单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
25641 2024-08-09
Recovery of viable endocrine-specific cells and transcriptomes from human pancreatic islet-engrafted mice
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文开发了一种从人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠中恢复活细胞的方法,并进行了功能和激素特异性转录组分析 首次实现了从移植后的小鼠中恢复活细胞,并进行了单细胞RNA测序和体外葡萄糖刺激胰岛素分泌实验 恢复的胰岛细胞产量相对较低 研究人胰腺胰岛移植后的细胞特性和功能 人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠后的活细胞和转录组 NA 糖尿病 RNA测序 单细胞RNA测序 细胞 NA
25642 2024-08-09
Lineage specification and pluripotency revealed by transcriptome analysis from oocyte to blastocyst in pig
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了从卵母细胞到猪早期囊胚的转录组,揭示了细胞谱系特化和多能性的分子特征 首次展示了猪早期胚胎中原始多能性特征的存在,并描述了X染色体剂量补偿的动态变化 NA 探讨猪早期胚胎发育中的细胞谱系特化和多能性 猪从卵母细胞到早期囊胚的早期胚胎 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从卵母细胞到早期囊胚的多个猪早期胚胎样本
25643 2024-08-09
Tracheal brush cells release acetylcholine in response to bitter tastants for paracrine and autocrine signaling
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文研究了气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制,及其在旁分泌和自分泌信号传导中的作用 首次直接证明了气管刷状细胞在苦味物质刺激下释放乙酰胆碱,并揭示了这一过程在自分泌和旁分泌信号传导中的调节机制 NA 探讨气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制及其在免疫反应中的作用 气管刷状细胞、苦味受体激动剂、乙酰胆碱释放 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 小鼠气管刷状细胞
25644 2024-08-09
Differential excitatory vs inhibitory SCN expression at single cell level regulates brain sodium channel function in neurodevelopmental disorders
2020-Jan, European journal of paediatric neurology : EJPN : official journal of the European Paediatric Neurology Society IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了人类和小鼠中电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式,揭示了这些通道在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达,及其在神经发育障碍中的潜在作用 本研究首次在单细胞水平上揭示了SCN1/2/3/8A在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达,与之前的低分辨率RNA筛选结果形成对比 NA 探讨电压门控钠通道在神经发育障碍中的作用机制 电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式 神经科学 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 人类和小鼠的样本
25645 2024-08-09
Simultaneous Measurement of Surface Proteins and Gene Expression from Single Cells
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种名为CITE-seq的新方法,该方法能够同时从单个细胞中测量表面蛋白和基因表达 CITE-seq方法结合了单细胞测序技术和寡核苷酸标记的抗体,实现了对细胞表面蛋白和基因表达的同步测量 NA 开发一种能够同时测量单细胞表面蛋白和基因表达的新技术 单细胞的表面蛋白和基因表达 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 单个细胞
25646 2024-08-09
Analysis of Transcriptional Profiling of Immune Cells at the Single-Cell Level
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了如何将10× genomics 5'V(D)J免疫细胞分析流程生成的单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 单细胞测序技术揭示了免疫细胞先前未知的多样性和特异性 NA 研究如何将单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 免疫细胞的转录组 生物信息学 NA RNA测序 NA RNA测序数据 NA
25647 2024-08-09
Decoding the development of the human hippocampus
2020-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq分析技术,揭示了人类海马体发育过程中的细胞类型、细胞谱系、分子特征和转录调控 首次通过多组学数据揭示了人类海马体发育的转录调控网络,并比较了人类和鼠类海马体的基因表达差异 NA 理解人类海马体的发育过程及其相关疾病 人类海马体在妊娠16-27周的发育过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,ATAC-seq NA 基因表达数据 30,416个细胞
25648 2024-08-09
B cells and tertiary lymphoid structures promote immunotherapy response
2020-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文通过RNA测序和计算方法研究了B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断(ICB)治疗反应中的作用 首次详细探讨了B细胞在ICB治疗反应中的作用,并发现B细胞标志物在响应者肿瘤中差异表达 研究主要基于RNA测序和计算方法,可能需要进一步的实验验证 探讨B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断治疗反应中的作用 B细胞和三级淋巴结构在ICB治疗中的功能和潜在作用 肿瘤学 黑色素瘤,肾细胞癌 RNA测序,MCP-counter计算方法,质谱流式细胞术 NA RNA 多个ICB治疗的患者群体,包括黑色素瘤和肾细胞癌患者
25649 2024-08-09
Species-Specific miRNAs in Human Brain Development and Disease
2019, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
综述 本文综述了物种特异性miRNA在人类大脑发育和疾病中的调控作用及其对人类大脑特征演变和神经系统疾病的贡献 探讨了miRNA表达的分化在塑造物种间基因表达差异中的重要作用,并介绍了单细胞测序方法在解析发育过渡期miRNA-mRNA相互作用中的应用 NA 阐明物种特异性miRNA调控机制,为神经疾病开发新型、全面和有效的治疗方法 人类大脑发育和神经系统疾病 NA 神经精神疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
25650 2024-08-09
Revealing Dynamic Mechanisms of Cell Fate Decisions From Single-Cell Transcriptomic Data
2019, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 开发了一种名为Topographer的新方法,用于从单细胞转录组数据构建定量的Waddington景观,揭示细胞命运决策的动态机制 Topographer方法能够识别复杂的细胞状态转换轨迹,并估计由命运和转换概率表征的复杂细胞类型动态 NA 揭示细胞命运决策的动态机制 单细胞转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及人类初级肌细胞的单细胞RNA-seq数据
25651 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing of the Cardiovascular System: New Looks for Old Diseases
2019, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在心血管系统研究中的应用,探讨了其在揭示细胞亚群和转录变异方面的潜力 scRNA-seq技术揭示了新的细胞亚群和转录变异,为心血管疾病的基础科学研究提供了新的见解 NA 探讨scRNA-seq在心血管系统研究中的应用及其对理解心血管系统和病理的潜在价值 心血管系统中的细胞亚群和转录变异 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA表达数据 NA
25652 2024-08-09
A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear cells in end-stage renal disease
2021-03-29, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,生成了来自健康志愿者和终末期肾病患者的单核细胞转录组图谱,并进行了无监督聚类和注释分析。 本研究首次生成了终末期肾病患者外周血单核细胞的高分辨率转录组图谱,并揭示了细胞类型特异性的终末期肾病相关通路和转录因子。 由于使用的是混合样本分析,结果的普遍性受到限制。 旨在深入了解终末期肾病中免疫异常的机制。 终末期肾病患者和健康志愿者的外周血单核细胞。 数字病理学 终末期肾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 10名健康志愿者和10名终末期肾病患者的外周血单核细胞,共生成12,981和9,578个单细胞转录组。
25653 2024-08-09
Allergen-specific IgG+ memory B cells are temporally linked to IgE memory responses
2020-07, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源 首次证明了在黏膜过敏原暴露下,人类IgE记忆存在于过敏原特异性的IgG+记忆B细胞中,这些细胞能迅速转换同种型,扩展为短寿命的IgE+浆母细胞,并作为治疗干预的潜在目标 NA 研究黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源 季节性过敏性鼻炎成年患者的PBMCs和鼻活检样本 免疫学 过敏性鼻炎 重链可变基因序列分析,单细胞转录组学 NA RNA 40名季节性过敏性鼻炎成年患者
25654 2024-08-09
Single-cell RNA sequencing analysis reveals alginate oligosaccharides preventing chemotherapy-induced mucositis
2020-05, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了海藻酸寡糖(AOS)预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用 首次在单细胞水平上研究了AOS对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用,并通过深度分析揭示了AOS通过调节转录因子表达来改善肠道功能 NA 研究AOS在单细胞水平上预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用 海藻酸寡糖(AOS)对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用 数字病理学 血液肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
25655 2024-08-09
Identification of key genes and pathways in abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis
2020-Apr, The Journal of international medical research IF:1.4Q4
研究论文 通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,识别与腹主动脉瘤相关的关键基因和通路 发现了四个新的与腹主动脉瘤相关的主要基因,这些基因在已知的动脉瘤基因数据库中未被记录 NA 识别与腹主动脉瘤发病机制和进展相关的关键基因,并探索其作为治疗靶点的潜力 腹主动脉瘤的关键基因和生物通路 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 507个上调基因和842个下调基因
25656 2024-08-09
Bulk and single cell transcriptomic data indicate that a dichotomy between inflammatory pathways in peripheral blood and arthritic joints complicates biomarker discovery
2020-03, Cytokine IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过整合分析基因表达微阵列数据和单细胞RNA测序数据,探讨了类风湿性关节炎(RA)中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异,以及这种差异对生物标志物发现的影响。 本研究首次通过大规模和单细胞转录组数据分析,揭示了周围血液和关节炎关节中炎症通路的差异,为生物标志物的发现提供了新的视角。 研究主要基于RA患者和健康对照的数据,未涵盖其他类型的关节炎,可能限制了结果的普遍性。 探讨类风湿性关节炎中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异,以及这种差异对生物标志物发现的影响。 类风湿性关节炎患者的滑膜、全血细胞、外周血单个核细胞和CD4+ T细胞,以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。 数字病理学 类风湿性关节炎 基因表达微阵列分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括RA患者和健康对照的多个样本类型,以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。
25657 2024-08-09
Single-cell sequencing in hematology
2020-03, Current opinion in oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了通过新型单细胞方法在造血作用和血液系统恶性肿瘤方面取得的最新关键见解,特别关注通过单细胞分辨率研究髓系恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞所获得的生物学见解。 近年来,单细胞水平的RNA、DNA和蛋白质表达分析新技术大量涌现,提供了前所未有的细胞异质性洞察。 传统的批量遗传分析可能会掩盖肿瘤内异质性的关键方面,这些异质性是治疗抵抗和克隆进化的关键疾病事件的基础。 探讨单细胞技术在血液系统癌症患者管理中的当前和潜在未来应用。 造血作用和血液系统恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞。 NA 血液系统恶性肿瘤 单细胞测序 NA RNA, DNA, 蛋白质表达 NA
25658 2024-08-09
Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls
2020-03, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为MosaicForecast的机器学习方法,用于在无匹配对照的测序数据中准确检测嵌合变异 MosaicForecast利用基于读取的相位和读取级别特征,与现有算法相比,显著提高了检测嵌合单核苷酸变异和插入缺失的特异性 NA 开发一种新的方法来检测嵌合体突变,并探讨其在疾病起源和发展中的作用 人类大脑全基因组测序数据中的嵌合单核苷酸变异和插入缺失 机器学习 NA 单细胞测序和靶向测序 机器学习方法 测序数据 人类大脑全基因组测序数据
25659 2024-08-09
Inhibition of lysine-specific histone demethylase 1A results in meiotic aberration during oocyte maturation in vitro in goats
2020-Feb, Theriogenology IF:2.4Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序技术探讨山羊卵母细胞体外成熟过程中组蛋白去甲基化酶LSD1的作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了山羊卵母细胞成熟过程中LSD1的功能及其对卵母细胞成熟的影响 研究主要集中在体外实验,未来需要进一步的体内实验验证 探讨组蛋白甲基化在山羊卵母细胞成熟中的作用机制 山羊的卵母细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 4516个差异表达基因
25660 2024-08-09
Critical Role of Cytosolic DNA and Its Sensing Adaptor STING in Aortic Degeneration, Dissection, and Rupture
2020-01-07, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本文研究了细胞质DNA及其感应适配器STING在主动脉退化、撕裂和破裂中的关键作用 首次揭示了细胞质DNA和STING信号通路在主动脉退化和散发型主动脉夹层形成中的关键机制 NA 识别驱动主动脉退化的机制,以开发有效的药物治疗预防疾病进展 主动脉平滑肌细胞和巨噬细胞中的细胞质DNA及STING通路的激活 NA 心血管疾病 单细胞转录组分析 NA 组织样本 来自散发型升主动脉夹层患者的主动脉组织样本及Stinggt/gt小鼠模型
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