单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 25281 - 25300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25281 | 2024-08-09 |
Single-cell resolution analysis of the human pancreatic ductal progenitor cell niche
2020-05-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918314117
PMID:32354994
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞，揭示了其亚群结构及分化潜力 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺主胰管中祖细胞样细胞的多个亚群及其向腺泡组织过渡的表型，并展示了这些细胞在移植后的分化能力 | NA | 研究人胰腺主胰管中多能祖细胞样细胞的特性及其在糖尿病中的潜在应用 | 人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个胰腺样本及糖尿病患者样本 |
| 25282 | 2024-08-09 |
Landscape of genomic imprinting and its functions in the mouse mammary gland
2020-05-05, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa020
PMID:32369566
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠乳腺中基因组印记及其功能 | 首次详细研究了小鼠乳腺中的基因组印记，并揭示了印记基因在乳腺发育和泌乳中的作用 | NA | 研究小鼠乳腺中基因组印记的作用及其对乳腺发育和泌乳的影响 | 小鼠乳腺中的印记基因及其表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 25283 | 2024-08-09 |
Interstitial Cell Remodeling Promotes Aberrant Adipogenesis in Dystrophic Muscles
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107597
PMID:32375047
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析健康与肌营养不良骨骼肌中的间质细胞群，揭示了CD142阳性细胞通过分泌GDF10抑制脂肪生成的作用，并发现肌营养不良中该细胞群的缺失与异常脂肪沉积有关。 | 首次通过单细胞RNA测序技术解析肌营养不良骨骼肌中间质细胞的特性，并发现CD142阳性细胞在抑制脂肪生成中的关键作用。 | 研究主要集中在小鼠和人类样本上，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性。 | 探究肌营养不良中骨骼肌纤维化和脂肪替代的机制，为治疗提供新思路。 | 肌营养不良患者的骨骼肌中间质细胞及其在脂肪生成中的作用。 | 数字病理学 | 肌营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 25284 | 2024-08-09 |
Defining the Homo- and Heterodimerization Propensities of Metabotropic Glutamate Receptors
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107605
PMID:32375054
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和开发基于荧光的定量检测方法，研究了代谢型谷氨酸受体（mGluRs）的同型和异型二聚化倾向 | 首次详细定义了组I、II和III mGluRs的同型和异型二聚化倾向，并通过体内RNA杂交和共免疫沉淀实验验证了mGluR2与mGluR3的异型二聚化偏好 | NA | 阐明代谢型谷氨酸受体的同型和异型二聚化倾向及其在神经系统中的生物学意义 | 代谢型谷氨酸受体（mGluRs）及其在皮质锥体细胞中的表达和二聚化倾向 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 荧光检测, 体内RNA杂交, 共免疫沉淀 | NA | RNA序列 | 多个皮质锥体细胞样本 |
| 25285 | 2024-08-09 |
Prediction model construction of mouse stem cell pluripotency using CpG and non-CpG DNA methylation markers
2020-May-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3448-3
PMID:32366211
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研究论文 | 本研究利用单细胞DNA甲基化和RNA测序数据，构建了一个机器学习模型，用于预测小鼠胚胎干细胞的多能性程度 | 首次测试了CpG和非CpG标记以及它们的组合在预测小鼠胚胎干细胞多能性中的预测能力 | NA | 研究CpG和非CpG甲基化与小鼠干细胞多能性的关系，并开发相应的预测模型 | 小鼠胚胎干细胞的多能性 | 机器学习 | NA | scBS-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA测序数据 | 16个CpG标记和33个非CpG标记 |
| 25286 | 2024-08-09 |
Reprogramming Axial Level Identity to Rescue Neural-Crest-Related Congenital Heart Defects
2020-05-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.04.005
PMID:32369742
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研究论文 | 本研究探讨了心脏神经嵴的分子机制，并发现了一种转录子电路，该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | 发现了一种新的转录子电路（Tgif1, Ets1, 和 Sox8），该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | NA | 揭示心脏神经嵴的分子机制，并探索其对心脏发育的影响 | 心脏神经嵴及其在心脏发育中的作用 | 心血管疾病 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25287 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Combination with Protein and DNA Analyses
2020-05-04, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9051130
PMID:32375335
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其与蛋白质和DNA分析结合的最新进展和应用 | 结合scRNA-seq与基因组或蛋白质组数据，能更全面地描述细胞异质性 | 讨论了scRNA-seq技术的优势和局限性，并指出其在商业化过程中仍面临的挑战 | 全面回顾scRNA-seq技术及其在生物医学应用中的潜力 | 单细胞RNA测序技术及其与蛋白质和DNA分析的结合 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25288 | 2024-08-09 |
Regenerative potential of prostate luminal cells revealed by single-cell analysis
2020-05-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay0267
PMID:32355025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺腔细胞的再生潜力 | 研究发现前列腺再生不仅由稀有的干细胞驱动，而是几乎所有持续存在的前列腺腔细胞都参与其中 | NA | 探讨前列腺再生过程中腔细胞的作用 | 前列腺腔细胞及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的前列腺组织样本 |
| 25289 | 2024-08-09 |
Context specificity of the EMT transcriptional response
2020-05-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16066-2
PMID:32358524
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研究论文 | 本文通过高多重单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了上皮-间质转化（EMT）反应的上下文特异性 | 首次展示了EMT反应的高度上下文特异性，并揭示了其信号依赖性和模块性 | NA | 研究EMT反应的特异性和复杂性 | 上皮-间质转化（EMT）反应 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 103,999个细胞，来自960个样本，包括12个EMT时间序列实验和独立的激酶抑制剂筛选 |
| 25290 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome in Chronic Myeloid Leukemia: Pseudotime Analysis Reveals Evidence of Embryonic and Transitional Stem Cell States
2020-05, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.04.005
PMID:32360510
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了慢性髓性白血病（CML）患者CD34+细胞的基因表达模式，并利用伪时间分析揭示了胚胎和过渡性干细胞状态的存在 | 首次通过单细胞转录组测序和伪时间分析，揭示了CML干细胞中存在的胚胎和过渡性干细胞状态，并发现了与多能性标记相关的基因表达模式 | 研究样本仅来自三位CML患者，可能影响结果的普遍性 | 探索慢性髓性白血病干细胞异质性的分子机制 | 慢性髓性白血病患者的CD34+细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | t-分布随机邻域嵌入（tSNE）算法 | 基因表达数据 | 三位CML患者的CD34+细胞 |
| 25291 | 2024-08-09 |
Highly parallel and efficient single cell mRNA sequencing with paired picoliter chambers
2020-04-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15765-0
PMID:32355211
|
research paper | 本文介绍了一种名为Paired-seq的单细胞mRNA测序平台，具有高细胞/珠利用效率、无细胞RNA去除能力、高基因检测能力和低成本的特点 | 利用差流阻力原理实现单细胞/条形码珠配对，结合阀门和泵实现无细胞RNA的完全去除，提高了mRNA检测的准确性和灵敏度 | NA | 开发一种高效、低成本的单细胞mRNA测序技术 | 单细胞mRNA测序技术及其在细胞生物学、发育生物学和精准医学中的应用 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 涉及mES细胞和药物处理细胞的单细胞表达谱 |
| 25292 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional networks in differentiating preadipocytes suggest drivers associated with tissue heterogeneity
2020-04-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16019-9
PMID:32355218
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合独特的网络方法和数据整合技术，预测了分化细胞的代谢表型，并识别了与脂肪细胞异质性相关的锌指蛋白网络 | 本研究首次识别了与脂肪细胞分化相关的锌指蛋白网络，并揭示了白色脂肪细胞的异质性及其与正常代谢和疾病的关系 | NA | 深入理解白色脂肪细胞的异质性及其与正常代谢和疾病的关系 | 人类前脂肪细胞在体外脂肪生成过程中的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少两种不同类型的皮下白色脂肪细胞 |
| 25293 | 2024-08-09 |
SpatialCPie: an R/Bioconductor package for spatial transcriptomics cluster evaluation
2020-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3489-7
PMID:32349652
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研究论文 | 介绍了一个名为SpatialCPie的R包，用于空间转录组数据聚类评估 | SpatialCPie能够在多个分辨率下对数据进行聚类，并通过饼图和聚类图直观展示空间区域与聚类之间的相似性和聚类间的关系 | NA | 开发工具以简化空间转录组数据分析中的聚类评估 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 多个公开可用数据集 |
| 25294 | 2024-08-09 |
Association of Urine sCD163 With Proliferative Lupus Nephritis, Fibrinoid Necrosis, Cellular Crescents and Intrarenal M2 Macrophages
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00671
PMID:32351512
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研究论文 | 研究评估尿液可溶性CD163（sCD163）作为狼疮性肾炎（LN）生物标志物的潜力 | 发现尿液sCD163在活动性LN患者中显著升高，并与多种肾脏病理特征相关，表明其作为预测肾脏病理的潜在标志物 | 研究主要集中在活动性LN患者，未涵盖所有LN患者群体 | 评估尿液sCD163作为狼疮性肾炎生物标志物的潜力 | 活动性狼疮性肾炎患者、活动性非肾脏狼疮患者、非活动性系统性红斑狼疮患者及健康对照 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA | NA | 尿液蛋白质 | 228名系统性红斑狼疮患者和56名健康对照 |
| 25295 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of liver-resident immune cells in human
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-0157-z
PMID:32351704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了人肝脏驻留免疫细胞的异质性 | 首次详细描述了人肝脏中超过30种不同免疫细胞亚群的组成、基因表达和功能模块，并提出了基于趋化因子受体的T和NK细胞分类系统 | NA | 揭示人肝脏驻留免疫细胞的异质性和功能多样性 | 人肝脏驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共70,706个CD45免疫细胞样本，包括肝脏、脾脏和外周血 |
| 25296 | 2024-08-09 |
YAP1 mediates gastric adenocarcinoma peritoneal metastases that are attenuated by YAP1 inhibition
2021-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-319748
PMID:32345613
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了YAP1在腹膜癌病中的重要作用，并证明了YAP1抑制剂在治疗中的有效性 | NA | 研究YAP1在胃腺癌腹膜转移中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 患者来源的腹膜癌细胞、患者来源的异种移植模型和患者来源的原位模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫荧光染色、免疫组织化学染色、RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | 细胞 | 约45%的晚期胃腺癌患者 |
| 25297 | 2024-08-09 |
Defective Sec61α1 underlies a novel cause of autosomal dominant severe congenital neutropenia
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.034
PMID:32325141
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研究论文 | 本文探讨了SEC61A1基因突变导致常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的新机制 | 首次报道SEC61A1基因突变与常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的关联 | NA | 扩展SEC61A1介导的疾病谱，包括常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症 | SEC61A1基因突变及其对中性粒细胞成熟的影响 | NA | 严重先天性中性粒细胞减少症 | 全外显子测序、Western blot、Ca2+通量测定、CD34+细胞体外分化、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 一个患有严重先天性中性粒细胞减少症的患者及其非近亲比利时父母 |
| 25298 | 2024-08-09 |
The origin, fate and function of macrophages in the peripheral nervous system-an update
2020-10-20, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaa030
PMID:32322888
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研究论文 | 本文综述了近年来巨噬细胞生物学领域的进展，特别是关于外周神经系统中巨噬细胞的起源、命运和功能 | 利用Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型和高通量技术如bulk RNA测序和单细胞RNA测序，首次详细描述了特定巨噬细胞群体的发育和功能 | 外周神经系统中的巨噬细胞群体尚未得到详细研究 | 探讨外周神经系统中巨噬细胞的发育、异质性和基因表达特征 | 外周神经系统中的巨噬细胞 | NA | NA | Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 转基因小鼠模型 |
| 25299 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing not detected using traditional RNA sequencing and microarray
2020-10, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-020-0428-1
PMID:32327726
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统RNA测序和微阵列技术未能检测到的差异表达基因 | 本研究首次使用10× genomics单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统技术未能检测到的差异表达基因，并探讨了这些基因与肺腺癌生存的关系 | 本研究仅限于肺腺癌细胞，且样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别肺腺癌细胞中的差异表达基因，并探讨其与癌症进展的关系 | 肺腺癌细胞和正常肺细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 159,219个细胞和594个样本 |
| 25300 | 2024-08-09 |
Using Single-Cell and Spatial Transcriptomes to Understand Stem Cell Lineage Specification During Early Embryo Development
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在早期胚胎发育过程中理解干细胞谱系特化的分子调控和组织模式 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新兴技术在解析细胞组织、形态和分子特性差异以及谱系分配中的应用 | NA | 探讨胚胎发育和干细胞分化过程中的分子调控机制和组织结构 | 干细胞谱系特化及其在胚胎发育中的分子轨迹和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |