单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2025-10-06 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱流式细胞术解析人类胶质瘤的免疫景观 | 发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群，建立超越M1/M2范式的巨噬细胞极化基因组框架，提供胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量相对有限，未完全阐明遗传差异和治疗效果对免疫的长期影响 | 解析IDH分层的人类原发性和复发性胶质瘤的免疫特征 | 48例人类胶质瘤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 144,678个单细胞转录组, 超过200万个免疫细胞, 来自48例人类胶质瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2542 | 2025-10-06 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
|
研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫-成纤维细胞通讯的分子机制 | 首次在人类心脏疾病中系统描绘免疫-成纤维细胞通讯机制，并发现IL-1β信号通路在驱动FAP/POSTN成纤维细胞形成中的关键作用 | 研究样本量有限（45例），体外培养系统未能完全重现人类疾病表型 | 探索心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制及其治疗潜力 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞基因表达谱、表位图谱、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本（包括健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2543 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating immune cells from human gastric muscularis propria for single-cell analysis
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103258
PMID:39133613
|
研究论文 | 本文提供了一种从人胃肌层分离免疫细胞进行单细胞分析的详细实验方案 | 开发了专门针对人胃肌层组织免疫细胞分离的单细胞分析方案 | NA | 建立人胃肌层免疫细胞分离和单细胞分析的标准实验流程 | 人胃肌层组织中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2544 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51761-4
PMID:39227568
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的个体发育、保守性和多样性 | 首次构建软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞单细胞图谱，发现软骨鱼中存在共表达T、B细胞标志的T细胞亚群和具有吞噬功能的B细胞群体 | 研究仅涵盖三种代表性鱼类物种，可能需要更多物种验证普遍性 | 阐明有颌类脊椎动物免疫系统的起源和进化特征 | 软骨鱼（白斑竹鲨）和硬骨鱼（斑马鱼和半滑舌鳎）的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种鱼类物种的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2545 | 2025-10-06 |
Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51763-2
PMID:39227584
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示七鳃鳗中一种表达MPL-L受体的独特T样细胞亚型 | 首次在无颌类脊椎动物中发现表达MPL样受体的新型T样淋巴细胞亚型 | 研究仅针对七鳃鳗单一物种，需在更多无颌类脊椎动物中验证 | 探究无颌类脊椎动物适应性免疫系统的细胞多样性 | 七鳃鳗(Lampetra morii)的鳃、肠道和血液组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 七鳃鳗多个组织(鳃、肠、血液、肝脏、肾脏、皮肤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2546 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中新型免疫抑制性T细胞，并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 首次在CMV感染的胶质母细胞瘤中发现双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞两种新型免疫细胞亚群，并证实FXYD6+ T细胞是一类新型免疫抑制性T细胞 | NA | 探究巨细胞病毒感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响，并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织、CMV感染的胶质母细胞瘤免疫微环境 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序,免疫电镜,免疫荧光,微滴数字PCR,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 2547 | 2025-10-06 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析免疫检查点抑制剂相关结肠炎的细胞机制，重点关注类固醇治疗患者的免疫细胞和基质细胞变化 | 首次在类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者中系统分析CD4+和CD8+组织驻留记忆T细胞、髓系细胞和基质细胞的失调机制 | 样本主要来自类固醇治疗过的患者，可能影响对疾病原始机制的解读 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制，特别是在类固醇治疗背景下的细胞变化 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 单细胞组学 | 免疫相关结肠炎 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 主要来自类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2548 | 2025-10-06 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
|
研究论文 | 通过谱系追踪与单细胞RNA测序技术研究上丘发育过程中祖细胞的多能性和定位模式 | 发现上丘发育过程中存在极端多能性的单个祖细胞，能够生成所有类型的神经元和胶质细胞，且细胞定位呈现非预定模式 | NA | 探索上丘发育过程中祖细胞的分化潜能和细胞定位规律 | 发育中的上丘组织 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2549 | 2025-10-06 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
|
研究论文 | 开发了一种结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序的平台，用于研究人类脂肪细胞中与代谢紊乱相关的候选基因 | 首次将CROP-Seq技术应用于脂肪生成和脂肪细胞生物学研究，能够同时评估多个候选基因的转录效应 | 研究基于SGBS细胞系，可能无法完全代表体内脂肪细胞的行为 | 识别与代谢疾病相关的脂肪生成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新型调节因子 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系 | 单细胞基因组学 | 代谢紊乱 | CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | CROP-Seq | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控单细胞捕获 |
| 2550 | 2025-10-06 |
ZetaSuite: computational analysis of two-dimensional high-throughput data from multi-target screens and single-cell transcriptomics
2022-07-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02729-4
PMID:35879727
|
研究论文 | 开发用于分析二维高通量数据的Zeta统计量和ZetaSuite软件包 | 提出新的Zeta统计量，专门用于分析二维高通量数据，并开发配套软件工具 | NA | 解决功能基因组学中二维高通量数据分析的挑战 | 二维RNAi筛选数据、癌症依赖性筛选数据、单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNAi筛选、单细胞转录组学 | 统计模型 | 高通量功能数据、单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2551 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of the cellular heterogeneity and interactions in the injured mouse spinal cord
2021-08-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210040
PMID:34132743
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠脊髓损伤部位的细胞异质性和相互作用 | 发现新的细胞亚群，并通过受体-配体对表达值识别调控血管生成、胶质增生和纤维化过程中特定细胞相互作用的信号通路 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 理解脊髓损伤后细胞异质性和相互作用的分子机制 | 小鼠脊髓损伤部位的所有细胞类型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠脊髓损伤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2552 | 2025-10-06 |
Multi-omics integrative analysis reveals novel genetic loci and candidate genes for ischemic stroke
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102633
PMID:40777745
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别缺血性脑卒中的新遗传位点和候选基因 | 首次整合三大GWAS数据库进行meta分析，发现124个新的IS相关位点，并开发基于大语言模型的智能助手StrokeGene | 遗传研究的发现需要进一步功能验证，样本来源限于现有数据库 | 探索缺血性脑卒中的遗传基础和新致病机制 | 人类遗传数据和动物模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | GWAS meta分析, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 大语言模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 三大GWAS数据库(GWAS Catalog, MEGASTROKE, Open GWAS)的整合数据 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 2553 | 2025-10-06 |
Multi-omics insights of immune cells in the risk and prognosis of idiopathic membranous nephropathy
2025-Aug-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08642-3
PMID:40783650
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了CD39调节性T细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的关键作用 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CD39 Tregs与IMN的因果关系，并构建了107个复合机器学习模型识别MN | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 探究免疫细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的作用机制 | 731种免疫细胞表型与特发性膜性肾病患者 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 多组学分析, 孟德尔随机化, 多重免疫荧光染色, 单细胞转录组分析, 流式细胞术 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2554 | 2025-10-06 |
Mitochondrial metabolic reprogramming in colorectal cancer: mechanisms of resistance and future clinical interventions
2025-Aug-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02670-y
PMID:40783392
|
综述 | 探讨结直肠癌中线粒体代谢重编程在治疗抵抗中的作用机制及潜在临床干预策略 | 系统阐述线粒体代谢重编程作为结直肠癌治疗抵抗的核心适应机制，并评估空间转录组学等新技术在个性化治疗中的转化价值 | NA | 分析线粒体代谢重编程导致结直肠癌治疗抵抗的机制并探索临床干预方向 | 结直肠癌细胞及其线粒体代谢机制 | NA | 结直肠癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 患者来源类器官 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2555 | 2025-10-06 |
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-Aug-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182050
PMID:40627450
|
研究论文 | 本研究开发了靶向FAP1的CAR工程化细胞毒性调节T细胞，用于治疗特发性肺纤维化 | 结合CAR-T细胞的靶向杀伤优势和Treg细胞的免疫抑制功能，首次开发CAR-cTregs治疗肺纤维化 | 研究基于博来霉素诱导的肺纤维化模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发治疗特发性肺纤维化的新型细胞免疫疗法 | FAP1+肺泡成纤维细胞和CAR工程化细胞毒性调节T细胞 | 细胞免疫治疗 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序，CAR-T细胞工程 | NA | 基因表达数据，病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2556 | 2025-10-06 |
Regulation of cortical neurogenesis by MED13L via transcriptional priming and its implications for MED13L syndrome
2025-Aug-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08532-8
PMID:40775066
|
研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了MED13L通过转录启动调控大脑皮层神经发生的分子机制 | 首次发现MED13L通过结合中介体复合物启动关键发育基因的转录激活，阐明了MED13L综合征的发育机制 | 研究基于小鼠模型，在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 探究MED13L综合征的发育和分子机制 | MED13L基因敲除小鼠模型 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学，免疫荧光，多组学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据，蛋白质定位数据 | MED13L敲除胚胎和成年小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 2557 | 2025-10-06 |
A human NK cell progenitor that originates in the thymus and generates KIR+NKG2A- NK cells
2025-Aug-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9650
PMID:40779632
|
研究论文 | 本研究发现了人类胸腺来源的NK细胞前体细胞，能够生成KIR+NKG2A- NK细胞 | 首次鉴定出胸腺来源的cILC1前体细胞(thyILC1)，揭示了胸腺依赖性NK细胞分化途径 | NA | 探索KIR+NKG2A- NK细胞的发育起源和分化途径 | 人类天然杀伤细胞(NK细胞)和先天淋巴样细胞(ILC) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括健康供体和22q11.2缺失综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2558 | 2025-10-06 |
Rapid generation of functional vascular organoids via simultaneous transcription factor activation of endothelial and mural lineages
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.05.014
PMID:40516530
|
研究论文 | 开发了一种通过同时激活内皮和壁细胞谱系转录因子快速生成功能性血管类器官的方法 | 通过正交激活ETV2和NKX3.1转录因子，实现内皮细胞和壁细胞的高效共分化，5天内生成无需ECM包埋的功能性3D血管类器官 | NA | 建立快速生成功能性血管类器官的平台，用于血管建模、疾病研究和再生细胞治疗 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、血管类器官、免疫缺陷小鼠 | 再生医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序、多西环素诱导系统、修饰RNA系统 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2559 | 2025-10-06 |
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009
PMID:40651470
|
研究论文 | 本研究揭示了细菌代谢物ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号通路触发肠道干细胞再生机制 | 首次发现细菌ADP-庚糖通过激活ALPK1-TIFA信号通路诱导肠道损伤后再生干细胞(revSCs)的形成 | ALPK1-TIFA信号通路在生理环境中的具体功能仍需进一步研究 | 探究ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用机制 | 肠道上皮干细胞、潘氏细胞 | 细胞生物学 | 肠道损伤 | 单细胞转录组测序、谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2560 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization analysis of inflammatory biomarkers and hepatocellular carcinoma risk: genetic causality and single-cell transcriptomics
2025-Aug-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03357-7
PMID:40775116
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组学验证炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞转录组学方法系统评估炎症生物标志物与肝细胞癌的因果关系 | 样本量有限（仅4个HCC样本），需要更大规模研究验证 | 探究炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 肝细胞癌患者和炎症生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | MR Egger，加权中位数，逆方差加权，加权模式，简单模式 | 遗传数据，单细胞转录组数据 | 4个肝细胞癌样本（BT1306，BT1307，scrSOL004，scrSOL006） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |