单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
25701 2024-08-09
Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc
2021-03, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组,识别了新的椎间盘细胞基因标记,并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱 本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因,并提出了新的标记基因,包括多能干细胞(MSC)标记基因 NA 旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型 大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群 数字病理学 NA 10X Genomics技术 NA 单细胞转录组 13,578个单细胞转录本
25702 2024-08-09
Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease
2021-03, Trends in cell biology IF:13.0Q1
研究论文 本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用 利用单细胞转录组学和多组学分析,揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制 NA 研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制 消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用 数字病理学 消化系统疾病 单细胞转录组学 NA 多组学数据 NA
25703 2024-08-09
Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文介绍了一种名为microSPLiT的高通量单细胞RNA测序方法,用于分析革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 microSPLiT方法能够解析细菌中异质的转录状态,并为无法进行单细胞分析的自然微生物群落提供高通量基因表达分析 NA 开发一种适用于细菌的高通量单细胞RNA测序方法 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 超过25,000个细胞
25704 2024-08-09
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过比较早期和晚期发作的先兆子痫的系统转录组,揭示了其不同的病理机制并发现了新的生物标志物 本研究首次系统比较了早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组,并结合单细胞转录组学,发现了新的特定生物标志物 NA 旨在揭示早期和晚期发作的先兆子痫之间的差异,并识别新的生物标志物 早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 使用患者血液样本进行实验验证
25705 2024-08-09
Hepatobiliary acid-base homeostasis: Insights from analogous secretory epithelia
2021-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
综述 本文综述了从类似分泌上皮中获得的关于肝胆酸碱稳态的见解 利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了人类胆管细胞的表达,提供了关于pH稳态及其在胆道系统中失调的分子基础的见解 NA 探讨在类似分泌上皮中发现的保守原则,并结合当前对胆管细胞生理学的认识 肝胆酸碱稳态及其在类似分泌上皮中的机制 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
25706 2024-08-09
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究通过活体成像技术,识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的神经干细胞(NSCs)。 首次通过活体成像技术识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的Gli1靶向NSCs,并比较了Gli1和Ascl1靶向细胞的转录组特征。 研究仅限于小鼠模型,且依赖于特定的基因标记技术。 旨在揭示成年小鼠海马体中神经干细胞的长期自我更新能力及其潜在机制。 研究对象为成年小鼠海马体中的神经干细胞及其子代细胞。 NA NA 双光子显微镜、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 研究涉及多个基因标记的神经干细胞及其子代细胞。
25707 2024-08-09
MS4A1 expression and function in T cells in the colorectal cancer tumor microenvironment
2021-02, Cellular immunology IF:3.7Q2
研究论文 本文研究了MS4A1基因在结直肠癌肿瘤微环境中T细胞的表达和功能 首次报道MS4A1基因在结直肠癌中的表达与患者生存率正相关,并发现CD8CD20 T细胞亚群在肿瘤微环境中的作用 NA 探讨MS4A1基因在结直肠癌免疫治疗中的作用机制 MS4A1基因在结直肠癌中的表达及其对T细胞功能的影响 数字病理学 结直肠癌 scRNA-Seq NA RNA序列 来自公共数据库的scRNA-Seq数据集及已发表的nivolumab治疗数据集
25708 2024-08-09
PD-1 blockade restores helper activity of tumor-infiltrating, exhausted PD-1hiCD39+ CD4 T cells
2021-01-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文通过表型、转录组和功能方法研究了头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞耗竭情况,并探讨了PD-1阻断对这些细胞辅助活性的恢复作用 首次详细描述了CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态,并证明了PD-1阻断可以恢复其辅助活性 NA 研究CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态及其对免疫检查点阻断的响应 头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞 免疫学 头颈癌、宫颈癌、卵巢癌 scRNA-Seq NA 转录组数据 NA
25709 2024-08-09
The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway mediates mesenchymal cell recruitment and fibrotic contraction in lung transplant fibrosis
2021-01, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本文研究了自噬素-溶血磷脂酸途径在肺移植纤维化中的间充质细胞招募和纤维化收缩的作用 首次展示了肺移植受者BAL液对人类肺组织衍生MSC的强烈趋化作用,并诱导收缩表型,通过LPA阻断完全消除了BAL介导的MSC趋化和胶原凝胶收缩 NA 识别诱导肺组织间充质干细胞迁移和收缩分化的介质 肺移植受者的间充质干细胞和肺移植纤维化机制 NA 肺纤维化 酶联免疫吸附试验,液相色谱-串联质谱法,单细胞RNA测序 NA 细胞 7名健康对照和21名肺移植受者的BAL液,7名健康对照和31名肺移植受者的BAL液,1名CLAD肺移植受者的BAL细胞
25710 2024-08-09
Study on the clinical mechanism of Tong-Xie-An-Chang Decoction in the treatment of diarrheal irritable bowel syndrome based on single-cell sequencing technology
2020-Dec-24, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究旨在评估通泻安肠汤治疗腹泻型肠易激综合征的临床疗效和安全性,并基于单细胞测序技术阐明其基因层面的治疗机制 利用单细胞测序技术探索腹泻型肠易激综合征患者外周血中T淋巴细胞的差异基因表达和细胞异质性 NA 评估通泻安肠汤在腹泻型肠易激综合征治疗中的临床疗效和安全性,并阐明其基因层面的治疗机制 腹泻型肠易激综合征患者 NA 肠易激综合征 单细胞测序 NA 基因数据 72名符合条件的腹泻型肠易激综合征患者
25711 2024-08-09
Lung megakaryocytes display distinct transcriptional and phenotypic properties
2020-12-22, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序、组织学、倍性分析和流式细胞术研究了来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞的转录组和表型特征 发现肺巨核细胞具有独特的转录特征,富集了成熟标志物,可能表明其具有更高效的血小板生产能力,并且表现出免疫和炎症相关的富集特征 NA 探讨肺巨核细胞的转录和表型特性 肺巨核细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞
25712 2024-08-09
Pulmonary neuroendocrine cells: physiology, tissue homeostasis and disease
2020-12-21, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
综述 本文综述了肺神经内分泌细胞(PNECs)的生理功能、组织稳态及其在疾病中的作用 介绍了PNECs在肺通气动力学、机械感应和类型2免疫反应中的作用,以及单细胞RNA测序揭示的PNECs基因表达异质性和再生过程中的重编程 NA 深入理解PNECs的基本特性在肺生物学和病理学中的重要性 肺神经内分泌细胞(PNECs)及其在呼吸疾病中的作用 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
25713 2024-08-09
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对人类寄生虫曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段进行了细胞图谱分析 首次为曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段提供了全面的细胞类型图谱 NA 揭示驱动曼氏血吸虫在哺乳动物体内发育的机制 曼氏血吸虫的早期发育阶段,特别是称为血吸虫幼虫的阶段 数字病理学 血吸虫病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两天的曼氏血吸虫幼虫样本
25714 2024-08-09
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology IF:5.2Q1
research paper 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统,用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 开发了一种新的测序系统,能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息,并提出了名为“分子足迹”的新方法 NA 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 NA NA 单分子测序 NA DNA条形码分子 30种DNA条形码分子
25715 2024-08-09
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响,并识别了不同β细胞群的基因表达模式 研究仅限于一周的高脂饮食干预,可能无法完全反映长期饮食干预的影响 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本
25716 2024-08-09
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞,揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型,并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞,并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌,可能影响结果的普遍性。 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本
25717 2024-08-09
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Kidney Organoids with Improved Collecting Duct Maturation and Injury Modeling
2020-12-15, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过独立生成两种肾前体细胞群——间充质和尿管芽样细胞,成功生成了具有收集系统的肾类器官,并探讨了激素在收集管细胞分化中的作用。 本文首次通过独立生成两种肾前体细胞群,实现了肾类器官中收集系统的形成,并利用单细胞RNA测序技术展示了近端小管成熟度的提高和非目标细胞群的减少。 NA 探索人类多能干细胞衍生的肾类器官在药物测试和再生医学中的应用,以及疾病模型的建立。 人类多能干细胞衍生的肾类器官及其收集管成熟和损伤模型的建立。 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
25718 2024-08-09
GAS2L1 Is a Potential Biomarker of Circulating Tumor Cells in Pancreatic Cancer
2020-Dec-15, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究分析了胰腺癌循环肿瘤细胞(CTC)的单细胞RNA测序数据,并提出GAS2L1作为胰腺癌CTC的新型生物标志物 本研究通过组合使用GAS2L1和其他标志物,提高了胰腺癌CTC的检测率 NA 探索胰腺癌循环肿瘤细胞的生物标志物 胰腺癌循环肿瘤细胞及其生物标志物 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 包括遗传工程小鼠模型(GEMM)和胰腺癌患者样本
25719 2024-08-09
The Evolving Knowledge on T and NK Cells in Classic Hodgkin Lymphoma: Insights into Novel Subsets Populating the Immune Microenvironment
2020-Dec-14, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤(cHL)中T细胞和NK细胞的最新研究进展,特别是通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等高维度分析技术揭示的免疫微环境中T细胞和NK细胞亚群的新发现 利用高维度分析技术揭示了cHL中T细胞和NK细胞亚群的新组成,并识别出具有耗竭表型的新型细胞毒性亚群,这些发现有助于理解先前未被认识的免疫逃逸机制 NA 探讨cHL微环境中最近识别的T细胞和NK细胞亚群的免疫学特征和功能属性,并讨论如何利用这些知识预测免疫治疗反应及设计提高PD-1阻断疗效的新策略 经典霍奇金淋巴瘤中的T细胞和NK细胞亚群 免疫学 霍奇金淋巴瘤 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA 细胞 NA
25720 2024-08-09
Elevated TUBA1A Might Indicate the Clinical Outcomes of Patients with Gastric Cancer, Being Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment
2020-Dec-12, Journal of gastrointestinal and liver diseases : JGLD IF:2.1Q3
研究论文 本研究评估了TUBA1A在胃癌中的表达及其对临床结果的影响,特别是与肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的关联 首次探讨了TUBA1A与胃癌患者生存和临床病理特征的关系,以及其在肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的作用 NA 探究TUBA1A在胃癌中的表达及其对患者生存和临床病理特征的影响 胃癌患者及正常样本中的TUBA1A表达 数字病理学 胃癌 基因集富集分析(GSEA) NA RNA测序数据 1881个样本,包括1618名胃癌患者和263个正常样本
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