单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 25421 - 25440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25421 | 2024-08-09 |
Multiplexed Single Cell mRNA Sequencing Analysis of Mouse Embryonic Cells
2020-01-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/60647
PMID:31984954
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研究论文 | 本文使用基于液滴的scRNA-Seq方法，以心脏为例，展示了如何对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 本文将两种策略整合到工作流程中，以在单次实验中同时分析多个样本，并成功同时分析了来自八个心脏样本的9,000多个细胞 | NA | 展示如何使用基于液滴的scRNA-Seq方法对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 小鼠胚胎组织细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-Seq | NA | mRNA | 9,000多个细胞，来自八个心脏样本 |
| 25422 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
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研究论文 | 本文通过比较四种不同的样本处理策略对新鲜胰岛样本的单细胞RNA测序数据的影响，探讨了样本准备对研究结果的重要性。 | 首次详细比较了不同样本处理方法对人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响，强调了样本处理方法在单细胞研究中的重要性。 | 研究仅限于胰岛组织，可能需要进一步研究其他类型组织以验证结论的普遍性。 | 评估不同样本准备协议对新鲜胰岛样本单细胞RNA测序数据的可能影响。 | 人类胰岛组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两个捐赠者的新鲜胰岛样本 |
| 25423 | 2024-08-09 |
Microglia response following acute demyelination is heterogeneous and limits infiltrating macrophage dispersion
2020-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay6324
PMID:31998844
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研究论文 | 本研究通过基因标记和单细胞RNA测序技术，探讨了急性脱髓鞘后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相互作用 | 揭示了小胶质细胞在限制浸润巨噬细胞扩散中的新作用，并提出这可能是中枢神经系统维持其“免疫特权”状态的一种先前未被识别的机制 | NA | 研究中枢神经系统损伤后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相对贡献 | 小胶质细胞和浸润巨噬细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25424 | 2024-08-09 |
Preparation of single cells from tumors for single-cell RNA sequencing
2020, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.05.057
PMID:32000902
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研究论文 | 本文描述了一种从人类肿瘤样本中生成单细胞悬浮液的协议，该协议已针对单细胞RNA测序进行了优化 | 提出了一个优化的单细胞RNA测序样本准备协议，旨在最大化细胞活力并最小化可能影响下游分析的细胞应激因素 | 样本准备过程如果执行不当，可能会产生误导性结果 | 优化单细胞RNA测序的样本准备过程 | 人类肿瘤样本中的单细胞悬浮液 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 25425 | 2024-08-09 |
Evaluating genetic causes of azoospermia: What can we learn from a complex cellular structure and single-cell transcriptomics of the human testis?
2021-Jan, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02116-8
PMID:31950241
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综述 | 本文综述了无精症的遗传原因，并探讨了人类睾丸的复杂细胞结构和单细胞转录组学在不同类型无精症中的应用 | 利用下一代测序技术，通过单细胞RNA测序获得了详细的细胞类型特异性表达模式，并结合现有数据集进行综合分析 | 需要对高度复杂的数据处理和可视化方法有深入了解才能正确解读单细胞RNA测序数据 | 探讨无精症的遗传原因及其对睾丸病理的影响 | 人类睾丸的细胞结构和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 62,751个睾丸细胞，每个细胞中位数为2637个转录本 |
| 25426 | 2024-08-09 |
Liquid Biopsy Based Single-Cell Transcriptome Profiling Characterizes Heterogeneity of Disseminated Tumor Cells from Lung Adenocarcinoma
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900224
PMID:31960581
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研究论文 | 本文利用高通量单细胞转录组测序技术和稀有DTC富集方法，解析了来自肺腺癌的恶性胸腔积液（MPE）中DTCs的异质性和独特的分子特征 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究液体活检中的DTCs异质性，并识别出19个肿瘤特异性标记物 | 研究仅限于肺腺癌的恶性胸腔积液样本，未涉及其他类型的癌症或样本 | 解析肿瘤细胞的异质性及其分子机制 | 肺腺癌中的扩散肿瘤细胞（DTCs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8213个来自恶性胸腔积液的细胞 |
| 25427 | 2024-08-09 |
Progress and applications of single-cell sequencing techniques
2020-06, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2020.104198
PMID:31958516
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综述 | 本文主要总结了单细胞测序技术的方法及其应用领域 | NA | NA | 总结单细胞测序技术的方法和应用领域，为其未来在临床上的应用提供潜在参考 | 单细胞测序技术的方法及其在胚胎和器官发育、免疫系统、癌症进展、寄生虫和传染病以及干细胞研究、抗体筛选和治疗研究开发等领域的应用 | NA | NA | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组 | NA |
| 25428 | 2024-08-09 |
Surfactant Expression Defines an Inflamed Subtype of Lung Adenocarcinoma Brain Metastases that Correlates with Prolonged Survival
2020-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-2184
PMID:31953311
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研究论文 | 研究通过量化肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）并分析其与肺腺癌脑转移的关系，揭示了表面活性剂代谢相关基因表达与免疫微环境及患者生存期的关联 | 首次发现表面活性剂代谢相关基因（SFTPA1, SFTPB, NAPSA）的高表达与肺腺癌脑转移的炎症亚型相关，这种亚型具有高密度的TIL和较长的生存期 | 研究样本量有限，且仅分析了部分患者的转录组数据 | 深入理解免疫系统与脑转移之间的相互作用，为这种致命疾病提供新的治疗选择 | 肺腺癌脑转移患者的肿瘤浸润淋巴细胞及表面活性剂代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81例肺腺癌脑转移患者，其中63例进行了转录组分析 |
| 25429 | 2024-08-09 |
Enhancing Hematopoiesis from Murine Embryonic Stem Cells through MLL1-Induced Activation of a Rac/Rho/Integrin Signaling Axis
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.12.009
PMID:31951812
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研究论文 | 本文开发了一种可诱导MLL1的胚胎干细胞系统，并展示了在胚胎干细胞分化过程中诱导野生型MLL1能够选择性地增加胚胎体和胚胎中造血潜能的过渡性c-Kit/Cd41群体 | 本文首次展示了MLL1通过增强Rac/Rho/整合素信号状态，而非增加Hox或其他经典MLL1靶点，来促进造血承诺 | 由于缺乏生理模型系统，MLL1蛋白是否限制HSC发育尚不清楚 | 研究MLL1在造血干细胞发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎干细胞和造血干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 涉及小鼠胚胎干细胞和造血干细胞群体 |
| 25430 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Trypanosoma brucei from tsetse salivary glands unveils metacyclogenesis and identifies potential transmission blocking antigens
2020-02-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914423117
PMID:31964820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从感染的采采蝇唾液腺中收集的2,045个寄生虫样本中，揭示了非洲锥虫的metacyclogenesis过程及其潜在的阻断传播抗原 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细揭示了非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并识别了可能的阻断传播抗原 | 需要进一步研究Fam10家族蛋白作为潜在的锥虫传播阻断疫苗抗原 | 深入理解非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并寻找阻断传播的潜在抗原 | 非洲锥虫及其在采采蝇唾液腺中的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2,045个寄生虫样本 |
| 25431 | 2024-08-09 |
Single-cell RNAseq analysis of testicular germ and somatic cell development during the perinatal period
2020-02-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.183251
PMID:31964773
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠围产期睾丸生殖细胞和体细胞的发育过程 | 研究首次识别了三个时间上不同的ProSG细胞亚群，包括一个迁移细胞群，其转录组与先前定义的T1-和T2-ProSG阶段不同 | NA | 研究睾丸生殖细胞和体细胞在围产期的发育过程 | 小鼠围产期的ProSG细胞及其后代和睾丸体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25432 | 2024-08-09 |
Tracking the important role of JUNB in hepatocellular carcinoma by single-cell sequencing analysis
2020-Feb, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2019.11235
PMID:31966074
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了JUNB在肝细胞癌（HCC）中的重要作用 | 首次揭示了JunB原癌基因在HCC的免疫反应和进展中的作用 | 研究仅基于一个HCC肿瘤样本和两个HCC细胞系，样本量较小 | 旨在揭示HCC发展和进展的潜在机制 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞和免疫反应 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 一个HCC肿瘤样本，两个HCC细胞系和正常外周血单个核细胞 |
| 25433 | 2024-08-09 |
Chromosome segregation error during early cleavage in mouse pre-implantation embryo does not necessarily cause developmental failure after blastocyst stage
2020-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-57817-x
PMID:31965014
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研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单个囊胚移植评估了早期卵裂阶段染色体分离错误与发育之间的关系 | 首次展示了早期染色体分离错误导致的微核形成并不一定会导致囊胚阶段后的发育失败 | 研究仅限于体外受精获得的鼠胚胎，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期卵裂阶段染色体分离错误对胚胎发育的影响 | 鼠的早期植入前胚胎 | NA | NA | 活细胞成像，单细胞测序 | NA | 图像，序列数据 | 使用了通过体外受精获得的鼠胚胎进行实验 |
| 25434 | 2024-08-09 |
Memory B Cell Activation, Broad Anti-influenza Antibodies, and Bystander Activation Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-01-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.12.063
PMID:31968262
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学、纵向抗体谱系测序和抗体结合测量，研究了流感疫苗接种后的抗体反应的分子和细胞特征 | 揭示了记忆B细胞激活的程序，包括CD11c和T-bet表达，与克隆扩增和分化为效应功能相关，并发现了流感疫苗接种引发的非特异性旁观者抗体激活 | NA | 探讨抗体记忆反应中转录程序、细胞增殖和抗原特异性抗体产生的协调机制 | 记忆B细胞的激活、抗体克隆的广谱性和旁观者激活 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 25435 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies
2020-01, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2019.11.010
PMID:31952776
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤功能异质性 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤内部结构，预测该技术将在多个研究领域广泛应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症治疗中的应用 | 肿瘤内部复杂性和功能异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 25436 | 2024-08-09 |
Visualization of Single Cell RNA-Seq Data Using t-SNE in R
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_8
PMID:31960377
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研究论文 | 本文详细介绍了使用t-SNE和Seurat工具在R环境中对单细胞RNA测序数据进行可视化的过程 | 采用t-SNE这一非线性降维技术，相较于早期的PCA方法，在单细胞RNA测序数据可视化方面具有优势 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-SNE | 基因表达数据 | NA |
| 25437 | 2024-08-09 |
Use of SuperCT for Enhanced Characterization of Single-Cell Transcriptomic Profiles
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_9
PMID:31960378
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研究论文 | 本文介绍了一种基于监督学习的新方法，用于增强单细胞转录组特征的表征 | 提出了一种基于监督学习的新方法，用于解决单细胞转录组技术中细胞身份识别的问题 | NA | 深入理解异质性组织中的细胞身份 | 单细胞转录组特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习 | 转录组数据 | 多种已知细胞类型的单细胞转录组数据 |
| 25438 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics identifies spatially dysregulated expression of GRM3 and USP47 in amyotrophic lateral sclerosis
2020-08, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12597
PMID:31925813
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，分析了携带C9orf72六核苷酸重复扩展的ALS患者死后皮质组织的转录组，以识别可能解释ALS发病机制中不同细胞类型和脑区差异脆弱性的失调转录本 | 本研究首次描述了在携带C9orf72六核苷酸重复扩展的ALS患者死后皮质组织中应用空间转录组学技术 | NA | 旨在通过空间解析的RNA测序技术，识别与ALS发病机制中不同细胞类型和脑区差异脆弱性相关的失调转录本 | ALS患者的死后皮质组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 包括多个死后脑区和脊髓组织，来自扩展的C9orf72、散发性ALS(sALS)和SOD1 ALS病例 |
| 25439 | 2024-08-09 |
BEM: Mining Coregulation Patterns in Transcriptomics via Boolean Matrix Factorization
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz977
PMID:31913438
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研究论文 | 本文介绍了一种新的布尔矩阵分解算法（BEM），通过期望最大化方法挖掘转录组数据中的共调控模式 | BEM算法更符合转录组共调控的分子机制，并且能够处理包含超过一亿数据点的大规模矩阵 | NA | 分析转录组数据中的共调控模式，揭示肿瘤信号扰动状态和亚型分类 | 转录组数据，包括批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 布尔矩阵分解（BMF） | 期望最大化（EM） | 转录组数据 | 超过100万个数据点 |
| 25440 | 2024-08-09 |
The emergence and promise of single-cell temporal-omics approaches
2020-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2019.12.005
PMID:31918114
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研究论文 | 本文探讨了单细胞时间组学方法的兴起及其在生物复杂系统中的应用潜力 | 介绍了新的单细胞分析方法，这些方法能够在测量转录组的同时捕捉到谱系信息或过去的分子事件 | NA | 强调单细胞领域的发展，描述用于研究的创新工具包，并考虑时间组学方法在疾病进展研究中的潜在影响 | 单细胞转录组数据及其在胚胎发育、疾病进展和刺激响应中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |