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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2026-03-03 |
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00654-x
PMID:41593100
|
研究论文 | 本研究开发了一种空间通量平衡分析（spFBA）框架，用于从空间转录组数据中估计代谢通量，揭示了结直肠癌和肾癌中的异质性代谢特征 | 提出了spFBA框架，首次将空间约束整合到代谢通量分析中，能够从空间转录组数据中推断相对代谢通量，揭示了传统基因表达分析无法检测的代谢程序 | 该方法依赖于相对代谢通量估计，可能无法提供绝对通量值；且需要空间转录组数据作为输入，限制了其在非空间数据中的应用 | 研究空间约束如何塑造癌症代谢，并开发新方法从空间转录组数据中揭示代谢异质性 | 结直肠癌（CRC）的原发肿瘤和肝转移样本，以及肾癌样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌，肾癌 | 空间转录组学，通量平衡分析（FBA） | 空间通量平衡分析（spFBA）框架 | 空间转录组数据 | 新生成的高分辨率配对结直肠癌原发肿瘤和肝转移数据集，以及独立的公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2542 | 2026-03-03 |
Single nuclei and spatial profiling of sacrococcygeal teratomas reveals cellular composition and X inactivation heterogeneity
2026-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01262-4
PMID:41565739
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研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了骶尾部畸胎瘤的细胞组成、异质性以及X染色体失活状态与细胞身份之间的联系 | 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单细胞核RNA测序与空间转录组学进行分析，揭示了肿瘤的细胞谱系异质性，并发现了女性肿瘤细胞中存在X染色体双等位基因表达现象及其与细胞身份和免疫景观的关联 | 样本量较小（仅8例肿瘤），且未能在研究中检测到假定的多能性细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制以及性别偏好的分子基础 | 骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 畸胎瘤 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 8例骶尾部畸胎瘤样本（6例产后：1例男性，5例女性；2例产前：均为女性） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2543 | 2026-03-03 |
Age-dependent immune responses and resident cell dynamics in young mice following pneumonia
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114219
PMID:41488789
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序，揭示了幼鼠肺炎后年龄依赖的免疫反应和肺驻留细胞动态，强调了早期免疫发育对疾病易感性的影响 | 首次在幼鼠模型中，结合单细胞和批量RNA测序技术，全面绘制了新生儿与幼年鼠肺驻留细胞的转录组图谱，并揭示了年龄特异性免疫动态与健康结局的关联 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且未探讨长期免疫后果或具体治疗干预 | 探究年龄特异性免疫动态与未成熟肺健康结局差异的关联 | 新生和幼年小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及新生和幼年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2544 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性，并识别了亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构，并开发了专门的人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其分子机制 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2545 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，系统探究了乳酸代谢在PDAC肿瘤微环境中的具体角色，并构建了基于机器学习的新型预后模型 | 样本量相对有限（8个PDAC样本），且研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质或代谢组层面的验证 | 探究乳酸代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中的作用机制及其临床意义 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者肿瘤组织中的恶性细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高通量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 集成机器学习（StepCox + Enet） | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 92名PDAC患者（ICGC队列），另有多组验证队列（GSE28735: 45例，GSE62452: 69例，GSE183795: 139例），单细胞分析涉及8个PDAC样本的50,795个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2546 | 2026-03-03 |
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1760782
PMID:41766877
|
综述 | 本文综述了乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME）的细胞、分子和代谢复杂性，并探讨了将免疫抑制性“冷”肿瘤转化为免疫反应性“热”肿瘤的免疫治疗策略 | 整合了代谢调节、基质重编程和精准联合疗法等新方向，以克服原发性和获得性耐药，并强调了结合空间转录组学和液体活检等新兴生物标志物策略 | NA | 探讨乳腺癌肿瘤免疫微环境的免疫抑制机制，并评估当前和新兴的免疫治疗方法，旨在改善治疗反应和克服耐药性 | 乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME） | NA | 乳腺癌 | 空间转录组学，液体活检 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2547 | 2026-03-03 |
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724740
PMID:41766913
|
研究论文 | 本研究通过整合组学分析和实验验证，揭示了METTL17和SLC27A1作为慢性肾脏病（CKD）的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA测序、单细胞转录组学和临床验证，系统性地鉴定了连接线粒体调控和巨噬细胞极化的关键基因METTL17和SLC27A1，并阐明了它们在CKD进展中的细胞特异性表达和细胞间通讯机制 | 研究主要基于转录组数据，蛋白质功能和调控机制需要进一步验证；动物模型为UUO模型，可能无法完全模拟人类CKD的所有病理特征 | 阐明慢性肾脏病（CKD）的分子机制，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 慢性肾脏病（CKD）患者外周血样本、单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠模型、近端肾小管细胞（PTCs）和平滑肌细胞（SMCs） | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组织化学, Western blotting | 机器学习 | 转录组数据, 临床数据, 实验数据 | CKD患者外周血样本和UUO小鼠模型（具体样本数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2548 | 2026-03-03 |
Benign, persistent, and invasive: mechanistic and translational approaches to middle‑ear cholesteatoma
2026, Exploration of targeted anti-tumor therapy
DOI:10.37349/etat.2026.1002359
PMID:41767763
|
综述 | 本文综述了中耳胆脂瘤的发病机制，并探讨了基于微环境的精准治疗策略 | 整合了单细胞转录组学、空间蛋白质组学和表观遗传学等最新机制研究，提出胆脂瘤的侵袭性源于微环境驱动而非遗传突变，为微环境导向的精准治疗提供了新视角 | 文章为综述性论文，未报告原始实验数据或具体临床研究结果，所提治疗策略大多处于临床前或早期实验阶段 | 阐明中耳胆脂瘤的发病机制并探索其转化治疗策略 | 中耳胆脂瘤（一种组织学良性但具有局部破坏性的角化鳞状上皮病变） | 数字病理学 | 耳部疾病（具体为中耳胆脂瘤） | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2549 | 2026-03-03 |
Uncovering potential molecular biomarkers for cancer-associated secondary lymphedema through integrated analyses of RNA-sequencing, machine learning, and clinical data
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1760040
PMID:41768256
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序、机器学习和临床数据分析，揭示了癌症相关继发性淋巴水肿的潜在分子生物标志物 | 首次结合RNA测序、多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据，识别出IL2RG、HOXD10和TSPAN1作为CASL的新型潜在分子标志物，并深入探讨了其与免疫细胞浸润及临床参数的关联 | 样本量相对较小（10例正常对照和40例CASL患者），且研究主要基于脂肪组织，可能无法全面反映CASL在其他组织中的分子机制 | 探索癌症相关继发性淋巴水肿的分子机制，并寻找其诊断和治疗的潜在生物标志物 | 脂肪组织样本（来自正常对照和CASL患者） | 机器学习 | 癌症相关继发性淋巴水肿 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习算法（包括SHAP解释性分析） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 50例（10例正常对照，40例CASL患者） | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2550 | 2026-03-03 |
Uncovering mitochondrial dynamics-related genes as potential diagnostic biomarkers for acute myocardial infarction
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1755024
PMID:41768570
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定出与急性心肌梗死相关的线粒体动力学基因COX7B和SNORD54作为新型诊断生物标志物 | 首次将线粒体动力学相关基因COX7B和SNORD54识别为急性心肌梗死的潜在诊断生物标志物，并通过单细胞RNA测序分析揭示了单核细胞和自然杀伤细胞的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的功能实验验证这些生物标志物的具体分子机制 | 探索急性心肌梗死中线粒体动力学相关基因作为诊断生物标志物的潜力 | 急性心肌梗死患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量，但包括急性心肌梗死和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2551 | 2026-03-03 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate vascular cell orchestration of inflammatory changes after UV light exposure in skin
2025-Dec-17, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.024
PMID:41419052
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了紫外线照射后皮肤中血管细胞协调炎症变化的机制 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统解析了UVB照射后皮肤不同层次（表皮、真皮、脂肪组织）的细胞特异性反应，并进行了跨物种（小鼠与人类）比较验证 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据为比较分析，需进一步临床验证；时间点仅关注照射后12小时，缺乏更长时间动态观察 | 阐明急性紫外线辐射对皮肤的复杂影响，特别是其在自身免疫过程（如皮肤狼疮）中的作用机制 | 小鼠皮肤组织（表皮、深层真皮、脂肪组织）及其中各类细胞（CD45免疫细胞、细胞角蛋白表皮细胞、内皮细胞、成纤维细胞） | 数字病理学 | 皮肤狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量，但基于单细胞RNA测序识别了4849个差异表达基因 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2552 | 2026-03-03 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
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研究论文 | 本研究揭示了肺细胞通过外泌体通讯在造血干细胞自我更新和移植中的重要作用 | 首次通过单细胞外泌体追踪分析和体内移植研究，发现肺细胞通过外泌体通讯调控造血干细胞稳态，挑战了传统认为仅骨髓微环境调控的观点 | 研究主要基于实验条件，在人类疾病如镰状细胞病和骨髓衰竭中的实际应用潜力仍需进一步验证 | 探究肺细胞外泌体通讯对造血干细胞自我更新和移植能力的影响及其分子机制 | 造血干细胞，特别是长期造血干细胞，以及人原代小气道上皮细胞来源的外泌体 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病，骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序，外泌体microRNA分析，蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，外泌体microRNA数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2553 | 2026-03-03 |
Mitochondrial and Glucose Metabolic Patterns in Pre-Granulosa Cells and Oocytes and Their Dysfunctions Induce Impaired Primordial Follicle Formation in Mice
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70110
PMID:41251108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠卵巢组织中前颗粒细胞和卵母细胞在糖酵解和氧化磷酸化信号通路上的动态基因表达变化，及其对原始卵泡形成的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了原始卵泡形成过程中前颗粒细胞和卵母细胞的能量代谢动态变化模式 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究原始卵泡形成过程中能量代谢的供应与需求机制 | 小鼠卵巢组织中的前颗粒细胞和卵母细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2554 | 2026-03-03 |
LogicSR: prior-guided symbolic regression for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf621
PMID:41269283
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研究论文 | 本文提出了一种名为LogicSR的计算框架，用于从单细胞转录组数据中高精度重建基因调控网络 | 将布尔逻辑模型的机制可解释性与符号回归的方程发现能力相结合，并利用先验知识通过多目标蒙特卡洛树搜索框架确保生物学合理性并加速最优调控方程的搜索 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于单细胞数据的稀疏性和噪声，以及动态组合调控的复杂性 | 从单细胞转录组数据中推断基因调控网络，以揭示基因调控机制 | 基因调控网络，特别是转录因子与靶基因之间的复杂组合调控 | 系统生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 布尔逻辑模型，符号回归，蒙特卡洛树搜索 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2555 | 2026-03-03 |
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70117
PMID:41288006
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评论 | 本文对Zeng等人（2025年）利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤的研究进行了前瞻性展望和批判性审视，强调了从单细胞图谱到功能验证的关键后续步骤 | 提出了对单细胞测序研究中计算预测的旁分泌网络（如Angptl4-Sdc4轴）进行严格体内功能验证的必要性，并探讨了靶向尖端细胞治疗策略中的治疗困境 | 评论文章本身不产生新数据，主要基于对现有研究的分析和展望；未提供具体的实验验证方案 | 批判性审视单细胞测序在脊髓损伤研究中的应用，提出从描述性见解向机制理解和治疗策略转化的关键挑战 | 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2556 | 2026-03-03 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1在缺血诱导的视网膜病变（OIR）小鼠模型中的作用，发现Epac1缺失可减轻Müller胶质细胞的病理性激活，并缓解视网膜神经变性 | 揭示了Epac1通过调节Müller细胞中的VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新作用机制 | 研究基于小鼠OIR模型，其发现向人类疾病的转化仍需进一步验证 | 探究Epac1在缺血诱导视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变（OIR）模型中的视网膜组织，特别是Müller胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫染色、qPCR、Western blot、邻近连接分析 | 小鼠遗传缺失模型（Epac1敲除） | 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质印迹数据 | 未明确说明具体数量的小鼠OIR模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2557 | 2026-03-03 |
Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium
2025-Sep-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611
PMID:40882639
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研究论文 | 本研究利用CITE-seq技术对成人视网膜色素上皮细胞进行单细胞转录组和表面组分析，揭示了其亚群的多样性、空间分布和功能差异 | 首次结合单细胞转录组和表面蛋白标记（CITE-seq）对成人RPE进行综合分析，发现了具有独特空间模式和功能的新亚群，并验证了培养过程中亚群的保留情况 | 研究主要基于成人样本，未涵盖发育或疾病状态下的RPE变化；样本量相对有限 | 探索成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其对视网膜生物学和细胞治疗的意义 | 成人视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | CITE-seq（转录组和表面蛋白标记测序），免疫组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据，表面蛋白数据，图像数据 | 成人RPE细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，表面蛋白检测 | NA | NA |
| 2558 | 2026-03-03 |
High-resolution spatial transcriptomics in fixed tissue using a cost-effective PCL-seq workflow
2025-Sep-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279906.124
PMID:40764053
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PCL-seq的高分辨率空间转录组学方法，适用于固定组织，具有成本效益 | 采用光控DNA标记策略和光裂解寡核苷酸，实现亚细胞分辨率，并兼容FFPE组织 | NA | 开发一种高分辨率、成本效益高的空间转录组学工作流程 | 小鼠胚胎的冷冻和FFPE组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎组织（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | PCL-seq工作流程 | 使用光裂解寡核苷酸和连接适配器，通过显微镜控制的光照指定感兴趣区域 |
| 2559 | 2026-03-03 |
Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
PMID:40550901
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研究论文 | 本研究探讨了Pten缺失如何通过先天免疫和NF-κB通路调控前列腺基底细胞的可塑性、重编程和肿瘤起始 | 揭示了Pten缺失导致基底细胞以区域化方式重编程为hillock样状态，并进展为近端样管腔状态，最终形成侵袭性肿瘤，且这一过程与先天免疫激活相关 | NA | 研究前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子机制 | 前列腺基底细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 原位表征 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据, 原位图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 2560 | 2026-03-03 |
Single-Cell Sequencing-Based Exploration of the Role of Tip Cells on Astrocytes and Macrophages After Spinal Cord Injury
2025-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70088
PMID:40891625
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和体外实验，探讨了尖端细胞在脊髓损伤后对星形胶质细胞和巨噬细胞的作用 | 揭示了尖端细胞通过Angptl4-Sdc4配体-受体通路调控星形胶质细胞迁移和巨噬细胞极化，并首次报道其在脊髓损伤中的核糖体蛋白表达特征 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探索脊髓损伤后尖端细胞对炎症微环境中星形胶质细胞和巨噬细胞的影响 | 尖端细胞、星形胶质细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |