单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
25601	2024-08-09	Photoactivated Selective Release of Droplets from Microwell Arrays 2020-Jan-22, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.9b17575 PMID:31912738	研究论文	本文介绍了一种通过光响应聚合物层实现微孔阵列中液滴选择性释放的技术	利用光响应聚合物层实现液滴的选择性释放，无需复杂的物理阀门网络和外部控制单元	NA	开发一种新的技术，用于从微孔阵列中选择性释放液滴，以便进一步分析	微孔阵列中的液滴	微流控技术	NA	光响应聚合物层	NA	液滴	大量液滴
25602	2024-08-09	Cell-to-Cell Variation in Defective Virus Expression and Effects on Host Responses during Influenza Virus Infection 2020-01-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mBio.02880-19 PMID:31937643	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了流感病毒感染下人A549细胞和原代支气管上皮细胞的病毒转录和宿主反应的动态变化	本研究首次详细描述了单细胞水平上缺陷型病毒基因组（DVGs）与宿主转录程序变异的相关性，并验证了缺陷型病毒基因组的干扰和免疫刺激功能	本研究主要集中在单细胞水平上的转录组分析，未涉及更广泛的细胞和组织层面的影响	旨在阐明流感病毒感染中单细胞水平上的病毒转录变异及其对宿主反应的影响	人A549细胞和原代支气管上皮细胞在流感病毒A感染下的病毒转录和宿主反应	数字病理学	流感	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	多个时间点的单个细胞样本
25603	2024-08-09	Identification and transfer of spatial transcriptomics signatures for cancer diagnosis 2020-01-13, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s13058-019-1242-9 PMID:31931856	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，通过支持向量机机器学习方法，识别并转移乳腺癌组织切片中的空间转录组学特征，以区分非恶性、原位导管癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC）区域	首次展示了从专家选择的乳腺癌组织切片中学习到的空间转录组学特征可以用于识别整个组织切片中的乳腺癌区域，包括未训练的区域，并且这些特征可以在未用于训练的组织切片中以高精度分类癌症区域	NA	研究空间转录组学特征在乳腺癌诊断中的应用	乳腺癌组织切片中的非恶性、DCIS和IDC区域	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学（ST）	支持向量机（SVM）	转录组数据	使用了四个公开的ST乳腺癌数据集，共25,179个表达转录本，798个表达特征转录本
25604	2024-08-09	The Renin-Angiotensin System in the Central Nervous System and Its Role in Blood Pressure Regulation 2020-01-10, Current hypertension reports IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s11906-019-1011-2 PMID:31925571	综述	本文主要讨论了先进技术如何帮助我们理解脑内肾素-血管紧张素系统（RAS）的神经生理和分子机制	使用了新的原位杂交技术和转基因动物模型，以及基因工程动物结合靶向病毒微注射技术	脑内RAS的存在仍然存在争议	探讨脑内RAS的运作机制及其在血压调节中的作用	脑内肾素-血管紧张素系统及其分子和神经生理机制	NA	NA	原位杂交技术，转基因动物模型，基因工程技术，靶向病毒微注射	NA	NA	NA
25605	2024-08-09	Recovery of viable endocrine-specific cells and transcriptomes from human pancreatic islet-engrafted mice 2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.201901022RR PMID:31914605	研究论文	本文开发了一种从人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠中恢复活细胞的方法，并进行了功能和激素特异性转录组分析	首次实现了从移植后的小鼠中恢复活细胞，并进行了单细胞RNA测序和体外葡萄糖刺激胰岛素分泌实验	恢复的胰岛细胞产量相对较低	研究人胰腺胰岛移植后的细胞特性和功能	人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠后的活细胞和转录组	NA	糖尿病	RNA测序	单细胞RNA测序	细胞	NA
25606	2024-08-09	Lineage specification and pluripotency revealed by transcriptome analysis from oocyte to blastocyst in pig 2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.201901818RR PMID:31914626	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了从卵母细胞到猪早期囊胚的转录组，揭示了细胞谱系特化和多能性的分子特征	首次展示了猪早期胚胎中原始多能性特征的存在，并描述了X染色体剂量补偿的动态变化	NA	探讨猪早期胚胎发育中的细胞谱系特化和多能性	猪从卵母细胞到早期囊胚的早期胚胎	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	从卵母细胞到早期囊胚的多个猪早期胚胎样本
25607	2024-08-09	Tracheal brush cells release acetylcholine in response to bitter tastants for paracrine and autocrine signaling 2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.201901314RR PMID:31914675	研究论文	本文研究了气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制，及其在旁分泌和自分泌信号传导中的作用	首次直接证明了气管刷状细胞在苦味物质刺激下释放乙酰胆碱，并揭示了这一过程在自分泌和旁分泌信号传导中的调节机制	NA	探讨气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制及其在免疫反应中的作用	气管刷状细胞、苦味受体激动剂、乙酰胆碱释放	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	小鼠气管刷状细胞
25608	2024-08-09	Differential excitatory vs inhibitory SCN expression at single cell level regulates brain sodium channel function in neurodevelopmental disorders 2020-Jan, European journal of paediatric neurology : EJPN : official journal of the European Paediatric Neurology Society IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.ejpn.2019.12.019 PMID:31928904	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类和小鼠中电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式，揭示了这些通道在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，及其在神经发育障碍中的潜在作用	本研究首次在单细胞水平上揭示了SCN1/2/3/8A在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，与之前的低分辨率RNA筛选结果形成对比	NA	探讨电压门控钠通道在神经发育障碍中的作用机制	电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式	神经科学	神经发育障碍	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	人类和小鼠的样本
25609	2024-08-09	Simultaneous Measurement of Surface Proteins and Gene Expression from Single Cells 2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_3 PMID:31933196	研究论文	本文介绍了一种名为CITE-seq的新方法，该方法能够同时从单个细胞中测量表面蛋白和基因表达	CITE-seq方法结合了单细胞测序技术和寡核苷酸标记的抗体，实现了对细胞表面蛋白和基因表达的同步测量	NA	开发一种能够同时测量单细胞表面蛋白和基因表达的新技术	单细胞的表面蛋白和基因表达	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	单个细胞
25610	2024-08-09	Analysis of Transcriptional Profiling of Immune Cells at the Single-Cell Level 2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_4 PMID:31933197	研究论文	本文介绍了如何将10× genomics 5'V(D)J免疫细胞分析流程生成的单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中	单细胞测序技术揭示了免疫细胞先前未知的多样性和特异性	NA	研究如何将单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中	免疫细胞的转录组	生物信息学	NA	RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
25611	2024-08-09	Decoding the development of the human hippocampus 2020-01, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-019-1917-5 PMID:31942070	研究论文	本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq分析技术，揭示了人类海马体发育过程中的细胞类型、细胞谱系、分子特征和转录调控	首次通过多组学数据揭示了人类海马体发育的转录调控网络，并比较了人类和鼠类海马体的基因表达差异	NA	理解人类海马体的发育过程及其相关疾病	人类海马体在妊娠16-27周的发育过程	数字病理学	NA	单细胞RNA测序，ATAC-seq	NA	基因表达数据	30,416个细胞
25612	2024-08-09	B cells and tertiary lymphoid structures promote immunotherapy response 2020-01, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-019-1922-8 PMID:31942075	研究论文	本文通过RNA测序和计算方法研究了B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断（ICB）治疗反应中的作用	首次详细探讨了B细胞在ICB治疗反应中的作用，并发现B细胞标志物在响应者肿瘤中差异表达	研究主要基于RNA测序和计算方法，可能需要进一步的实验验证	探讨B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断治疗反应中的作用	B细胞和三级淋巴结构在ICB治疗中的功能和潜在作用	肿瘤学	黑色素瘤，肾细胞癌	RNA测序，MCP-counter计算方法，质谱流式细胞术	NA	RNA	多个ICB治疗的患者群体，包括黑色素瘤和肾细胞癌患者
25613	2024-08-09	Species-Specific miRNAs in Human Brain Development and Disease 2019, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2019.00559 PMID:31920559	综述	本文综述了物种特异性miRNA在人类大脑发育和疾病中的调控作用及其对人类大脑特征演变和神经系统疾病的贡献	探讨了miRNA表达的分化在塑造物种间基因表达差异中的重要作用，并介绍了单细胞测序方法在解析发育过渡期miRNA-mRNA相互作用中的应用	NA	阐明物种特异性miRNA调控机制，为神经疾病开发新型、全面和有效的治疗方法	人类大脑发育和神经系统疾病	NA	神经精神疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
25614	2024-08-09	Revealing Dynamic Mechanisms of Cell Fate Decisions From Single-Cell Transcriptomic Data 2019, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2019.01280 PMID:31921315	研究论文	开发了一种名为Topographer的新方法，用于从单细胞转录组数据构建定量的Waddington景观，揭示细胞命运决策的动态机制	Topographer方法能够识别复杂的细胞状态转换轨迹，并估计由命运和转换概率表征的复杂细胞类型动态	NA	揭示细胞命运决策的动态机制	单细胞转录组数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及人类初级肌细胞的单细胞RNA-seq数据
25615	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing of the Cardiovascular System: New Looks for Old Diseases 2019, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2019.00173 PMID:31921894	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管系统研究中的应用，探讨了其在揭示细胞亚群和转录变异方面的潜力	scRNA-seq技术揭示了新的细胞亚群和转录变异，为心血管疾病的基础科学研究提供了新的见解	NA	探讨scRNA-seq在心血管系统研究中的应用及其对理解心血管系统和病理的潜在价值	心血管系统中的细胞亚群和转录变异	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA表达数据	NA
25616	2024-08-09	A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear cells in end-stage renal disease 2021-03-29, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association DOI:10.1093/ndt/gfz227 PMID:31883338	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，生成了来自健康志愿者和终末期肾病患者的单核细胞转录组图谱，并进行了无监督聚类和注释分析。	本研究首次生成了终末期肾病患者外周血单核细胞的高分辨率转录组图谱，并揭示了细胞类型特异性的终末期肾病相关通路和转录因子。	由于使用的是混合样本分析，结果的普遍性受到限制。	旨在深入了解终末期肾病中免疫异常的机制。	终末期肾病患者和健康志愿者的外周血单核细胞。	数字病理学	终末期肾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	10名健康志愿者和10名终末期肾病患者的外周血单核细胞，共生成12,981和9,578个单细胞转录组。
25617	2024-08-09	Allergen-specific IgG+ memory B cells are temporally linked to IgE memory responses 2020-07, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2019.11.046 PMID:31883847	研究论文	本研究探讨了黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源	首次证明了在黏膜过敏原暴露下，人类IgE记忆存在于过敏原特异性的IgG+记忆B细胞中，这些细胞能迅速转换同种型，扩展为短寿命的IgE+浆母细胞，并作为治疗干预的潜在目标	NA	研究黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源	季节性过敏性鼻炎成年患者的PBMCs和鼻活检样本	免疫学	过敏性鼻炎	重链可变基因序列分析，单细胞转录组学	NA	RNA	40名季节性过敏性鼻炎成年患者
25618	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing analysis reveals alginate oligosaccharides preventing chemotherapy-induced mucositis 2020-05, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1038/s41385-019-0248-z PMID:31900405	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了海藻酸寡糖（AOS）预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用	首次在单细胞水平上研究了AOS对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用，并通过深度分析揭示了AOS通过调节转录因子表达来改善肠道功能	NA	研究AOS在单细胞水平上预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用	海藻酸寡糖（AOS）对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用	数字病理学	血液肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
25619	2024-08-09	Identification of key genes and pathways in abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis 2020-Apr, The Journal of international medical research IF:1.4Q4 DOI:10.1177/0300060519894437 PMID:31885343	研究论文	通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别与腹主动脉瘤相关的关键基因和通路	发现了四个新的与腹主动脉瘤相关的主要基因，这些基因在已知的动脉瘤基因数据库中未被记录	NA	识别与腹主动脉瘤发病机制和进展相关的关键基因，并探索其作为治疗靶点的潜力	腹主动脉瘤的关键基因和生物通路	生物信息学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	507个上调基因和842个下调基因
25620	2024-08-09	Bulk and single cell transcriptomic data indicate that a dichotomy between inflammatory pathways in peripheral blood and arthritic joints complicates biomarker discovery 2020-03, Cytokine IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cyto.2019.154960 PMID:31881419	研究论文	本研究通过整合分析基因表达微阵列数据和单细胞RNA测序数据，探讨了类风湿性关节炎（RA）中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。	本研究首次通过大规模和单细胞转录组数据分析，揭示了周围血液和关节炎关节中炎症通路的差异，为生物标志物的发现提供了新的视角。	研究主要基于RA患者和健康对照的数据，未涵盖其他类型的关节炎，可能限制了结果的普遍性。	探讨类风湿性关节炎中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。	类风湿性关节炎患者的滑膜、全血细胞、外周血单个核细胞和CD4+ T细胞，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。	数字病理学	类风湿性关节炎	基因表达微阵列分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括RA患者和健康对照的多个样本类型，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。