单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 25701 - 25720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25701 | 2024-08-09 |
Interleukin 1 beta and Matrix Metallopeptidase 3 Contribute to Development of Epidermal Growth Factor Receptor-Dependent Serrated Polyps in Mouse Cecum
2019-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2019.08.025
PMID:31470007
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研究论文 | 研究了白细胞介素1β（IL1B）和基质金属蛋白酶3（MMP3）在表皮生长因子受体（EGFR）依赖性锯齿状息肉发展中的作用 | 发现IL1B激活的PDGFRA+纤维母细胞产生的MMP3对锯齿状息肉的发展至关重要 | 研究仅限于小鼠模型，可能与人类疾病存在差异 | 探究IL1B和MMP3在EGFR依赖性锯齿状息肉发展中的机制 | 小鼠结肠中的锯齿状息肉 | NA | NA | 逆转录聚合酶链反应, 酶联免疫吸附试验, 免疫荧光, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | C57BL/6（对照）和HBUS小鼠 |
| 25702 | 2024-08-09 |
Cardiomyocyte dedifferentiation and remodeling in 3D scaffolds to generate the cellular diversity of engineering cardiac tissues
2019-Nov-01, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c9bm01003c
PMID:31455969
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研究论文 | 本研究探讨了心肌细胞在三维支架微环境中的细胞命运及其在工程心脏组织细胞多样性生成中的作用 | 首次展示了细胞在三维支架微环境中为生存而进行的适应性去分化，生成异质性组织 | NA | 确定心肌细胞在三维支架微环境中的细胞命运及其在生成工程心脏组织细胞多样性中的作用 | 心肌细胞在三维支架中的去分化和重塑过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 包含与心脏内源性类别相关的多种细胞类型 |
| 25703 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Map of the Human and Mouse Bladders
2019-11, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019040335
PMID:31462402
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术创建了人类和小鼠膀胱的单细胞转录组图谱 | 发现了两种新型的人类膀胱细胞类型，并验证了这些细胞在小鼠和老鼠膀胱中的存在 | NA | 为了理解良性膀胱疾病和膀胱癌的细胞起源，创建了正常人类膀胱的细胞解剖学综合图谱 | 人类和小鼠的膀胱细胞类型及其功能 | digital pathology | bladder cancer | scRNA-seq | NA | text | 12,423个人类膀胱细胞和12,884个小鼠膀胱细胞 |
| 25704 | 2024-08-09 |
Dissecting dynamic expression of autophagy-related genes during human fetal digestive tract development via single-cell RNA sequencing
2019-11, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2019.1656956
PMID:31470757
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了人类胎儿消化道发育过程中自噬相关基因的动态表达 | 首次揭示了自噬在早期人类胚胎消化道，特别是小肠发育中的重要作用 | NA | 研究自噬在人类胎儿消化道发育中的作用 | 人类胚胎消化道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过5000个人类胚胎消化道细胞，时间跨度从6周到25周 |
| 25705 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma Reveals Tumor-Initiating Progenitors and Oncogenic Cascades during Tumorigenesis and Relapse
2019-09-16, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2019.07.009
PMID:31474569
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研究论文 | 利用单细胞转录组分析技术，研究了Sonic Hedgehog型髓母细胞瘤中的前体细胞异质性和肿瘤起始及复发机制 | 首次揭示了OLIG2表达的胶质前体细胞在髓母细胞瘤起始和复发中的作用，并识别了相关的致癌网络 | NA | 探索髓母细胞瘤中肿瘤起始前体细胞的异质性和身份，以及其在肿瘤发生和复发中的作用 | Sonic Hedgehog型髓母细胞瘤中的前体细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25706 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of human bone marrow and blood natural killer cells defined by single-cell transcriptome
2019-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11947-7
PMID:31477722
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，定义了人骨髓和血液中自然杀伤细胞的异质性 | 首次通过单细胞转录组分析，揭示了人骨髓和血液中自然杀伤细胞的不同群体及其特征 | NA | 深入理解人自然杀伤细胞的异质性和发育过程 | 人骨髓和血液中的自然杀伤细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25707 | 2024-08-09 |
Spatial and temporal tools for building a human cell atlas
2019-09-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E18-10-0667
PMID:31465255
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研究论文 | 本文讨论了利用高灵敏度、高内容和高通量的显微技术，以及深度和高通量的单细胞测序方法，结合计算和建模工具，构建时空细胞图谱的方法 | 提出了优化实验条件以全面观察组织，跨越多个时间尺度的分子分析，以及管理大数据集、提取数据模式和相关性、整合和可视化数据的新工具 | 需要进一步优化实验条件，扩展分子分析的时间尺度，并开发新的数据管理和分析工具 | 构建时空细胞图谱，以促进科学界的数据和工具共享 | 时空细胞图谱的构建方法和技术 | 生物信息学 | NA | 显微技术，单细胞测序 | NA | 图像，序列数据 | NA |
| 25708 | 2024-08-09 |
A hotspot for new genes
2019-08-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50136
PMID:31464682
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研究论文 | 本文通过果蝇的单细胞RNA测序，揭示了新基因在精子形成过程中的表达情况 | 提供了关于新基因在精子形成过程中表达的详细和前所未有的图像 | NA | 探索新基因在果蝇精子形成过程中的表达 | 果蝇的单细胞RNA | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 25709 | 2024-08-09 |
Light-induced injury in mouse embryos revealed by single-cell RNA sequencing
2019-Aug-29, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-019-0256-1
PMID:31466525
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了高强度光照对小鼠胚胎的影响 | 首次通过转录组学研究探索了光照诱导的损伤及其在着床前胚胎中的响应 | NA | 研究高强度光照对小鼠胚胎的影响及其潜在的修复响应 | 小鼠胚胎从2细胞阶段到囊胚阶段的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同光照条件下的多个小鼠胚胎样本 |
| 25710 | 2024-08-09 |
High-resolution analysis of germ cells from men with sex chromosomal aneuploidies reveals normal transcriptome but impaired imprinting
2019-08-28, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-019-0720-3
PMID:31462300
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研究论文 | 本研究通过深度亚硫酸氢盐测序和单细胞RNA测序技术，分析了Klinefelter综合征患者生殖细胞的表观遗传和转录组特征 | 首次揭示了Klinefelter综合征患者生殖细胞具有正常的转录组，但在印记区域存在DNA甲基化异常 | 研究受限于Klinefelter综合征患者睾丸中生殖细胞数量较少 | 探究Klinefelter综合征患者生殖细胞的分子生物学特性，特别是其DNA甲基化模式和转录组 | Klinefelter综合征患者的生殖细胞 | NA | 性染色体非整倍体 | 深度亚硫酸氢盐测序，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25711 | 2024-08-09 |
Temporal and partial inhibition of GLI1 in neural stem cells (NSCs) results in the early maturation of NSC derived oligodendrocytes in vitro
2019-08-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-019-1374-y
PMID:31455382
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研究论文 | 本研究通过在神经干细胞（NSCs）中短暂和部分抑制GLI1，促进了NSC来源的少突胶质细胞在体外早期成熟 | 使用小分子GANT61短暂和部分抑制GLI1，促进了少突胶质细胞前体细胞（OPCs）的迁移能力和早期分化为产生髓鞘的少突胶质细胞 | NA | 开发一种基于小分子的体外方案，以更快地生成功能性少突胶质细胞 | 人诱导多能干细胞（iPSC）和人胚胎干细胞（hESCs）来源的神经干细胞（NSCs）及其衍生的少突胶质细胞 | 干细胞研究 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | 192个少突胶质细胞前体细胞（OPCs） |
| 25712 | 2024-08-09 |
ALK mutation dynamics and clonal evolution in a neuroblastoma model exhibiting two ALK mutations
2019-Aug-13, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.27119
PMID:31452835
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研究论文 | 本研究分析了神经母细胞瘤模型中ALK基因突变动力学和克隆进化 | 首次揭示了神经母细胞瘤模型中ALK基因双突变（F1174L和L1196M）的动态变化及其对药物反应的影响 | NA | 探索神经母细胞瘤中ALK基因突变动力学及克隆进化 | 神经母细胞瘤细胞系及其ALK基因突变 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 全外显子测序, 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 两个神经母细胞瘤细胞系，分别来自原发肿瘤和骨髓 |
| 25713 | 2024-08-09 |
Reconstructing B-cell receptor sequences from short-read single-cell RNA sequencing with BRAPeS
2019-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.201900371
PMID:31451449
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BRAPeS的算法，用于从短读长配对端单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体序列 | BRAPeS算法能够在非常短的读长（25 bp）下准确重建B细胞受体序列，降低了成本并增加了可分析的细胞数量 | NA | 开发一种算法以从短读长单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体序列 | B细胞受体序列 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 算法 | RNA序列 | 单个B细胞 |
| 25714 | 2024-08-09 |
Aging promotes reorganization of the CD4 T cell landscape toward extreme regulatory and effector phenotypes
2019-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw8330
PMID:31457092
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和多维蛋白质分析，揭示了年龄对CD4 T细胞景观的重塑，特别是极端调节性和效应性表型的积累。 | 首次详细描述了随着年龄增长，CD4 T细胞亚群的显著变化，特别是耗竭、细胞毒性和激活的调节T细胞（aT）的积累。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨年龄相关CD4 T细胞功能变化及其与慢性炎症和免疫下降的关系。 | CD4 T细胞的功能和表型变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质分析 | 数千个CD4 T细胞，来自年轻和老年小鼠 |
| 25715 | 2024-08-09 |
PanoView: An iterative clustering method for single-cell RNA sequencing data
2019-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007040
PMID:31469823
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PanoView的迭代聚类方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | PanoView方法集成了基于密度的聚类算法OLMC，通过启发式方法估计所需参数，无需调整参数即可同时检测主要和稀有细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | OLMC | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎下丘脑的单细胞RNA测序数据 |
| 25716 | 2024-08-09 |
DNA Methylation in Epidermal Differentiation, Aging, and Cancer
2020-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2019.05.011
PMID:31427190
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综述 | 本文综述了DNA甲基化在表皮分化、衰老和癌症中的作用 | 讨论了DNA甲基转移酶的功能角色、甲基化时钟以及肿瘤起源细胞的确定等最新发现 | NA | 探讨表皮稳态、衰老和癌症中与DNA甲基化相关的最新进展 | 表皮分化、衰老和癌症中的DNA甲基化机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 25717 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics: putting genome-wide expression on the map
2020-01, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-019-0484-7
PMID:31444395
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25718 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq characterization of anatomically identified OLM interneurons in different transgenic mouse lines
2019-12, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.14549
PMID:31420995
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了在解剖学和电生理学上识别的海马体oriens-lacunosum moleculare（OLM）中间神经元，这些神经元在不同的转基因小鼠系中表达。 | 研究发现OLM中间神经元中Npy的表达一致性，以及Htr3a在OLM中的低频表达和Htr3b在Htr3aCre-OLM中的特异性表达。 | 研究结果表明Htr3b的差异表达可能是由于Htr3a-Cre BAC转基因系设计导致的意外结果。 | 旨在广泛表征OLM细胞，并探讨其功能和发育起源。 | 海马体oriens-lacunosum moleculare（OLM）中间神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Sst-Cre和BAC转基因Htr3a-Cre小鼠系中的OLM类型进行分析。 |
| 25719 | 2024-08-09 |
Activation of Hedgehog Signaling Promotes Development of Mouse and Human Enteric Neural Crest Cells, Based on Single-Cell Transcriptome Analyses
2019-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2019.08.019
PMID:31442438
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了 Hedgehog 信号通路激活对小鼠和人源肠神经嵴细胞发育的影响。 | 首次揭示了 Hedgehog 信号通路激活促进小鼠和人源肠神经嵴细胞向神经元和胶质细胞谱系分化的机制。 | NA | 探究 Hedgehog 信号通路激活如何调控人多能干细胞衍生的肠神经嵴细胞的发育。 | 小鼠和人源肠神经嵴细胞，以及人多能干细胞衍生的肠神经嵴细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组 | 包括 Tg(GBS-GFP), Sufuf/f; Wnt1-cre, Ptch1+/-, 和 Gli3Δ699/Δ699 小鼠的肠道组织，以及 IMR90 和 UE02302 人多能干细胞系衍生的神经嵴细胞。 |
| 25720 | 2024-08-09 |
Glucose-Dependent Insulinotropic Polypeptide Receptor-Expressing Cells in the Hypothalamus Regulate Food Intake
2019-11-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2019.07.013
PMID:31447324
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研究论文 | 研究通过创建Gipr-Cre敲入小鼠，识别和操纵表达葡萄糖依赖性胰岛素释放肽受体（GIPR）的细胞，并探讨其在调节食物摄入中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出下丘脑中表达GIPR的细胞群，并发现这些细胞在血管、胶质和神经元细胞中表现出转录组特征。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证这些发现。 | 旨在识别和操纵表达GIPR的细胞，以了解其在调节食物摄入和能量平衡中的作用。 | 下丘脑中表达GIPR的细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |