单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 34313 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2025-11-15 |
Single-cell hdWGCNA identifies ICI-related-colitis key CD8 + T cells linked to immunotherapy response and prognosis in colon cancer
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03891-4
PMID:41217618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和hdWGCNA分析鉴定与免疫检查点抑制剂相关结肠炎(CIC)相关的关键CD8+T细胞，并探讨其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | 首次使用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)识别CIC相关基因模块，发现CIC关键CD8+T细胞在免疫治疗反应中的重要作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需进一步实验证实 | 探索免疫检查点抑制剂相关结肠炎的免疫学机制及其对结肠癌预后的影响 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和未发生结肠炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 伪时间分析, hdWGCNA | 预后评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和对照患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2542 | 2025-11-15 |
Deciphering cell-type-and temporally specific matrisome expression signatures in human cortical development and neurodevelopmental disorders via scRNA-seq meta-analysis
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64381-3
PMID:41219193
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达特征及其与神经发育障碍的关联 | 首次通过大规模scRNA-seq荟萃分析系统描绘人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达动态，并揭示其与神经发育障碍的关联 | 研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；样本时间窗口限于孕8-26周；数据来源于不同研究的整合 | 阐明人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组基因表达特征及其在神经发育障碍中的潜在作用 | 人类皮质发育过程中的各种细胞类型及其基质组基因表达 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 荟萃分析 | 单细胞转录组数据 | 37个供体，孕8-26周，来自6项独立研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2543 | 2025-11-15 |
In-silico discovery of druggable molecular signatures that drive dengue fever to severe dengue fever highlighting common pathogenesis through single-cell RNA-Seq analysis
2025-Nov-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23000-3
PMID:41219276
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现登革热向重症登革热转变的关键分子特征和候选药物 | 整合多个单细胞RNA测序数据集，识别出与登革热疾病进展相关的关键细胞类型和宿主基因，并通过计算药物筛选推荐候选治疗药物 | 研究基于计算分析，需要实验验证；样本来源和数量可能存在限制 | 探索登革热向重症登革热发展的分子机制并发现潜在治疗靶点 | 登革热和重症登革热患者样本 | 生物信息学 | 登革热 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异表达分析, 蛋白质相互作用网络分析, 分子对接, ADME/T分析 | PPI网络分析, 分子对接模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE220969和GSE154386)，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2544 | 2025-11-15 |
Exploring drug resistance via intercellular crosstalk using spatial transcriptomics in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-Nov-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01122-1
PMID:41219363
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索高级别浆液性卵巢癌中细胞间通讯与PARP抑制剂耐药性的关系 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，发现midkine信号通路在PARP抑制剂耐药中的作用，并鉴定出SDC4受体表达与患者生存期的关联 | 样本量较小（仅8个肿瘤样本），需要在更大队列中验证发现 | 探索高级别浆液性卵巢癌中PARP抑制剂耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 8个高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组平台 |
| 2545 | 2025-11-15 |
Molecular mechanisms and genetic predisposition to osteoarthritis and osteosarcoma through Mendelian inheritance patterns
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03917-x
PMID:41219646
|
研究论文 | 通过孟德尔遗传方法系统分析骨关节炎和骨肉瘤的遗传变异特征和细胞分子网络 | 首次结合GWAS和单细胞RNA测序系统阐明两种骨科疾病的遗传易感机制和细胞异质性特征 | NA | 探究骨关节炎和骨肉瘤的遗传易感性和分子机制 | 骨关节炎和骨肉瘤的遗传变异及细胞分子网络 | 生物信息学 | 骨科疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, t-SNE降维分析, 蛋白互作网络分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2546 | 2025-11-15 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identifies shared and specific immune signatures in Takayasu Arteritis
2025-Nov-11, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03673-x
PMID:41219777
|
研究论文 | 通过整合外周血T细胞亚群的bulk RNA测序和主动脉组织的单细胞RNA测序，揭示高安动脉炎中CD4⁺和CD8⁺ T细胞的共享和特异性免疫特征 | 首次整合外周血T细胞亚群的bulk转录组和主动脉组织的单细胞转录组分析，发现EGR1作为跨区室一致上调的关键转录调节因子 | 样本量较小（8例初治TAK患者外周血，3例TAK患者主动脉组织），需更大规模验证 | 寻找高安动脉炎的机制性生物标志物和治疗靶点 | 高安动脉炎患者的外周血CD4⁺和CD8⁺ T细胞及主动脉组织 | 生物信息学 | 高安动脉炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因富集分析, 蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据 | 8例初治TAK患者外周血+3例健康对照，3例TAK患者主动脉组织+3例动脉粥样硬化对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2547 | 2025-11-15 |
