单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 25281 - 25300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25281 | 2024-08-09 |
Transcriptomics: a Solution for Renal Osteodystrophy?
2020-06, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-020-00583-6
PMID:32222893
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review | 本文综述了肾性骨营养不良（ROD）的分子机制及其在骨骼组织转录组学分析中的最新进展和局限性 | 单细胞转录组学分析在识别骨骼中特化的细胞亚群方面已取得成功，但尚未在ROD中进行 | ROD是一种普遍且了解不足的骨病，治疗选择有限 | 探讨ROD的发病机制，并开发适当的诊断和治疗策略 | 肾性骨营养不良（ROD）及其相关骨骼组织的转录组学分析 | NA | 肾性骨营养不良 | 转录组学 | NA | NA | NA |
| 25282 | 2024-08-09 |
Evaluation of STAR and Kallisto on Single Cell RNA-Seq Data Alignment
2020-05-04, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1534/g3.120.401160
PMID:32220951
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研究论文 | 本文系统比较了STAR和Kallisto两种方法在单细胞RNA测序数据对齐方面的性能 | 首次进行了STAR和Kallisto在单细胞RNA测序数据对齐方面的无偏第三方比较 | STAR虽然提高了准确性和基因丰度，但计算时间更长，内存使用更多 | 评估STAR和Kallisto在单细胞RNA测序数据对齐中的表现 | Drop-seq、Fluidigm和10x genomics数据 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了10x genomics PBMC 3K scRNA-Seq和鼠脑皮质单核RNA测序数据 |
| 25283 | 2024-08-09 |
Embryonic endothelial evolution towards first hematopoietic stem cells revealed by single-cell transcriptomic and functional analyses
2020-05, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0300-2
PMID:32203131
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和功能分析揭示了胚胎内皮细胞向最初造血干细胞的演化过程 | 首次使用高精度单细胞转录组学技术，无偏倚地检查了连续发育阶段的内皮细胞群体，并结合计算预测和体内功能验证，精确捕获了具有造血干细胞能力的内皮细胞 | NA | 揭示胚胎内皮细胞向最初造血干细胞的演化过程及其分子机制 | 胚胎内皮细胞和造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从胚胎第9.5天到第11.0天，每隔0.5天收集的内皮细胞群体 |
| 25284 | 2024-08-09 |
Visualization of cardiovascular development, physiology and disease at the single-cell level: Opportunities and future challenges
2020-05, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2020.03.005
PMID:32205182
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病研究中的应用，并讨论了其局限性和未来应用的前景 | scRNA-seq能够解析单个细胞间的生物学差异，并识别容易被忽视的稀有细胞群体 | 讨论了scRNA-seq现有的局限性 | 介绍scRNA-seq方法并总结其在心血管疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25285 | 2024-08-09 |
Mossy cell synaptic dysfunction causes memory imprecision via miR-128 inhibition of STIM2 in Alzheimer's disease mouse model
2020-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13144
PMID:32222058
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研究论文 | 本研究揭示了苔藓细胞（MCs）突触功能障碍通过miR-128抑制STIM2导致阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的记忆不精确 | 发现miR-128通过抑制STIM2的翻译在AD小鼠的MCs中表达增加，从而导致记忆不精确 | NA | 揭示记忆维持或丧失细节的关键突触和分子机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的苔藓细胞（MCs）和SST抑制性中间神经元 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 阿尔茨海默病小鼠的苔藓细胞（MCs） |
| 25286 | 2024-08-09 |
Cardelino: computational integration of somatic clonal substructure and single-cell transcriptomes
2020-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0766-3
PMID:32203388
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cardelino的计算方法，用于推断克隆树配置和单细胞RNA测序（scRNA-seq）检测的单个细胞的克隆起源 | Cardelino方法灵活地整合了基于批量外显子测序数据推断的不完美克隆树信息和scRNA-seq数据中稀疏表达的变异等位基因信息 | NA | 开发一种方法来描述克隆之间的表型变异 | 人类皮肤成纤维细胞系的scRNA-seq和外显子测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），外显子测序 | NA | RNA | 32个人类皮肤成纤维细胞系 |
| 25287 | 2024-08-09 |
Integrative differential expression and gene set enrichment analysis using summary statistics for scRNA-seq studies
2020-03-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15298-6
PMID:32221292
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研究论文 | 本文开发了一种名为iDEA的集成计算方法，通过分层贝叶斯框架联合执行差异表达（DE）和基因集富集（GSE）分析，适用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究 | iDEA方法通过集成DE和GSE分析，提高了DE分析的效力和一致性以及GSE分析的准确性，并且仅使用DE汇总统计数据作为输入，便于与现有DE方法互补和配对 | NA | 开发一种集成且可扩展的计算方法，用于在scRNA-seq研究中联合进行差异表达和基因集富集分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层贝叶斯框架 | 汇总统计数据 | 分析了三个scRNA-seq数据集 |
| 25288 | 2024-08-09 |
Acute kidney injury promotes development of papillary renal cell adenoma and carcinoma from renal progenitor cells
2020-03-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaw6003
PMID:32213630
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研究论文 | 本文研究了急性肾损伤（AKI）如何促进肾前体细胞发展为乳头状肾细胞腺瘤和癌 | 首次展示了AKI如何通过增加细胞有丝分裂和多倍体化，以及NOTCH1过表达，促进乳头状肾细胞癌的发展和复发 | 研究主要基于小鼠模型和人类细胞培养，可能需要更多临床数据验证 | 探讨急性肾损伤对乳头状肾细胞癌发展的影响及其分子机制 | 急性肾损伤后的肾前体细胞和乳头状肾细胞癌 | NA | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单中心和多中心研究的数据，以及小鼠和人类细胞培养样本 |
| 25289 | 2024-08-09 |
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer
2020-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.020
PMID:32209487
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25290 | 2024-08-09 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
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研究论文 | 研究Domatinostat（4SC-202）对非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）细胞存活和单细胞异质性的影响 | 首次探讨了Domatinostat（4SC-202）对ATRT细胞的细胞毒性和细胞抑制作用，并可能靶向癌症干细胞 | 研究主要在2D和3D细胞培养模型中进行，尚未在体内进行验证 | 探究Domatinostat（4SC-202）对非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）的治疗潜力 | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）细胞 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ATRT-06球状体样本 |
| 25291 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its application in breast cancer
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-268
PMID:32217511
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在乳腺癌研究中的应用 | 单细胞测序技术能够分析转录组，探索细胞组成、分化和命运，精细绘制肿瘤微环境，为精准分层和个性化治疗提供支持 | 传统的高通量测序在描述基因组结构改变和亚克隆进化方面存在不足，忽视了肿瘤内、肿瘤间或患者间的异质性 | 旨在解码肿瘤与其微环境在单细胞水平上的多方面相互作用变化，为更好地理解复杂的发病机制和新的免疫治疗途径提供基础 | 乳腺癌及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25292 | 2024-08-09 |
Applications of single-cell RNA sequencing in virology
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-223
PMID:32217512
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在病毒学中的应用及其研究进展 | scRNA-seq技术能够揭示病毒感染过程中细胞异质性的影响，以及病毒与宿主细胞间复杂的相互作用 | NA | 旨在为理解病毒感染和致病机制提供参考，并可能促进潜在抗病毒靶点的开发 | 病毒感染及其与宿主细胞的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25293 | 2024-08-09 |
Long-Term Expansion of Pancreatic Islet Organoids from Resident Procr+ Progenitors
2020-03-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.02.048
PMID:32200801
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术发现了一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞在成年小鼠胰腺胰岛中存在，并能形成胰岛样类器官，具有功能性β细胞的特性 | 首次发现并描述了成年小鼠胰腺中的一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞能够形成功能性胰岛样类器官 | NA | 探索成年小鼠胰腺中Procr阳性细胞群的特性和功能 | 成年小鼠胰腺中的Procr阳性细胞群及其形成的胰岛样类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约占胰岛细胞1%的Procr细胞 |
| 25294 | 2024-08-09 |
Myeloid Cells Enriched for a Dendritic Cell Population From People Living With HIV Have Altered Gene Expression Not Restored by Antiretroviral Therapy
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00261
PMID:32194550
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研究论文 | 研究了HIV感染者中富集的髓系树突状细胞（mDC）的基因表达变化，并探讨了抗逆转录病毒治疗（ART）对这些变化的影响 | 发现HIV感染者中的mDC存在转录变化，部分变化无法通过ART完全恢复 | ART未能完全恢复HIV感染者中mDC的功能 | 探讨ART对HIV感染者中mDC基因表达变化的影响 | HIV感染者中的髓系树突状细胞（mDC） | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HIV感染者和未感染个体的mDC |
| 25295 | 2024-08-09 |
Alginate oligosaccharides improve germ cell development and testicular microenvironment to rescue busulfan disrupted spermatogenesis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.43189
PMID:32194870
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研究论文 | 本文研究了海藻酸寡糖（AOS）对布苏法因破坏的精子发生过程的缓解作用，并通过单细胞RNA测序等技术分析了其对小鼠睾丸细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其分子机制 | NA | 探讨AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其机制 | 小鼠睾丸细胞及精子发生过程 | NA | 男性生殖障碍 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 蛋白质印迹, 液相色谱-质谱联用 | NA | RNA, 代谢物 | 小鼠睾丸样本 |
| 25296 | 2024-08-09 |
Identification and Analysis of Glioblastoma Biomarkers Based on Single Cell Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00167
PMID:32195242
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序结果，利用计算方法筛选出能够区分胶质母细胞瘤肿瘤与其周围环境的标志物，并构建了分类模型。 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中筛选出31个重要基因作为潜在的标志物，并构建了支持向量机分类模型。 | 本研究仅分析了2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞的基因表达谱，样本量相对较小。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和分析胶质母细胞瘤的生物标志物。 | 胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其周围环境。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达谱 | 2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞 |
| 25297 | 2024-08-09 |
Corrigendum: The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00339
PMID:32211338
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25298 | 2024-08-09 |
An Effective Biclustering-Based Framework for Identifying Cell Subpopulations From scRNA-seq Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.2979717
PMID:32167906
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研究论文 | 本文提出了一种基于双聚类的框架DivBiclust，用于从高维噪声的单细胞RNA测序数据中有效识别细胞亚群 | DivBiclust框架在识别细胞亚群方面比九种最先进的方法具有更高的准确性 | NA | 研究如何从单细胞RNA测序数据中识别具有不同功能的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类 | 转录组数据 | 十组不同大小和不同丢失率的实际单细胞RNA测序数据 |
| 25299 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing study of retinal immune regulators identified CD47 and CD59a expression in photoreceptors-Implications in subretinal immune regulation
2020-07, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.24618
PMID:32166783
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集，发现视网膜神经元表达多种免疫调节分子，特别是光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的潜在作用。 | 首次揭示了光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据集和细胞培养实验，缺乏直接的体内功能验证。 | 探讨视网膜神经元中免疫调节分子的表达及其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 视网膜神经元中的免疫调节分子CD47和CD59a的表达及其功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括661W细胞、WERI-Rb1细胞、人眼微切割的光感受器以及实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎（EAU）小鼠的视网膜。 |
| 25300 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing in Hematological Diseases
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900228
PMID:32181578
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了对肿瘤和微环境细胞间变异的深入见解，并允许高分辨率地解析疾病的发病机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 血液系统疾病，包括白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |