单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 25721 - 25740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25721 | 2024-08-09 |
FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1440
PMID:31796518
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研究论文 | 研究FLASH照射对肺祖细胞的保护作用及其减少放射诱导衰老的效果 | FLASH照射技术能特异性地保护正常组织免受晚期放射诱导毒性的影响，减少DNA损伤和复制性衰老的风险 | FLASH照射的有益效果在缺乏端粒酶活性的Terc-/-小鼠中消失，表明其效果依赖于正常的端粒酶功能 | 探讨FLASH照射与传统放射治疗相比，在减少正常细胞DNA损伤和保护肺祖细胞方面的效果 | 使用C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠以及人肺细胞进行体外研究 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | RNA | C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠，以及人肺细胞 |
| 25722 | 2024-08-09 |
Understanding the complexity of retina and pluripotent stem cell derived retinal organoids with single cell RNA sequencing: current progress, remaining challenges and future prospective
2020-03, Current eye research
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/02713683.2019.1697453
PMID:31794277
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在视网膜和多能干细胞衍生的视网膜类器官研究中的最新进展、未解决问题及技术挑战 | 单细胞RNA测序技术能够详细记录单个细胞的转录组，揭示视网膜发育、正常生理和疾病中的细胞异质性，并提供细胞类型特异性标记和信号通路的新见解 | 需要克服技术挑战以实现反映所有视网膜细胞类型的复杂性、功能和相互作用的一致结果 | 探讨单细胞RNA测序在视网膜和视网膜类器官研究中的应用，以及面临的挑战和未来展望 | 视网膜组织和多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25723 | 2024-08-09 |
Functional genomic approaches to elucidate the role of enhancers during development
2020-03, Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine
DOI:10.1002/wsbm.1467
PMID:31808313
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研究论文 | 本文讨论了利用功能基因组学方法阐明增强子在发育中的作用 | 介绍了大规模并行报告分析技术用于大规模验证增强子功能，并回顾了CRISPR基因编辑工具和单细胞转录组学在研究发育过程中基因调控的最新进展 | 功能性验证大规模增强子序列仍是一个基本挑战 | 理解增强子序列中哪些序列对功能至关重要 | 增强子在发育中的作用及其功能 | 遗传/基因组方法 | NA | 测序技术，CRISPR，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 25724 | 2024-08-09 |
Continuous and Discrete Neuron Types of the Adult Murine Striatum
2020-02-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.004
PMID:31813651
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和定量RNA原位杂交技术，探讨了成年小鼠纹状体中刺突投射神经元（SPN）的分子和解剖多样性 | 本研究首次通过计算方法区分了单细胞RNA测序数据中的离散和连续异质性，并发现了纹状体中SPN的四种主要离散类型，以及这些类型内的连续异质性 | NA | 旨在定义成年小鼠纹状体中刺突投射神经元的分子和解剖多样性 | 成年小鼠纹状体中的刺突投射神经元（SPN） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量RNA原位杂交（ISH） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25725 | 2024-08-09 |
Allele-specific single-cell RNA sequencing reveals different architectures of intrinsic and extrinsic gene expression noises
2020-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1134
PMID:31799601
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研究论文 | 本文利用等位特异性单细胞RNA测序技术，在老鼠成纤维细胞中评估了3975个基因的内在和外在表达噪声成分 | 首次揭示了内在和外在基因表达噪声的不同架构，并验证了TATA盒和微小RNA靶向等因素对这些噪声的影响 | NA | 探究内在和外在基因表达噪声的架构及其影响因素 | 老鼠成纤维细胞中的3975个基因 | 基因组学 | NA | 等位特异性单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 3975个基因 |
| 25726 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Renal Endothelium Heterogeneity and Metabolic Adaptation to Water Deprivation
2020-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080832
PMID:31818909
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾脏内皮细胞的异质性和对缺水的代谢适应 | 首次揭示了肾脏内皮细胞在缺水和高渗环境下对氧化磷酸化的代谢适应的新角色 | NA | 研究肾脏内皮细胞在不同微环境条件下的异质性和对缺水的代谢适应 | 肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过40,000个鼠肾脏内皮细胞 |
| 25727 | 2024-08-09 |
CD4+ T Cell Help Is Required for the Formation of a Cytolytic CD8+ T Cell Subset that Protects against Chronic Infection and Cancer
2019-12-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.10.009
PMID:31810883
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了CD4 T细胞在慢性感染期间调控CD8 T细胞分化的机制，特别是发现了一个表达CXCR1的具有强效细胞溶解功能的CD8 T细胞亚群。 | 本研究首次揭示了CD4 T细胞通过IL-21帮助形成具有强效细胞溶解功能的CXCR1表达CD8 T细胞亚群，这一发现为免疫治疗中增强CD8 T细胞的杀伤功能提供了新的分子机制。 | NA | 研究CD4 T细胞在慢性感染期间如何调控CD8 T细胞的分化，并探索其在免疫治疗中的应用。 | CD4 T细胞和CD8 T细胞在慢性感染和癌症中的相互作用。 | 免疫学 | 慢性感染和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25728 | 2024-08-09 |
Discovery of specialized NK cell populations infiltrating human melanoma metastases
2019-12-05, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.133103
PMID:31801909
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序分析了从人类黑色素瘤转移病灶中分离的自然杀伤（NK）细胞，揭示了肿瘤浸润NK细胞的转录程序与循环NK细胞的主要差异 | 首次详细描述了肿瘤浸润NK细胞的独特基因表达模式，包括细胞毒性和趋化因子合成程序 | NA | 研究人类实体瘤中NK细胞的功能状态 | 人类黑色素瘤转移病灶中的NK细胞 | digital pathology | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多个患者的肿瘤浸润NK细胞 |
| 25729 | 2024-08-09 |
Hic1 Defines Quiescent Mesenchymal Progenitor Subpopulations with Distinct Functions and Fates in Skeletal Muscle Regeneration
2019-Dec-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.004
PMID:31809738
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研究论文 | 本文研究了骨骼肌再生过程中组织驻留间充质前体细胞（MPs）的功能和命运，并确定了Hic1作为MPs的标记物。 | 首次揭示了Hic1在骨骼肌再生中调控MPs静止状态的作用，并识别出具有不同功能和谱系潜力的MPs亚群。 | NA | 探究骨骼肌再生过程中间充质前体细胞的功能和命运。 | 骨骼肌中的间充质前体细胞及其在再生过程中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | RNA序列，ATAC序列 | 多个骨骼肌中的Hic1 MPs亚群 |
| 25730 | 2024-08-09 |
IL-33 Signaling Alters Regulatory T Cell Diversity in Support of Tumor Development
2019-12-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.120
PMID:31801068
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在肺腺癌的遗传工程小鼠模型中，纵向分析了调节性T细胞（T）的动态变化及其在肿瘤发展中的作用 | 首次揭示了ST2在调节性T细胞介导的癌症免疫抑制中的关键作用 | NA | 探究调节性T细胞在肿瘤发展中的作用及ST2的潜在治疗价值 | 调节性T细胞及其在肺腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 遗传工程小鼠模型 |
| 25731 | 2024-08-09 |
From single-cell RNA-seq to transcriptional regulation
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0327-4
PMID:31792409
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25732 | 2024-08-09 |
Spatial EGFR Dynamics and Metastatic Phenotypes Modulated by Upregulated EphB2 and Src Pathways in Advanced Prostate Cancer
2019-Dec-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11121910
PMID:31805710
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研究论文 | 研究探讨了EphB2和Src信号通路在调节晚期前列腺癌中表皮生长因子受体（EGFR）动态及其激活中的作用 | 首次报道了EphB2和Src信号通路在调节EGFR动态和激活中的作用，并提供了单粒子追踪技术和单细胞RNA测序的数据支持 | 研究主要集中在PC3细胞系和部分DU145细胞上，可能无法完全代表所有晚期前列腺癌的情况 | 探究EphB2和Src信号通路在晚期前列腺癌中对EGFR动态和细胞侵袭性的调节作用 | 晚期前列腺癌细胞系和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单粒子追踪技术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括PC3、LNCaP和DU145细胞系以及来自患者的循环肿瘤细胞 |
| 25733 | 2024-08-09 |
HeLa-CCL2 cell heterogeneity studied by single-cell DNA and RNA sequencing
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0225466
PMID:31790455
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研究论文 | 本研究使用单细胞DNA和RNA测序技术研究HeLa-CCL2细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上研究HeLa-CCL2细胞的拷贝数变异和转录组异质性，并分析了基因组与转录组在单细胞水平上的关系 | 单细胞测序技术在研究异质性细胞时需要更谨慎和严格的数据分析 | 探讨HeLa-CCL2细胞在单细胞水平上的基因组和转录组异质性 | HeLa-CCL2细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞DNA和RNA测序 | NA | DNA和RNA数据 | 多个HeLa-CCL2细胞 |
| 25734 | 2024-08-09 |
Early Transcriptional Landscapes of Chlamydia trachomatis-Infected Epithelial Cells at Single Cell Resolution
2019, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2019.00392
PMID:31803632
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-Seq）分析了衣原体感染的HEp-2细胞的早期转录组景观 | 首次在单细胞水平上研究衣原体感染的早期转录组变化，揭示了感染特定细胞轨迹和差异表达基因 | 研究样本量较小，仅包括200个细胞，可能影响结果的普遍性 | 评估单细胞RNA测序技术在衣原体生物学中的应用，并识别早期宿主细胞的衣原体感染生物标志物 | 衣原体感染的HEp-2细胞和模拟感染的HEp-2细胞 | 数字病理学 | 生殖道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 264个时间匹配的衣原体感染和模拟感染的HEp-2细胞 |
| 25735 | 2024-08-09 |
CellBench: R/Bioconductor software for comparing single-cell RNA-seq analysis methods
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz889
PMID:31778143
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研究论文 | 本文介绍了CellBench软件，用于比较单细胞RNA测序分析方法 | CellBench软件支持任务中心或组合方式的方法比较，自动运行方法组合，并提供运行时间测量和表格输出，便于总结和可视化 | NA | 开发新软件以管理单细胞RNA测序分析方法的基准测试 | 单细胞RNA测序分析方法的基准测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25736 | 2024-08-09 |
A single-cell transcriptome atlas for zebrafish development
2020-03-15, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2019.11.008
PMID:31782996
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序方法，构建了一个斑马鱼发育过程中的单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了斑马鱼从咽囊到早期幼体阶段的细胞类型及其基因表达变化，为生物学家提供了新的细胞类型和发育阶段特异性表达信息 | NA | 旨在填补我们对动物发育及人类疾病中细胞类型及其变化了解的空白 | 斑马鱼发育过程中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44,102个细胞，跨越四天的发育过程，使用重复实验确认高重复性 |
| 25737 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics: A High-Resolution Avenue for Plant Functional Genomics
2020-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2019.10.008
PMID:31780334
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在植物功能基因组学中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术，能够在单细胞分辨率下研究复杂组织中的调控过程 | 处理和分析复杂数据集存在挑战 | 深入了解组织功能并促进这些信息在植物细胞图谱中的应用 | 植物细胞在不同组织中的协同作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 任何给定组织的任何植物细胞 |
| 25738 | 2024-08-09 |
Tumor mutation burden, immune checkpoint crosstalk and radiosensitivity in single-cell RNA sequencing data of breast cancer
2020-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2019.11.003
PMID:31767471
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研究论文 | 本研究分析了乳腺癌和免疫细胞的单细胞RNA测序数据，主要关注肿瘤突变负荷（TMB）、免疫检查点交叉对话和放射敏感性 | 本研究首次在单细胞水平上探讨了乳腺癌中肿瘤突变负荷、免疫检查点交叉对话与放射敏感性的关系 | 研究样本量较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨乳腺癌中单细胞RNA测序数据中的肿瘤突变负荷、免疫检查点交叉对话和放射敏感性的关系 | 乳腺癌细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 肿瘤细胞和免疫细胞共492个，其中肿瘤细胞来自原发肿瘤和转移淋巴结共317个 |
| 25739 | 2024-08-09 |
Single-Cell Capture, RNA-seq, and Transcriptome Analysis from the Neural Retina
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0175-4_12
PMID:31786788
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研究论文 | 本文描述了从成年视网膜组织中进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）的当前技术，包括视网膜解剖、视网膜分离、细胞群体评估、cDNA合成、文库构建和下一代测序，并介绍了使用开源工具的scRNA-seq数据分析流程 | 介绍了从成年视网膜组织中进行scRNA-seq的技术流程，并引入了使用开源工具的数据分析方法 | NA | 解决细胞异质性挑战 | 成年视网膜组织中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 超过100种神经细胞亚型 |
| 25740 | 2024-08-09 |
Refining the adipose progenitor cell landscape in healthy and obese visceral adipose tissue using single-cell gene expression profiling
2019-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.201900561
PMID:31767614
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对健康和肥胖小鼠内脏脂肪组织中的脂肪前体细胞进行了细胞图谱构建和异质性分析 | 研究首次识别出两种不同的脂肪组织来源干细胞（ASCs）和三种不同的前脂肪细胞（PAs），并发现了新的细胞表面标记物，这些标记物与传统的ASCs和前脂肪细胞标记物结合使用，可以通过流式细胞术区分这些APC亚群 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 旨在深入研究脂肪组织的基本生物学特性，以推动解决肥胖问题的创新解决方案 | 健康和肥胖小鼠的内脏脂肪组织中的脂肪前体细胞（APCs） | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及健康和肥胖小鼠的内脏脂肪组织样本 |