单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 25401 - 25420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25401 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.05.001
PMID:32445619
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肿瘤浸润性NK细胞的转录组，发现抑制转录因子HIF-1α可以增强NK细胞的抗肿瘤活性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HIF-1α抑制对NK细胞功能的激活作用，并发现IL-18在其中的关键作用 | NA | 探索增强肿瘤免疫疗法中免疫细胞功能的策略 | 肿瘤浸润性NK细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类肿瘤浸润性NK细胞 |
| 25402 | 2024-08-09 |
Molecular taxonomy of human ocular outflow tissues defined by single-cell transcriptomics
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2001896117
PMID:32439707
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了人类传统流出组织细胞图谱，并识别了12种不同的细胞类型 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了人类眼流出组织的分子分类，并识别了两种不同的表达模式（肌成纤维细胞样和成纤维细胞样） | NA | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人类眼流出组织的细胞和分子分类 | 人类眼流出组织的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8只人眼捐赠者的8,758个细胞 |
| 25403 | 2024-08-09 |
Forward genetic analysis using OCT screening identifies Sfxn3 mutations leading to progressive outer retinal degeneration in mice
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921224117
PMID:32457148
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研究论文 | 本文通过正向遗传分析结合光学相干断层扫描（OCT）筛选，在老鼠中发现了导致渐进性外视网膜退化的Sfxn3基因突变 | 首次揭示了Sfxn3基因在视网膜功能中的未知作用，并展示了其在多个视网膜细胞类型中的表达 | NA | 通过正向遗传学方法发现与视网膜疾病相关的基因 | 老鼠视网膜中的Sfxn3基因及其突变 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 光学相干断层扫描（OCT）、CRISPR/Cas9技术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 11个突变基因，多个老鼠品系 |
| 25404 | 2024-08-09 |
Putative regulators for the continuum of erythroid differentiation revealed by single-cell transcriptome of human BM and UCB cells
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915085117
PMID:32457162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从成人骨髓和脐带血中分离出的终末期红细胞的转录组，揭示了红细胞分化过程中的潜在调控因子 | 首次在单细胞分辨率下记录了人类终末期红细胞的转录组，区分了早期和晚期多染性红细胞以及不同发育阶段的正染性红细胞 | NA | 旨在理解伴随人类红细胞生成过程的动态发育变化 | 成人骨髓和脐带血中的终末期红细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 从成人骨髓和脐带血中分离出的CD34CD235a阳性细胞 |
| 25405 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics: New Insights in Heart Research
2020-05-26, Circulation
IF:35.5Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25406 | 2024-08-09 |
Myeloma cells shift osteoblastogenesis to adipogenesis by inhibiting the ubiquitin ligase MURF1 in mesenchymal stem cells
2020-05-26, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aay8203
PMID:32457115
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研究论文 | 研究揭示了多发性骨髓瘤细胞通过抑制间充质干细胞中的泛素连接酶MURF1，促进脂肪生成并抑制骨形成的过程 | 首次揭示了多发性骨髓瘤细胞与间充质干细胞相互作用，通过激活PKCβ1信号和抑制MURF1介导的泛素化，稳定PPARγ2蛋白，从而促进脂肪生成并抑制骨形成 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探讨多发性骨髓瘤细胞如何影响间充质干细胞的分化，以及这种影响对骨形成的影响 | 多发性骨髓瘤细胞和间充质干细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，体外共培养，皮下注射 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠模型 |
| 25407 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics reveals opioid usage evokes widespread suppression of antiviral gene program
2020-05-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16159-y
PMID:32457298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了慢性阿片类药物使用对免疫系统的广泛抑制作用，特别是对天然单核细胞和多种免疫细胞中抗病毒基因程序的抑制。 | 首次系统性地描述了阿片类药物如何影响免疫系统，特别是在单细胞水平上揭示了抗病毒基因程序的广泛抑制。 | 研究主要集中在体外实验和特定细胞类型的分析，可能需要进一步的体内研究来验证这些发现。 | 旨在无偏见地理解阿片类药物对免疫系统的调节作用。 | 研究对象包括阿片类药物依赖者和对照组的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 研究未明确提及样本数量 |
| 25408 | 2024-08-09 |
Characterization of radioresistant epithelial stem cell heterogeneity in the damaged mouse intestine
2020-05-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-64987-1
PMID:32444673
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞qRT-PCR分析，揭示了在损伤小肠中Lgr5表达细胞衍生物中存在的放射抵抗性肠干细胞（ISCs）及其在肠上皮再生中的作用 | 首次发现Lgr5表达细胞衍生物中的放射抵抗性肠干细胞在损伤小肠上皮再生中的关键作用，并通过单细胞RNA测序揭示了CD81表达与ISC和增殖相关基因表达的相关性 | NA | 研究损伤小肠中放射抵抗性上皮干细胞的异质性及其在肠上皮再生中的作用 | 小鼠损伤小肠中的放射抵抗性上皮干细胞 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞qRT-PCR分析，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |
| 25409 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Tumor-Derived Fibroblasts and Normal Tissue-Resident Fibroblasts Reveals Fibroblast Heterogeneity in Breast Cancer
2020-May-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12051307
PMID:32455670
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）的异质性 | 首次详细描述了三阴性乳腺癌中CAFs的六个亚群，并发现这些亚群在不同肿瘤类型中普遍存在 | 研究仅限于使用BALB/c-derived 4T1乳腺肿瘤模型，可能需要进一步的人体组织验证 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关成纤维细胞的分子和表型异质性 | 三阴性乳腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞及其亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及4T1肿瘤中的多个成纤维细胞亚群 |
| 25410 | 2024-08-09 |
Gene regulatory networks during the development of the Drosophila visual system
2020, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2020.02.010
PMID:32450970
|
研究论文 | 本文描述了果蝇视觉系统发育过程中涉及的已知基因调控网络，并探讨了这些基因网络中的通用组件 | 讨论了果蝇视觉系统作为单细胞转录组学时代基因调控网络发现模型的优势 | NA | 研究果蝇视觉系统发育过程中的基因调控网络 | 果蝇视觉系统的发育及其基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25411 | 2024-08-09 |
Hybrid Stem Cell States: Insights Into the Relationship Between Mammary Development and Breast Cancer Using Single-Cell Transcriptomics
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00288
PMID:32457901
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常乳腺发育与乳腺癌之间的关系，特别是混合型干细胞状态在其中的作用 | 本研究首次整合了人类和小鼠的乳腺单细胞RNA测序数据，以及TCGA中的乳腺癌bulk RNA测序数据，以探究正常乳腺和癌症中的混合型干细胞状态 | NA | 利用单细胞RNA测序技术量化正常乳腺在不同发育阶段和条件重编程下的细胞状态分布 | 正常乳腺干细胞和乳腺癌细胞的混合型状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA-seq数据 | 包括人类和小鼠的多个乳腺单细胞RNA测序数据集，以及TCGA中的乳腺癌bulk RNA测序数据 |
| 25412 | 2024-08-09 |
Targeting dual signalling pathways in concert with immune checkpoints for the treatment of pancreatic cancer
2021-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321000
PMID:32424005
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研究论文 | 本研究利用分子靶向治疗与免疫检查点抑制的交叉点，探索治疗胰腺癌的新方法 | 发现MEK和CDK4/6抑制剂联合治疗在多种PDX模型中有效延缓肿瘤进展，并能增强T细胞浸润和改变骨髓细胞群，与免疫检查点抑制剂协同作用 | NA | 定义治疗胰腺癌的新方法 | 患者来源的细胞系和异种移植模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和多光谱成像 | NA | 细胞系和异种移植模型 | 多种PDX模型 |
| 25413 | 2024-08-09 |
Dendritic cells in tumor microenvironment promoted the neuropathic pain via paracrine inflammatory and growth factors
2020-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2020.1771068
PMID:32434423
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤微环境中受损的Wnt1浸润树突状细胞对与癌症相关的神经性疼痛的贡献 | 首次揭示了肿瘤微环境中浸润的树突状细胞通过旁分泌炎症和生长因子促进神经性疼痛的机制 | 研究未涉及旁分泌因子信号阻断对缓解癌症疼痛的具体效果 | 探索肿瘤微环境中树突状细胞对神经性疼痛的影响 | 肿瘤微环境中的树突状细胞及其对神经性疼痛的影响 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及肺癌和肿瘤旁组织的树突状细胞 |
| 25414 | 2024-08-09 |
New avenues for systematically inferring cell-cell communication: through single-cell transcriptomics data
2020-12, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00727-5
PMID:32435978
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据探讨了细胞间通信的研究方法 | 利用单细胞RNA测序技术，提供了高分辨率的转录组数据，深化了对细胞表型异质性和复杂组织组成的理解 | 讨论了当前单细胞分辨率下细胞间通信研究的挑战 | 系统地推断细胞间通信 | 多细胞生物中的细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 25415 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Calvarial and Long-Bone Endocortical Cells
2020-10, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4052
PMID:32427356
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-Seq）研究了环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并通过比较新鲜分离细胞与体外培养细胞的细胞类型丰度和转录组，揭示了体内外细胞异质性的显著差异。 | 本文首次使用scRNA-Seq技术检测了环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并揭示了体内外细胞异质性的显著差异。 | 由于仅7%的测序内皮质细胞为成骨细胞，且仅采样了其转录组的一小部分，因此可能无法检测到基因表达的微小变化。 | 研究环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并揭示体内外细胞异质性的差异。 | 新生鼠颅骨细胞和长骨内皮质细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 新鲜分离的颅骨细胞和体外培养12天的细胞，以及接受载体或硬化素中和抗体治疗1周的小鼠新鲜回收的长骨内皮质细胞。 |
| 25416 | 2024-08-09 |
Spatial-omics: Novel approaches to probe cell heterogeneity and extracellular matrix biology
2020-09, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2020.04.004
PMID:32416243
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综述 | 本文综述了新兴的空间组学技术如何通过高分辨率映射表达谱，直接在组织内进行细胞间相互作用和细胞外基质生物学的研究 | 空间组学技术能够保留细胞在样本中的空间背景、细胞几何形状及其周围细胞外基质，从而探索先前未被研究的信号传导方式 | NA | 探讨空间转录组学和蛋白质组学技术如何应用于研究细胞与细胞外基质的相互作用 | 细胞间相互作用和细胞外基质生物学 | 生物信息学 | 纤维化疾病 | 空间组学技术 | NA | 组织 | NA |
| 25417 | 2024-08-09 |
Radiation-Enhanced Expression of CCL22 in Nasopharyngeal Carcinoma is Associated With CCR4+ CD8 T Cell Recruitment
2020-09-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2020.05.001
PMID:32428547
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research paper | 本研究旨在确定鼻咽癌（NPC）细胞在接受放疗后免疫相关基因表达的动态变化 | 发现放疗增强的CCL22释放促进了CCR4+效应CD8 T细胞的迁移，这可能与放疗介导的抗肿瘤免疫有关 | NA | 研究放疗对鼻咽癌细胞中免疫相关基因表达的影响 | 鼻咽癌患者来源的肿瘤异种移植瘤、细胞系、CCR4+ CD8 T细胞以及TCGA来源的批量RNA-seq或单细胞RNA-seq（scRNA-seq）数据集 | digital pathology | nasopharyngeal carcinoma | RNA-seq | NA | RNA | 使用健康志愿者外周血单个核细胞排序的CCR4+ CD8 T细胞以及TCGA来源的批量或单细胞RNA-seq数据集 |
| 25418 | 2024-08-09 |
Nascent transcript and single-cell RNA-seq analysis defines the mechanism of action of the LSD1 inhibitor INCB059872 in myeloid leukemia
2020-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.144758
PMID:32422235
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研究论文 | 本文通过新兴转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了LSD1抑制剂INCB059872在髓系白血病中的作用机制 | 首次使用精密核运行测序（PRO-seq）和ChIP-seq技术，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq），详细解析了INCB059872在髓系白血病中的早期调控事件及其对基因表达的影响 | 文章未详细讨论INCB059872的剂量限制性毒性及其在临床应用中的具体挑战 | 探究LSD1抑制剂INCB059872在髓系白血病中的作用机制及其对患者的影响 | 髓系白血病细胞及患者骨髓样本 | 数字病理学 | 髓系白血病 | 精密核运行测序（PRO-seq）、ChIP-seq、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括AML细胞系、患者骨髓样本及小鼠骨髓细胞 |
| 25419 | 2024-08-09 |
scVAE: variational auto-encoders for single-cell gene expression data
2020-08-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa293
PMID:32415966
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的新方法scVAE，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | 该方法直接使用原始计数数据作为输入，避免了数据预处理步骤，并能稳健地估计每个细胞的预期基因表达水平和潜在表示 | NA | 开发一种新的方法来分析和从大量的复杂单细胞转录组数据中得出相关的生物学推断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAE | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 |
| 25420 | 2024-08-09 |
scTPA: a web tool for single-cell transcriptome analysis of pathway activation signatures
2020-08-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa532
PMID:32437538
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研究论文 | 本文介绍了scTPA，一个基于网络的工具，用于分析人类和小鼠单细胞RNA测序数据中的通路激活特征 | scTPA整合了四种广泛使用的基因集富集方法，基于不同功能和分类的生物通路集合，评估单细胞的通路激活分数 | NA | 开发一个有效的网络工具，用于基于先前生物通路知识的单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据的功能解释和细胞簇注释 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据 |