单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 25521 - 25540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25521 | 2024-08-09 |
Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference
2019-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1865-2
PMID:31836005
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研究论文 | 本文介绍了Vireo，一种用于无基因型参考的池化单细胞RNA测序数据贝叶斯解复用的计算高效模型 | Vireo模型可以在只有部分或没有基因型信息的情况下应用，这是其独特之处 | NA | 解决现有解复用策略依赖完整基因型数据的局限性 | 池化单细胞RNA测序数据的解复用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | RNA测序数据 | NA |
| 25522 | 2024-08-09 |
GCN2 drives macrophage and MDSC function and immunosuppression in the tumor microenvironment
2019-12-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax8189
PMID:31836669
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研究论文 | 研究探讨了GCN2在肿瘤微环境中对巨噬细胞和髓源抑制细胞（MDSCs）功能及免疫抑制作用的影响 | 揭示了GCN2在肿瘤免疫反应中的新作用，即通过调控巨噬细胞和MDSCs的表型促进抗肿瘤免疫 | NA | 探究GCN2在肿瘤免疫反应中的作用及其机制 | GCN2在肿瘤微环境中对巨噬细胞和髓源抑制细胞（MDSCs）的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类样本 |
| 25523 | 2024-08-09 |
Molecular determinants of nephron vascular specialization in the kidney
2019-12-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12872-5
PMID:31836710
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研究论文 | 本文通过高通量批量和单细胞RNA测序技术，研究了肾脏非淋巴管内皮细胞中的分子途径，以识别从胚胎到成年期间决定血管分区的分子途径。 | 首次揭示了肾脏血管特异性标志物，包括特定的转录因子、离子通道、溶质转运体和血管分泌因子，这些因子协调肾脏功能。 | NA | 解析肾脏血管标志物的分子决定因素，为重建肾单位和揭示肾脏疾病的发病机制奠定基础。 | 肾脏的非淋巴管内皮细胞 | NA | 肾脏疾病 | 高通量批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 25524 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptional signatures of the human placenta in term and preterm parturition
2019-12-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.52004
PMID:31829938
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了足月和早产分娩中人类胎盘的细胞类型组成和转录活性 | 首次鉴定出两种细胞类型：绒毛膜羊膜中的淋巴内皮蜕膜细胞和胎盘绒毛中的非增殖性间质细胞滋养层细胞 | NA | 填补对生理和病理性分娩中胎盘细胞类型组成和转录活性的知识空白 | 人类胎盘的绒毛树、基板和绒毛膜羊膜膜 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及足月分娩和早产分娩的女性样本 |
| 25525 | 2024-08-09 |
Exploring inflammatory signatures in arthritic joint biopsies with Spatial Transcriptomics
2019-12-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-55441-y
PMID:31831833
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜活检，以探索炎症部位的无偏 mRNA 研究 | 利用空间转录组学技术，结合高分辨率组织学图像，实现对特定细胞类型的数字化描绘，从而深入理解慢性炎症疾病中的细胞机制和多样性 | NA | 探索慢性炎症疾病中炎症部位的转录组特征 | 类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 脊柱关节炎 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | 受影响的关节滑膜组织活检 |
| 25526 | 2024-08-09 |
A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart
2019-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.025
PMID:31835037
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研究论文 | 本文通过分子方法揭示了胚胎心脏在三个发育阶段中细胞类型的全面转录景观，并将细胞类型特异性基因表达映射到特定的解剖域 | 本文利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，首次详细描绘了人类胚胎心脏发育过程中的基因表达和细胞类型分布 | NA | 深入探索人类心脏形态发生过程中器官范围的基因表达协调 | 人类胚胎心脏在三个发育阶段的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 三个发育阶段的人类胚胎心脏样本 |
| 25527 | 2024-08-09 |
Accuracy, robustness and scalability of dimensionality reduction methods for single-cell RNA-seq analysis
2019-12-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1898-6
PMID:31823809
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research paper | 本文比较了18种常用的降维方法在30个公开的单细胞RNA测序数据集上的性能 | 本文填补了单细胞RNA测序降维方法比较研究的空白 | NA | 评估不同降维方法在单细胞RNA测序数据分析中的有效性 | 18种降维方法在30个单细胞RNA测序数据集上的性能 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 30个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 25528 | 2024-08-09 |
A Galaxy-based training resource for single-cell RNA-sequencing quality control and analyses
2019-12-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giz144
PMID:31825480
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研究论文 | 本文开发了一系列实用的脚本及其相应的Galaxy包装器，使之前对scRNA-seq分析感到畏惧的研究人员能够进行scRNA-seq培训和质量控制 | 本文通过简单的命令行工具实现了“可视化-过滤-可视化”范式，并使用Loom格式在工具之间交换数据，使得scRNA-seq数据分析更加直观和易于操作 | NA | 开发易于使用的工具和培训材料，帮助研究人员掌握scRNA-seq数据的质量控制和后续分析 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析工具和培训资源 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 短读序列数据 | NA |
| 25529 | 2024-08-09 |
Semblance: An empirical similarity kernel on probability spaces
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aau9630
PMID:31840051
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研究论文 | 本文提出了一种新的相似性度量方法Semblance，该方法利用特征的经验分布来计算观测值之间的成对相似性 | Semblance是一种无分布假设的相似性度量方法，能够更重视数据分布边缘的观测对之间的相似性 | NA | 研究如何在没有明确数据概率分布的情况下，更有效地计算观测值之间的相似性 | 观测值之间的相似性度量方法 | 机器学习 | NA | NA | Mercer核 | 多种数据类型 | NA |
| 25530 | 2024-08-09 |
Characterizing smoking-induced transcriptional heterogeneity in the human bronchial epithelium at single-cell resolution
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3413
PMID:31844660
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了吸烟对人类支气管上皮细胞转录异质性的影响 | 发现了吸烟者支气管上皮细胞中毒素代谢基因的定位、组织重塑以及一个新的peri-goblet上皮亚群 | 样本量较小，仅包括12名参与者 | 探究吸烟对人类支气管上皮细胞特定细胞类型和整体组织成分的具体影响 | 人类支气管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 12名从未吸烟者和12名当前吸烟者的支气管上皮细胞 |
| 25531 | 2024-08-09 |
Advancements in Single-cell Sequencing and the Prospect of Its Forensic Application
2019-Oct, Fa yi xue za zhi
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研究论文 | 本文总结了单细胞测序技术的最新进展及其在法医学应用的前景 | 单细胞测序的超高分辨率为生命科学多个领域，包括法医基因组学，提供了新的视角和前沿 | NA | 探讨单细胞测序技术在法医学中的应用前景 | 单细胞测序技术及其在法医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA序列 | NA |
| 25532 | 2024-08-09 |
Siglecs, Novel Immunotherapy Targets, Potentially Enhance The Effectiveness of Existing Immune Checkpoint Inhibitors in Glioma Immunotherapy
2019, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S223406
PMID:31819511
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研究论文 | 本文研究了Siglec家族成员在胶质瘤免疫抑制中的作用，并探讨了它们与现有免疫检查点抑制剂联合使用的可能性 | 首次揭示了Siglec-5、-7、-9和-16在胶质瘤中的免疫抑制作用，并提出了与免疫检查点抑制剂联合使用的新策略 | NA | 研究Siglec家族成员在胶质瘤免疫治疗中的作用 | Siglec家族成员及其在胶质瘤免疫抑制中的作用 | NA | 胶质瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 1024个胶质瘤样本和1551个胶质瘤单细胞 |
| 25533 | 2024-08-09 |
Dissecting the human immune system with single cell RNA sequencing technology
2020-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5MR1019-179R
PMID:31803960
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析人类免疫系统中的最新进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术能够分析单个细胞的转录组，特别适合解析免疫细胞的异质性 | 文章提到了单细胞RNA测序技术在免疫学应用中需要克服的潜在障碍 | 促进对人类免疫学的理解 | 人类免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25534 | 2024-08-09 |
SpaCell: integrating tissue morphology and spatial gene expression to predict disease cells
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz914
PMID:31808789
