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当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2026-02-10 |
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341839
PMID:41650015
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了STING激活通过介导NLRP3相关的细胞焦亡，从而加剧心肌缺血再灌注损伤 | 首次整合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学，系统阐明了STING-NLRP3轴在心肌缺血再灌注损伤中调控细胞焦亡的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，其在人类患者中的直接适用性仍需进一步临床验证 | 探究心肌缺血再灌注损伤中细胞焦亡的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注模型、人心肌细胞缺氧/复氧模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和人心肌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2542 | 2026-02-10 |
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342306
PMID:41650163
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了OTU去泛素化酶5（OTUD5）与线粒体抗病毒信号蛋白（MAVS）在原发性胆汁性胆管炎（PBC）先天免疫中的相互作用机制 | 首次结合微阵列、scRNA-seq和蛋白质组学分析，在PBC患者中鉴定出OTUD5与MAVS在单核巨噬细胞亚群11中的过表达及其相互作用，并验证了OTUD5敲低对MAVS表达的抑制作用 | 样本量相对较小（16例PBC患者组织，10例健康对照），且主要基于外周血和细胞系研究，缺乏更深入的体内功能验证 | 探索OTUD5在PBC发病机制中的作用，并开发靶向治疗策略 | 原发性胆汁性胆管炎（PBC）患者的外周血样本、肝组织以及RAW264.7细胞系 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 微阵列、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | 16例PBC患者组织样本，10例健康对照组织样本，以及PBC患者和健康对照的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2543 | 2026-02-10 |
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2025-Dec-31, Rejuvenation research
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15491684251403435
PMID:41457786
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研究论文 | 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析，识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 结合多组织表达数量性状位点、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架，从外周和中枢组织角度系统识别并验证了KOA的潜在治疗靶点 | 需要未来进一步实验验证所识别靶点在KOA中的作用机制 | 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 膝骨关节炎 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 表达数量性状位点分析、孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、遗传信息空间映射 | 孟德尔随机化模型、gsMap框架 | 基因组关联研究数据、空间转录组学数据、蛋白质定量性状位点数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | E16.5小鼠胚胎组织的空间转录组学 |
| 2544 | 2026-02-10 |
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-025-06677-8
PMID:41460373
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞分析，探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 | 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合，在牙周炎中进行系统性生物标志物鉴定，并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键基因的表达模式 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的实验验证和前瞻性临床研究来确认生物标志物的临床效用 | 识别和表征牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的关键生物标志物，以深入理解其分子机制 | 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | 机器学习（Boruta算法，LASSO回归，递归特征消除） | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个牙周炎数据集（包括GSE16134， GSE10334， GSE152042） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2545 | 2026-02-10 |
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2025-Dec-15, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
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研究论文 | 本研究通过高灵敏度单细胞转录组分析，定义了毛囊干细胞及其微环境中多种细胞类型的转录组特征，并揭示了细胞间通讯网络 | 首次通过流式分选结合高灵敏度转录组测序，对毛囊微环境中四种相邻区域的六种细胞群体进行系统分析，实现了前所未有的基因检测灵敏度 | 研究基于小鼠背部皮肤样本，人类数据的验证仍需进一步研究 | 揭示毛囊干细胞及其微环境的分子特征和信号相互作用机制 | 小鼠背部皮肤中的毛囊乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮细胞、毛囊上皮细胞和真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞分选 | NA | 转录组数据 | 从小鼠背部4个相邻区域分选的6种细胞群体，共56个全转录组测量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2546 | 2026-02-10 |
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66446-9
PMID:41309646
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研究论文 | 本研究探讨了成年上皮细胞在再生过程中命运可塑性的调控机制，揭示了HIF1a-SOX9轴作为限制细胞身份转换的关键屏障 | 首次发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子，并证明解除再生屏障可促进食管细胞向皮肤细胞的谱系转换 | 研究基于3D再生培养系统，可能无法完全模拟体内复杂环境；谱系转换效率较低，机制仍需进一步验证 | 探究成年上皮细胞命运可塑性的调控机制及再生过程中的谱系转换限制因素 | 成年食管上皮细胞与真皮基质细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2547 | 2026-02-10 |
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64750-y
PMID:41193429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术，揭示了牛感染布氏锥虫时存在隐秘的传播适应性血流形式，挑战了基于啮齿动物模型的传统假设 | 首次在牛的低寄生虫血症水平下，通过单细胞转录组学识别出具有细长型和粗短型相关转录组的混合寄生虫群体，揭示了宿主特异性差异 | 研究主要基于牛和鼠类感染模型，可能未完全覆盖所有自然宿主或环境条件下的寄生虫行为，且形态学标记蛋白表达未在粗短型样寄生虫中检测到 | 探究布氏锥虫在自然宿主（牛）中的发育和传播机制，特别是低寄生虫血症条件下的形式分化 | 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的寄生虫群体，包括其转录组和形态特征 | 寄生虫学与传染病学 | 非洲动物锥虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、显微镜观察 | NA | 转录组数据、图像数据 | 牛和鼠类感染样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2548 | 2026-02-10 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.25.650540
PMID:40654702
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性测序，揭示了十三纹地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 发现了视锥细胞不仅来源于早期神经祖细胞，还来源于晚期神经祖细胞，这种延长生成期由转录因子表达的异时性转变驱动 | 未明确说明样本数量，且机制验证主要在基因表达层面，缺乏更深入的体内功能验证 | 探究地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 | 十三纹地松鼠的视网膜发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2549 | 2026-02-10 |
TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073
PMID:40065693
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TrAGEDy的新方法，用于对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，避免错误整合步骤 | TrAGEDy能够处理不对称生物过程的轨迹对齐，优于现有工具，在模拟和真实数据中均表现更优 | NA | 开发一种方法以对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，用于比较不同生物过程 | T细胞和布氏锥虫血流形式的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2550 | 2026-02-10 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.634947
PMID:39975181
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研究论文 | 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加通过VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 揭示了肝动脉缓冲反应诱导的动脉血流增加通过VCAM-1介导的巨噬细胞招募和Spp1+巨噬细胞驱动纤维化的新机制 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；未涉及长期疾病进展或治疗干预的评估 | 探究门脉高压中肝动脉血流增加导致门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型中的肝脏组织、巨噬细胞和门脉成纤维细胞 | NA | 门脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA-FISH、微CT、免疫细胞分析、转录组分析 | NA | 图像数据、转录组数据、血流动力学数据 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2551 | 2026-02-10 |
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38567
PMID:39403515
|
研究论文 | 本文评估了五种监督机器学习算法在自动注释肾脏单细胞和单核RNA测序数据中细胞类型的性能 | 首次系统比较了五种监督分类方法在肾脏scRNA-seq和snRNA-seq数据中的细胞类型注释性能，并展示了跨数据集和测序技术的高准确性 | 研究样本数量有限，且当模型主要在scRNA-seq数据上训练并测试于snRNA-seq数据时，性能有所下降 | 开发自动细胞类型注释方法以替代耗时的手动注释，促进肾脏疾病细胞机制研究 | 肾脏细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 支持向量机, 随机森林, 多层感知器, k近邻, 极端梯度提升 | RNA测序数据 | 79个肾脏活检样本中的62,120个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 2552 | 2026-02-10 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在海洋无脊椎动物研究中的应用、关键发现及未来挑战 | 首次系统性地综合了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的文献，提供了关于细胞类型组成、动态过程响应及细胞类型进化等方面的关键见解，并讨论了跨实验和跨物种数据比较的挑战 | 本文为综述性文章，不涉及原始数据分析，主要基于现有文献进行综合评述，未提出新的实验方法或模型 | 综述海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状、关键发现、挑战及未来方向 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2553 | 2026-02-10 |
The developmental hierarchy and scarcity of replicative slender trypanosomes in blood challenges their role in infection maintenance
2023-10-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306848120
PMID:37824530
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研究论文 | 本文通过实验证明，在小鼠急性和慢性感染中，布氏锥虫的发育性细胞周期停滞是不可逆的，并揭示了细胞周期停滞和可逆性粗短样转录组出现的时间层次，同时发现感染建立后血液中增殖寄生虫异常稀少 | 首次实验证实布氏锥虫发育性细胞周期停滞在血液中不可逆，揭示细胞周期停滞与转录组变化的时间层次，并挑战了血液中增殖寄生虫在维持感染中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类或其他哺乳动物宿主中的情况；单细胞转录组分析可能受技术限制影响 | 探究布氏锥虫在哺乳动物宿主中的发育动态、细胞周期停滞的不可逆性及其在感染维持中的作用 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）在血液中的不同形态阶段（细长型和粗短型） | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2554 | 2026-02-10 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，对布氏锥虫的血液期和原循环期细胞周期进行了高分辨率转录组分析 | 首次在无需细胞分选或同步化的情况下，通过单细胞转录组学获得了两种生命形式的高分辨率细胞周期调控转录组；开发了适用于冷冻保存样本的高效冻融方案 | 研究主要基于转录组层面，蛋白质功能验证和调控机制研究有待深入 | 解析布氏锥虫不同生命阶段的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫的血液期和原循环期细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断计算模型 | 单细胞转录组数据 | 未同步化的细胞群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2555 | 2026-02-10 |
Aging alters the epigenetic asymmetry of HSC division
2018-09, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2003389
PMID:30235201
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研究论文 | 本文探讨了造血干细胞（HSCs）分裂中表观遗传不对称性随衰老的变化 | 通过综合配对子细胞分析（包括单细胞3D共聚焦成像、单细胞移植、单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq），揭示了HSCs分裂结果与有丝分裂前极性状态的强关联，并发现衰老非极性HSCs优先进行自我更新的对称分裂，而年轻极性HSCs优先进行不对称分裂 | 未明确提及具体局限性 | 研究衰老如何改变HSCs分裂的表观遗传不对称性及其机制 | 造血干细胞（HSCs） | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞3D共聚焦成像, 单细胞移植 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2556 | 2026-02-10 |
CaSTLe - Classification of single cells by transfer learning: Harnessing the power of publicly available single cell RNA sequencing experiments to annotate new experiments
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0205499
PMID:30304022
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CaSTLe的基于迁移学习的单细胞RNA测序数据细胞分类方法，通过利用已标注的公共数据集来注释新实验中的细胞类型 | 开发了基于稳健特征工程和XGBoost分类模型的迁移学习框架，能够在基因数量极少的情况下实现准确的细胞类型分类，并适用于大规模数据集 | 方法依赖于先前标注数据集的可用性和质量，且未在多种复杂疾病或组织类型中进行广泛验证 | 通过迁移学习自动标注单细胞RNA测序数据中的细胞类型，以克服传统手动聚类或FACS方法的局限性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2557 | 2026-02-09 |
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01753-y
PMID:41642399
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综述 | 本文回顾了乳腺癌脑转移的最新研究进展，重点探讨了转移机制、肿瘤微环境相互作用、受体不一致性、诊断创新和治疗策略 | 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、c-MYC、PI3K/AKT/mTOR和RET在BCBM进展中的作用，并引入了液体活检、空间转录组学和放射组学等新兴诊断工具 | 机器学习的外部验证有限，未来需要标准化诊断平台并在前瞻性试验中测试受体重新评估的生存影响 | 阐明乳腺癌脑转移的机制并指导精准管理 | 乳腺癌脑转移的分子机制、肿瘤微环境相互作用及诊断治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 液体活检、空间转录组学、放射组学、机器学习 | 机器学习 | 分子数据、影像数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2558 | 2026-02-09 |
Integrating single-nucleus barcoding with spatial transcriptomics via Stamp-seq to reveal immunotherapy response-enhancing functional modules in NSCLC
2026-Feb-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00861-6
PMID:41644517
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研究论文 | 开发了一种名为Stamp-seq的方法，结合单核条形码与空间转录组学，以揭示非小细胞肺癌中增强免疫治疗响应的功能模块 | Stamp-seq利用定制高密度DNA测序芯片，通过限制酶可切割的空间条形码标记单核，实现单细胞分辨率、精确亚型分类和空间映射，成本降低 | 未在摘要中明确提及具体限制，但暗示传统空间转录组技术存在细胞边界推断、基因检测低和成本高的问题 | 揭示非小细胞肺癌中免疫治疗响应的空间细胞生态系统和功能模块 | 非小细胞肺癌组织中的单核细胞，特别是IGHG1浆细胞及其相关细胞群落 | 空间转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单核条形码与空间转录组学整合技术 | NA | 空间转录组数据 | 未在摘要中指定具体样本数量 | NA | 单核条形码，空间转录组学 | 定制高密度DNA测序芯片 | Stamp-seq芯片，空间条形码分布密度为1.6微米，实现单细胞分辨率 |
| 2559 | 2026-02-09 |
Single cell atlas decodes the molecular dynamics of scar repair after human rotator cuff tear
2026-Feb-05, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00501-5
PMID:41644521
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了人类肩袖撕裂后瘢痕修复的分子动态，揭示了纤维化瘢痕微环境的细胞和分子图谱 | 首次在人类肩袖撕裂样本中应用单细胞RNA测序技术，系统解析了纤维化瘢痕微环境的异质性细胞亚群及其分子机制，并识别了骨桥蛋白和TGF-β信号通路作为关键驱动因子 | 研究样本来源于患者手术切除组织，可能无法完全反映瘢痕形成的早期动态过程；样本量相对有限 | 探究人类肩袖撕裂后不可逆纤维化瘢痕形成的细胞和分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 肩袖撕裂患者的肌腱残端组织 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者肩袖撕裂肌腱残端组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2560 | 2026-02-09 |
A peripheral glial niche orchestrates the early stages of skin wound healing
2026-Feb-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.015
PMID:41512873
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤外周神经中的修复胶质细胞通过形成促修复微环境，在急性皮肤伤口愈合早期阶段调控免疫反应和成纤维细胞功能 | 首次发现外周神经中的修复胶质细胞在皮肤伤口愈合早期发挥关键调控作用，通过分泌CCL2等单核细胞趋化蛋白招募巨噬细胞，协调免疫反应和成纤维细胞转化 | 研究主要关注急性皮肤伤口模型，慢性伤口或其他组织类型的修复过程是否适用尚需验证 | 阐明皮肤伤口愈合早期阶段的细胞调控机制 | 小鼠皮肤急性伤口模型中的修复胶质细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 多重成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |