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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示斑马鱼与人类肝脏中保守的细胞身份和纤维化表型 | 首次建立成年斑马鱼肝脏的单细胞RNA测序图谱,发现colec11作为斑马鱼肝星状细胞的新保守标记物,并通过比较分析验证斑马鱼作为肝纤维化研究模型的实用性 | 未明确提及局限性 | 表征成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组以确定其作为研究肝纤维化模型的效用 | 成年斑马鱼肝脏和人类肝脏中的单细胞,尤其是肝星状细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 斑马鱼肝脏样本和人类肝脏样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2522 | 2026-04-25 |
CD16+CD163+ monocytes traffic to sites of inflammation during necrotizing enterocolitis in premature infants
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200344
PMID:34269788
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研究论文 | 利用悬浮和成像质谱流式技术结合单细胞RNA测序,揭示了早产儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞从外周向炎症部位迁移的机制 | 首次鉴定出与NEC相关的CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞新亚型,并证明其从外周循环向肠道炎症组织迁移,为手术性NEC的生物标志物和治疗靶点开发提供新方向 | 未明确说明,但可能包括样本量有限及功能验证需进一步动物实验支持 | 阐明早产儿坏死性小肠结肠炎中炎症相关免疫细胞的亚型及迁移机制 | 早产儿坏死性小肠结肠炎患者的肠道黏膜组织和外周血中的免疫细胞(中性粒细胞、单核细胞/巨噬细胞) | 数字病理学 | 早产儿坏死性小肠结肠炎 | 悬浮质谱流式技术、成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式细胞图像数据 | NA(未明确说明患者数量) | NA | 单细胞RNA测序、质谱流式技术 | NA | NA |
| 2523 | 2026-04-25 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
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研究论文 | 利用空间转录组学和原位测序研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的转录变化和细胞相互作用 | 首次使用全基因组空间转录组学分析揭示AD小鼠模型淀粉样斑块周围100微米范围内的早期和晚期转录变化,并定义了两个基因共表达网络(OLIGs和PIGs),且通过原位测序在细胞水平验证 | 未提及具体局限性 | 研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的分子变化和细胞相互作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型和人类脑切片 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 原位测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠和人类脑切片 | 10x Genomics | 空间转录组学, 原位测序 | 10x Visium, 原位测序平台 | 10x Visium空间转录组学, 原位测序(具体平台未说明) |
| 2524 | 2026-04-25 |
A discriminative learning approach to differential expression analysis for single-cell RNA-seq
2019-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0303-9
PMID:30664774
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA-seq差异表达分析的判别学习方法 | 通过检测大量细胞中的转录动态和基因丰度变化来识别差异表达,并利用伪比对获得的转录本兼容性计数进行无需量化的3'单细胞RNA-seq分析,可识别之前无法检测的标记基因 | 未提及 | 开发一种改进的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 判别学习模型 | 单细胞转录组数据 | 大量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2525 | 2026-04-24 |
PPP1R14A in male erectile dysfunction: key role in smooth muscle cells
2026-Jun, Sexual medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1093/sexmed/qfag021
PMID:42022378
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与全基因组关联分析,揭示PPP1R14A在男性勃起功能障碍中通过调控平滑肌细胞功能发挥关键作用 | 首次通过多组学整合分析(scRNA-seq、GWAS、蛋白质数量性状位点)系统性解析勃起功能障碍的分子机制,发现PPP1R14A作为候选治疗靶点,并筛选出黄体酮和氨苄西林等潜在结合化合物 | 样本量有限,缺乏直接体内外功能验证实验,药物候选的安全性和有效性需进一步临床验证,未能涵盖所有勃起功能障碍亚型和人群多样性 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点并阐明其分子机制 | 勃起功能障碍患者及糖尿病和老年小鼠模型的阴茎海绵体组织 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数量性状位点数据, 表达数量性状位点数据 | 2579个差异表达基因(来自单细胞RNA测序预处理), 113种血浆蛋白(孟德尔随机化分析涉及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2526 | 2026-04-24 |
Dissecting placental host-pathogen interactions: Rift Valley fever virus infection in early human trophoblast stem cells
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115584
PMID:42023155
|
研究论文 | 利用早期人类滋养层干细胞模型解析裂谷热病毒感染胎盘的宿主-病原体互作机制 | 首次使用早期人类滋养层干细胞(hTSC)建立胎盘感染的体外模型,并结合单细胞转录组学与病毒链特异性转录组学揭示裂谷热病毒在早期胎盘中的致病机制 | 未明确说明,但可能包括体外模型与体内环境的差异以及仅使用第一孕期细胞的局限性 | 探究裂谷热病毒在母胎界面的垂直传播机制及其对滋养层细胞的感染和病理影响 | 人早期滋养层干细胞(hTSC) | 数字病理学 | 裂谷热病毒感染相关妊娠疾病 | 免疫荧光、qRT-PCR、蛋白质印迹、单细胞转录组学、病毒链特异性转录组学 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 人类早期滋养层干细胞(未明确具体数量) | Illumina | 单细胞转录组学 | Illumina NovaSeq | 单细胞转录组测序及链特异性病毒转录组分析 |
| 2527 | 2026-04-24 |
Single-cell gene expression and TCR profiling reveal age-related differences in recent thymic emigrants
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115582
PMID:42023153
|
研究论文 | 利用单细胞基因表达和TCR谱系分析揭示新生和成年小鼠近期胸腺迁出细胞在表型和功能上的年龄相关差异 | 首次结合单细胞转录组学和TCR测序,系统比较新生与成年阶段RTE的差异,并发现新生RTE中利用种系编码TCR的细胞具有更明显的效应基因特征 | 研究基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究不同年龄阶段(新生与成年)近期胸腺迁出细胞的表型、功能及TCR使用差异 | 新生和成年小鼠的CD8阳性RTE细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 基因表达数据、TCR序列数据 | 小鼠模型,依赖命运映射模型比较新生和成年样本,具体数量未详述 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 2528 | 2026-04-24 |
CD163 and Tim-4 identify resident intestinal macrophages that are spatially regulated by TGF-β
2026-May-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240801
PMID:42012484
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,识别肠道中由TGF-β空间调控的常驻巨噬细胞,并揭示CD163和Tim-4作为其标志物 | 挑战了肠道巨噬细胞仅存在于肌肉层的传统观点,发现固有层和黏膜下/肌层中均存在长寿命巨噬细胞,并揭示TGF-β信号对固有层巨噬细胞身份维持的关键作用 | 未提及的局限性 | 探究肠道不同组织中长寿命巨噬细胞的表型特征及其调控机制 | 野生型和Ccr2-/-小鼠的肠道巨噬细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和Ccr2-/-小鼠肠道组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2529 | 2026-04-24 |
Parasympathetic nerves in the kidney pelvis contribute to blood pressure regulation
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.002
PMID:41565024
|
研究论文 | 该论文通过实验验证了肾盂中的副交感神经存在,并发现其参与血压调节 | 首次通过光遗传学激活证实迷走神经-肾脏传入通路具有降血压功能,并利用遗传编码乙酰胆碱传感器直接监测肾神经递质释放 | 未明确副交感神经释放乙酰胆碱的具体细胞类型及下游信号通路机制 | 探究肾脏副交感神经支配的存在性及其生理功能 | 小鼠肾盂中的神经支配和乙酰胆碱受体表达 | 生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、定量反转录聚合酶链反应、荧光原位杂交、光纤光度法、光遗传学 | NA | 基因表达数据、生理信号 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序 |
| 2530 | 2026-04-24 |
Klotho in the kidney distal convolution regulates urinary Klotho excretion and kidney calcium reabsorption, but not phosphate homeostasis
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.030
PMID:41759932
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研究论文 | 本研究探讨了肾脏远端曲小管中的Klotho蛋白对尿Klotho排泄和钙重吸收的调节作用,但不影响磷酸盐稳态 | 首次通过多种基因修饰小鼠模型和单细胞RNA测序,明确肾脏远端曲小管(特别是晚期DCT/CNT)是尿液中可溶性Klotho的主要来源,且远端曲小管Klotho调控钙重吸收而非磷酸盐稳态 | 研究基于小鼠模型,结论向人类外推需谨慎;未深入探讨远端曲小管Klotho调控钙重吸收的分子机制细节 | 阐明肾脏远端曲小管中Klotho蛋白在可溶性Klotho释放和矿物质代谢调节中的功能 | 小鼠肾脏远端曲小管细胞及多种基因修饰小鼠模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因修饰小鼠模型(Kl-KODC、Kl-KODCT/CNT、Kl-KODCT仅、泛肾小管敲除) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于分析分离的小鼠远端曲小管细胞 |
| 2531 | 2026-04-24 |
Senolytic Treatment With Fisetin Reverses Age-Related Endothelial Dysfunction Partially Mediated by SASP Factor CXCL12
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70500
PMID:42021544
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老相关内皮功能障碍的分子机制,发现SASP因子CXCL12是关键驱动因素,以及非瑟酮通过清除衰老细胞逆转这一过程 | 首次通过单细胞转录组学揭示衰老内皮细胞中SASP因子CXCL12的升高,并证明非瑟酮治疗可逆转其表达,同时阐明CXCL12在介导内皮功能障碍中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证尚需进一步研究;未完全阐明非瑟酮影响CXCL12的具体分子机制 | 识别与衰老内皮细胞相关的信号通路、内皮相关SASP因子及其对内皮功能的影响 | 小鼠主动脉内皮细胞、人类主动脉内皮细胞、循环SASP因子 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠:年轻(6月龄)和老年(27月龄)雌雄小鼠,每组包括非瑟酮处理组和对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2532 | 2026-04-24 |
Causal Associations Between Immune Cell-Specific Gene Expression and Major Depressive Disorder: A Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization Study
2026-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504837R
PMID:42018362
|
研究论文 | 通过单细胞转录组范围的孟德尔随机化研究,发现免疫细胞特异性基因表达与重度抑郁症之间的因果关联 | 首次将单细胞cis-eQTL数据与孟德尔随机化方法结合,在免疫细胞亚型层面鉴定与抑郁症因果相关的基因靶点 | NA | 利用遗传证据识别特定免疫细胞类型的分子靶点,为精准免疫治疗提供新方向 | 14种免疫细胞亚型(包括CD4 T细胞、未成熟B细胞和浆细胞) | 机器学习 | 重度抑郁症 | 单细胞转录组测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据和GWAS汇总统计数据 | OneK1K队列中14种免疫细胞亚型的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2533 | 2026-04-24 |
Histone lactylation maintains bovine early embryo development via regulating embryonic genome activation
2026-Apr-23, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01398-8
PMID:42021385
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研究论文 | 研究组蛋白乳酸化修饰通过调控胚胎基因组激活来维持牛早期胚胎发育 | 首次揭示组蛋白乳酸化修饰在牛早期胚胎发育中的作用及其通过调控胚胎基因组激活影响胚胎发育的机制,并发现β-烟酰胺单核苷酸可逆转抑制效应 | 未提及具体局限性 | 探究组蛋白乳酸化修饰对牛早期胚胎发育的影响及其机制 | 牛体外受精胚胎 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序、5-乙炔尿苷染色 | NA | 基因表达数据 | 牛体外受精胚胎(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2534 | 2026-04-24 |
Immune Mediators in Birdshot Chorioretinopathy: A Systematic Review
2026-Apr-23, Ocular immunology and inflammation
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/09273948.2026.2655441
PMID:42023421
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综述 | 系统综述了麻雀脉络膜视网膜病变(BSCR)中的免疫介质及其作为生物标志物或治疗靶点的潜力 | 首次系统整合BSCR中细胞因子、趋化因子和免疫细胞群的证据,并强调Th17、CD8+和NK细胞在发病机制中的作用 | 纳入研究数量有限(14项),且多为小样本研究;缺乏足够的多组学数据整合 | 评估BSCR中免疫介质的表达及其作为生物标志物或治疗靶点的潜在价值 | BSCR患者的外周血、房水和玻璃体液样本 | 数字病理学 | 麻雀脉络膜视网膜病变 | RNA测序 | NA | 文本 | 纳入14项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2535 | 2026-04-24 |
The MIF-CD74 axis drives colorectal cancer via glycolytic reprogramming and is targeted by a novel small-molecule inhibitor
2026-Apr-22, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01202-9
PMID:42018204
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研究论文 | 揭示MIF-CD74轴通过糖酵解重编程驱动结直肠癌进展,并鉴定出一种新型小分子抑制剂 | 首次阐明MIF-CD74轴通过上调糖酵解酶促进结直肠癌瓦博格效应的新机制,并发现新型高效抑制剂F3277-0933 | 未在更大规模临床队列中验证抑制剂疗效,且体外实验向临床转化仍需进一步研究 | 研究MIF在结直肠癌代谢重编程中的作用机制及其靶向治疗潜力 | 结直肠癌组织样本、细胞系及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序、虚拟筛选、功能实验 | NA | 单细胞测序数据、临床样本数据、药物筛选数据 | TCGA/GTEx/CPTAC/HPA数据库数据及临床样本验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序分析数据集GSE166555和GSE144735 |
| 2536 | 2026-04-24 |
Cell migration inducing protein alleviates adverse remodeling after ischemia and reperfusion injury by controlling fibroblast activation
2026-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag086
PMID:42019016
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研究论文 | 探究细胞迁移诱导蛋白在控制成纤维细胞活化后减轻缺血再灌注损伤后不良重塑的作用 | 首次揭示CEMIP通过调节透明质酸周转和抑制成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,在心肌梗死后愈合中发挥保护作用 | 仅使用全球Cemip敲除小鼠模型,未在特定细胞类型中验证,且机制研究主要基于体外实验 | 研究CEMIP在心肌梗死后心脏重塑中的功能及其潜在治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠心脏样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2537 | 2026-04-24 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过对淋巴结转移性肢端黑色素瘤进行单细胞RNA测序,揭示SPP1+巨噬细胞驱动的肿瘤微环境重塑及其在转移中的作用 | 首次在肢端黑色素瘤中系统描绘肿瘤微环境在淋巴结转移中的单细胞层面变化,发现SPP1巨噬细胞通过自分泌扩增及SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并验证了抗SPP1治疗的治疗潜力 | 样本量有限(需结合独立验证队列),功能性验证主要依赖体外和体内实验,尚需进一步临床转化验证 | 阐明肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移中的作用机制 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和配对正常组织(伴或不伴淋巴结转移) | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 治疗初治肢端黑色素瘤患者的肿瘤及配对正常样本,涉及淋巴结转移与非转移病例的比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2538 | 2026-04-24 |
Predictive model for clear cell renal cell carcinoma: a novel model integrating sunitinib resistance and prognosis related genes and clinical factors
2026-Apr-22, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04357-x
PMID:42020680
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研究论文 | 开发一种整合舒尼替尼耐药性、预后相关基因和临床因素的列线图模型,用于预测肾透明细胞癌患者的药物敏感性、治疗反应和生存结果 | 首次将舒尼替尼耐药相关基因(IFITM1、IMPA2、KCNN3)与临床因素整合,构建临床基因预后列线图模型(CGPNM),实现药物敏感性、治疗反应和生存结果的综合预测 | 摘要未提及研究的局限性 | 识别与肾透明细胞癌舒尼替尼耐药和预后相关的关键基因,并开发一个整合基因和临床因素的临床基因预后列线图模型 | 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 | 机器学习 | 肾透明细胞癌 | RNA-seq | 列线图模型 | 基因表达数据、临床因素数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2539 | 2026-04-24 |
Imputing causality and clonal dynamics from single-cell transcriptomics in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
2026-Apr-22, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02914-5
PMID:42020783
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞,揭示PIGA突变干细胞的克隆动态和因果关系 | 首次从单细胞转录组层面解析PNH患者中正常造血干细胞与PNH型造血干细胞在骨髓衰竭背景下的差异表达模式,以及免疫负向选择对正常造血干细胞的影响 | 样本量较小,仅纳入PNH细胞比例较大(>50%)和较小(10-50%)的两组患者,可能无法完全反映疾病异质性 | 探究阵发性睡眠性血红蛋白尿症中PIGA突变干细胞的克隆扩增机制及骨髓衰竭的病理生理学 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者,根据PNH细胞比例分为大(>50%)和小(10-50%)两组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2540 | 2026-04-24 |
Dysfunction of the neurovascular unit as a temporal driver in Alzheimer's pathogenesis
2026-Apr-22, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-026-00548-2
PMID:42021347
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综述 | 系统回顾了阿尔茨海默病进展中神经血管单元功能障碍的作用,以及空间转录组学和类器官技术在NVU研究中的应用 | 强调神经血管单元功能障碍可能是阿尔茨海默病发病的早期驱动因素,并整合三维NVU类器官、单细胞分辨率空间转录组学和人工智能技术构建功能结构模型的新视角 | 未明确提及本综述的局限性,但可能受限于现有研究数据的完整性和技术进步的速度 | 系统梳理神经血管单元功能障碍在阿尔茨海默病进展中的时序作用及相关技术应用 | 神经血管单元功能障碍事件,包括内皮细胞紧密连接损伤、周细胞退化、星形胶质细胞和小胶质细胞激活、神经元凋亡,以及Aβ沉积与NVU功能障碍的协同作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 类器官技术, 人工智能, 机器学习, 深度学习 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞分辨率空间转录组学 |