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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2025-11-25 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680117
PMID:41256660
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的基因面板设计框架scGPD,利用单细胞RNA-seq数据为靶向空间转录组学选择紧凑且非冗余的基因集 | 采用基因-基因相关性感知的门控机制,从数据中提取信息特征,促进所选基因的多样性并消除冗余 | NA | 为靶向空间转录组学技术设计信息丰富的基因面板 | 单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2522 | 2025-11-25 |
A Phase I Trial of Evorpacept, Lenalidomide, and Rituximab for Patients with B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2025-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1826
PMID:40729376
|
研究论文 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的安全性及抗肿瘤活性 | 首次将CD47阻断剂Evorpacept与来那度胺和利妥昔单抗联合用于治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤,并证明其可逆转SIRPα+巨噬细胞介导的耐药机制 | 单臂I期研究,样本量较小(20例患者),缺乏对照组 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗在B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和初步疗效 | 接受过至少两种系统治疗的B细胞非霍奇金淋巴瘤成年患者 | 肿瘤免疫治疗 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 20例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2523 | 2025-11-25 |
Multiscale Hyperbolic Embedding for Cell Hierarchies in Large-Scale Bioinformatics Data
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.29.679407
PMID:41256490
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研究论文 | 提出一种名为MuH-MDS的多尺度双曲嵌入算法,用于处理大规模生物信息学数据中的细胞层次结构 | 使用物理学中的'绝热'近似方法优化局部位置同时保持聚类中心固定,计算速度比现有方法提高10倍,能够处理超过80,000个样本的大规模数据集 | 论文未明确说明算法的具体局限性 | 开发可扩展且有效的分析方法,用于大规模数据集的细胞层次结构可视化与解释 | 大规模生物信息学数据集,包括包含80,000多个样本的胚胎发生单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双曲多维标度(MuH-MDS) | 单细胞RNA测序数据 | 超过80,000个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2524 | 2025-11-25 |
BTK Inhibitor Synergizes With CD19-Targeted Chimeric Antigen Receptor-T Cells in Patients With Relapsed or Refractory B-Cell Lymphoma: An Open-Label Pragmatic Clinical Trial
2025-Oct, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71321
PMID:41123227
|
研究论文 | 本研究评估BTK抑制剂联合CD19靶向CAR-T细胞治疗复发或难治性B细胞淋巴瘤的安全性和疗效 | 首次在临床试验中证实BTK抑制剂能够增强CAR-T细胞疗法的抗肿瘤效果,并发现BTKi治疗组T细胞更倾向于早期分化且衰竭程度更低 | 非随机化试验设计,样本量较小(n=37),组间分配基于患者自主选择 | 评估BTK抑制剂联合CD19-CAR-T细胞治疗B细胞淋巴瘤的安全性和临床疗效 | 37例复发或难治性B细胞淋巴瘤患者 | 临床医学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞转录组数据 | 37例患者(CAR-T单药组24例,联合治疗组13例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2525 | 2025-11-25 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-seq Data
2025-Sep-29, ArXiv
PMID:41256885
|
研究论文 | 通过层论拓扑方法和机器学习模型,利用群体规模单核RNA测序数据进行阿尔茨海默病药物重定位研究 | 首次将持久层拉普拉斯算子应用于蛋白质-蛋白质相互作用分析,并结合群体规模snRNA-seq数据开发顺序靶点-药物选择模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证预测结果 | 开发计算药物重定位方法治疗阿尔茨海默病 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的小胶质细胞和脑血管组织细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 差异基因表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 机器学习模型, 持久层拉普拉斯模型 | 基因表达数据 | 来自多患者多区域研究的数十万个细胞核 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2526 | 2025-11-25 |
Interleukin-4-mediated Pro-Regenerative Cellular Reprogramming in 3-dimensional Liver Culture
2025-Sep-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101626
PMID:40907663
|
研究论文 | 本研究利用小鼠三维肝脏切片模型探究白细胞介素-4在肝脏细胞重编程中的作用 | 首次在保留肝脏复杂细胞相互作用的三维培养系统中揭示IL-4的促再生作用机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探究IL-4在肝脏再生中的细胞重编程作用 | 小鼠肝脏切片(包括正常和硫代乙酰胺诱导的病变肝脏) | 单细胞组学 | 肝坏死/肝纤维化 | 单核RNA测序,免疫组织化学染色,ATP检测 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 8-10周龄C57BL/6小鼠的肝脏切片 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2527 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immunoinflammatory cells in the progression of renal tubulointerstitial fibrosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337092
PMID:41269996
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了UUO模型中免疫炎症细胞的动态变化及其与成纤维细胞的相互作用网络 | 研究仅基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的具体作用机制 | 单侧输尿管梗阻模型小鼠的肾脏组织 | 单细胞测序分析 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点(3天、7天、14天)的UUO模型小鼠和假手术组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2528 | 2025-11-25 |
Multi-omics analysis indicates an association between TAPBP and prostate cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336438
PMID:41270069
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定与前列腺癌相关的关键基因TAPBP | 首次整合蛋白质组、转录组、单细胞测序和多种统计方法系统筛选前列腺癌相关基因 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和数量未明确说明 | 识别导致前列腺癌发生的关键基因并寻找潜在药物靶点 | 前列腺癌相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 前列腺癌 | PWAS, TWAS, 单细胞测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2529 | 2025-11-25 |
PDIA3 orchestrates effector T cell program by serving as a chaperone to facilitate the non-canonical nuclear import of STAT1 and PKM2
2024-Aug-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.038
PMID:38822524
|
研究论文 | 本研究揭示了PDIA3通过促进STAT1和PKM2的非经典核输入来调控效应T细胞程序的新机制 | 首次发现PDIA3作为分子伴侣促进STAT1和PKM2的非经典核输入,调控Th1和Th17细胞分化 | PDIA3的高诱导仅发生在异常外部刺激下,这一机制可能在病理条件下特异性发生 | 探索类风湿关节炎中T细胞效应程序的调控机制 | 类风湿关节炎患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2530 | 2025-11-25 |
Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: Insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517679
PMID:39759507
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别前列腺癌中NEFH+恶性细胞亚型及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次发现NEFH+恶性细胞亚型位于分化末端,具有更高恶性程度,并揭示其通过PTN-NCL通路与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索前列腺癌恶性细胞亚型与肿瘤微环境相互作用的机制,为诊疗提供新见解 | 前列腺癌患者单细胞RNA测序数据及MDA PCa 2b、VCap细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因本体分析,基因集富集分析,inferCNV分析,细胞轨迹推断,转录因子调控网络分析 | 风险评分模型,细胞通信预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2531 | 2025-11-24 |
Minimum Redundancy Maximum Relevance Feature Selection-Application on Single-Cell RNA Sequencing Dataset
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_22
PMID:41273564
|
研究论文 | 本研究评估了最小冗余最大相关性特征选择方法在帕金森病单细胞RNA测序数据集上的应用效果 | 将mRMR特征选择方法应用于帕金森病单细胞RNA测序数据,并比较了有无特征选择对分类算法性能的影响 | 仅使用了单一疾病数据集进行评估,缺乏在其他疾病或数据集上的验证 | 评估特征选择方法在单细胞RNA测序数据分析中的效果 | 帕金森病患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | mRMR, 分类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2532 | 2025-11-24 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
|
综述 | 本章讨论慢病毒载体中组成型和脑细胞类型特异性启动子及增强子的开发与应用,以实现精确高效的基因递送 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序技术鉴定新型增强子区域,开发更精细靶向的慢病毒载体 | NA | 提高不同脑细胞群体中转基因表达的精确性和效率 | 兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞等脑细胞群体 | 基因治疗 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2533 | 2025-11-24 |
Screening and Validation of Genes Associated With Lysosomal-Dependent Cell Death in Colorectal Cancer
2025-Dec, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70024
PMID:40964747
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌与溶酶体依赖性细胞死亡的相关性,鉴定出ATP6V0A4、CLU和IL13RA2作为潜在生物标志物 | 首次构建基于溶酶体依赖性细胞死亡相关基因的结直肠癌风险模型,并系统评估其与肿瘤免疫微环境和化疗药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索结直肠癌中溶酶体依赖性细胞死亡相关基因的预后价值和治疗靶点潜力 | 结直肠癌患者和正常组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,Cox回归分析,LASSO分析,富集分析 | 风险模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA-CRC和GSE17538数据集,包含临床样本 | NA | 单细胞测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2534 | 2025-11-24 |
Zebrafish: A Versatile and Powerful Model for Biomedical Research
2025-Dec, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.70080
PMID:41108536
|
综述 | 本文系统阐述了斑马鱼作为生物医学研究模型的优势、应用领域及最新技术进展 | 整合了CRISPR/Cas9、单细胞转录组学、计算建模和机器学习等前沿技术,拓展了斑马鱼在精准医疗中的应用场景 | 存在物种特异性脂质代谢差异和抗体可用性有限等问题 | 探讨斑马鱼模型在精准医疗和疾病建模中的应用价值 | 斑马鱼(Danio rerio)生物模型 | 生物医学研究 | 心血管疾病、神经系统疾病、代谢疾病、肿瘤疾病、传染性疾病、神经精神疾病 | CRISPR/Cas9、prime editing、morpholino、单细胞转录组学、计算建模、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2535 | 2025-11-24 |
An injectable hyaluronic acid-silanol hydrogel containing arginine and puerarin for immune modulation and enhanced diabetic wound healing
2025-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.08.040
PMID:41268352
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研究论文 | 本研究开发了一种含有精氨酸和葛根素的可注射透明质酸-硅醇水凝胶,用于糖尿病伤口愈合的免疫调节和促进治疗 | 首次将透明质酸、硅醇与精氨酸和葛根素结合制成可注射水凝胶,并通过单细胞RNA测序技术深入分析其对巨噬细胞极化的调节机制 | 研究主要基于糖尿病小鼠模型,尚未在临床环境中验证其安全性和有效性 | 开发新型糖尿病伤口愈合治疗方法 | 糖尿病伤口愈合过程及巨噬细胞极化调控 | 生物医学工程 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序,体外实验,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2536 | 2025-11-24 |
Dissecting Shared Genetic Architecture of Thoracic Aortic Aneurysm and Aortic Related Traits and Identifying SplA/Ryanodine Receptor Domain and SOCS Box Containing 1 Involved in Smooth Muscle Phenotype Switching and Cell Senescence Through Alternative Splicing
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502457R
PMID:41251448
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研究论文 | 本研究通过整合基因组数据识别胸主动脉瘤及相关性状的共享遗传结构,并验证SPSB1基因通过可变剪接调控平滑肌细胞表型转换和细胞衰老的作用机制 | 首次系统解析胸主动脉瘤与相关性状的共享遗传结构,发现SPSB1基因通过可变剪接调控平滑肌细胞表型转换的新机制 | 遗传关联研究的样本量未明确说明,功能验证主要依赖小鼠模型和体外实验 | 揭示胸主动脉瘤的遗传基础和相关致病机制 | 胸主动脉瘤患者、小鼠模型、平滑肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, RNA测序, GWAS, MTAG, N-GWAMA | 机器学习 | 基因组数据, 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 2537 | 2025-11-24 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in Lymphatic malformations
2025-Nov-22, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
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研究论文 | 本研究通过多维单细胞分析揭示了淋巴管畸形中的免疫功能障碍和炎症反应机制 | 首次整合单细胞RNA、T细胞受体和B细胞受体测序技术,系统描绘淋巴管畸形患者的免疫图谱,发现促炎性单核细胞扩增和S100A8作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限,主要关注外周血和胸腔积液,未深入探究其他组织部位的免疫变化 | 阐明淋巴管畸形患者的免疫表型和分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq), 单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq) | NA | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 单细胞B细胞受体测序 | NA | NA |
| 2538 | 2025-11-24 |
Systemic activation and tissue infiltration of CD8 + CX3CR1 + T cells in non-small cell lung cancer treated with neoadjuvant immune checkpoint blockade
2025-Nov-22, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03160-9
PMID:41275012
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现CD8+CX3CR1+T细胞在非小细胞肺癌新辅助免疫检查点阻断治疗中显著富集并发挥重要作用 | 首次系统揭示了CD8+CX3CR1+T细胞在NA-ICB治疗中的动态变化、组织迁移和功能分化特征 | 样本量相对有限(40例患者),需要更大规模研究验证 | 探究新辅助免疫检查点阻断治疗非小细胞肺癌中响应性T细胞亚型的特征 | 26例NA-ICB治疗和14例初治的非小细胞肺癌患者的肿瘤组织、配对正常肺组织和外周血样本 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, TCR repertoire分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 40例非小细胞肺癌患者(26例治疗组,14例对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2539 | 2025-11-24 |
ASAH1-mediated sphingolipid metabolic reprogramming in venetoclax resistance of AML: beyond the monocytic phenotypes
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15272-9
PMID:41275169
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了ASAH1介导的鞘脂代谢重编程在急性髓系白血病 Venetoclax耐药机制中的关键作用 | 首次发现单核细胞AML中鞘脂代谢异常与Venetoclax耐药相关,并证明ASAH1基因敲除可增强药物敏感性而不影响单核细胞表型标记 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索急性髓系白血病对Venetoclax耐药的分子机制 | 急性髓系白血病患者骨髓样本、患者来源异种移植模型和诱导耐药细胞系 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,脂质组学测序,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,脂质组学数据 | AML患者骨髓样本、PDX模型和耐药细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,脂质组学测序 | NA | NA |
| 2540 | 2025-11-24 |
Micro-Organ Chip Deciphers Tumor-Derived G-CSF as Remote Commander of Lung Pre-Metastatic Niche via VEGFA-KDR Cascade
2025-Nov-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518584
PMID:41275332
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研究论文 | 本研究利用微器官芯片技术揭示了乳腺癌来源的G-CSF通过VEGFA-KDR信号轴远程调控肺转移前微环境形成的机制 | 首次使用微器官芯片实现肿瘤与肺组织非接触共培养,发现PMN形成不依赖肿瘤细胞直接接触且具有非肿瘤类型特异性,鉴定G-CSF-KDR轴为新型调控通路 | 研究基于体外芯片模型,需进一步体内验证;机制研究主要聚焦于G-CSF-VEGFA-KDR轴,可能存在其他调控因子 | 探究乳腺癌肺转移前微环境的形成机制 | 肿瘤组织与肺组织的相互作用 | 器官芯片技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 细胞因子阵列分析 | 微器官芯片 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |