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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2025-11-15 |
Expression patterns of desmosome family members during tooth development and the role of Desmocollin-3 in cytodifferentiation of stratum intermedium
2025-Dec, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现桥粒蛋白家族成员在牙釉中间层特异性表达,并揭示Desmocollin-3对维持牙釉中间层细胞完整性和成釉细胞分化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定牙釉中间层特异性标志物,并揭示Desmocollin-3在牙釉中间层细胞分化和成釉细胞谱系定向中的新功能 | 研究主要使用体外细胞系模型,需要进一步在体内验证;样本量有限,仅分析了出生后12天的磨牙 | 鉴定牙釉中间层特异性标志物并研究Desmocollin-3在维持牙釉中间层细胞完整性和分化中的功能 | 出生后12天小鼠磨牙和SF2牙上皮细胞系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 出生后12天小鼠磨牙 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2522 | 2025-11-15 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式,发现INF2和DSTN等15个关键基因与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和相关的二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2523 | 2025-11-15 |
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
PMID:41145025
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在重度牙周炎中的调控机制,重点关注NF-κB信号通路的作用 | 首次在单细胞水平揭示牙周炎中性粒细胞中NF-κB信号通路的激活状态及其在细胞间通讯中的关键作用 | 研究主要基于GEO数据库分析,实验验证部分仅限于LPS刺激的牙龈中性粒细胞模型 | 探索重度牙周炎中中性粒细胞的调控机制 | 牙周炎患者的中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA转录组测序, 实时PCR, 共免疫染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | RNA测序数据, 基因表达数据 | 来自GEO数据库的单细胞和批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2524 | 2025-11-15 |
Uncovering the Molecular Networks of Extracellular Vesicles in the Pathogenesis of Periodontitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103936
PMID:41138693
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研究论文 | 通过整合多种组学数据揭示牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和因果遗传分析系统研究牙周炎中的EV相关基因网络 | 需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 牙周炎相关基因、细胞外囊泡相关基因 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 因果遗传分析, 分子对接 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2525 | 2025-11-15 |
Elucidating the Mechanism of Radiation Therapy on Mesenchymal Cell Fate in Preventing Heterotopic Ossification
2025-Dec-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006366
PMID:38829115
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研究论文 | 本研究通过动物模型探究放射治疗预防异位骨化的机制,在单细胞水平分析放射诱导的间充质细胞命运变化 | 首次在单细胞水平探索放射治疗预防创伤性异位骨化的机制,揭示放射对间充质祖细胞数量和分化的双重影响 | 研究仅限于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明放射治疗预防异位骨化的分子机制 | C57BL6J雄性小鼠的间充质祖细胞 | 单细胞测序分析 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光显微镜,显微计算机断层扫描 | 动物模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2526 | 2025-11-15 |
Analysis of the role of RNA regulatory networks in cancer treatment: Mechanisms, applications and future prospects (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2909
PMID:41220798
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综述 | 本文综述了RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制、应用前景及未来发展方向 | 重点关注isomiRs的功能动态及其在精准肿瘤学中的转化潜力,整合了单细胞测序和CRISPR筛选等先进技术 | NA | 分析RNA调控网络在癌症治疗中的机制、应用和未来前景 | RNA调控网络,特别是isomiRs和竞争性内源RNA网络 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序,CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2527 | 2025-11-15 |
A drop-based workflow for fast and robust joint profiling of transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000258
PMID:41221081
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研究论文 | 开发了一种基于液滴微流控的单细胞多组学工作流程,可在同一细胞中同时分析转录组和染色质可及性 | 提出快速、稳健的液滴微流控协议,实现单细胞水平RNA和染色质可及性的同步分析 | NA | 开发单细胞多组学技术以解析细胞异质性和生物学复杂性 | 单个细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴微流控系统, 凝胶珠乳浊液(GEM)生成技术 |
| 2528 | 2025-11-15 |
TLR4-IN-C34 attenuates the progression of osteoarthritis through inhibiting inflammation, angiogenesis and pain
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112084
PMID:40854507
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研究论文 | 本文研究TLR4抑制剂C34通过抑制炎症、血管生成和疼痛来减缓骨关节炎进展的作用机制 | 首次在单细胞水平证实TLR4在OA患者软骨中表达升高,并发现特异性TLR4抑制剂C34具有多重抗OA效应 | NA | 探讨TLR4抑制剂C34对骨关节炎的治疗作用及机制 | 人类软骨样本、小鼠骨关节炎模型 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2529 | 2025-11-15 |
Fibroblast Ferroptosis Aggravates Inflammation Response in Dental Pulpitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103927
PMID:41076786
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研究论文 | 本研究揭示牙髓成纤维细胞铁死亡在牙髓炎中加剧炎症反应的新机制 | 首次发现牙髓成纤维细胞铁死亡是牙髓炎症的关键驱动因素,并证实铁死亡抑制剂可缓解炎症 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化需要进一步验证 | 探究铁死亡在牙髓炎中的功能意义及治疗策略 | 人牙髓组织、小鼠模型、牙髓成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光共定位、细胞培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | 人牙髓组织临床标本、实验小鼠模型、体外细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2530 | 2025-11-15 |
Evolution and Co-occurrence of PI3K Pathway Gene Mutations in Endometrial Carcinoma Molecular Subtypes at the Single-Cell Level
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1237
PMID:40833784
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研究论文 | 通过单细胞测序研究子宫内膜癌分子亚型中PI3K通路基因突变的进化模式和共存情况 | 首次在单细胞水平揭示不同分子亚型子宫内膜癌中PI3K通路基因突变的进化模式差异 | 样本量较小,属于探索性研究,需要进一步验证 | 探究PI3K通路基因突变在子宫内膜癌不同分子亚型中的进化模式 | 子宫内膜样子宫内膜癌组织样本 | 单细胞基因组学 | 子宫内膜癌 | 单核DNA测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 11个肿瘤样本(NSMP=5,MMRd=3,POLE=3),共50,009个细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 针对64个癌症相关基因热点变异及PTEN、PIK3R1、PIK3CA编码序列的测序 |
| 2531 | 2025-11-15 |
Composition and functional state of T and NK cells in the extramedullary myeloma tumor microenvironment
2025-Nov-14, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0170
PMID:41236394
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了髓外多发性骨髓瘤肿瘤微环境中T细胞和NK细胞的组成与功能状态 | 首次系统描述EMM肿瘤微环境中T细胞和NK细胞的组成特征和功能状态,并与骨髓微环境进行比较 | 样本量有限,仅在一半的EMM肿瘤中观察到特定现象 | 探究髓外多发性骨髓瘤肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能状态 | 髓外多发性骨髓瘤患者的肿瘤微环境免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2532 | 2025-11-15 |
The aberrant migration and differentiation of neural crest cells are associated with the production of HVP in bearded chicken
2025-Nov-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01726-7
PMID:41236583
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胡须鸡内脏腹膜黑变病的细胞起源和分子机制 | 首次发现HVP黑色素细胞与雪旺细胞具有共同神经嵴细胞起源,并鉴定出SEMA3C-PLXND1和TNC-SDC1轴在黑色素细胞异常迁移和黏附中的关键作用 | 研究样本仅来自胡须鸡,结果在其他鸡种中的普适性需要进一步验证 | 探究内脏腹膜黑变病的细胞起源和分子机制 | 胡须鸡的黑色、褪色和正常腹膜组织 | 单细胞转录组学 | 内脏腹膜黑变病 | 单细胞RNA测序 | UMAP, CellChat | 单细胞转录组数据 | 40日和120日龄胡须鸡的腹膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2533 | 2025-11-15 |
Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma
2025-Nov-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028963
PMID:40758944
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研究论文 | 通过分析多发性骨髓瘤病灶微环境中的中性粒细胞动态,揭示其免疫抑制机制并探索治疗新策略 | 首次在多发性骨髓瘤中鉴定出三个独特的CXCR2+成熟中性粒细胞亚群,并证实TREM1+CD10+亚群与患者预后不良相关 | 临床前模型研究,需进一步临床验证 | 解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境中中性粒细胞的免疫抑制功能 | 多发性骨髓瘤患者的病灶和骨髓样本中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光成像,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多发性骨髓瘤患者配对病灶和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2534 | 2025-11-15 |
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2025-Nov-13, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110805
PMID:41233206
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研究论文 | 本研究通过基因负荷分析和单细胞转录组测序揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础和发育机制 | 整合遗传负荷分析与胚胎单细胞转录组数据,首次系统识别MRKHS的新候选基因并揭示潜在的双基因遗传模式 | MRKHS的遗传病因仍未完全阐明,需要进一步功能验证 | 阐明MRKHS的分子遗传机制和胚胎发育基础 | 727名MRKHS先证者和2504名女性对照个体,人类和小鼠胚胎后肾组织 | 遗传学 | 生殖系统发育异常 | 外显子组测序,基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 727例患者和2504例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2535 | 2025-11-15 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2025-Nov-13, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
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研究论文 | 本研究揭示了活性氧缺陷通过促进小鼠转录本D家族逆转录转座子表达驱动狼疮早期发病的机制 | 首次发现MTD逆转录转座子在组织驻留巨噬细胞中的异常表达与狼疮发病相关,并证明其可作为治疗靶点 | 研究主要基于ROS缺陷的lpr小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明NCF1基因变异导致狼疮的免疫失调机制 | 活性氧缺陷的狼疮易感lpr小鼠的组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮 | bulk RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据 | 狼疮易感lpr小鼠的脾脏、肾脏和颅骨硬脑膜组织 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 2536 | 2025-11-15 |
Exploring the mediating role of potential therapeutic genes in the pathogenesis of hypopituitarism through the metabolites from a genomic perspective
2025-Nov-13, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10169-1
PMID:41233666
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研究论文 | 通过整合基因组数据与代谢物信息,探索潜在治疗基因在垂体功能减退症发病机制中的中介作用 | 首次采用孟德尔随机化方法系统分析基因-代谢物-垂体功能减退症的因果路径,发现UBAC1基因通过1-Methyl-4-imidazoleacetate代谢物介导疾病风险的机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据,缺乏实验验证;中介效应仅解释4.35%的总效应,可能存在其他未发现的机制 | 识别垂体功能减退症的潜在药物靶点并阐明其发病机制 | 垂体功能减退症相关基因和血清/脑脊液代谢物 | 基因组学 | 垂体功能减退症 | 表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位 | 两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化 | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2537 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveal cell-specific mechanisms in systemic lupus erythematosus
2025-Nov-13, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf606
PMID:41233983
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和共定位分析,揭示了系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的致病基因 | 首次在14种人类免疫细胞类型中整合sc-eQTL数据与MR和贝叶斯共定位分析,识别细胞特异性致病机制 | 研究主要关注遗传调控机制,未涉及环境因素和其他非遗传因素的影响 | 识别系统性红斑狼疮中细胞特异性的因果基因和潜在治疗靶点 | 14种人类免疫细胞类型的单细胞表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2538 | 2025-11-15 |
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
PMID:40957419
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研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结通过TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴促进转移的机制 | 首次发现TNBC中TLR4依赖的FRC-单核细胞轴在TDLNs中形成免疫抑制微环境并促进转移 | 主要基于小鼠模型研究,人类样本验证相对有限 | 探究三阴性乳腺癌肿瘤引流淋巴结中细胞网络重组对转移的影响 | 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类TNBC样本 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学,体外抑制实验 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 小鼠肿瘤模型和人类TNBC样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2539 | 2025-11-15 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠单细胞RNA测序数据与体外实验,揭示了缺氧程度调控少突胶质前体细胞在脑卒中后的动态适应性变化 | 首次发现缺氧程度差异可诱导少突胶质前体细胞分化为不同功能亚型(血管生成型和少突胶质生成型),并提出“氧张力”作为关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索少突胶质前体细胞在缺血性脑卒中后的功能适应性及其在细胞治疗中的应用潜力 | 小鼠少突胶质前体细胞及短暂性大脑中动脉闭塞模型 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,细胞培养,细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2540 | 2025-11-15 |
Tracing the enteric neural crest cell pathway from origin to colonization: insights into Hirschsprung's disease
2025-Nov-11, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11211-w
PMID:41217573
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综述 | 本文系统综述了肠道神经系统发育过程中肠神经嵴细胞的迁移路径及其在先天性巨结肠症中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学新技术,揭示ENS发育过程中的时空异质性和谱系多样化 | 肠道组织的固有复杂性(包括多样细胞类型、微环境相互作用和多尺度调控网络)仍阻碍机制洞察和精准治疗 | 阐明肠道神经系统发育的分子机制,重点关注肠神经嵴细胞的迁移过程 | 肠神经嵴细胞及其形成的肠道神经系统 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |