单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27109 篇文献，本页显示第 25461 - 25480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25461 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq characterization of anatomically identified OLM interneurons in different transgenic mouse lines
2019-12, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.14549
PMID:31420995
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了在解剖学和电生理学上识别的海马体oriens-lacunosum moleculare（OLM）中间神经元，这些神经元在不同的转基因小鼠系中表达。 | 研究发现OLM中间神经元中Npy的表达一致性，以及Htr3a在OLM中的低频表达和Htr3b在Htr3aCre-OLM中的特异性表达。 | 研究结果表明Htr3b的差异表达可能是由于Htr3a-Cre BAC转基因系设计导致的意外结果。 | 旨在广泛表征OLM细胞，并探讨其功能和发育起源。 | 海马体oriens-lacunosum moleculare（OLM）中间神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Sst-Cre和BAC转基因Htr3a-Cre小鼠系中的OLM类型进行分析。 |
| 25462 | 2024-08-09 |
Activation of Hedgehog Signaling Promotes Development of Mouse and Human Enteric Neural Crest Cells, Based on Single-Cell Transcriptome Analyses
2019-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2019.08.019
PMID:31442438
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了 Hedgehog 信号通路激活对小鼠和人源肠神经嵴细胞发育的影响。 | 首次揭示了 Hedgehog 信号通路激活促进小鼠和人源肠神经嵴细胞向神经元和胶质细胞谱系分化的机制。 | NA | 探究 Hedgehog 信号通路激活如何调控人多能干细胞衍生的肠神经嵴细胞的发育。 | 小鼠和人源肠神经嵴细胞，以及人多能干细胞衍生的肠神经嵴细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组 | 包括 Tg(GBS-GFP), Sufuf/f; Wnt1-cre, Ptch1+/-, 和 Gli3Δ699/Δ699 小鼠的肠道组织，以及 IMR90 和 UE02302 人多能干细胞系衍生的神经嵴细胞。 |
| 25463 | 2024-08-09 |
Glucose-Dependent Insulinotropic Polypeptide Receptor-Expressing Cells in the Hypothalamus Regulate Food Intake
2019-11-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2019.07.013
PMID:31447324
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研究论文 | 研究通过创建Gipr-Cre敲入小鼠，识别和操纵表达葡萄糖依赖性胰岛素释放肽受体（GIPR）的细胞，并探讨其在调节食物摄入中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出下丘脑中表达GIPR的细胞群，并发现这些细胞在血管、胶质和神经元细胞中表现出转录组特征。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证这些发现。 | 旨在识别和操纵表达GIPR的细胞，以了解其在调节食物摄入和能量平衡中的作用。 | 下丘脑中表达GIPR的细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 25464 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type-specific HPV expression in hyperplastic skin lesions
2019-11, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2019.08.007
PMID:31425970
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了免疫抑制患者皮肤增生性病变中HPV的细胞类型特异性表达 | 首次使用单细胞RNA测序技术在免疫抑制患者的皮肤病变中检测到HPV78在基底角质形成细胞、表层角质形成细胞和毛囊干细胞中的表达 | NA | 揭示免疫抑制诱导的HPV生命周期与表皮过度增殖之间的机制联系 | 免疫抑制患者皮肤增生性病变中的HPV表达 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 一个免疫抑制患者的HPV阳性皮肤病变样本 |
| 25465 | 2024-08-09 |
Integrating multiomics longitudinal data to reconstruct networks underlying lung development
2019-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00554.2018
PMID:31432713
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研究论文 | 本研究通过整合多组学纵向数据，构建了调控肺发育的动态网络模型 | 开发了一个详细的、全面的和交互式的模型，提供了主要表达轨迹、特定关键事件的调控因子以及表观遗传变化的影响信息 | NA | 构建一个模型来全面理解调控肺发育的动态网络 | 小鼠和人肺发育过程中的mRNA、microRNA、DNA甲基化和蛋白质组学数据 | 数字病理学 | NA | 激光捕获显微切割 | NA | 多组学数据 | 14个预定时间点的小鼠肺泡样本和时间序列的人类多组学数据集 |
| 25466 | 2024-08-09 |
The Molecular Diversity of Vagal Afferents Revealed
2019-10, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2019.08.002
PMID:31421944
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术，研究者揭示了小鼠迷走神经传入纤维的分子多样性 | 发现了24种迷走神经传入纤维亚型，揭示了之前未被认识的多样性水平 | NA | 揭示迷走神经传入纤维的分子多样性 | 小鼠的迷走神经传入纤维 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 25467 | 2024-08-09 |
GDF15 is an epithelial-derived biomarker of idiopathic pulmonary fibrosis
2019-10-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00062.2019
PMID:31432710
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研究论文 | 本文研究了生长与分化因子15（GDF15）作为特发性肺纤维化（IPF）的表皮来源生物标志物的潜力 | 首次鉴定GDF15为IPF中显著上调的分泌蛋白，并发现其在IPF患者肺组织中的mRNA表达显著增加，与肺功能相关 | NA | 探讨GDF15作为IPF病理过程中的潜在生物标志物 | 特发性肺纤维化（IPF）及其相关生物标志物GDF15 | NA | 特发性肺纤维化 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及小鼠和IPF患者的肺组织及血液样本 |
| 25468 | 2024-08-09 |
Reconstructing complex lineage trees from scRNA-seq data using MERLoT
2019-09-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz706
PMID:31428793
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MERLoT的工具，用于从单细胞转录组数据中重建复杂的细胞谱系树 | MERLoT工具具有灵活性和用户友好性，能够推断重建树上的时间基因表达谱 | NA | 开发一种新工具以解决从单细胞转录组数据中重建复杂细胞谱系树的挑战 | 单细胞转录组数据和细胞谱系树的重建 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百个模拟数据集和多个实际案例数据 |
| 25469 | 2024-08-09 |
Diverse repertoire of human adipocyte subtypes develops from transcriptionally distinct mesenchymal progenitor cells
2019-09-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1906512116
PMID:31420514
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研究论文 | 本文报道了4种不同的人类脂肪细胞亚型及其各自的间充质前体细胞的存在和特征 | 发现了多种新型的人类脂肪细胞亚型，这些亚型在表型和功能上具有差异性，并且与特定的间充质前体细胞相关 | NA | 揭示人类脂肪组织功能及其在代谢疾病中的作用 | 人类脂肪细胞亚型及其间充质前体细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25470 | 2024-08-09 |
Stochastic cell-cycle entry and cell-state-dependent fate outputs of injury-reactivated tectal radial glia in zebrafish
2019-08-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.48660
PMID:31442201
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研究论文 | 本研究探讨了斑马鱼视顶盖中受伤后重新激活的放射状胶质细胞（RG）的细胞周期进入和细胞状态依赖的命运输出 | 发现了受伤后重新激活的RG在细胞周期进入中的随机性，并揭示了Notch/Delta侧向抑制在这一过程中的作用 | NA | 研究中枢神经系统（CNS）受伤后胶质细胞的增殖和命运控制 | 斑马鱼视顶盖中的放射状胶质细胞（RG） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA序列 | NA |
| 25471 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling guided combinatorial immunotherapy for fast-evolving CDK4/6 inhibitor-resistant HER2-positive breast cancer
2019-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11729-1
PMID:31444334
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，探索了针对快速进化的CDK4/6抑制剂耐药的HER2阳性乳腺癌的组合免疫治疗策略 | 本研究首次揭示了耐药肿瘤中免疫抑制性未成熟骨髓细胞（IMC）的浸润，并证明了IMC靶向酪氨酸激酶抑制剂和免疫检查点阻断的组合能增强抗肿瘤免疫并克服耐药性 | NA | 旨在通过前临床模型和单细胞分析，寻找针对快速进化的CDK4/6抑制剂耐药肿瘤的治疗策略 | CDK4/6抑制剂耐药的HER2阳性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25472 | 2024-08-09 |
An elastic-net logistic regression approach to generate classifiers and gene signatures for types of immune cells and T helper cell subsets
2019-Aug-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-2994-z
PMID:31438843
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研究论文 | 本文使用弹性网逻辑回归方法构建了针对十种不同类型免疫细胞和五种T辅助细胞亚群的分类器，并开发了相应的基因签名 | 利用机器学习方法从高维转录组数据中提取信息基因签名，并成功应用于未注释细胞类型的分类 | NA | 开发能够预测疾病中宿主免疫反应程度和功能导向的分类器 | 不同类型的免疫细胞和T辅助细胞亚群 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 弹性网逻辑回归 | RNA-seq数据 | 使用了单细胞RNA-seq（scRNA-seq）数据集进行验证 |
| 25473 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogenicity in colorectal cancer
2019-Aug, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000016916
PMID:31441872
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的癌细胞，揭示了其细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析结直肠癌的细胞异质性，提供了对癌细胞群中不同细胞类型的无偏见分析 | 研究仅基于单一结直肠癌患者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 揭示结直肠癌的细胞异质性，并为后续研究提供深入见解 | 结直肠癌患者的癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2824个细胞 |
| 25474 | 2024-08-09 |
A Tool for Visualization and Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Based on Text Mining
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00734
PMID:31447887
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研究论文 | 本文介绍了一种基于文本挖掘的单细胞RNA测序数据可视化和分析工具 | 该工具采用TF-IDF模型进行数据转换，适用于处理稀疏和零膨胀的单细胞数据，并展示了其在区分不同细胞类型方面的优越性 | NA | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的新型计算流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | TF-IDF | 文本 | 数千个细胞 |
| 25475 | 2024-08-09 |
scHinter: imputing dropout events for single-cell RNA-seq data with limited sample size
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz627
PMID:31392316
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研究论文 | 提出了一种名为scHinter的方法，用于在小样本量的单细胞RNA测序数据中填补丢失事件 | scHinter采用基于投票的集成距离和合成少数过采样技术进行随机插值，并嵌入了分层框架以提高小样本的填补可靠性 | NA | 开发新的填补方法，提高对不同样本量数据的通用性 | 单细胞RNA测序数据中的丢失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小样本量 |
| 25476 | 2024-08-09 |
Using multiple measurements of tissue to estimate subject- and cell-type-specific gene expression
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz619
PMID:31400192
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研究论文 | 本文开发了一种基于经验贝叶斯方法，利用多个组织测量数据来估计个体和细胞类型特异性基因表达的方法 | 提出了一种新的方法来整合组织水平的基因表达数据和单细胞RNA测序数据，以估计个体和细胞类型特异性的基因表达 | 单细胞RNA测序数据可能存在噪声，并且通常来自少数个体 | 开发一种方法来估计个体和细胞类型特异性的基因表达，并应用于识别基因表达数量性状位点 | 基因表达数据，特别是来自多个脑区的数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | 经验贝叶斯方法 | 基因表达数据 | 数千个个体 |
| 25477 | 2024-08-09 |
Alternating EM algorithm for a bilinear model in isoform quantification from RNA-seq data
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz640
PMID:31400221
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研究论文 | 本文介绍了一种名为XAEM的新方法，用于从RNA-seq数据中进行isoform水平的基因表达估计，该方法基于一个更灵活和稳健的统计模型，并使用交替期望最大化（AEM）算法进行实现 | XAEM方法考虑了Xβ作为一个双线性模型，其中X和β都是未知的，并通过多样本RNA-seq数据的联合分析进行联合估计，自动执行潜在未知偏差的经验校正 | NA | 开发一种新的方法来提高从RNA-seq数据中估计isoform水平基因表达的准确性 | RNA-seq数据中的isoform水平基因表达 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 双线性模型 | RNA-seq数据 | 多样本RNA-seq数据 |
| 25478 | 2024-08-09 |
Single-Cell Survey of Human Lymphatics Unveils Marked Endothelial Cell Heterogeneity and Mechanisms of Homing for Neutrophils
2019-09-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.06.027
PMID:31402260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对33,000个人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞（LECs）进行了全面分析 | 揭示了六种主要类型的人类LECs，并发现了髓质淋巴管内皮细胞在人类免疫中的新作用 | NA | 全面表征淋巴管内皮细胞的异质性，并揭示其在人类免疫中的新角色 | 人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 33,000个淋巴管内皮细胞 |
| 25479 | 2024-08-09 |
Author Correction: Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2019-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0212-1
PMID:31409908
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correction | 对一篇关于单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌内肿瘤异质性和恶性进展的论文进行修正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25480 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq identifies a reversible mesodermal activation in abnormally specified epithelia of p63 EEC syndrome
2019-08-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1908180116
PMID:31413199
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞（iPSCs）建立了表皮分化模型，并分析了p63突变导致的EEC综合征患者iPSCs的分化缺陷 | 首次揭示了p63突变导致的表皮分化缺陷可以通过抑制中胚层诱导来逆转 | NA | 探究p63突变导致的表皮分化缺陷的细胞和分子机制，并寻找潜在的治疗策略 | p63突变导致的EEC综合征患者iPSCs的分化缺陷 | 数字病理学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |