单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27130 篇文献，本页显示第 25261 - 25280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25261 | 2024-08-09 |
Single-cell characterization and metabolic profiling of in vitro cultured human skeletal progenitors with enhanced in vivo bone forming capacity
2020-03, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0151
PMID:31738481
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研究论文 | 研究了无血清预处理对人类骨膜来源细胞的细胞和分子变化，以及其在体内骨形成能力增强的机制 | 首次揭示了无血清预处理通过激活与骨发育和骨折愈合相关的通路和转录调控因子，增强体内骨形成能力 | NA | 探索无血清预处理对人类骨膜来源细胞的影响及其在体内骨形成中的作用 | 人类骨膜来源细胞及其在无血清预处理后的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25262 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals differential nutrient absorption functions in human intestine
2020-02-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191130
PMID:31753849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自人类回肠、结肠和直肠的14,537个上皮细胞，揭示了小肠和大肠在营养吸收功能上的差异 | 发现了人类大肠中类似潘氏细胞的存在，并鉴定了人类瞬时增殖细胞和杯状细胞的新标记基因 | NA | 详细描述人类肠道细胞组成和功能，以更好地理解人类肠道疾病 | 人类肠道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,537个上皮细胞 |
| 25263 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome sequencing of rumen ciliates provides insight into their molecular adaptations to the anaerobic and carbohydrate-rich rumen microenvironment
2020-02, Molecular phylogenetics and evolution
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.ympev.2019.106687
PMID:31740334
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，探索了三种瘤胃纤毛虫（Entodinium furca、Diplodinium dentatum和Isotricha intestinalis）对瘤胃厌氧和富含碳水化合物微环境的分子适应性 | 首次揭示了瘤胃纤毛虫通过水平基因转移（HGT）获取原核生物基因来消化植物生物质的机制 | NA | 探究瘤胃纤毛虫对瘤胃微环境的分子和机制性适应 | 三种瘤胃纤毛虫的适应性进化 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 三种瘤胃纤毛虫 |
| 25264 | 2024-08-09 |
Guiding T lymphopoiesis from pluripotent stem cells by defined transcription factors
2020-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0251-7
PMID:31729468
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研究论文 | 本文研究了通过特定转录因子在体外诱导多能干细胞向T淋巴细胞分化的方法 | 首次证明Runx1和Hoxa9的协同短暂表达可以在体外PSC分化方案中优先产生可移植的造血祖细胞，这些祖细胞能够归巢到胸腺并发育成成熟的T细胞 | NA | 实现从多能干细胞中获得免疫活性及治疗性T淋巴细胞 | 多能干细胞向T淋巴细胞的分化 | 干细胞生物学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25265 | 2024-08-09 |
Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ
2020-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0631-4
PMID:31740815
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研究论文 | 本文介绍了一种名为pciSeq的方法，通过结合单细胞RNA测序和原位测序技术，实现了对紧密相关细胞类型的精细空间映射。 | pciSeq方法利用先前的scRNA-seq分类结果，通过多重原位RNA检测技术来识别细胞类型，为理解组织中细胞类型的空间组织提供了一种新方法。 | NA | 开发一种新的方法来识别和映射紧密相关细胞类型的空间组织。 | 小鼠海马区CA1的抑制性神经元及其层状组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 原位测序 | NA | RNA | 小鼠海马区CA1的抑制性神经元 |
| 25266 | 2024-08-09 |
Enteroendocrine Progenitor Cell-Enriched miR-7 Regulates Intestinal Epithelial Proliferation in an Xiap-Dependent Manner
2020, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2019.11.001
PMID:31756561
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研究论文 | 研究探讨了肠内分泌细胞（EEC）前体细胞中富集的miR-7如何通过Xiap依赖的方式调节肠道上皮细胞增殖 | 首次证明EEC前体细胞中富集的miR-7受饮食扰动的影响，并通过完整的Xiap和Egfr信号通路调节肠道类器官的生长 | NA | 探究肠内分泌细胞前体细胞在肠道上皮生长和更新中的作用机制 | 肠内分泌细胞（EEC）前体细胞及其miR-7的调控作用 | NA | NA | 无偏序列分析、单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 使用了八种不同的老鼠模型和分类方法 |
| 25267 | 2024-08-09 |
Transcriptomic, epigenetic, and functional analyses implicate neutrophil diversity in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus
2019-12-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1908576116
PMID:31754025
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研究论文 | 本文通过转录组学、表观遗传学和功能分析研究了中性粒细胞在系统性红斑狼疮发病机制中的多样性 | 首次系统地确定了低密度粒细胞（LDGs）的起源、表型、功能和致病性异质性 | NA | 探究中性粒细胞在系统性红斑狼疮中的作用及其多样性 | 系统性红斑狼疮中的低密度粒细胞（LDGs）及其亚群 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | bulk和单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组数据 | 系统性红斑狼疮低密度粒细胞、自体正常密度中性粒细胞和健康对照中性粒细胞 |
| 25268 | 2024-08-09 |
TCR sequencing paired with massively parallel 3' RNA-seq reveals clonotypic T cell signatures
2019-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0544-5
PMID:31745340
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研究论文 | 本文介绍了一种结合TCR测序和大规模3' RNA-seq的方法，用于分析单细胞RNA测序样本中的TCR序列和相应转录组 | 该方法能够同时分析TCR序列和相应的全转录组，适用于常见的3' scRNA-seq方法，并可适应事后处理的样本 | NA | 研究与共享TCR的T细胞相关的转录组特征，特别是在食物过敏等疾病中，克隆型驱动的反应对理解基础生物学至关重要 | 免疫细胞，特别是T细胞及其抗原受体TCR | 数字病理学 | 食物过敏 | 3'单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 免疫小鼠和食物过敏患者的样本 |
| 25269 | 2024-08-09 |
Murine single-cell RNA-seq reveals cell-identity- and tissue-specific trajectories of aging
2019-12, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.253880.119
PMID:31754020
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠三个组织中超过50,000个细胞，揭示了细胞身份和组织特异性衰老轨迹 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术，结合矩阵分解和最优传输方法，揭示了细胞身份和组织环境对衰老轨迹和幅度的影响 | NA | 探讨细胞身份和组织环境对哺乳动物细胞衰老轨迹的影响 | 小鼠的三个组织中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 25270 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Profound Alterations in Mechanosensitive Dorsal Root Ganglion Neurons with Vitamin E Deficiency
2019-Nov-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.10.064
PMID:31733517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了维生素E缺乏对机械敏感的背根神经节神经元（DRGNs）的深刻影响 | 研究发现维生素E缺乏导致机械敏感的酪氨酸羟化酶阳性（TH+）DRGNs中电压门控Ca和K通道显著上调，这一发现挑战了传统的本体感觉机制 | NA | 探讨维生素E缺乏对背根神经节神经元分子特征和功能特性的影响 | 背根神经节神经元（DRGNs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Ttpa小鼠的背根神经节神经元 |
| 25271 | 2024-08-09 |
A divergent transcriptional landscape underpins the development and functional branching of MAIT cells
2019-11-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aay6039
PMID:31757835
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，分析了小鼠和人类中伴随MAIT细胞发育各阶段转录景观的变化。 | 首次详细描述了MAIT细胞发育过程中的转录调控事件，并揭示了成熟MAIT细胞中的不同亚群。 | NA | 研究MAIT细胞发育过程中的转录调控机制。 | MAIT细胞的发育和功能分支。 | 免疫学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 |
| 25272 | 2024-08-09 |
Development and validation of a metastasis-associated prognostic signature based on single-cell RNA-seq in clear cell renal cell carcinoma
2019-11-20, Aging
DOI:10.18632/aging.102434
PMID:31747386
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，开发并验证了一种基于透明细胞肾细胞癌的转移相关预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出44个转移相关标记基因，并构建了一个包含17个关键转移相关基因的预后模型 | NA | 开发和验证一种新的预后标志物，用于预测透明细胞肾细胞癌患者的总生存期和无进展生存期 | 透明细胞肾细胞癌的单细胞表达谱和转移相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 121个细胞样本和626名患者 |
| 25273 | 2024-08-09 |
Non-Genetic Intra-Tumor Heterogeneity Is a Major Predictor of Phenotypic Heterogeneity and Ongoing Evolutionary Dynamics in Lung Tumors
2019-11-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.045
PMID:31747591
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研究论文 | 本文分析了肺鳞状细胞癌中的基因和非基因性肿瘤内异质性（ITH），通过多区域批量和单细胞测序，探讨了其在基因组、转录组和肿瘤-免疫相互作用及组织病理学特征层面的影响。 | 研究发现非基因性异质性是影响肺肿瘤组织病理学特征异质性和进化动力学的主要因素。 | NA | 探讨基因和非基因性肿瘤内异质性对肿瘤表型和可演化性的影响。 | 肺鳞状细胞癌的肿瘤内异质性。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 多区域样本 |
| 25274 | 2024-08-09 |
Neuronal maturation reduces the type I IFN response to orthobunyavirus infection and leads to increased apoptosis of human neurons
2019-Nov-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-019-1614-1
PMID:31739796
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研究论文 | 研究使用人脑类器官（COs）探讨了不同发育阶段的神经元对拉科斯特病毒（LACV）感染的反应，发现神经元成熟度增加会提高对LACV诱导的细胞凋亡的敏感性 | 首次揭示了神经元成熟度与对LACV感染反应之间的关系，以及外源性重组干扰素在保护神经元免受病毒诱导的细胞死亡中的作用 | 研究主要集中在体外模型，未来需要进一步在体内模型中验证这些发现 | 探讨神经元对拉科斯特病毒感染的反应及其与神经元成熟度的关系 | 人脑类器官中的不同发育阶段神经元 | NA | 儿童虫媒脑炎 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含不同发育阶段神经元的人脑类器官 |
| 25275 | 2024-08-09 |
Assessment of computational methods for the analysis of single-cell ATAC-seq data
2019-11-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1854-5
PMID:31739806
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研究论文 | 本文介绍了一个基准框架，用于评估10种计算方法在13个合成和真实数据集上的单细胞ATAC-seq数据分析能力 | 首次系统地评估了多种计算方法在单细胞ATAC-seq数据分析中的表现，并提供了最佳实践推荐 | 文章主要集中在计算方法的比较，未深入探讨生物学解释和实际应用场景 | 评估和比较不同的计算方法在单细胞ATAC-seq数据分析中的效果 | 10种计算方法和13个合成及真实数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 超过80,000个细胞的大数据集 |
| 25276 | 2024-08-09 |
Bulk and Single-Cell Next-Generation Sequencing: Individualizing Treatment for Colorectal Cancer
2019-Nov-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11111809
PMID:31752125
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综述 | 本文综述了下一代测序技术（NGS）在结直肠癌（CRC）个体化治疗中的最新进展和未来展望 | 通过多区域批量组织NGS和新兴的单细胞转录组学，结合循环游离DNA（cfDNA）的NGS，揭示了预测治疗反应和药物开发的新策略 | NA | 旨在通过集成测序系统探索基因组和转录组，以克服研究和临床挑战，推动精准肿瘤学的发展 | 结直肠癌（CRC） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 25277 | 2024-08-09 |
Contribution of Single-Cell Transcriptomics to the Characterization of Human Spermatogonial Stem Cells: Toward an Application in Male Fertility Regenerative Medicine?
2019-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms20225773
PMID:31744138
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研究论文 | 本文讨论了利用单细胞转录组测序技术（scRNAseq）在人类精原干细胞（SSC）及其前体细胞定义方面的最新进展 | scRNAseq技术作为一种新的诊断工具，用于个性化调查男性不育症 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在人类精原干细胞及其前体细胞定义中的应用，以及其在男性生育再生医学中的潜在应用 | 人类精原干细胞（SSC）及其前体细胞 | 基因组学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25278 | 2024-08-09 |
Sertoli cell-only phenotype and scRNA-seq define PRAMEF12 as a factor essential for spermatogenesis in mice
2019-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13193-3
PMID:31729367
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研究论文 | 本文研究了PRAMEF12在维持小鼠精子发生中的关键作用，并通过单细胞转录组分析揭示了其对精原干细胞的影响。 | 首次揭示了PRAMEF12在精子发生中的重要作用，并通过单细胞转录组分析详细描述了其对精原干细胞状态的影响。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证。 | 探讨PRAMEF12在精子发生中的作用及其对生殖医学的潜在影响。 | 小鼠的精子发生过程及PRAMEF12的作用。 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠的精子发生过程中的多个细胞状态 |
| 25279 | 2024-08-09 |
A Bayesian mixture model for the analysis of allelic expression in single cells
2019-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13099-0
PMID:31729374
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research paper | 本文提出了一种用于单细胞RNA-Seq数据中等位基因表达分析的贝叶斯混合模型方法 | 该方法通过跨细胞池化信息，提高了等位基因比例估计的准确性，并减少了采样变异性，同时不牺牲细胞间的异质性 | NA | 旨在改进单细胞水平上等位基因特异性表达的分析方法 | 单细胞RNA-Seq数据中的等位基因特异性表达 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | 贝叶斯混合模型 | RNA-Seq数据 | 多个单细胞样本 |
| 25280 | 2024-08-09 |
B Cells and T Follicular Helper Cells Mediate Response to Checkpoint Inhibitors in High Mutation Burden Mouse Models of Breast Cancer
2019-11-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.028
PMID:31730857
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研究论文 | 本研究通过使用三阴性乳腺癌小鼠模型，识别了免疫检查点抑制剂反应的介导机制 | 开发了新的乳腺肿瘤模型，并揭示了免疫检查点疗法通过激活T滤泡辅助细胞和B细胞来促进抗肿瘤反应 | NA | 识别免疫检查点抑制剂反应的介导机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序 | NA | mRNA测序数据 | 免疫疗法治疗和未治疗的敏感及耐药小鼠模型的肿瘤样本 |