单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 25321 - 25340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25321 | 2024-08-09 |
Transcriptional Dynamics of Hepatic Sinusoid-Associated Cells After Liver Injury
2020-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31215
PMID:32145072
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探索了肝脏损伤后肝窦相关细胞的异质性及其在纤维化过程中的转变和相互作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了肝窦相关细胞在纤维化过程中的功能关系，并识别了关键基因PLVAP在调控微循环交换及其在慢性肝病中的破坏作用 | NA | 研究肝脏损伤后肝窦相关细胞的转录动力学及其在纤维化过程中的作用 | 肝窦相关细胞在肝脏损伤后的异质性和转变 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25322 | 2024-08-09 |
Environmental Carcinogenesis at the Single-Cell Level
2020-10, Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology
DOI:10.1158/1055-9965.EPI-19-1364
PMID:32132147
|
研究论文 | 本文探讨了环境化学物质如何导致癌症的机制，并提出使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）来更有效地捕捉这些化学物质的微妙和复杂影响 | 提出使用scRNA-seq技术来研究环境化学物质对基因表达的影响，以及这些化合物如何影响细胞间的信号传导和相互作用 | 传统的流行病学相关性分析、细胞实验和动物模型无法全面检查细胞异质性和组织选择性影响 | 阐明环境化学物质导致癌症的机制 | 环境化学物质对不同细胞类型的选择性作用及其对细胞微环境的影响 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25323 | 2024-08-09 |
RobustClone: a robust PCA method for tumor clone and evolution inference from single-cell sequencing data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa172
PMID:32159762
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RobustClone的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤克隆和进化 | RobustClone采用扩展的鲁棒主成分分析和低秩矩阵分解方法，能够有效处理单细胞测序数据中的错误 | NA | 开发一种高效的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤克隆的进化 | 肿瘤细胞的克隆基因型和进化关系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 鲁棒主成分分析 | 单细胞单核苷酸变异和单细胞拷贝数变异数据 | 两个scSNV和两个scCNV数据集 |
| 25324 | 2024-08-09 |
Deep Phenotyping by Mass Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing Reveals LYN-Regulated Signaling Profiles Underlying Monocyte Subset Heterogeneity and Lifespan
2020-05-08, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315708
PMID:32151196
|
研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序深入分析了LYN酪氨酸激酶在调节单核细胞亚群异质性和寿命中的作用 | 首次探讨了LYN在特定单核细胞亚群稳态调节中的作用，并揭示了其在pMo生理学中的关键角色 | NA | 全面剖析单核细胞的异质性以及Lyn缺陷如何影响单核细胞亚群的组成、信号传导和基因表达 | 单核细胞及其亚群 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及Lyn缺陷的单核细胞和pMo，以及Ldlr-/-小鼠模型 |
| 25325 | 2024-08-09 |
The hypocretin (orexin) system: from a neural circuitry perspective
2020-05-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2020.107993
PMID:32135427
|
综述 | 本文综述了下丘脑中的下丘脑分泌素/食欲素神经元系统的神经回路功能及其在多种行为调节中的作用 | 介绍了病毒介导的追踪系统以及光遗传学、纤维光度测量、细胞类型/通路特异性操作和单细胞RNA测序等先进技术在研究下丘脑分泌素/食欲素系统中的应用 | NA | 探讨下丘脑分泌素神经元到目标脑区的神经通路功能及其对多种行为的调节作用 | 下丘脑分泌素/食欲素神经元及其神经回路 | 神经科学 | NA | 光遗传学、纤维光度测量、单细胞RNA测序 | NA | 神经回路图谱 | NA |
| 25326 | 2024-08-09 |
Statistical significance of cluster membership for unsupervised evaluation of cell identities
2020-05-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa087
PMID:32142108
|
研究论文 | 本文介绍了一种非参数方法，通过测试簇成员资格来无监督地评估细胞身份 | 提出了后验包含概率（PIPs）来评估簇成员资格，并应用于多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 研究如何准确推断细胞身份 | 单细胞RNA测序数据中的细胞身份 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集，包括Jurkat和293T细胞系、八个供体的细胞身份以及外周血单个核细胞 |
| 25327 | 2024-08-09 |
scID Uses Discriminant Analysis to Identify Transcriptionally Equivalent Cell Types across Single-Cell RNA-Seq Data with Batch Effect
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100914
PMID:32151972
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scID的方法，利用Fisher线性判别分析框架来识别跨批次效应的单细胞RNA测序数据中的转录相关细胞类型 | scID方法能够提高在存在批次效应的单细胞RNA测序数据集中识别转录相似细胞类型的能力 | NA | 开发一种新的方法来解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别问题，特别是在存在批次效应的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Fisher线性判别分析 | RNA测序数据 | 多个已发表的数据集 |
| 25328 | 2024-08-09 |
Single-cell mutational profiling enhances the clinical evaluation of AML MRD
2020-03-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019001181
PMID:32150611
|
研究论文 | 本研究通过靶向单细胞测序技术，在急性髓系白血病（AML）的诊断、缓解和复发阶段对MRD进行评估 | 采用靶向单细胞测序技术，提高了AML MRD临床评估的准确性，并能区分前白血病克隆和恶性克隆 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探索单细胞测序技术在AML MRD检测中的应用及其对克隆演化的影响 | 急性髓系白血病患者的MRD及克隆演化 | 数字病理学 | 白血病 | 靶向单细胞测序 | NA | 单细胞序列数据 | 共测序了310,737个单细胞，包括10例复发和4例未复发患者 |
| 25329 | 2024-08-09 |
Complementary Metagenomic Approaches Improve Reconstruction of Microbial Diversity in a Forest Soil
2020-Mar-10, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00768-19
PMID:32156798
|
研究论文 | 本文通过结合细胞分选基础的迷你宏基因组学方法和整体宏基因组学方法，提高了森林土壤微生物多样性的重建 | 本文采用细胞分选基础的迷你宏基因组学方法，与整体宏基因组学方法相结合，揭示了土壤微生物群落的系统发育多样性和功能特性 | 尽管本文的方法提高了微生物多样性的重建，但仍存在部分微生物难以在实验室培养和复杂样本序列组装有限的问题 | 探索和提高森林土壤微生物多样性的认识 | 森林土壤中的微生物群落 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因组 | 200个迷你宏基因组组装的基因组（sorted-MAGs）和29个整体宏基因组组装的基因组（MAGs） |
| 25330 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of the Muscle Stem Cell Hierarchy Identifies Heterotypic Communication Signals Involved in Skeletal Muscle Regeneration
2020-03-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.067
PMID:32160558
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肌肉再生过程中肌肉干细胞的调控机制 | 研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肌肉干细胞与非肌源性细胞之间的旁分泌信号交流，并确定了与肌肉再生相关的多个候选配对 | NA | 探究肌肉再生过程中肌肉干细胞的调控机制 | 肌肉干细胞及其在肌肉再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 超过34,000个单细胞转录组，涵盖四个时间点 |
| 25331 | 2024-08-09 |
Functional hypoxia drives neuroplasticity and neurogenesis via brain erythropoietin
2020-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15041-1
PMID:32152318
|
研究论文 | 本研究通过新型报告鼠模型，展示了认知挑战在海马体锥体神经元中诱导局部/内源性低氧，从而增强EPO及其受体EPOR的表达，并通过高剂量EPO管理促进新CA1神经元的出现和树突棘密度的增加。 | 首次揭示了认知挑战通过诱导局部低氧，触发神经元EPO/EPOR表达，进而促进神经可塑性和神经发生的机制。 | 研究主要依赖于动物模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨EPO在脑部的作用机制及其对认知功能的改善效果。 | EPO在脑部的表达及其对神经可塑性和神经发生的影响。 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 使用新型报告鼠模型进行实验 |
| 25332 | 2024-08-09 |
Time-lapse single-cell transcriptomics reveals modulation of histone H3 for dormancy breaking in fission yeast
2020-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15060-y
PMID:32152323
|
研究论文 | 本研究开发了一种方法，用于从正在进行萌发的单个非同步分生酵母孢子中组装转录组，以评估萌发过程中随时间的转录组变化 | 本研究首次揭示了在萌发初期，组蛋白H3基因的转录波动对孢子萌发的重要性 | 本研究缺乏同步萌发大量孢子的方法，因此分析萌发时的基因表达仍具有挑战性 | 探讨休眠细胞如何打破休眠的关键问题 | 分生酵母的休眠孢子 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 单个非同步分生酵母孢子 |
| 25333 | 2024-08-09 |
Long-lived T follicular helper cells retain plasticity and help sustain humoral immunity
2020-03-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aay5552
PMID:32144185
|
研究论文 | 本文探讨了长寿的T滤泡辅助细胞（T）在维持体液免疫中的作用及其生物学特性 | 首次揭示了T细胞在组织分离过程中易受NAD诱导的细胞死亡影响，以及长寿T细胞在转录和代谢上的独特性 | NA | 研究长寿T细胞的生物学特性和其在体液免疫中的作用 | 长寿T滤泡辅助细胞及其在免疫反应中的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少400天后的感染样本 |
| 25334 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Foxp1-Driven Mechanisms Essential for Striatal Development
2020-03-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.030
PMID:32130906
|
research paper | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了Foxp1转录因子在小鼠纹状体发育中的细胞类型特异性调控机制 | 首次揭示了Foxp1在单细胞水平上调控纹状体细胞组成、神经化学结构和连接性的机制，并关联到FOXP1功能缺失突变患者的表型 | NA | 探究Foxp1在纹状体发育中的转录调控机制及其对功能和行为的影响 | 小鼠纹状体的单细胞和Foxp1调控的靶基因 | digital pathology | autism | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 25335 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2113-3
PMID:32132714
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25336 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis software providers scramble to offer solutions
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0449-8
PMID:32152578
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25337 | 2024-08-09 |
[Application of Single-cell RNA Sequencing in Research on Tumor Immune Microenvironment]
2020-Feb-28, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.11194
PMID:32131950
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够在单细胞水平上检测细胞的转录组，描述其功能状态，从而加深对肿瘤免疫微环境中不同细胞群组成和功能的理解 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境的组成和功能 | 肿瘤免疫微环境中的细胞群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25338 | 2024-08-09 |
A Synthesis Concerning Conservation and Divergence of Cell Types across Epithelia
2020-11-02, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a035733
PMID:32122885
|
研究论文 | 本文通过比较两种发育相关的鼠类上皮组织——气道上皮和小肠上皮，探讨了细胞类型的共性和特异性及其在组织功能中的作用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和计算分析方法，揭示了细胞类型在不同组织中的分布、起源和功能，以及细胞更新和分化的动态过程 | NA | 研究细胞类型在不同上皮组织中的保守性和差异性 | 鼠类气道上皮和小肠上皮组织 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及两种鼠类上皮组织 |
| 25339 | 2024-08-09 |
Targeted Apoptosis of Ductular Reactive Cells Reduces Hepatic Fibrosis in a Mouse Model of Cholestasis
2020-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31211
PMID:32128842
|
研究论文 | 本文研究了胆汁淤积性肝病中，通过靶向诱导胆管反应性细胞（DR细胞）凋亡来减少肝纤维化的方法。 | 使用MCL1抑制剂S63845，一种促凋亡BH3模拟疗法，显著降低了DKO和Mdr2-/- ERC的生存能力，并减少了DR细胞的数量以及炎症和肝纤维化的标志物。 | NA | 研究胆汁淤积性肝病中DR细胞的作用及其通过药物靶向MCL1来减少肝纤维化的效果。 | 胆管反应性细胞（DR细胞）及其在肝纤维化中的作用。 | NA | 肝病 | 单细胞转录组学，免疫染色，高分辨率质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 野生型（WT），Tr-/-，Mdr2-/-和DKO小鼠的胆管反应性细胞（ERCs） |
| 25340 | 2024-08-09 |
The Long Journey from Diagnosis to Therapy
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
评论 | 作者回顾了自己在遗传学领域的40年科研生涯，特别是在杜氏肌营养不良症从诊断到治疗方面的贡献 | 介绍了单细胞测序和体细胞CRISPR编辑等新技术在精准医学中的应用前景 | NA | 回顾遗传学领域的发展，特别是从诊断到治疗的过程 | 杜氏肌营养不良症及其他单基因疾病 | 遗传学 | 肌肉疾病 | 单细胞测序, CRISPR编辑 | NA | NA | NA |