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaCell的用户友好型深度学习软件，该软件能够整合组织形态学和空间基因表达数据，以预测疾病细胞 | SpaCell软件创新地整合了数百万像素强度值与数千个基因表达测量数据，提高了细胞类型识别和组织图像标签预测的分辨率和准确性 | NA | 开发一种能够整合组织形态学和空间基因表达数据以预测疾病细胞的深度学习软件 | 组织形态学和空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学(ST) | 深度学习模型 | 图像和基因表达数据 | NA |
| 25535 | 2024-08-09 |
FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1440
PMID:31796518
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研究论文 | 研究FLASH照射对肺祖细胞的保护作用及其减少放射诱导衰老的效果 | FLASH照射技术能特异性地保护正常组织免受晚期放射诱导毒性的影响，减少DNA损伤和复制性衰老的风险 | FLASH照射的有益效果在缺乏端粒酶活性的Terc-/-小鼠中消失，表明其效果依赖于正常的端粒酶功能 | 探讨FLASH照射与传统放射治疗相比，在减少正常细胞DNA损伤和保护肺祖细胞方面的效果 | 使用C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠以及人肺细胞进行体外研究 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | RNA | C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠，以及人肺细胞 |
| 25536 | 2024-08-09 |
Understanding the complexity of retina and pluripotent stem cell derived retinal organoids with single cell RNA sequencing: current progress, remaining challenges and future prospective
2020-03, Current eye research
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/02713683.2019.1697453
PMID:31794277
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在视网膜和多能干细胞衍生的视网膜类器官研究中的最新进展、未解决问题及技术挑战 | 单细胞RNA测序技术能够详细记录单个细胞的转录组，揭示视网膜发育、正常生理和疾病中的细胞异质性，并提供细胞类型特异性标记和信号通路的新见解 | 需要克服技术挑战以实现反映所有视网膜细胞类型的复杂性、功能和相互作用的一致结果 | 探讨单细胞RNA测序在视网膜和视网膜类器官研究中的应用，以及面临的挑战和未来展望 | 视网膜组织和多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25537 | 2024-08-09 |
Functional genomic approaches to elucidate the role of enhancers during development
2020-03, Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine
DOI:10.1002/wsbm.1467
PMID:31808313
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研究论文 | 本文讨论了利用功能基因组学方法阐明增强子在发育中的作用 | 介绍了大规模并行报告分析技术用于大规模验证增强子功能，并回顾了CRISPR基因编辑工具和单细胞转录组学在研究发育过程中基因调控的最新进展 | 功能性验证大规模增强子序列仍是一个基本挑战 | 理解增强子序列中哪些序列对功能至关重要 | 增强子在发育中的作用及其功能 | 遗传/基因组方法 | NA | 测序技术，CRISPR，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 25538 | 2024-08-09 |
Continuous and Discrete Neuron Types of the Adult Murine Striatum
2020-02-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.004
PMID:31813651
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和定量RNA原位杂交技术，探讨了成年小鼠纹状体中刺突投射神经元（SPN）的分子和解剖多样性 | 本研究首次通过计算方法区分了单细胞RNA测序数据中的离散和连续异质性，并发现了纹状体中SPN的四种主要离散类型，以及这些类型内的连续异质性 | NA | 旨在定义成年小鼠纹状体中刺突投射神经元的分子和解剖多样性 | 成年小鼠纹状体中的刺突投射神经元（SPN） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量RNA原位杂交（ISH） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25539 | 2024-08-09 |
Allele-specific single-cell RNA sequencing reveals different architectures of intrinsic and extrinsic gene expression noises
2020-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1134
PMID:31799601
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研究论文 | 本文利用等位特异性单细胞RNA测序技术，在老鼠成纤维细胞中评估了3975个基因的内在和外在表达噪声成分 | 首次揭示了内在和外在基因表达噪声的不同架构，并验证了TATA盒和微小RNA靶向等因素对这些噪声的影响 | NA | 探究内在和外在基因表达噪声的架构及其影响因素 | 老鼠成纤维细胞中的3975个基因 | 基因组学 | NA | 等位特异性单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 3975个基因 |
| 25540 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Renal Endothelium Heterogeneity and Metabolic Adaptation to Water Deprivation
2020-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080832
PMID:31818909
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾脏内皮细胞的异质性和对缺水的代谢适应 | 首次揭示了肾脏内皮细胞在缺水和高渗环境下对氧化磷酸化的代谢适应的新角色 | NA | 研究肾脏内皮细胞在不同微环境条件下的异质性和对缺水的代谢适应 | 肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过40,000个鼠肾脏内皮细胞 |