单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 25641 - 25660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25641 | 2024-08-09 |
Alterations in the Transcriptional Programs of Myeloma Cells and the Microenvironment during Extramedullary Progression Affect Proliferation and Immune Evasion
2020-02-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-0694
PMID:31558476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了骨髓和胸膜积液或腹水中多发性骨髓瘤细胞及其微环境的转录组变化，揭示了其在髓外进展中的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤细胞在髓外进展中的转录组变化及其对细胞增殖和免疫逃逸的影响 | 研究样本仅来自15名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨多发性骨髓瘤髓外进展的分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15名患者的骨髓或髓外多发性骨髓瘤样本 |
| 25642 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals chemokine self-feeding of myeloma cells promotes extramedullary metastasis
2020-02, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.13623
PMID:31561267
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研究论文 | 本研究旨在探讨多发性骨髓瘤细胞从骨髓转移到外周血的初始机制 | 发现克隆循环浆细胞中异常上调的趋化因子CXCL12可能使这些细胞逃避骨髓保留并转移到血液中 | NA | 确定多发性骨髓瘤细胞从骨髓转移到外周血的机制 | 多发性骨髓瘤细胞和外周血中的克隆循环浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 25643 | 2024-08-09 |
Latent cellular analysis robustly reveals subtle diversity in large-scale single-cell RNA-seq data
2019-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz826
PMID:31566233
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的分析流程——潜在细胞分析（LCA），用于处理大规模单细胞RNA测序数据 | LCA结合了余弦相似度测量和基于图的聚类算法，能够在不进行显性基因过滤的情况下，提供对群体数量推断、降维、特征选择和技术变异控制的启发式解决方案 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，如低信噪比、数据稀疏性、批次效应和可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 数十万细胞 |
| 25644 | 2024-08-09 |
Diesel exhaust particles dysregulate multiple immunological pathways in murine macrophages: Lessons from microarray and scRNA-seq technologies
2019-12-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2019.108116
PMID:31568751
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研究论文 | 研究柴油废气颗粒（DEP）对小鼠巨噬细胞免疫途径的失调作用，使用微阵列和单细胞RNA测序技术进行分析 | 首次综合使用微阵列和单细胞RNA测序技术，分别在体外和体内研究DEP对巨噬细胞基因表达的影响 | 研究主要集中在巨噬细胞上，未涉及其他细胞类型对DEP的反应 | 探讨柴油废气颗粒如何通过影响巨噬细胞的基因表达，进而影响心血管疾病的发展 | 小鼠的腹膜和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用C57BL/6J小鼠的腹膜巨噬细胞，体内实验使用C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 |
| 25645 | 2024-08-09 |
Mass cytometry-based single-cell analysis of human stem cell reprogramming uncovers differential regulation of specific pluripotency markers
2019-12-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009061
PMID:31570522
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术分析了人类干细胞重编程过程中多能性标志物和细胞周期标志物的表达 | 首次使用质谱流式细胞术研究人类重编程和多能性，揭示了hiPSC重编程过程中的几个中间细胞簇和标志物表达模式 | NA | 研究人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的重编程过程 | 人类干细胞重编程过程中的多能性标志物和细胞周期标志物 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 25646 | 2024-08-09 |
Centrifugal-Driven Droplet Generation Method with Minimal Waste for Single-Cell Whole Genome Amplification
2019-11-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b02786
PMID:31571488
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研究论文 | 本文介绍了一种离心驱动的液滴生成方法，用于快速、方便地从较小体积样本中生成均匀液滴，以实现单细胞全基因组扩增。 | 该方法通过减少扩增偏差和增加基因组覆盖率，解决了传统多重置换扩增（MDA）方法的非均匀扩增问题，并实现了超过98%的样本利用率。 | NA | 开发一种新的液滴生成方法，以提高单细胞全基因组扩增的质量和效率。 | 单细胞全基因组扩增技术。 | 生物医学 | NA | 多重置换扩增（MDA） | NA | 基因组数据 | 5 μL样本 |
| 25647 | 2024-08-09 |
Early adaptive immune activation detected in monozygotic twins with prodromal multiple sclerosis
2019-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI128475
PMID:31566584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了多发性硬化症（MS）不一致同卵双胞胎脑脊液细胞的基因表达模式，揭示了早期适应性免疫激活的证据 | 首次在MS和亚临床神经炎症（SCNI）受试者的脑脊液细胞中检测到克隆扩增的CD8+ T细胞、浆母细胞和CD4+ T细胞，并发现这些细胞具有组织驻留记忆T（TRM）细胞的特征 | 样本量较小，仅包括六对同卵双胞胎，可能影响结果的普遍性 | 探究多发性硬化症的早期适应性免疫激活机制 | 多发性硬化症不一致同卵双胞胎的脑脊液细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2752个脑脊液细胞 |
| 25648 | 2024-08-09 |
Diversification and CXCR4-Dependent Establishment of the Bone Marrow B-1a Cell Pool Governs Atheroprotective IgM Production Linked to Human Coronary Atherosclerosis
2019-10-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315786
PMID:31549940
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研究论文 | 本文研究了骨髓B-1a细胞池的多样化和CXCR4依赖性建立，以及其与人类冠状动脉粥样硬化相关的抗动脉粥样硬化IgM产生的关系。 | 首次报道了骨髓B-1a细胞的独特IgM抗体谱，并确定了CXCR4表达是调控骨髓B-1a细胞定位和氧化特定表位IgM产生的关键因素。 | NA | 研究骨髓B-1a细胞的IgM抗体谱，并确定CXCR4是否调控B-1细胞产生抗动脉粥样硬化IgM。 | 骨髓B-1a细胞、CXCR4、IgM抗体 | 心血管疾病 | 冠状动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 50名人类受试者 |
| 25649 | 2024-08-09 |
Novel dynamics of human mucociliary differentiation revealed by single-cell RNA sequencing of nasal epithelial cultures
2019-10-23, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.177428
PMID:31558434
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了人类鼻上皮细胞培养物中黏膜纤毛分化的动态过程 | 发现了多纤毛细胞的前体亚群——deuterosomal细胞，并鉴定了其特异性标记物；揭示了杯状细胞可以是多纤毛细胞的前体，解释了混合细胞的存在；识别了参与再生过程的一系列分子 | NA | 阐明黏膜纤毛上皮分化的关键驱动因素，以理解正常或病理性再生的发生机制 | 人类鼻上皮细胞的黏膜纤毛分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类、猪和鼠的呼吸道样本 |
| 25650 | 2024-08-09 |
Activation of Skeletal Stem and Progenitor Cells for Bone Regeneration Is Driven by PDGFRβ Signaling
2019-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.08.013
PMID:31543445
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，结合谱系追踪和条件性小鼠突变，揭示了PDGF-PDGFRβ信号在骨修复过程中对骨骼干细胞和祖细胞（SSPCs）扩展、迁移和血管生成的重要作用。 | 本研究首次确定了PDGF-PDGFRβ信号在骨修复中对SSPCs的激活和招募的关键作用，并揭示了MMP-9和VCAM-1在其下游的机制。 | NA | 探索骨修复过程中骨骼干细胞和祖细胞的激活和招募机制。 | 骨骼干细胞和祖细胞（SSPCs）及其在骨修复中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组分析，谱系映射，细胞追踪，条件性小鼠突变 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25651 | 2024-08-09 |
Human Germline Cell Development: from the Perspective of Single-Cell Sequencing
2019-10-17, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.08.025
PMID:31563431
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术分析人类生殖细胞发育的进展 | 利用单细胞转录组和表观基因组测序技术，全面剖析人类生殖细胞发育的组学动态 | NA | 探讨人类生殖细胞发育的分析进展 | 包括植入前和植入胚胎、胎儿生殖细胞（FGCs）以及成年精子发生 | NA | NA | 单细胞转录组和表观基因组测序技术 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 25652 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of hESC-Derived 3D Retinal Organoids Reveals Novel Genes Regulating RPC Commitment in Early Human Retinogenesis
2019-10-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.08.012
PMID:31543471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从人胚胎干细胞衍生的3D视网膜类器官中分离的细胞，揭示了早期人类视网膜发生中视网膜祖细胞（RPC）的时序进展 | 发现了两种具有独特分子特征的RPC亚型，并识别了与Notch和Wnt信号通路以及染色质重塑相关的动态调控基因，特别是CCND1在促进早期视网膜神经发生中的作用 | NA | 揭示早期人类视网膜发生中的关键通路和新基因 | 人胚胎干细胞衍生的3D视网膜类器官中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人胚胎干细胞衍生的3D视网膜类器官中分离的细胞 |
| 25653 | 2024-08-09 |
Transcriptional control of lung alveolar type 1 cell development and maintenance by NK homeobox 2-1
2019-10-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1906663116
PMID:31548395
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研究论文 | 本文通过细胞特异性敲除小鼠模型、基因组分析和3D成像技术，研究了NK homeobox 2-1（NKX2-1）在肺泡I型细胞（AT1细胞）发育和维持中的作用 | 首次揭示了NKX2-1在AT1细胞转录调控网络中的关键作用，并展示了AT1细胞在特定条件下向胃肠道细胞命运转变的惊人可塑性 | NA | 探究NKX2-1在肺泡I型细胞发育和维持中的转录调控作用 | 肺泡I型细胞（AT1细胞） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、3D成像 | NA | 基因组数据 | 细胞特异性敲除小鼠模型 |
| 25654 | 2024-08-09 |
Aldh1b1 expression defines progenitor cells in the adult pancreas and is required for Kras-induced pancreatic cancer
2019-10-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1901075116
PMID:31548432
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研究论文 | 本文研究了成年胰腺中Aldh1b1表达的前体细胞，并探讨了其在Kras诱导的胰腺癌中的作用 | 首次证明了Aldh1b1表达的中心腺泡细胞在成年胰腺中的前体细胞特性，并揭示了其在Kras诱导的胰腺癌中的关键作用 | NA | 探讨成年胰腺中前体细胞的存在及其在癌症发展中的潜在作用 | 成年胰腺中的前体细胞及其在胰腺癌中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25655 | 2024-08-09 |
Revisiting Vascular Remodeling in the Single-Cell Transcriptome Era
2019-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.119.313174
PMID:31553668
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25656 | 2024-08-09 |
Urothelial organoids originating from Cd49fhigh mouse stem cells display Notch-dependent differentiation capacity
2019-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12307-1
PMID:31562298
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研究论文 | 本文建立了可长期维持的鼠源尿路上皮类器官，并研究了其分化能力 | 首次建立了可无限期维持的鼠源尿路上皮类器官，并揭示了Notch信号通路在其分化中的作用 | NA | 研究尿路上皮干细胞生物学及其分化机制 | 鼠源尿路上皮干细胞及其类器官 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 五个具有不同基因表达谱的细胞群 |
| 25657 | 2024-08-09 |
An Efficient and Flexible Method for Deconvoluting Bulk RNA-Seq Data with Single-Cell RNA-Seq Data
2019-09-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells8101161
PMID:31569701
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research paper | 本文开发了一种名为多组学矩阵分解（MOMF）的计算统计方法，用于利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算批量RNA测序（RNA-seq）数据的细胞类型组成 | MOMF方法不仅直接建模基因表达数据的计数性质，还有效考虑了细胞类型特异性平均基因表达水平的不确定性 | NA | 估算复杂疾病的细胞类型组成，以研究疾病的细胞异质性，并可能促进早期疾病诊断和预防 | 胶质母细胞瘤（GBM）、结直肠癌（CRC）和2型糖尿病（T2D）的细胞类型组成 | digital pathology | NA | RNA-seq, scRNA-seq | MOMF | 基因表达数据 | 涉及胶质母细胞瘤、结直肠癌和2型糖尿病的研究数据 |
| 25658 | 2024-08-09 |
Ageing affects DNA methylation drift and transcriptional cell-to-cell variability in mouse muscle stem cells
2019-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12293-4
PMID:31554804
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研究论文 | 研究探讨了衰老对小鼠肌肉干细胞DNA甲基化漂移和转录细胞间变异性的影响 | 首次结合单细胞转录组和DNA甲基组分析，揭示了衰老过程中干细胞分子多样性的变化 | NA | 探究衰老过程中干细胞的分子多样性变化及其机制 | 小鼠肌肉干细胞的DNA甲基化和转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学 | NA | 转录组和DNA甲基组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 25659 | 2024-08-09 |
Cytogenetics and Cytogenomics Evaluation in Cancer
2019-Sep-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms20194711
PMID:31547595
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研究论文 | 本文探讨了细胞遗传学和细胞基因组学技术在癌症检测、分子特征识别以及癌症起始和发展理解中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在癌症基因组学中的新应用，如肿瘤内异质性检测、克隆进化图谱绘制等 | 尽管技术进步，但许多候选生物标志物尚未在临床中得到明确的患者益处 | 旨在通过高吞吐量技术进步和多学科努力，提高对人类癌症染色体重排和基因组改变的理解 | 癌症的细胞遗传学和细胞基因组学技术 | 数字病理学 | NA | 下一代测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 25660 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Spatial and Temporal Turnover of Keratinocyte Differentiation Regulators
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00775
PMID:31552090
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，分析了22,338个人类包皮角质形成细胞的转录调控，揭示了角质形成细胞分化调控因子的空间和时间变化 | 识别了在角质形成细胞分化过程中协同表达变化的转录因子组，并展示了这些转录因子在超级增强子中的预测结合富集与分化状态的转变一致 | NA | 研究角质形成细胞分化过程中的动态基因调控 | 人类包皮角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22,338个人类包皮角质形成细胞 |