Delineating transcriptomic signatures of in vitro human skeletal muscle models in comparison to in vivo references
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102684
PMID:41135530
|
研究论文 | 通过大规模转录组数据分析比较体外人类骨骼肌模型与体内参考组织的转录组特征差异 | 首次对39项研究中400多个样本进行大规模转录组比较分析，系统评估体外骨骼肌模型的保真度 | 研究基于现有公开数据集，可能受原始实验设计差异影响 | 评估体外骨骼肌模型在转录组水平上对体内组织的再现程度 | 人类骨骼肌体外模型（2D和3D）及体内参考组织 | 转录组学 | NA | RNA测序，包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过400个样本，涵盖39项研究 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2548 | 2025-11-15 |
Extracellular vesicle-induced lipid dysregulation drives liver premetastatic niche formation in colorectal cancer
2025-Nov-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334851
PMID:40562522
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡通过诱导肝脏脂质积累促进肝转移前微环境形成的机制 | 首次发现高转移性结直肠癌细胞通过细胞外囊泡传递促脂肪生成脂质驱动肝脏转移前微环境形成 | NA | 阐明结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡促进肝转移前微环境形成的分子机制 | 结直肠癌细胞、肝转移前微环境、细胞外囊泡、库普弗细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 脂质组学、单细胞测序、类器官培养 | NA | 脂质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 小鼠模型和结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2549 | 2025-11-15 |
Investigating prognostic features in high-grade serous ovarian cancer through gene regulatory network inference with single-cell transcriptomic profiles
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22937-9
PMID:41214061
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据推断基因调控网络，识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 开发了结合单细胞RNA测序分析、元细胞构建、基因调控网络推断和预后预测的分类流程，证明基于调控子的特征比差异表达特征更有效 | 需要同时具备用于GRN推断的单细胞数据和具有临床结果的大块RNA-seq数据才能推广到其他癌症类型 | 识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，大块RNA测序，基因调控网络推断 | 二元分类模型 | 单细胞转录组数据，大块RNA测序数据 | 118,173个细胞（来自HGSOC患者），1,211个元细胞，342名TCGA HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq，大块RNA-seq | NA | NA |
| 2550 | 2025-11-15 |
Sex-specific associations between phthalate exposure and stroke risk: a cross-sectional study integrating molecular mechanisms of vascular dysfunction
2025-Nov-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003762
PMID:41235807
|
研究论文 | 本研究通过横断面分析探讨了邻苯二甲酸盐暴露与中风风险之间的性别特异性关联，并揭示了潜在的分子机制 | 首次发现邻苯二甲酸盐暴露与女性中风风险的特异性关联，并通过网络毒理学和分子对接分析揭示了内皮细胞特异性KDR-AKT1-MAPK8信号通路的作用机制 | 横断面研究设计无法确定因果关系，研究依赖自我报告的中风诊断 | 评估邻苯二甲酸盐暴露与中风风险之间的关联，特别关注性别特异性差异 | 8,184名美国国家健康与营养调查(NHANES)参与者(4,140名女性和4,044名男性) | 环境流行病学 | 中风 | 加权分位数和(WQS)回归,网络毒理学,蛋白质-蛋白质相互作用映射,Friends算法,分子对接分析,单细胞RNA测序 | WQS回归模型 | 尿液代谢物浓度数据,分子对接数据,单细胞RNA测序数据 | 8,184名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2551 | 2025-11-15 |
Pro-osteogenic implants inhibit local excessive B cell maturation via neutrophils-derived CD52 signaling to enhance osseointegration
2025-Nov-07, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了促骨生成植入物通过中性粒细胞来源的CD52信号抑制局部B细胞过度成熟以增强骨整合的机制 | 首次发现促骨生成植入物通过中性粒细胞-CD52-SiglecG轴间接抑制B细胞成熟，揭示了B细胞在骨整合中的关键作用及新型免疫调节机制 | 研究基于小鼠胫骨植入模型，尚未在人类临床环境中验证 | 探究B细胞在植入性生物材料介导的骨整合过程中的作用机制 | 小鼠胫骨植入模型中的免疫细胞和骨髓间充质基质细胞 | 免疫学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2552 | 2025-11-15 |
A novel information-theoretic approach reveals loss of effective biomolecular communication in aging muscle cells
2025-Nov-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf195
PMID:40920357
|
研究论文 | 本研究应用信息论方法分析骨骼肌单细胞RNA-seq数据，揭示衰老过程中肌肉细胞生物分子通讯效率的下降 | 首次将信息论方法应用于单细胞RNA-seq数据，量化衰老过程中转录因子与靶基因间通讯效率的损失 | 研究仅基于转录组数据，未考虑其他分子层面的调控机制 | 探究衰老过程中生物分子通讯效率的变化规律 | 年轻、中年和老年动物的骨骼肌细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 信息论模型 | 单细胞转录组数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的动物骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2553 | 2025-11-15 |
Spatial Multiomics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708
PMID:40759029
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术定义了高级别胶质瘤切除边缘的共享肿瘤浸润特征 | 首次在匹配的肿瘤核心和边缘区域生成单核多组学数据集，结合空间转录组学识别出跨HGG亚型的共享浸润特征 | 样本量较小（4例用于单核测序，2例用于空间转录组学），需要更大队列验证 | 研究高级别胶质瘤切除边缘的残留病变生物学特征 | 高级别胶质瘤患者的肿瘤核心和边缘组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, 染色质免疫沉淀测序 | 计算分析包括功能富集、差异分析、RNA速度和伪时间分析 | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 4例不同亚型的4级高级别胶质瘤（36,811个snRNA-seq核，30,705个snATAC-seq核），外加2例用于空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2554 | 2025-11-15 |
Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03122-1
PMID:40935899
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据揭示了胰岛素信号相关细胞命运通过顺式调控元件激活促进无功能性垂体促性腺激素腺瘤的侵袭性 | 首次发现胰岛素信号相关细胞命运驱动肿瘤侵袭性，并识别了SREBF1和IGF2BP2相关顺式调控元件在染色质互作重建中的关键作用 | 样本量相对有限（3例单细胞测序患者），需要更大规模研究验证 | 探究无功能性垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 无功能性垂体促性腺激素腺瘤患者和原代细胞系 | 单细胞多组学 | 垂体腺瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 顺式共可及网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞表观基因组数据 | 3例NFGA患者（单细胞测序），210例患者队列验证，3个原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2555 | 2025-11-15 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
|
综述 | 本文系统阐述了免疫细胞在心脏损伤中的动态变化机制及其治疗意义 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据，提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明免疫细胞在心血管疾病中的动态作用机制及治疗策略 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2556 | 2025-11-15 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
|
研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术揭示人类胎盘的免疫景观及其在妊娠疾病中的生物标志物和治疗潜力 | 首次利用空间分析技术解析胎盘微环境中免疫细胞与滋养细胞的相互作用空间组织 | 未整合多组学和纵向分析数据 | 研究胎盘微环境在妊娠疾病中的免疫调控机制 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间基因表达数据, 空间蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2557 | 2025-11-15 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-Nov, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨骨桥蛋白抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻大鼠蛛网膜下腔出血后神经炎症的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现蛛网膜下腔出血大鼠颞叶组织中SPP1（OPN）显著增加，并验证OPN抑制剂通过TLR4/NF-κB通路发挥神经保护作用 | 研究仅使用大鼠模型，样本量未明确说明，缺乏临床验证 | 研究骨桥蛋白抑制剂对蛛网膜下腔出血后神经炎症的保护作用 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，脑立体定向注射，免疫荧光 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2558 | 2025-11-15 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究开发了Sig27基因面板及其衍生面板Sig27IMG，用于评估前列腺癌复发风险并揭示肿瘤的免疫抑制特性 | 首次提出27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG，能够通过评估肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制特性来预测前列腺癌复发 | 研究基于回顾性数据集，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发基因标志物面板用于前列腺癌复发风险分层和免疫抑制特性评估 | 前列腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 基因面板评分系统 | 基因表达数据 | 3,133个肿瘤样本（批量RNA-seq），53名患者（单细胞RNA-seq），后续扩展到5,672名患者（17种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 2559 | 2025-11-15 |
The role of hypothyroidism in cirrhosis pathogenesis: A retrospective cohort study and multi-omics integration analysis
2025-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011947
PMID:41202080
|
研究论文 | 本研究通过回顾性队列分析和多组学整合分析揭示了甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次揭示甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系，发现HLA-DQA1和CD27作为潜在治疗靶点，并鉴定甘草酸和左甲状腺素钠为候选药物 | 研究主要基于回顾性数据和遗传分析方法，需要进一步实验验证 | 探讨甲状腺功能减退在肝硬化发病机制中的作用 | 肝硬化患者和甲状腺功能减退患者 | 多组学整合分析 | 肝硬化 | 连锁不平衡评分回归，孟德尔随机化，转录组关联研究，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 孟德尔随机化模型，基因共表达网络模型，分子对接模型 | 临床数据，遗传数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 基于Medical Information Mart for Intensive Care临床数据库的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2560 | 2025-11-15 |
Curcumin-chitosan microspheres inhibit epithelial cell PANoptosis: analysis of key PANoptosis gene distribution via single-cell RNA sequencing and in vivo validation in ulcerative colitis mice
2025-Nov, General physiology and biophysics
IF:1.3Q4
DOI:10.4149/gpb_2025030
PMID:41217223
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内实验验证姜黄素-壳聚糖微球通过抑制上皮细胞PANoptosis改善溃疡性结肠炎 | 首次揭示姜黄素-壳聚糖微球通过调控肠上皮细胞PANoptosis缓解溃疡性结肠炎的机制 | NA | 探究姜黄素-壳聚糖微球对溃疡性结肠炎的治疗作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2细胞系 | 单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |