单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 25721 - 25740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25721 | 2024-08-09 |
Bayesian Inference of Allelic Inclusion Rates in the Human T Cell Receptor Repertoire
2019-11-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.09.006
PMID:31677971
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研究论文 | 本文开发并实验验证了一种完全贝叶斯推理模型，用于可靠地估计α和β TCR等位基因包含率 | 提出了一个完全贝叶斯推理模型来估计α和β TCR等位基因包含率，并提供了超过51,000个先前未发表的等位基因包含TCR序列集的数据库 | 单细胞测序技术的局限性阻碍了对这些双受体T细胞的全面计数 | 研究人类T细胞受体库中的等位基因包含率 | αβ T细胞的等位基因包含现象 | NA | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯推理模型 | 序列数据 | 超过51,000个TCR序列集，来自8名健康个体 |
| 25722 | 2024-08-09 |
Self-renewing endometrial epithelial organoids of the human uterus
2019-11-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915389116
PMID:31666317
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研究论文 | 本研究使用已建立的器官培养协议，从人类子宫内膜活检中生成并全面分析了三维子宫内膜上皮器官（EEO）培养物 | 本研究首次详细描述了人类子宫内膜上皮器官的生成及其在激素处理下的基因表达变化 | NA | 研究子宫内膜在妊娠早期的作用及其生理和病理机制 | 人类子宫内膜上皮器官（EEO）及其在激素处理下的反应 | NA | 不孕症 | 实时定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自2个不同供体的子宫内膜样本 |
| 25723 | 2024-08-09 |
Modular transcriptional programs separately define axon and dendrite connectivity
2019-11-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50822
PMID:31687928
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研究论文 | 本文研究了T4/T5神经元的转录调控程序，揭示了不同树突和轴突连接模式的转录程序 | 本文首次揭示了模块化转录程序在定义神经元连接模式中的独立控制作用 | NA | 探索神经元连接模式的转录调控机制 | T4/T5神经元的树突和轴突连接模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种T4/T5神经元亚型 |
| 25724 | 2024-08-09 |
DoubletDecon: Deconvoluting Doublets from Single-Cell RNA-Sequencing Data
2019-11-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.082
PMID:31693907
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DoubletDecon的方法，用于从单细胞RNA测序数据中去除双细胞捕获的技术伪影 | DoubletDecon结合了去卷积分析和独特细胞状态基因表达的识别，能够高灵敏度地识别不同类型的双细胞，并避免将有效的混合谱系和过渡细胞状态误判为双细胞 | NA | 开发一种方法来检测和去除单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同细胞复杂度的单细胞RNA测序数据集 |
| 25725 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development
2019-11-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50777
PMID:31682227
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研究论文 | 本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化 | 首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解 | NA | 探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化 | 鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞 | 蛋白质组学 | NA | 单细胞 shotgun 质谱技术 | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 多个单细胞样本 |
| 25726 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney
2019-11-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005
PMID:31689386
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研究论文 | 本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成 | 研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer | NA | 增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏 | 数字病理学 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本 |
| 25727 | 2024-08-09 |
Stress-Induced Metabolic Disorder in Peripheral CD4+ T Cells Leads to Anxiety-like Behavior
2019-10-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.001
PMID:31675497
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研究论文 | 本研究探讨了外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的病理作用及其调控机制 | 首次揭示了CD4 T细胞中由应激诱导的白三烯B4触发线粒体裂变，进而导致焦虑、抑郁和社会行为异常的机制 | NA | 阐明外周CD4+ T细胞在情绪障碍中的病理作用及调控机制 | 外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的作用 | NA | 焦虑症 | 代谢组学分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25728 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics in complex tissues using microprobe capillary electrophoresis mass spectrometry
2019, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.07.001
PMID:31668233
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）的单细胞蛋白质组学分析方法，能够在不分离或解剖整个细胞的情况下，直接对嵌入复杂组织中的单个细胞进行蛋白质组学分析 | 该技术利用微尺度样品收集和处理、分离及离子化技术的最新进展，将高分辨率质谱技术扩展到单细胞水平，揭示了胚胎细胞和神经元之间先前未知的蛋白质组学差异 | NA | 旨在扩展我们对单个细胞产生的蛋白质差异（异质性）及其对正常和受损发育贡献的理解 | 研究对象包括非洲爪蟾和斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 | 蛋白质组学 | NA | 微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS） | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 |
| 25729 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding neocortical development
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.20332.1
PMID:31681469
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综述 | 本文综述了最近在理解新皮质发育方面的突出进展，特别关注背侧前体细胞和兴奋性神经元 | 强调了神经干细胞在不同类别中的分化及其增殖和神经元产生的过程，以及最近关于神经元迁移的发现 | NA | 总结新皮质发育的最新进展，并探讨其进化和疾病机制 | 新皮质发育，特别是背侧前体细胞和兴奋性神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25730 | 2024-08-09 |
Subregion-specific rules govern the distribution of neuronal immediate-early gene induction
2020-09-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913658116
PMID:31636216
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研究论文 | 本文研究了即时早期基因（IEG）在神经元集合中的分布规律，特别是在背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）中，通过急性可卡因暴露后的表达情况。 | 发现了IEG表达的区域特异性规则，并观察到IEG表达的神经元集合形成空间定义的集群，这些集群与多个IEG的协同和强表达相关。 | 研究主要集中在背侧纹状体的SPN中，未涵盖所有脑结构和刺激类型。 | 探讨IEG在神经元集合中的分布规律及其与记忆形成的关系。 | 背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）和皮质神经元的IEG表达。 | 神经科学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | RNA序列 | 小鼠背侧纹状体中的SPN和皮质神经元 |
| 25731 | 2024-08-09 |
deepMc: Deep Matrix Completion for Imputation of Single-Cell RNA-seq Data
2020-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2019.0278
PMID:31657645
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度矩阵分解的方法deepMc，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 利用深度学习技术解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达数据 | 机器学习 | NA | 深度矩阵分解 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 25732 | 2024-08-09 |
Migraine-associated gene expression in cell types of the central and peripheral nervous system
2020-04, Cephalalgia : an international journal of headache
IF:5.0Q1
DOI:10.1177/0333102419877834
PMID:31660761
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了中枢和周围神经系统中与偏头痛相关的基因表达情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术，确定了与偏头痛相关的基因在中枢和周围神经系统中的具体细胞类型表达 | NA | 确定与偏头痛相关的基因在神经系统中的细胞类型特异性表达 | 中枢和周围神经系统中的细胞类型 | NA | 偏头痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 25733 | 2024-08-09 |
SINC: a scale-invariant deep-neural-network classifier for bulk and single-cell RNA-seq data
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz801
PMID:31647523
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SINC的尺度不变深度神经网络分类器，用于批量和单细胞RNA-seq数据分析 | SINC分类器能够在不进行序列深度缩放的情况下直接使用原始计数数据，且在不同序列深度估计下给出相同结果 | NA | 开发一种尺度不变的深度神经网络分类器，用于样本分类，如正常与癌变样本的区分 | 批量和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 九个批量和单细胞数据集 |
| 25734 | 2024-08-09 |
PlanExp: intuitive integration of complex RNA-seq datasets with planarian omics resources
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz802
PMID:31647529
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研究论文 | 本文介绍了一个名为PlanExp的网络应用程序，用于探索和可视化不同RNA-seq实验（传统和单细胞RNA-seq）中的基因表达数据，特别是针对地中海扁虫Schmidtea mediterranea | PlanExp提供了多种交互式绘图工具，如热图、散点图等，并整合了PlanNET网络应用程序，实现了基因组和转录水平的序列注释链接，以及基因/蛋白质网络编辑器和单细胞RNA-seq数据的遗传相互作用预测 | NA | 旨在帮助研究人员理解和分析扁虫再生和发育过程中的大量转录组和基因组数据 | 地中海扁虫Schmidtea mediterranea的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25735 | 2024-08-09 |
Macrophage-Derived CXCL9 and CXCL10 Are Required for Antitumor Immune Responses Following Immune Checkpoint Blockade
2020-01-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1868
PMID:31636098
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研究论文 | 研究免疫检查点阻断治疗后，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在抗肿瘤免疫反应中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中对T细胞招募和治疗效果的关键作用 | NA | 探讨免疫检查点阻断治疗中，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10对T细胞招募和治疗效果的影响 | 巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 免疫学 | NA | NanoString-based分析、流式细胞术、细胞珠阵列、单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 包括小鼠模型和接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 |
| 25736 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Diversity in Embryonic Salivary Glands
2020-01, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/0022034519883888
PMID:31644367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的14,441个细胞的转录组，以揭示这些腺体在芽形成初期的分子特征 | 首次全面描述了芽形成阶段特定的细胞分子标志，并提供了胚胎期腮腺的转录组数据，尤其是对未充分研究的间充质细胞群体 | NA | 探索胚胎期唾液腺中细胞多样性的分子基础 | 胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,441个细胞 |
| 25737 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation
2019-12-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠压力超负荷诱导的心力衰竭模型中心脏免疫浸润的组成和免疫激活情况 | 揭示了在心力衰竭中，除了已知的巨噬细胞和T淋巴细胞外，中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞和肥大细胞等多种免疫细胞类型也参与了免疫激活 | NA | 探究压力超负荷诱导的心力衰竭中的心脏免疫反应 | 小鼠心脏中的免疫细胞亚群及其在心力衰竭中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 25738 | 2024-08-09 |
Isolation of Cardiomyocytes Undergoing Mitosis With Complete Cytokinesis
2019-12-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.314908
PMID:31648614
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研究论文 | 本研究开发了一种新技术，通过使用分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 本研究提出了一种新的方法，通过分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离具有真正有丝分裂潜力的心肌细胞，这是对基于DNA含量的现有方法的替代 | NA | 深入理解心肌细胞分裂的机制，特别是那些完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 从人诱导多能干细胞衍生的真正增殖的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 25739 | 2024-08-09 |
Inhibiting repressive epigenetic modification promotes telomere rejuvenation in somatic cell reprogramming
2019-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901486RR
PMID:31645134
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研究论文 | 研究通过小分子筛选和实验验证，发现褪黑素能促进体细胞核转移（SCNT）重编程过程中的端粒恢复，提高克隆动物的生产效率 | 首次研究了褪黑素处理与SCNT介导重编程中端粒恢复的关系，并发现褪黑素能抑制与基因沉默相关的异染色质表观遗传修饰 | NA | 提高体细胞核转移重编程的效率，促进克隆动物的生产 | 体细胞核转移重编程过程中的端粒恢复和表观遗传修饰 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量FISH实验 | NA | RNA | SCNT衍生胚胎 |
| 25740 | 2024-08-09 |
Single-cell study of neural stem cells derived from human iPSCs reveals distinct progenitor populations with neurogenic and gliogenic potential
2019-Dec, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.12731
PMID:31651061
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来源于人诱导多能干细胞（iPSCs）和胎脑的神经干细胞（NSCs），揭示了神经发生和胶质发生前体细胞的异质性 | 发现了来源于iPS细胞的NSC与胎脑来源的NSC在神经发生前体细胞的异质性及自发分化潜能上的差异 | NA | 研究神经干细胞阶段细胞类型的内在异质性 | 来源于人诱导多能干细胞和胎脑的神经干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个来源于人诱导多能干细胞的神经干细胞系和一个来源于胎脑的神经干细胞系 |