单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27109 篇文献，本页显示第 25561 - 25580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25561 | 2024-08-09 |
Mapping human pluripotent stem cell-endothelial cell differentiation using scRNA-seq: a step towards therapeutic angiogenesis
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz464
PMID:31263875
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25562 | 2024-08-09 |
Proteomics and single-cell RNA analysis of Akap4-knockout mice model confirm indispensable role of Akap4 in spermatogenesis
2019-10-15, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2019.06.017
PMID:31255637
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9系统生成Akap4敲除小鼠模型，并利用蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，证实了Akap4在精子发生中的不可或缺的作用 | 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，全面分析了Akap4敲除小鼠的精子形态、运动能力和生育能力的变化 | NA | 验证Akap4在精子发生中的作用 | Akap4敲除小鼠的精子形态、运动能力和生育能力 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统，蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据，单细胞RNA测序数据 | Akap4敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 25563 | 2024-08-09 |
Matrix-metalloproteinase expression and gelatinase activity in the avian retina and their influence on Müller glia proliferation
2019-10, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2019.112984
PMID:31251936
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研究论文 | 本研究探讨了兴奋性毒性损伤后鸟类视网膜中明胶酶活性的动态变化及其对Müller胶质细胞前体细胞形成的影响 | 首次揭示了MMP2在Müller胶质细胞向Müller胶质细胞前体细胞重编程中的作用 | NA | 研究明胶酶在视网膜再生中的作用 | 鸟类视网膜中的明胶酶活性和Müller胶质细胞前体细胞的形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鸟类视网膜中的多种细胞类型，包括少突胶质细胞、非星形内视网膜胶质细胞（NIRG）、小胶质细胞、Müller胶质细胞（MG）等 |
| 25564 | 2024-08-09 |
CD166 Engagement Augments Mouse and Human Hematopoietic Progenitor Function via Activation of Stemness and Cell Cycle Pathways
2019-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3053
PMID:31260147
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研究论文 | 本文研究了CD166在鼠和人类造血祖细胞功能中的增强作用，通过激活干细胞和细胞周期通路 | 首次展示了CD166同型相互作用在体外增强鼠和人类造血祖细胞生成的能力，并通过单细胞RNA测序分析揭示了CD166参与激活多种信号通路 | NA | 探讨CD166在维持干细胞/祖细胞功能中的作用 | 鼠和人类的造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自野生型和CD166敲除小鼠的LSK细胞以及人脐带血CD34细胞 |
| 25565 | 2024-08-09 |
Nondestructive Identification and Accurate Isolation of Single Cells through a Chip with Raman Optical Tweezers
2019-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b01604
PMID:31251569
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研究论文 | 本文设计了一种利用拉曼光学镊子（ROT）的芯片，用于非破坏性地识别和精确隔离特定单个细胞 | 该平台能够进一步结合其他单细胞技术，如单细胞测序，成为一种多角度的单细胞分析方法 | NA | 开发一种新的芯片技术，用于单细胞的识别和隔离 | 胃癌细胞BGC823、红细胞、淋巴细胞等不同类型的细胞 | 生物技术 | 胃癌 | 拉曼光学镊子（ROT） | NA | 细胞 | 四种不同类型的细胞，包括胃癌细胞BGC823、红细胞、淋巴细胞等 |
| 25566 | 2024-08-09 |
De novo prediction of cell-type complexity in single-cell RNA-seq and tumor microenvironments
2019-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.201900443
PMID:31266885
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据分析方法，用于无监督预测细胞类型复杂度和肿瘤微环境中的异质性深度 | 本文引入了一种结合非负矩阵分解和贝叶斯模型比较的方法，无需使用经验参数或间接质量指标即可直接评估样本中子群的数量 | NA | 开发一种新的算法，用于准确预测单细胞RNA测序数据中的细胞类型复杂度和肿瘤微环境中的异质性 | 单细胞RNA测序数据和肿瘤微环境中的细胞类型异质性 | 生物信息学 | 肿瘤学 | 非负矩阵分解 | 贝叶斯模型比较 | 单细胞RNA测序数据 | 包括模拟数据、初级血液单核细胞和胰腺细胞数据以及一系列单细胞肿瘤样本 |
| 25567 | 2024-08-09 |
Neutrophils Driving Unconventional T Cells Mediate Resistance against Murine Sarcomas and Selected Human Tumors
2019-07-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.047
PMID:31257026
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研究论文 | 本文通过遗传学方法和细胞转移技术，发现中性粒细胞在抵抗3-甲基胆蒽诱导的致癌作用中起关键作用，并与非典型αβ T细胞（UTC）的极化和I型免疫反应有关。 | 首次揭示了中性粒细胞在抵抗肿瘤中的关键作用，并通过批量和单细胞RNA测序分析了UTC的先天性特征和多样性。 | NA | 研究中性粒细胞在抵抗肿瘤中的作用及其机制。 | 中性粒细胞、非典型αβ T细胞（UTC）、3-甲基胆蒽诱导的致癌作用及选择性人类肿瘤。 | NA | 肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25568 | 2024-08-09 |
Identification of Genes With Enriched Expression in Early Developing Mouse Cone Photoreceptors
2019-07-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.19-26951
PMID:31260032
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研究论文 | 本文研究了小鼠早期发育的视锥光感受器中富集表达的基因 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了在小鼠早期发育的视锥光感受器中富集表达的新基因 | NA | 旨在识别在小鼠胚胎视锥光感受器中差异表达的基因，以了解视锥和视杆光感受器的分化过程 | 小鼠早期发育的视锥光感受器中的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和鸡的视网膜样本 |
| 25569 | 2024-08-09 |
Polled Digital Cell Sorter (p-DCS): Automatic identification of hematological cell types from single cell RNA-sequencing clusters
2019-Jul-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-2951-x
PMID:31262249
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Polled Digital Cell Sorter (p-DCS)的计算工具，用于自动识别单细胞RNA测序簇中的血液细胞类型 | 该工具使用投票算法自动识别细胞类型，无需专家手动解读，并能处理多个scRNA-seq数据集 | NA | 开发一种自动化的方法来识别单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的血液细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 投票算法 | 基因表达数据 | 8个骨髓样本 |
| 25570 | 2024-08-09 |
Recharacterizing Tumor-Infiltrating Lymphocytes by Single-Cell RNA Sequencing
2019-07, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-18-0658
PMID:31262773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术重新表征肿瘤浸润淋巴细胞（TIL），特别是T细胞的异质性、克隆扩增、迁移和功能状态转换等基本特性 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤内免疫细胞，特别是T细胞亚群的详细特性，并探讨了新的T细胞标志物在治疗或预后中的潜力 | NA | 深入理解肿瘤浸润淋巴细胞的异质性和功能状态转换 | 肿瘤浸润淋巴细胞，特别是T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 25571 | 2024-08-09 |
Obesity remodels activity and transcriptional state of a lateral hypothalamic brake on feeding
2019-06-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax1184
PMID:31249056
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研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA测序和纵向体内双光子钙成像技术，研究了肥胖小鼠模型中侧下丘脑区域（LHA）的功能改变，该区域是调节进食的高度保守脑区。 | 首次揭示了肥胖如何影响侧下丘脑区域（LHA）的谷氨酸能神经元的转录谱和功能，以及这种改变如何促进过度进食和肥胖。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于人类。 | 探讨肥胖如何通过神经适应性改变侧下丘脑区域（LHA）的功能，从而影响进食行为。 | 侧下丘脑区域（LHA）的谷氨酸能神经元及其在肥胖状态下的功能和转录状态。 | 神经科学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序，双光子钙成像 | NA | 转录组数据，钙成像数据 | 小鼠模型 |
| 25572 | 2024-08-09 |
Developmental kinetics and transcriptome dynamics of stem cell specification in the spermatogenic lineage
2019-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10596-0
PMID:31243281
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研究论文 | 本文通过多转基因报告小鼠模型、单细胞RNA测序和移植分析，研究了哺乳动物精子发生系中干细胞特化的发育动力学和转录组动态 | 揭示了从胎儿期前体细胞到新生儿期精原细胞的异质性前体细胞群在晚期胎儿和新生儿发育期间的动态变化，并证明了胎儿期前体细胞中存在预编程的干细胞命运 | NA | 定义从前体细胞到精原干细胞的轨迹 | 哺乳动物精子发生系中的干细胞特化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多转基因报告小鼠模型 |
| 25573 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Developmental Origins and Ontogenetic Stability of Neurexin Alternative Splicing Profiles
2019-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.05.090
PMID:31242409
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探讨了小鼠成熟和胚胎细胞中neurexin多样性的起源及其在发育过程中的稳定性 | 发现了发育相关细胞中共享的neurexin表达模式，并展示了neurexin表达模式在早期发育阶段确定并在神经元成熟过程中保持不变 | NA | 揭示neurexin替代剪接模式的发育起源和个体发生稳定性 | neurexin的替代剪接模式及其在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多组小鼠成熟和胚胎细胞 |
| 25574 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq: Introduction to Bioinformatics Analysis
2019-06, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.92
PMID:31237421
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（RNA-seq）数据的生物信息学分析流程 | 提供了当前公开可用的计算工具来分析单细胞RNA-seq数据，并专注于单细胞转录组异质性的解释以及细胞簇和簇间差异表达基因的识别 | NA | 探索细胞群体的异质性并理解不同细胞中的分子机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25575 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of lupus nephritis
2019, Lupus science & medicine
IF:3.7Q1
DOI:10.1136/lupus-2019-000329
PMID:31245017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在理解狼疮和狼疮性肾炎分子发病机制中的应用 | scRNA-seq技术的高通量特性加速了生物系统和疾病中的发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在狼疮和狼疮性肾炎研究中的应用 | scRNA-seq技术及其在狼疮和狼疮性肾炎中的应用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 25576 | 2024-08-09 |
CHETAH: a selective, hierarchical cell type identification method for single-cell RNA sequencing
2019-09-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz543
PMID:31226206
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CHETAH的单细胞RNA测序细胞类型识别方法，该方法通过层次分类技术，能够快速且准确地识别细胞类型，并提供中间或未分类的选项 | CHETAH算法在处理未知类型的细胞时具有更高的特异性，如在肿瘤样本中能够准确识别出恶性细胞，并将其标记为中间或未分类 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序细胞类型识别方法，以提高细胞类型识别的准确性和特异性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次分类 | 基因表达数据 | NA |
| 25577 | 2024-08-09 |
Cellular crosstalk in the development and regeneration of the respiratory system
2019-09, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-019-0141-3
PMID:31217577
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综述 | 本文综述了呼吸系统在发育和再生过程中细胞间相互作用的研究进展 | 利用单细胞测序技术、细胞和组织成像以及细胞谱系追踪等新技术的进展，揭示了呼吸系统细胞和功能异质性比预期更高且高度适应 | NA | 探讨协调呼吸系统发育和再生的细胞间相互作用 | 呼吸系统的细胞相互作用及其在发育、环境交互和损伤响应中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 25578 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Chemotaxis-Mediated Intraorgan Crosstalk During Cardiogenesis
2019-08-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315243
PMID:31221018
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了心脏发育过程中不同心脏前体细胞（CP）分化层次的全景图，并探讨了化学趋化介导的器官内对话在心脏形成中的作用 | 首次展示了心脏前体细胞在不同胚胎发育阶段的单细胞转录组全景图，并揭示了化学趋化因子在心脏发育中的关键作用 | NA | 探讨心脏发育过程中器官内通信如何控制心脏不同解剖区域的顺序构建 | 心脏前体细胞（CP）的分化过程及其在心脏发育中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 胚胎发育不同阶段的Nkx2-5和Isl1谱系细胞 |
| 25579 | 2024-08-09 |
Characteristics of Waldenström Macroglobulinemia in Korean Patients According to Mutational Status of MYD88 and CXCR4: Analysis Using Ultra-Deep Sequencing
2019-08, Clinical lymphoma, myeloma & leukemia
DOI:10.1016/j.clml.2019.03.009
PMID:31221512
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研究论文 | 本研究探讨了韩国Waldenström巨球蛋白血症（WM）患者中MYD88和CXCR4突变状态的特征，并使用超深度测序技术进行了分析。 | 本研究首次在亚洲WM患者中详细分析了MYD88和CXCR4的突变频率及其临床特征，并使用超深度测序技术检测了Sanger测序无法检测到的CXCR4突变。 | 研究样本量较小，仅包括31名患者，可能影响结果的普遍性。 | 研究韩国WM患者中MYD88和CXCR4突变状态的特征，并探讨这些突变对疾病的影响。 | 研究对象为韩国WM患者，重点关注MYD88和CXCR4的突变状态及其对疾病特征的影响。 | 数字病理学 | Waldenström巨球蛋白血症 | 超深度测序 | NA | DNA序列 | 31名患者 |
| 25580 | 2024-08-09 |
Enhancement of LIN28B-induced hematopoietic reprogramming by IGF2BP3
2019-08-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.325100.119
PMID:31221665
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，研究了Lin28b和Igf2bp3在诱导成人造血干细胞和祖细胞（HSPCs）向胎儿模式重编程中的相互作用和机制 | 发现Lin28b和Igf2bp3共同表达能更有效地在体内重新激活胎儿样B细胞发育，形成一个自调节环，稳定数千个mRNA | NA | 探索Lin28b和Igf2bp3在重编程成人HSPCs向胎儿模式中的作用，以及这种重编程方法在基础研究和临床应用中的潜力 | 成人造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | 生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | NA | RNA | NA |