单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 25741 - 25760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25741 | 2024-08-09 |
A single-cell view of tissue regeneration in plants
2019-12, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2019.09.003
PMID:31655397
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综述 | 本文综述了利用先进的分子遗传学和计算技术在植物组织再生中对单个细胞的研究进展 | 通过单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和实时成像技术，定义了再生组织中的形态发生和细胞变化，并利用迭代计算和实验方法阐明了候选机制 | NA | 探讨植物组织再生的细胞机制 | 植物组织再生中的细胞死亡、分裂、去分化和转分化过程 | 分子遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25742 | 2024-08-09 |
Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia
2019-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463
PMID:31662298
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研究论文 | 本研究探讨了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄特异性及其对疾病表型的影响 | 首次揭示了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄依赖性作用，并发现关键转录因子的活性差异 | NA | 研究融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的作用及其与年龄的关系 | 融合致癌基因、儿童急性髓系白血病、关键转录因子 | 数字病理学 | 白血病 | 染色质可及性分析、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用诱导性转基因小鼠模型进行分析 |
| 25743 | 2024-08-09 |
Tumour-associated macrophage-derived interleukin-1 mediates glioblastoma-associated cerebral oedema
2019-12-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awz331
PMID:31665239
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的白细胞介素-1在胶质母细胞瘤相关脑水肿中的作用，并探讨了地塞米松对此过程的影响。 | 首次证明了地塞米松能阻断骨髓来源和脑内巨噬细胞中的白细胞介素-1产生，并抑制其下游效应，同时揭示了白细胞介素-1信号通路在胶质母细胞瘤相关脑水肿治疗中的潜在价值。 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床应用的实际效果和副作用需要进一步验证。 | 探讨胶质母细胞瘤相关脑水肿的机制及潜在治疗策略。 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关巨噬细胞、脑水肿、地塞米松治疗效果。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | 涉及骨髓来源和脑内巨噬细胞的细胞培养及小鼠模型实验。 |
| 25744 | 2024-08-09 |
Non-templated addition and template switching by Moloney murine leukemia virus (MMLV)-based reverse transcriptases co-occur and compete with each other
2019-11-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.010676
PMID:31640989
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研究论文 | 本研究详细分析了基于Moloney鼠白血病病毒（MMLV）的逆转录酶在模板切换过程中的偏倚，特别是RNA模板5'端序列和性质（加帽与非加帽）对这些偏倚的影响 | 研究发现非模板添加和模板切换是同时且相互竞争的过程，这与当前对模板切换过程的理解相反 | NA | 探讨单细胞RNA测序中模板切换机制的细节及其影响因素 | Moloney鼠白血病病毒（MMLV）型逆转录酶的模板切换特性和非模板添加的组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 25745 | 2024-08-09 |
Dynamics of trophoblast differentiation in peri-implantation-stage human embryos
2019-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1911362116
PMID:31636193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析培养的人类囊胚细胞，定义了在绒毛膜形成前的第8天至第12天植入期周围胎盘滋养层细胞的转录组图谱 | 首次详细描述了人类胚胎植入期间滋养层细胞的动态分化过程，并揭示了不同类型滋养层细胞的转录组特征 | NA | 研究人类胚胎植入期间滋养层细胞的分化动态及其转录组特征 | 人类胚胎植入期间的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从培养的胚胎中手动挑选的3种早期胎盘细胞类型（细胞滋养层细胞、合体滋养层细胞和迁移性滋养层细胞） |
| 25746 | 2024-08-09 |
Immunology Driven by Large-Scale Single-Cell Sequencing
2019-11, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2019.09.004
PMID:31645299
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研究论文 | 本文讨论了利用大规模单细胞多组学数据和改进的计算方法来解析免疫细胞身份的必要性 | 提出了结合大规模单细胞多组学数据和先进计算方法来深入研究免疫细胞的多样性和可塑性 | NA | 探讨如何利用大规模单细胞多组学数据和计算方法来解析免疫细胞身份 | 免疫细胞的多样性和可塑性 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 大规模 |
| 25747 | 2024-08-09 |
Single-pollen-cell sequencing for gamete-based phased diploid genome assembly in plants
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251033.119
PMID:31649061
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研究论文 | 本文介绍了一种结合花粉原生质体分离和单细胞DNA扩增技术的新方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装 | 本文首次成功利用单花粉细胞测序技术，实现了梨基因组的高效准确分相，揭示了梨参考基因组中8.12%的基因存在镶嵌式组装 | 该方法目前仅在梨这一特定植物物种中得到验证，其普遍适用性有待进一步研究 | 开发一种新的方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装，并分析基因表达的等位效应 | 梨基因组及其在花粉中减数分裂期间的重组信息 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 12个花粉细胞 |
| 25748 | 2024-08-09 |
A chemical probe of CARM1 alters epigenetic plasticity against breast cancer cell invasion
2019-10-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47110
PMID:31657716
|
研究论文 | 本文介绍了一种具有前药特性的CARM1化学探针，能够改变表观遗传可塑性，抑制乳腺癌细胞侵袭 | 发现了一种新的CARM1依赖机制，用于癌症转移，并开发了一种化学探针来靶向这一过程 | NA | 研究CARM1蛋白在乳腺癌细胞侵袭中的作用，并开发相应的化学探针 | CARM1蛋白及其在乳腺癌细胞侵袭中的作用 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25749 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic atlas of the human retina identifies cell types associated with age-related macular degeneration
2019-10-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12780-8
PMID:31653841
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研究论文 | 本文通过大规模并行单细胞RNA测序（scRNA-seq）构建了人类视网膜的首个单细胞转录组图谱，并识别了与年龄相关性黄斑变性（AMD）相关的细胞类型。 | 首次报道了人类视网膜的单细胞转录组图谱，并通过多分辨率网络分析识别了所有主要视网膜细胞类型及其基因表达特征。 | NA | 识别与年龄相关性黄斑变性（AMD）相关的细胞类型。 | 人类视网膜的细胞类型及其基因表达特征。 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用两个独立平台进行的人类视网膜样本。 |
| 25750 | 2024-08-09 |
Generation and function of progenitor T cells from StemRegenin-1-expanded CD34+ human hematopoietic progenitor cells
2019-10-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2018026575
PMID:31648315
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研究论文 | 研究通过使用StemRegenin-1（SR1）扩增的CD34+人造血祖细胞生成前体T细胞，并探讨其在加速T细胞重建和恢复免疫功能中的作用 | 首次展示了SR1扩增的脐带血可以诱导CD34+造血干细胞和祖细胞（HSPCs）超过250倍的扩增，并能生成大量前体T细胞，这些细胞在体内显示出有效的胸腺植入和外周T细胞功能 | 研究仅在17名患者中进行了初步的临床试验，需要更大规模的研究来验证其安全性和有效性 | 加速造血干细胞移植（HSCT）后的免疫恢复，减少T细胞免疫缺陷 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞，以及由此生成的前体T细胞 | 造血干细胞移植 | NA | StemRegenin-1扩增技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 17名接受SR1扩增和未扩增脐带血单位的患者 |
| 25751 | 2024-08-09 |
Phenotypic Switching of Naïve T Cells to Immune-Suppressive Treg-Like Cells by Mutant KRAS
2019-Oct-18, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm8101726
PMID:31635338
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研究论文 | 本文研究了突变型KRAS如何通过肿瘤源性外泌体、患者血清或小鼠异种移植模型诱导CD4 T细胞向免疫抑制性Treg样细胞的表型转换 | 发现了一种新的细胞外非细胞因子依赖的KRAS在T细胞表型转换中的作用 | NA | 探讨突变型KRAS在T细胞表型转换中的作用及其在非小细胞肺癌治疗中的潜在应用 | CD4 T细胞、突变型KRAS非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 数学模型 | 细胞 | NA |
| 25752 | 2024-08-09 |
Combinatorial prediction of marker panels from single-cell transcriptomic data
2019-10, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20199005
PMID:31657111
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研究论文 | 本文介绍了一种名为COMET的计算框架，用于从单细胞转录组数据中识别细胞群体的候选标记面板 | COMET框架首次实现了多基因标记面板的相关性排序预测，并展示了其在单基因和多基因水平上的准确性 | NA | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞群体的标记面板 | 单细胞转录组数据中的细胞群体及其标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 转录组数据 | NA |
| 25753 | 2024-08-09 |
Clustering methods for single-cell RNA-sequencing expression data: performance evaluation with varying sample sizes and cell compositions
2019-08-14, Statistical applications in genetics and molecular biology
IF:0.8Q3
DOI:10.1515/sagmb-2019-0004
PMID:31646845
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研究论文 | 本文评估了11种单细胞RNA测序（scRNA-seq）聚类方法在不同样本大小和细胞组成条件下的性能 | 首次系统评估了样本大小和细胞组成对scRNA-seq数据聚类方法性能的影响 | 研究仅使用了合成数据集，可能与真实数据存在差异 | 评估不同样本大小和细胞组成对scRNA-seq数据聚类方法性能的影响 | 11种scRNA-seq聚类方法的性能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 聚类方法 | 表达数据 | 合成数据集，具有不同的样本大小和子群数量 |
