单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 25641 - 25660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25641 | 2024-08-09 |
Corrigendum: The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00339
PMID:32211338
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25642 | 2024-08-09 |
An Effective Biclustering-Based Framework for Identifying Cell Subpopulations From scRNA-seq Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.2979717
PMID:32167906
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研究论文 | 本文提出了一种基于双聚类的框架DivBiclust，用于从高维噪声的单细胞RNA测序数据中有效识别细胞亚群 | DivBiclust框架在识别细胞亚群方面比九种最先进的方法具有更高的准确性 | NA | 研究如何从单细胞RNA测序数据中识别具有不同功能的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类 | 转录组数据 | 十组不同大小和不同丢失率的实际单细胞RNA测序数据 |
| 25643 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing study of retinal immune regulators identified CD47 and CD59a expression in photoreceptors-Implications in subretinal immune regulation
2020-07, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.24618
PMID:32166783
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集，发现视网膜神经元表达多种免疫调节分子，特别是光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的潜在作用。 | 首次揭示了光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据集和细胞培养实验，缺乏直接的体内功能验证。 | 探讨视网膜神经元中免疫调节分子的表达及其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 视网膜神经元中的免疫调节分子CD47和CD59a的表达及其功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括661W细胞、WERI-Rb1细胞、人眼微切割的光感受器以及实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎（EAU）小鼠的视网膜。 |
| 25644 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing in Hematological Diseases
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900228
PMID:32181578
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了对肿瘤和微环境细胞间变异的深入见解，并允许高分辨率地解析疾病的发病机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 血液系统疾病，包括白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 25645 | 2024-08-09 |
Exploring high-dimensional biological data with sparse contrastive principal component analysis
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa176
PMID:32176249
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研究论文 | 本文提出了一种新的主成分分析（PCA）变体——稀疏对比PCA，用于从高维生物数据中提取稀疏、稳定、可解释且相关的生物信号 | 稀疏对比PCA方法结合了控制数据的使用，以去除不想要的变异，同时满足恢复稳定和相关特征的双重目标 | NA | 解决从受技术噪声干扰的高通量测序数据中恢复可解释生物信号的问题 | 高维生物数据，包括蛋白质表达、微阵列基因表达和单细胞转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | PCA | 稀疏对比PCA | 高维数据 | 涉及多个公开可用的数据集 |
| 25646 | 2024-08-09 |
The liver as an immunological barrier redefined by single-cell analysis
2020-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13193
PMID:32176810
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术重新定义了肝脏作为免疫屏障的作用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对肝脏中的免疫细胞进行了深入的表型分析，从而重新定义了肝脏的免疫屏障功能 | 需要多模态单细胞深度表型分析方法来研究难以获取的稀有细胞群体 | 探讨单细胞技术如何推进或重新定义我们对肝脏免疫屏障的理解 | 肝脏中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的健康及疾病状态下的肝脏样本 |
| 25647 | 2024-08-09 |
Mass Cytometry and Single-Cell RNA-seq Profiling of the Heterogeneity in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Interacting with Silver Nanoparticles
2020-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.201907674
PMID:32163679
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了银纳米颗粒与人类外周血单个核细胞的异质性相互作用 | 本文首次结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，深入研究了纳米颗粒与免疫细胞的异质性相互作用 | NA | 探究纳米颗粒与人类免疫细胞的相互作用，为纳米材料的毒性评估提供深入知识 | 银纳米颗粒与人类外周血单个核细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种细胞类型，包括单核细胞和B细胞 |
| 25648 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq data analysis on the receptor ACE2 expression reveals the potential risk of different human organs vulnerable to 2019-nCoV infection
2020-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-020-0754-0
PMID:32170560
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了不同人体器官对2019-nCoV感染的潜在风险 | 首次通过scRNA-seq数据分析，构建了不同人体器官对2019-nCoV感染的风险图 | NA | 研究2019-nCoV感染的病理机制和传播途径 | 人体主要生理系统的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 主要人体生理系统的单细胞RNA测序数据 |
| 25649 | 2024-08-09 |
Significant Evolutionary Constraints on Neuron Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-04-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa054
PMID:32176293
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研究论文 | 本文通过分析超过280,000个单细胞的RNA测序数据和大量脑组织的发育转录组，揭示了神经元细胞在进化上的显著限制 | 发现不同器官的细胞类型在进化限制上显著重叠，且成熟神经元比神经干细胞及新生神经元受到更多限制 | NA | 探讨脑细胞类型间的进化差异及其对神经疾病发病机制和药物开发的影响 | 神经元细胞及其在不同脑区的进化限制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过280,000个细胞 |
| 25650 | 2024-08-09 |
ISX-9 manipulates endocrine progenitor fate revealing conserved intestinal lineages in mouse and human organoids
2020-04, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.01.012
PMID:32180555
|
研究论文 | 研究使用小分子ISX-9探索肠内分泌细胞（EECs）的分化过程 | 首次使用ISX-9作为工具，探索EECs的分化，并揭示了人类和老鼠肠道器官中保守的内分泌谱系 | NA | 探索ISX-9对肠内分泌细胞分化的影响 | 肠内分泌细胞的分化过程 | NA | NA | 实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR），荧光激活细胞分选，免疫染色和单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 25651 | 2024-08-09 |
Tumor Copy Number Deconvolution Integrating Bulk and Single-Cell Sequencing Data
2020-04, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2019.0302
PMID:32181683
|
研究论文 | 本文开发了一种结合大量和单细胞测序数据进行肿瘤拷贝数反卷积的策略 | 提出了一个混合成员模型，通过非负矩阵分解进行克隆反卷积，并结合高效的坐标下降算法，以及通过混合整数线性规划模型整合反卷积与克隆系统发育推断 | 单细胞测序技术存在高噪声、难以扩展到大群体、技术伪影和大数据集等限制 | 旨在通过结合大量和单细胞测序数据，提高肿瘤内异质性分析的准确性 | 肿瘤内异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 大量DNA测序 | 混合成员模型, 非负矩阵分解, 混合整数线性规划模型 | 基因组拷贝数数据 | 使用半模拟数据进行验证 |
| 25652 | 2024-08-09 |
Finding cell-specific expression patterns in the early Ciona embryo with single-cell RNA-seq
2020-03-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-61591-1
PMID:32188910
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了海鞘胚胎16细胞阶段的细胞特异性基因表达模式 | 成功发现了新的细胞特异性表达模式，并通过原位杂交和单细胞qPCR进行了验证 | NA | 探索和表征控制发育过程的基因及其表达模式 | 海鞘胚胎的细胞特异性基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16细胞阶段的海鞘胚胎 |
| 25653 | 2024-08-09 |
Loss of the branched-chain amino acid transporter CD98hc alters the development of colonic macrophages in mice
2020-03-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0842-3
PMID:32188932
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研究论文 | 本研究通过构建CD98hc分支链氨基酸转运蛋白在CX3CR1巨噬细胞中的可诱导敲除小鼠模型，探讨了分支链氨基酸在肠道巨噬细胞发育中的作用 | 首次揭示了CD98hc缺失对结肠巨噬细胞发育的影响，并通过单细胞RNA测序分析了其对巨噬细胞发育途径的改变 | NA | 探究分支链氨基酸转运蛋白CD98hc在结肠巨噬细胞发育中的功能 | 结肠巨噬细胞的发育 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25654 | 2024-08-09 |
Defining Epidermal Basal Cell States during Skin Homeostasis and Wound Healing Using Single-Cell Transcriptomics
2020-03-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.091
PMID:32187560
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合RNAScope和荧光寿命成像技术，揭示了表皮基底细胞在皮肤稳态和伤口愈合过程中的转录异质性 | 首次全面解析了基底细胞在分化过程中的动态变化，并提出了一个修订的“层次-谱系”稳态模型 | NA | 研究表皮基底细胞在皮肤稳态和伤口愈合中的转录异质性 | 表皮基底细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25655 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Practical Methods for Liver Cell Biology: A Short Overview
2020-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062027
PMID:32188134
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综述 | 本文详细介绍了在第8届欧洲肝脏细胞生物学俱乐部会议（ECLCB-8）上提出的用于研究肝脏细胞生物学的新型体外和体内方法 | 利用先进技术改进细胞分离技术，实现高纯度细胞分离，并推动2D和3D显微镜及高通量检测方法（如批量或单细胞RNA测序）的发展 | NA | 旨在详细描述用于研究肝脏细胞生物学的新方法 | 肝脏病理学、干细胞和类器官研究、肝脏疾病的体内评估 | NA | 肝脏疾病 | RNA测序 | NA | NA | NA |
| 25656 | 2024-08-09 |
Comparative Molecular Analysis of Cancer Behavior Cultured In Vitro, In Vivo, and Ex Vivo
2020-Mar-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030690
PMID:32183351
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研究论文 | 本研究通过比较4T1小鼠乳腺癌细胞在2D和3D培养、皮下或原位同种移植（来自免疫健全或免疫缺陷小鼠）以及体外肿瘤体中的转录组谱，揭示了分子特征的差异 | 本研究首次综合比较了癌细胞在不同培养条件下的分子特征，特别是细胞周期进展、细胞信号传导和细胞外基质重塑相关基因的表达差异 | 研究主要集中在小鼠乳腺癌细胞，可能不完全适用于其他类型的癌细胞或人体细胞 | 旨在通过比较不同培养条件下的癌细胞行为，提高体外培养系统的模拟能力 | 4T1小鼠乳腺癌细胞在不同培养条件下的转录组谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及多种培养条件和不同免疫状态的小鼠样本 |
| 25657 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis
2020-03-12, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c190037
PMID:32163201
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研究论文 | 本文介绍了单细胞转录组测序的商业平台、数据分析流程、数据库以及在生物医学研究中的应用 | 单细胞测序技术的最新进展为生物医学研究提供了深入了解多种生物过程的见解 | NA | 介绍和描述单细胞RNA测序的商业平台及其在生物医学研究中的应用 | 单细胞测序技术及其在生物学和医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25658 | 2024-08-09 |
Cell Lysis Based on an Oscillating Microbubble Array
2020-Mar-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi11030288
PMID:32164279
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研究论文 | 本研究开发了一种基于振荡微泡阵列的细胞裂解方法 | 利用振荡微泡产生的剪切应力实现多次细胞裂解，提高了裂解效率 | NA | 开发一种高效、快速的细胞裂解设备，用于细胞生物学研究、疾病诊断和干细胞治疗 | 细胞裂解及其释放的DNA、RNA和蛋白质等细胞内物质 | 生物技术 | NA | DNA琼脂糖凝胶电泳 | NA | DNA | NA |
| 25659 | 2024-08-09 |
Molecular Heterogeneity and Cellular Diversity: Implications for Precision Treatment in Medulloblastoma
2020-Mar-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030643
PMID:32164294
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤在分子和细胞层面的异质性，包括四个主要亚组（WNT、SHH、Group 3 和 Group 4）的组织学特征、遗传和表观遗传改变、蛋白质组学景观、起源细胞、肿瘤微环境和治疗策略 | 利用癌症基因组学、单细胞测序和复杂肿瘤模型，革命性地描述和分层了髓母细胞瘤 | NA | 探讨髓母细胞瘤的异质性及其对精准治疗的影响 | 髓母细胞瘤的分子和细胞异质性 | 数字病理学 | 儿童恶性脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 分子和细胞数据 | NA |
| 25660 | 2024-08-09 |
Expression and Localization of Kcne2 in the Vertebrate Retina
2020-03-09, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.61.3.33
PMID:32191288
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研究论文 | 研究Kcne2在脊椎动物视网膜中的表达和定位 | 首次详细描述了Kcne2在不同物种视网膜中的保守定位模式，跨越至少3亿年的脊椎动物进化 | NA | 研究Kcne2在视网膜中的表达和定位，探讨其在细胞兴奋性调节中的重要作用 | Kcne2在视网膜中的表达和定位 | NA | NA | 单细胞转录组分析，免疫组化技术 | NA | 转录组数据，免疫组化图像 | 数万个小鼠视网膜细胞，多种脊椎动物（斑马鱼、牛鸟、绵羊、小鼠、猕猴）的视网膜样本 |