单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
25621 2024-08-09
Global immune characterization of HBV/HCV-related hepatocellular carcinoma identifies macrophage and T-cell subsets associated with disease progression
2020-Dec-08, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV/HCV相关肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中的免疫细胞异质性及其动态变化 首次在单细胞水平上揭示了HBV/HCV相关HCC中免疫细胞的复杂网络,并识别出与疾病进展相关的特定巨噬细胞和T细胞亚群 NA 探究HBV/HCV相关肝细胞癌中免疫细胞的异质性及其与疾病进展的关系 HBV/HCV相关肝细胞癌中的免疫细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 41,698个免疫细胞来自七对HBV/HCV相关HCC肿瘤和非肿瘤肝组织
25622 2024-08-09
Characterization and generation of human definitive multipotent hematopoietic stem/progenitor cells
2020-Dec-01, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,解析了人类早期造血阶段的多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)的特征,并从人类胚胎干细胞(hESCs)中生成了这些细胞 首次详细描述了人类早期造血过程中的分子特征,并发现了CD44在区分早期原始和确定性造血中的特异性作用 NA 深入理解人类早期造血过程,并为临床目的生成血液和免疫细胞提供基础 人类多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)及其在早期造血过程中的特征 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
25623 2024-08-09
Evolving insights: how DNA repair pathways impact cancer evolution
2020-11-15, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了DNA修复途径如何影响癌症进化的最新发现 利用单细胞测序等新技术深入理解癌症进化及其与DNA修复的关系 NA 探讨DNA修复对癌症进化的影响及其在临床治疗中的应用 癌症进化及其与DNA修复的关系 NA 癌症 单细胞测序 NA 基因组数据 NA
25624 2024-08-09
Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis
2020, American journal of translational research IF:1.7Q4
PMID:33312370
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱,并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 NA 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 骨关节炎中的软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 480个软骨细胞样本
25625 2024-08-09
Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2
2020, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制,并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 NA 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 胶质母细胞瘤 数字病理学 神经系统疾病 单细胞测序 NA 转录组数据 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本
25626 2024-08-09
Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors
2020, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达,发现这些组织中受体表达较低 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据,未进行新的实验验证 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 NA NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据
25627 2024-08-09
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了血管平滑肌细胞的可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用 引入了新技术如杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪以及具有空间分辨率的单细胞测序技术,以深化对这些细胞复杂生物学的理解 NA 旨在进一步阐明动脉粥样硬化疾病的发病机制,以发现新的治疗方法 血管平滑肌细胞及其在血管壁炎症中的作用 心血管疾病 动脉粥样硬化 杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪、单细胞测序技术 NA 细胞 NA
25628 2024-08-09
Coupled co-clustering-based unsupervised transfer learning for the integrative analysis of single-cell genomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于耦合协同聚类的无监督迁移学习算法(coupleCoC),用于多模态单细胞基因组数据的整合分析 coupleCoC算法基于信息理论的协同聚类框架,能够同时对细胞和基因组特征进行聚类,减少单细胞数据的噪声,并促进单细胞数据集之间的知识转移 NA 开发一种新的无监督迁移学习算法,用于整合分析多模态单细胞基因组数据 多模态单细胞基因组数据,包括单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)和单细胞甲基化数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、单细胞甲基化数据 协同聚类 基因组数据 涉及多种单细胞基因组数据集,包括scATAC-seq和scRNA-seq数据、单细胞甲基化和scRNA-seq数据以及来自小鼠和人类的scRNA-seq数据
25629 2024-08-09
FEATS: feature selection-based clustering of single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种基于特征选择的单细胞RNA测序数据聚类工具FEATS FEATS采用单变量特征选择方法进行聚类,通过选择最具有信息量的特征来提高聚类性能 NA 提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和效率 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA RNA-seq NA 基因表达数据 多种单细胞RNA测序数据集
25630 2024-08-09
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究探讨了系统性幼年特发性关节炎(SJIA)中循环单核细胞和骨髓巨噬细胞的转录表型,并揭示了TRIM8作为IFN-γ过度反应的中介和巨噬细胞激活综合征(MAS)的风险因素。 本研究首次识别了SJIA中单核细胞和骨髓巨噬细胞的转录表型,并发现TRIM8在IFN-γ信号传导中的重要作用,为理解SJIA中的MAS提供了新的分子机制和潜在治疗靶点。 研究仅使用了26名SJIA患者的单核细胞和1名患者的骨髓巨噬细胞进行分析,样本量较小,可能影响结果的普遍性。 识别SJIA中循环单核细胞和骨髓巨噬细胞的极化表型,并探索IFN-γ反应的分子特征。 系统性幼年特发性关节炎(SJIA)患者的单核细胞和骨髓巨噬细胞。 数字病理学 幼年特发性关节炎 RNA测序 NA RNA 26名SJIA患者的单核细胞和1名患者的骨髓巨噬细胞
25631 2024-08-09
Stem cell-intrinsic mechanisms regulating adult hair follicle homeostasis
2021-04, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本文聚焦于成体毛囊干细胞(HFSCs)内在机制在毛囊稳态中的调节作用 讨论了单细胞RNA测序和活体成像等技术进步,揭示了HFSC及其前体细胞的异质性,并增进了对HFSC与微环境间交流的理解 NA 探讨HFSC内在机制在成体皮肤稳态中的作用 成体毛囊干细胞及其在毛发生长和皮肤伤口愈合中的作用 NA NA 单细胞RNA测序,活体成像 NA RNA NA
25632 2024-08-09
Melatonin improves the effect of cryopreservation on human oocytes by suppressing oxidative stress and maintaining the permeability of the oolemma
2021-Mar, Journal of pineal research IF:8.3Q1
research paper 本研究探讨了褪黑素(MLT)通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来改善人类卵子冷冻保存效果的作用 首次报道了褪黑素在人类卵子冷冻保存中的应用,通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来提高卵子的发育能力 研究仅限于体外成熟的卵子,未涉及体内环境的影响 研究褪黑素对人类卵子冷冻保存效果的影响 体外成熟的卵子 NA NA 荧光染色、单细胞RNA测序、免疫荧光 NA 卵子 随机分为新鲜组、MLT处理冷冻保存组(MC组)和无MLT处理冷冻保存组(NC组),每组包含10 μM、100 μM、1 mM和10 mM的MLT处理子组
25633 2024-08-09
Similarities between bovine and human germline development revealed by single-cell RNA sequencing
2021-03, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序、定量实时PCR和免疫荧光分析,研究了牛和人类原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 揭示了牛和人类原始生殖细胞在基因表达和分化模式上的相似性 NA 评估牛原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 牛和人类的原始生殖细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 40至90天胎龄的牛胎儿生殖腺
25634 2024-08-09
Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2
2021-03, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了Slide-seqV2技术,该技术通过改进文库生成、珠子合成和阵列索引,实现了接近单细胞分辨率的高灵敏度空间转录组学分析 Slide-seqV2的RNA捕获效率提高了约50%,接近基于液滴的单细胞RNA-seq技术的检测效率 NA 旨在提高空间转录组学技术的灵敏度和分辨率,以更好地理解组织形成和功能 研究对象包括小鼠海马体中的神经元和新生小鼠大脑皮层的时空发育 空间转录组学 NA Slide-seqV2 NA 转录组数据 涉及小鼠海马体和新生小鼠大脑皮层的样本
25635 2024-08-09
Cyclophosphamide and Vinorelbine Activate Stem-Like CD8+ T Cells and Improve Anti-PD-1 Efficacy in Triple-Negative Breast Cancer
2021-02-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究通过使用三阴性乳腺癌模型,探讨了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗对肿瘤内免疫环境的影响 该研究首次展示了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗能够激活抗原呈递细胞,增加肿瘤内Tcf1干细胞样CD8 T细胞,并促进前体耗竭CD8 T细胞的增加 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其疗效 探讨环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗在三阴性乳腺癌中的免疫调节作用 三阴性乳腺癌模型中的免疫细胞和肿瘤生长 肿瘤学 乳腺癌 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 超过50,000个肿瘤内免疫细胞
25636 2024-08-09
Single-cell RNA-Seq revealed profound immune alteration in the peripheral blood of patients with bacterial infection
2021-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细菌感染患者外周血中免疫细胞的变化 开发了名为PBMCode的条形码分析框架,揭示了细菌感染下外周血中免疫细胞群和细胞状态的详细变化 需要在未来研究中进一步关注宿主对细菌感染反应的复杂性 更好地理解人类宿主对细菌感染的反应,以改善人类健康 细菌感染患者外周血中的免疫细胞 NA 细菌感染 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA RNA测序数据 外周血单个核细胞(PBMCs)
25637 2024-08-09
Gene Regulatory Network Analysis and Engineering Directs Development and Vascularization of Multilineage Human Liver Organoids
2021-01-20, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文展示了通过整合分析和工程化基因调控网络(GRNs)在多谱系人肝类器官中指导成熟和血管形态发生的方法 通过过表达PROX1和ATF5,结合靶向CRISPR介导的转录激活内源性CYP3A4,重新编程组织GRN,改善了原生肝功能 NA 研究如何通过基因调控网络的分析和工程化促进人肝类器官的发育和血管化 多谱系人肝类器官 NA NA CRISPR NA RNA-seq NA
25638 2024-08-09
Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome
2021-01, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类乳腺癌肿瘤浸润性免疫细胞中的γδ T细胞亚型,发现一种与良好临床结果相关的γδ T细胞亚型 本研究首次在乳腺癌肿瘤中鉴定出一种与改善总体癌症生存率相关的γδ T细胞亚型 NA 探索γδ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用 人类乳腺癌肿瘤浸润性γδ T细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 健康成人供体的外周血γδ T细胞和乳腺癌患者的肿瘤活检样本
25639 2024-08-09
Analysis of canine myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) utilizing fluorescence-activated cell sorting, RNA protection mediums to yield quality RNA for single-cell RNA sequencing
2021-Jan, Veterinary immunology and immunopathology IF:1.4Q2
研究论文 本研究通过荧光激活细胞分选(FACS)和RNA保护介质优化犬类髓源抑制细胞(MDSC)的单细胞RNA测序 本研究优化了MDSC的FACS分选策略,并使用了RiboLock™和RNAlater™来保护RNA质量,提高了RNA完整性,从而改善了单细胞RNA测序的数据质量 由于正常样本中细胞数量较少,未进行进一步的通路分析 优化犬类MDSC的FACS分选和RNA保护方法,以提高单细胞RNA测序的数据质量 犬类髓源抑制细胞(MDSC) 数字病理学 口腔黑色素瘤 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 两个样本,一个来自正常犬,另一个来自未治疗的口腔黑色素瘤犬
25640 2024-08-09
Single-cell analysis reveals the purification and maturation effects of glucose starvation in hiPSC-CMs
2021-01-01, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄糖饥饿对人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)纯化和成熟的影响。 首次全面评估了葡萄糖饥饿对hiPSC-CMs转录异质性的影响,并揭示了其对心肌细胞纯化和成熟的作用。 NA 探讨葡萄糖饥饿处理对hiPSC-CMs纯化和成熟的影响。 人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
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