单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 25361 - 25380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25361 | 2024-08-09 |
New Developments in Transcriptomic Analysis of Synovial Tissue
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.00021
PMID:32083090
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研究论文 | 本文探讨了转录组技术在类风湿性关节炎患者关节组织病理变化研究中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在理解细胞亚群多样性和功能方面的新进展，以及未来高分辨率空间转录组技术的发展前景 | NA | 研究转录组技术在类风湿性关节炎病理机制和潜在治疗靶点发现中的应用 | 类风湿性关节炎患者的关节组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25362 | 2024-08-09 |
IDOL regulates systemic energy balance through control of neuronal VLDLR expression
2019-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0127-7
PMID:32072135
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research paper | 本文研究了IDOL通过调控神经元中VLDLR表达来调节系统性能量平衡的作用 | 首次揭示了IDOL在神经元中通过调控VLDLR表达影响能量平衡的新机制 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究IDOL在系统性能量代谢中的作用及其机制 | IDOL、VLDLR及其在能量代谢中的作用 | NA | diet-induced obesity | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 组织特异性敲除小鼠 |
| 25363 | 2024-08-09 |
Glial cell diversity and methamphetamine-induced neuroinflammation in human cerebral organoids
2021-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0676-x
PMID:32051547
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研究论文 | 本研究使用人脑类器官和单细胞RNA测序技术，探讨了甲基苯丙胺（METH）对胎儿脑发育的影响 | 首次在单细胞分辨率下研究METH诱导的神经炎症，并识别了转录上不同的星形胶质细胞和少突胶质细胞亚群 | NA | 探究METH如何通过分子机制导致神经发育缺陷 | 人脑类器官中的胶质细胞多样性和METH诱导的神经炎症 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 分析了来自八个未处理和六个METH处理的人脑类器官的20,758个细胞 |
| 25364 | 2024-08-09 |
Single-Cell Genomic Characterization Reveals the Cellular Reprogramming of the Gastric Tumor Microenvironment
2020-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3231
PMID:32060101
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胃癌及其配对正常组织和外周血单个核细胞，揭示了胃癌肿瘤微环境中细胞重编程的关键元素。 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析胃癌肿瘤微环境中的细胞重编程，揭示了细胞数量、转录状态和细胞间相互作用的变化。 | NA | 揭示胃癌肿瘤微环境中细胞重编程的关键元素，为理解肿瘤生物学和识别新的治疗靶点提供依据。 | 胃癌患者的肿瘤组织、配对正常组织和外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 56,167个细胞，包括32,407个胃癌细胞、18,657个配对正常组织细胞和5,103个外周血单个核细胞。 |
| 25365 | 2024-08-09 |
ZIAQ: a quantile regression method for differential expression analysis of single-cell RNA-seq data
2020-05-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa098
PMID:32053182
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ZIAQ的分位数回归方法，用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | ZIAQ算法是首个同时考虑了dropout率和复杂单细胞RNA测序数据分布的方法 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据差异表达分析的敏感性和特异性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | 分位数回归 | RNA测序数据 | NA |
| 25366 | 2024-08-09 |
Single cell RNA-seq reveals the landscape of tumor and infiltrating immune cells in nasopharyngeal carcinoma
2020-05-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2020.02.010
PMID:32061950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了鼻咽癌肿瘤及其浸润免疫细胞的复杂景观 | 首次揭示了鼻咽癌肿瘤及其浸润免疫细胞的景观，并分析了肿瘤细胞和免疫细胞的异质性 | NA | 探讨鼻咽癌肿瘤清除机制及其对靶向和免疫治疗的影响 | 鼻咽癌肿瘤细胞及其浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 三个鼻咽癌肿瘤组织 |
| 25367 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomes Reveal Diverse Regulatory Strategies for Olfactory Receptor Expression and Axon Targeting
2020-04-06, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2020.01.049
PMID:32059767
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了果蝇嗅觉受体神经元（ORNs）的转录调控机制，揭示了不同ORN类型在嗅觉受体表达和轴突导向中的多样性调控策略 | 首次通过单细胞RNA测序技术，识别了33个ORNs的转录组集群，并将其与解剖学和生理学定义的ORN类型相对应，揭示了ORNs在生理和连接性协调中的复杂调控网络 | NA | 探究神经元如何协调其生理功能和连接性的调控机制 | 果蝇嗅觉受体神经元（ORNs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 33个转录组集群的ORNs |
| 25368 | 2024-08-09 |
Extensive Clonal Branching Shapes the Evolutionary History of High-Risk Pediatric Cancers
2020-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-3468
PMID:32041836
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研究论文 | 本文通过全基因组拷贝数和全外显子突变分析，重建了56个儿童原发性肿瘤的进化历史，揭示了高风险儿童癌症中广泛克隆分支的进化模式。 | 首次详细探讨了儿童癌症中肿瘤细胞的达尔文进化，特别是通过单细胞测序证实了分支进化的普遍性，并比较了高风险与临床有利肿瘤的遗传多样性。 | 研究主要集中在特定类型的儿童癌症，可能无法完全代表所有儿童癌症的进化模式。 | 探讨儿童癌症中肿瘤细胞的进化历史和遗传变异模式。 | 56个儿童原发性肿瘤，包括神经母细胞瘤、肾母细胞瘤和横纹肌肉瘤。 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 全基因组拷贝数分析、全外显子突变分析、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 56个肿瘤样本，547个单个癌细胞 |
| 25369 | 2024-08-09 |
Comparative single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) reveals liver metastasis-specific targets in a patient with small intestinal neuroendocrine cancer
2020-04, Cold Spring Harbor molecular case studies
IF:1.8Q3
DOI:10.1101/mcs.a004978
PMID:32054662
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研究论文 | 通过比较单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析小肠神经内分泌肿瘤原发灶与匹配的肝转移灶，探讨其对患者转移性疾病治疗的指导作用 | 首次通过比较单细胞RNA测序揭示了小肠神经内分泌肿瘤肝转移灶的特定靶点，并展示了其在指导转移性疾病治疗中的潜在价值 | 在特定病例中，比较单细胞RNA测序并未改变治疗方案，且患者疾病进展涉及未被特征化的非肝转移灶 | 探讨比较单细胞RNA测序在指导小肠神经内分泌肿瘤患者转移性疾病治疗中的应用 | 小肠神经内分泌肿瘤的原发灶与肝转移灶 | 数字病理学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 一个患者的原发小肠神经内分泌肿瘤及匹配的肝转移灶 |
| 25370 | 2024-08-09 |
Cancer-associated fibroblasts that restrain cancer progression: Hypotheses and perspectives
2020-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14346
PMID:32060987
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAF）在癌症进展中的作用，特别是最近发现的具有抑制癌症作用的CAF（rCAF），并探讨了其与抑制纤维化疾病的成纤维细胞的相似性及其在开发新型抗癌疗法中的潜在应用 | 最近的研究揭示了特定亚群的CAF具有抑制癌症的作用，表明CAF在功能和分子水平上具有异质性 | 使用体外培养细胞进行实验可能导致转录和表观遗传变化，从而影响实验结果的解释 | 探讨CAF在癌症进展中的作用，特别是具有抑制癌症作用的CAF（rCAF），并讨论其在开发新型抗癌疗法中的应用 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25371 | 2024-08-09 |
scCATCH: Automatic Annotation on Cell Types of Clusters from Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100882
PMID:32062421
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研究论文 | 介绍了一种名为scCATCH的单细胞聚类自动注释工具，用于从单细胞RNA测序数据中自动注释细胞类型 | scCATCH通过基于证据的评分和组织特异性细胞注释策略，实现了高一致性的细胞类型注释，并优于现有的Seurat等方法 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在六个来自不同组织的已发表的单细胞RNA测序数据集中，scCATCH准确注释了67%-100%的聚类（平均83%） |
| 25372 | 2024-08-09 |
Epithelial Vegfa Specifies a Distinct Endothelial Population in the Mouse Lung
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.009
PMID:32059772
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研究论文 | 本文研究了小鼠肺部由上皮细胞VEGFA指定的一种特殊内皮细胞群体 | 首次揭示了上皮细胞VEGFA在小鼠肺部指定一种特殊内皮细胞群体中的作用 | NA | 探讨上皮细胞VEGFA在小鼠肺部内皮细胞分化中的作用 | 小鼠肺部的内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 约15%的肺部内皮细胞 |
| 25373 | 2024-08-09 |
A Comparative Analysis of Single-Cell Transcriptome Identifies Reprogramming Driver Factors for Efficiency Improvement
2020-Mar-06, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2019.12.035
PMID:32045876
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研究论文 | 本文通过比较分析单细胞转录组，识别出提高重编程效率的驱动因子 | 发现了在核移植2细胞和4细胞胚胎中不完全激活的途径，以及在正常发育的核移植胚胎中发育转录因子的显著表达变化 | NA | 阐明体细胞核移植重编程的潜在分子机制并提高其效率 | 体细胞核移植胚胎中的重编程过程 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及核移植2细胞和4细胞胚胎的多个样本 |
| 25374 | 2024-08-09 |
Occludin protects secretory cells from ER stress by facilitating SNARE-dependent apical protein exocytosis
2020-03-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1909731117
PMID:32051248
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研究论文 | 本文研究了闭合蛋白通过促进SNARE依赖的顶端蛋白胞吐作用保护分泌细胞免受内质网压力的影响 | 首次揭示了闭合蛋白在保护乳汁产生细胞免受内质网压力中的作用，并提出其他紧密连接成分可能参与类似功能的可能性 | NA | 探讨闭合蛋白在乳腺生理中的作用及其对乳汁产生细胞内质网压力的影响 | 闭合蛋白在乳汁产生细胞中的功能及其对内质网压力的影响 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 突变小鼠的乳腺组织 |
| 25375 | 2024-08-09 |
Origin and functional heterogeneity of fibroblasts
2020-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201903188R
PMID:32037627
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综述 | 本文综述了成纤维细胞的起源、功能异质性及其在疾病中的作用 | 探讨了成纤维细胞的发育起源、分子和功能定义、表观遗传控制及其免疫调节功能的演变 | NA | 探讨成纤维细胞的起源和功能异质性 | 成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因工程小鼠模型 | NA |
| 25376 | 2024-08-09 |
CellTagging: combinatorial indexing to simultaneously map lineage and identity at single-cell resolution
2020-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0247-2
PMID:32051617
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellTagging的方法，通过组合细胞索引技术同时捕获细胞谱系信息和细胞身份 | CellTagging方法能够与高通量单细胞RNA测序结合，通过连续的细胞标记构建多层次的谱系树 | 目前的单细胞方法在细胞处理过程中通常会丢失谱系关系 | 开发一种能够同时映射细胞谱系和身份的高通量单细胞技术 | 细胞谱系信息和细胞身份 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 25377 | 2024-08-09 |
Elevated circulating Th2 but not group 2 innate lymphoid cell responses characterize canine atopic dermatitis
2020-Mar, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110015
PMID:32058160
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研究论文 | 研究探讨了犬类特应性皮炎中Th2细胞和2型先天淋巴细胞（ILC2）的反应特征 | 描述了先前未被特征化的犬类ILC2样细胞和Th2细胞，并发现它们在体外产生2型细胞因子并表达转录因子Gata3 | NA | 旨在深入了解导致犬类特应性皮炎的免疫学和遗传学途径，以促进新型治疗方法的开发 | 犬类特应性皮炎中的Th2细胞和ILC2细胞 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25378 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Atlas of Murine Endothelial Cells
2020-02-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.01.015
PMID:32059779
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研究论文 | 本文构建了一个包含来自11种小鼠组织的超过32,000个单个内皮细胞转录组图谱，并识别了78个内皮细胞亚群 | 首次系统地描述了小鼠内皮细胞在不同组织中的异质性，并揭示了内皮细胞在不同血管床和组织类型中的代谢基因特征 | NA | 研究内皮细胞在不同组织中的转录组异质性 | 小鼠内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过32,000个单个内皮细胞 |
| 25379 | 2024-08-09 |
Immune cell landscaping reveals a protective role for regulatory T cells during kidney injury and fibrosis
2020-02-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.130651
PMID:32051345
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研究论文 | 本文通过比较两种导致肾脏再生或纤维化的老鼠模型，利用单细胞RNA测序技术分析了免疫细胞组成，揭示了调节性T细胞在肾脏损伤和纤维化中的保护作用 | 本文首次揭示了调节性T细胞在肾脏损伤和纤维化中的保护作用，并展示了其在不同环境下的功能可塑性 | NA | 研究免疫细胞在肾脏损伤、再生和纤维化过程中的变化 | 老鼠模型中的免疫细胞组成和基因表达 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种老鼠模型 |
| 25380 | 2024-08-09 |
Amniotic fluid cell-free transcriptome: a glimpse into fetal development and placental cellular dynamics during normal pregnancy
2020-02-12, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-0690-5
PMID:32050959
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研究论文 | 本研究探讨了正常妊娠期间羊水细胞游离转录组的变化，以及这些变化如何反映胎儿发育和胎盘细胞动态 | 首次报道了在正常妊娠中，单细胞基因组特征可以在羊水中追踪，并显示出复杂的表达模式 | 需要更大的异质性队列、评估潜在的混杂因素和新的分析方法来定义正常的表达和剪接模式 | 研究正常妊娠期间羊水细胞游离转录组的变化，以发现生物标志物 | 羊水样本中的基因表达和剪接模式 | NA | NA | 人类转录组阵列 | NA | 转录组数据 | 30例中期妊娠和68例足月妊娠的羊水样本 |