119082
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研究论文 | 本文介绍了一种名为V-SVA的R Shiny应用程序，用于检测和注释单细胞RNA测序数据中的隐藏变异源 | 开发了一种交互式框架，包括用于发现与检测到的变异源相关的基因、使用公共数据库和基因集进行基因注释以及使用降维方法进行数据可视化的工具 | NA | 旨在促进对由算法检测到的替代变量的解释，区分其是否具有生物学意义或源于技术原因 | 单细胞RNA测序数据中的变异源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 替代变量分析 | 基因表达数据 | NA |
| 25773 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing data suggest a role for angiotensin-converting enzyme 2 in kidney impairment in patients infected with 2019-novel coronavirus
2020-May-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000000783
PMID:32118645
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25774 | 2024-08-09 |
scRMD: imputation for single cell RNA-seq data via robust matrix decomposition
2020-05-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa139
PMID:32119079
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRMD的计算高效插补方法，用于单细胞RNA测序数据中的缺失值插补 | 将缺失值插补问题建模为鲁棒矩阵分解，并开发了scRMD方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，以改善下游分析 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 鲁棒矩阵分解 | 基因表达数据 | NA |
| 25775 | 2024-08-09 |
CellPhoneDB: inferring cell-cell communication from combined expression of multi-subunit ligand-receptor complexes
2020-04, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0292-x
PMID:32103204
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellPhoneDB的新型数据库，该数据库用于推断由多亚基配体-受体复合物介导的细胞间通信 | CellPhoneDB数据库考虑了配体和受体的亚基结构，能够准确表示异源复合物，并集成了统计框架，用于从单细胞转录组数据中预测细胞间的富集交互作用 | NA | 开发和优化用于推断细胞间通信的数据库和统计框架 | 细胞间通信的配体-受体复合物及其交互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 转录组数据 | 约10,000个细胞，19种细胞类型 |
| 25776 | 2024-08-09 |
Epithelial Planar Bipolarity Emerges from Notch-Mediated Asymmetric Inhibition of Emx2
2020-03-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2020.01.027
PMID:32109392
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、扩散伪时间分析、谱系追踪和突变分析，揭示了表皮细胞平面双极性起源于Notch介导的Emx2不对称抑制的机制 | 首次揭示了表皮细胞平面双极性形成的初始对称性破坏步骤，并阐明了Emx2不对称表达的机制 | NA | 探究表皮细胞平面双极性的形成机制 | 斑马鱼神经毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25777 | 2024-08-09 |
Sonoselective transfection of cerebral vasculature without blood-brain barrier disruption
2020-03-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914595117
PMID:32123081
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研究论文 | 本文介绍了一种在不影响血脑屏障的情况下，通过磁共振成像引导的聚焦超声方法实现脑部血管内皮细胞选择性转染的技术 | 首次实现了在不影响血脑屏障的情况下，通过低压脉冲1.1-MHz聚焦超声激活携带阳离子质粒的微泡，实现脑部血管内皮细胞的选择性基因传递 | NA | 开发一种非侵入性治疗手段，实现特定脑区域内皮细胞选择性基因表达，以改善脑部病理状况的治疗 | 脑部血管内皮细胞 | 生物医学工程 | NA | 聚焦超声 (FUS), 微泡 (MBs), 磁共振成像 (MRI) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 25778 | 2024-08-09 |
The Molecular Anatomy of Mouse Skin during Hair Growth and Rest
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.012
PMID:32109378
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和单分子RNA荧光原位杂交技术，构建了小鼠皮肤在毛发生长和休息期的系统分子图谱，确定了56种细胞类型和状态的基因表达谱及其空间位置。 | 研究揭示了外根鞘（ORS）和内毛囊层如何协调毛发生产，并发现了ORS由两种转录上不同的细胞类型组成，这些细胞类型具有不同的基质细胞类型相互作用能力。 | NA | 旨在深入理解皮肤稳态的分子机制，特别是在毛发生长和休息期间。 | 小鼠皮肤在毛发生长和休息期间的细胞类型和状态。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, single-molecule RNA FISH | NA | 基因表达数据 | 56种细胞类型和状态 |
| 25779 | 2024-08-09 |
Embracing the dropouts in single-cell RNA-seq analysis
2020-03-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14976-9
PMID:32127540
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序分析中的dropout现象，并提出了一种基于dropout模式的共现聚类算法 | 本文创新地将dropout视为有用信号而非问题，并提出了一种新的聚类算法来基于dropout模式对细胞进行聚类 | NA | 探索dropout在单细胞RNA测序分析中的应用，并开发新的计算算法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout现象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 多个已发表数据集 |
| 25780 | 2024-08-09 |
Peripheral T cell expansion predicts tumour infiltration and clinical response
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2056-8
PMID:32103181
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研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了不同类型癌症患者肿瘤、正常邻近组织和外周血中T细胞和T细胞受体的分布情况 | 首次揭示了效应样T细胞的克隆型扩张不仅在肿瘤内，还在正常邻近组织中，并且这种扩张与患者对PD-L1抑制剂的反应相关 | 文章未明确提及 | 探究T细胞在肿瘤免疫中的起源和命运，以及其与癌症治疗反应的关系 | 不同类型癌症患者的T细胞和T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同类型癌症患者 |