| 25754 | 2024-08-09 |
Mind the Map: Technology Shapes the Myeloid Cell Space
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.02287
PMID:31636632
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研究论文 | 本文探讨了髓系细胞系统中细胞类型分类的挑战，并讨论了多维技术如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序在细胞类型识别中的应用 | 利用多维技术如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序来挑战现有的细胞类型理解，并提出新的分类策略 | 尽管新技术强大，但需要将其结果与数十年来建立的先前知识相结合 | 报告髓系细胞系统中细胞类型分类的早期尝试，讨论当前方法及其优缺点，并提出未来分类策略 | 髓系细胞系统的细胞类型分类 | NA | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 25755 | 2024-08-09 |
MTGO-SC, A Tool to Explore Gene Modules in Single-Cell RNA Sequencing Data
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00953
PMID:31649730
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MTGO-SC的工具，用于在单细胞RNA测序数据中探索基因模块 | MTGO-SC是专门为单细胞RNA测序数据设计的生物网络模块检测算法的适应版本，能够利用网络拓扑结构和节点（基因）的注释来隔离基因功能模块 | NA | 旨在通过识别基因交互网络中的功能模块来理解生物过程，揭示生物机制、候选生物标志物或药物发现/再定位的潜在目标 | 单细胞RNA测序数据中的基因模块 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | MTGO-SC算法 | 基因网络数据 | 每个细胞簇（通常是细胞类型或状态）组成每个样本的网络 |
| 25756 | 2024-08-09 |
Microbiome Big-Data Mining and Applications Using Single-Cell Technologies and Metagenomics Approaches Toward Precision Medicine
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00972
PMID:31649735
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序和宏基因组学方法进行微生物组大数据挖掘的当前分析策略及其在精准医学中的应用 | 提出了多组学方法和单细胞测序的整合，以全面理解微生物组在宏观和微观层面的特性 | NA | 探讨微生物组大数据挖掘在精准医学中的应用 | 微生物组及其与宿主器官和疾病的关系 | 精准医学 | NA | 单细胞测序, 宏基因组学 | NA | 大数据 | NA |
| 25757 | 2024-08-09 |
Evaluation of methods to assign cell type labels to cell clusters from single-cell RNA-sequencing data
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.18490.3
PMID:31508207
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研究论文 | 本文评估了五种方法在单细胞RNA测序数据中为细胞簇分配细胞类型标签的性能 | 首次系统比较了多种方法在单细胞RNA测序数据中为细胞簇分配细胞类型标签的性能 | 方法性能受细胞类型签名中基因数量的影响，小签名更可能导致错误结果 | 评估不同方法在单细胞RNA测序数据中自动分配细胞类型标签的能力 | 五种方法在不同单细胞RNA测序数据集中的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及五个数据集，细胞数量从约3,700到约68,000不等 |
| 25758 | 2024-08-09 |
Molecular heterogeneity unravelled by single-cell transcriptomics in patients with essential thrombocythaemia
2020-03, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.16225
PMID:31610612
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了七名未治疗的原发性血小板增多症患者的CD34细胞转录组，揭示了患者间的分子异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了原发性血小板增多症患者的分子异质性和克隆多样性 | 样本量较小，仅包括七名患者和一个健康对照 | 探究原发性血小板增多症患者的分子异质性和克隆多样性 | 原发性血小板增多症患者的CD34细胞 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 七名原发性血小板增多症患者和一名健康成人 |
| 25759 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumor immune microenvironment heterogenicity and granulocytes enrichment in colorectal cancer liver metastases
2020-02-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2019.10.016
PMID:31610266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了结直肠癌肝转移组织及其邻近组织的肿瘤免疫微环境组成和特征 | 首次进行了结直肠癌肝转移的单细胞转录组分析，揭示了肿瘤微环境中粒细胞的富集现象 | NA | 探索结直肠癌肝转移的肿瘤微环境组成，并为治疗提供新思路 | 结直肠癌肝转移组织及其邻近组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从结直肠癌患者中采集的肝转移癌组织和邻近组织样本 |
| 25760 | 2024-08-09 |
Transcriptional Profiling of Individual Airway Projecting Vagal Sensory Neurons
2020-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-019-01782-8
PMID:31630330
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）探究了迷走感觉神经元的转录特征 | 首次对投射到气道和肺部的迷走感觉神经元进行单细胞RNA测序，揭示了其分子特征和功能 | NA | 深入了解迷走支气管肺感觉神经元的转录特征 | 迷走支气管肺感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个迷走感觉神经元 |