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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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25221 | 2024-08-09 |
Stably expressed genes in single-cell RNA sequencing
2020-02, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720020400041
PMID:32336251
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研究论文 | 本文研究了在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中表达稳定的基因,并探讨了这些基因在数据标准化中的应用 | 提出使用内源性表达稳定的基因作为scRNA-seq数据标准化的参考,而不是依赖外部合成基因 | 尚未明确表达稳定的基因在不同标准化方法中的适用性 | 探索在单细胞RNA测序中用于数据标准化的稳定表达基因 | 研究与细胞结构相关的基因及其在scRNA-seq中的表达稳定性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
25222 | 2024-08-09 |
Improved Prognostic Prediction of Glioblastoma using a PAS Detected from Single-cell RNA-seq
2020, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.44034
PMID:32328180
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据筛选出与胶质母细胞瘤预后相关的差异表达基因,并构建了一个预测模型来提高患者的生存概率预测 | 利用单细胞RNA测序数据筛选出与胶质母细胞瘤预后相关的基因集,并构建了一个新的预测模型 | NA | 提高胶质母细胞瘤患者的生存概率预测 | 胶质母细胞瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
25223 | 2024-08-09 |
Changing Technologies of RNA Sequencing and Their Applications in Clinical Oncology
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00447
PMID:32328458
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研究论文 | 本文讨论了RNA测序技术的发展及其在临床肿瘤学中的应用 | 介绍了从批量RNA测序到数字空间RNA分析等多种RNA测序技术的进步 | 未明确提及 | 指导癌症研究人员选择最适合其生物学问题的RNA测序技术 | RNA测序技术的不同类型及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
25224 | 2024-08-09 |
Modeling glioblastoma invasion using human brain organoids and single-cell transcriptomics
2020-08-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa091
PMID:32297954
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研究论文 | 本研究利用人脑类器官和单细胞转录组学来模拟胶质母细胞瘤的侵袭过程 | 首次使用人脑类器官作为支架来研究患者来源的胶质母细胞瘤细胞的侵袭行为 | NA | 研究胶质母细胞瘤的侵袭过程及其转录组异质性 | 胶质母细胞瘤细胞和人脑类器官 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个患者样本 |
25225 | 2024-08-09 |
Regulation of adipocyte thermogenesis: mechanisms controlling obesity
2020-08, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15331
PMID:32301220
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综述 | 本文综述了脂肪细胞生物学,特别是脂肪细胞产热调节机制及其在肥胖和肥胖相关疾病中的作用 | 揭示了脂肪细胞的三种类型(白色、米色和棕色)及其在不同解剖位置的功能差异,以及单细胞测序研究显示的脂肪细胞前体异质性 | NA | 探讨如何通过增加产热脂肪细胞的数量及其激活来阐明肥胖及其相关疾病的部分病理生理基础 | 脂肪细胞的生物学特性及其在能量平衡中的作用 | NA | 肥胖 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
25226 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cell-Type-Specific Mechanisms of Neurological Diseases
2020-07, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-020-00496-5
PMID:32297206
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
25227 | 2024-08-09 |
Integrated scRNA-Seq Identifies Human Postnatal Thymus Seeding Progenitors and Regulatory Dynamics of Differentiating Immature Thymocytes
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.03.019
PMID:32304633
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了人类青春期后胸腺细胞群体,并识别了两种可能的胸腺种子形成前体细胞 | 首次在人类中使用scRNA-seq技术详细描述了胸腺种子形成前体细胞及其在T细胞发育中的作用 | NA | 研究青春期后人类胸腺细胞的发育过程及其调控机制 | 人类青春期后胸腺细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
25228 | 2024-08-09 |
Prostate cancer cell-intrinsic interferon signaling regulates dormancy and metastatic outgrowth in bone
2020-06-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050162
PMID:32314873
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和体外分析,揭示了肿瘤内在免疫信号在维持前列腺癌细胞休眠状态中的关键作用 | 本文首次证明了肿瘤内在的I型IFN信号的丢失促进了前列腺癌在骨中的进展,并通过HDAC抑制恢复IFN信号,增强了肿瘤细胞的可见性,促进了长期的抗肿瘤免疫,并阻止了骨中的癌症生长 | NA | 探讨前列腺癌骨转移休眠状态的机制,并寻找新的治疗策略 | 前列腺癌细胞及其在骨中的休眠和转移生长 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括患者样本在内的多种样本 |
25229 | 2024-08-09 |
CD39 Produced from Human GMSCs Regulates the Balance of Osteoclasts and Osteoblasts through the Wnt/β-Catenin Pathway in Osteoporosis
2020-06-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.04.003
PMID:32304668
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙龈来源的间充质干细胞(GMSCs)产生的CD39通过Wnt/β-Catenin通路调节骨质疏松症中破骨细胞和成骨细胞平衡的作用 | 首次揭示了GMSC通过CD39和Wnt/β-Catenin通路促进骨形成的新机制,为骨质疏松症和其他骨丢失疾病提供了潜在的治疗靶点 | NA | 研究GMSCs在骨质疏松症中的作用及其调节骨形成和保护的机制 | GMSCs、CD39、Wnt/β-Catenin通路 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | RNA测序(RNA-seq)、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了卵巢切除的鼠模型进行实验 |
25230 | 2024-08-09 |
Megakaryocyte and Platelet Transcriptomics for Discoveries in Human Health and Disease
2020-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.119.313280
PMID:32295424
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综述 | 本文综述了巨核细胞和血小板转录组学在人类健康和疾病研究中的最新发现 | 介绍了新一代RNA测序技术和核糖体足迹分析在巨核细胞和血小板转录组研究中的应用 | NA | 探讨巨核细胞和血小板转录组分析在人类健康和疾病中的应用 | 巨核细胞和血小板的转录组 | NA | NA | 下一代RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
25231 | 2024-08-09 |
Identification of calcium and integrin-binding protein 1 as a novel regulator of production of amyloid β peptide using CRISPR/Cas9-based screening system
2020-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201902966RR
PMID:32307772
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9系统筛选方法,鉴定钙和整合素结合蛋白1(CIB1)作为β淀粉样肽(Aβ)生成的新型调控因子 | 首次发现CIB1通过调控γ-分泌酶的亚细胞定位来调节Aβ的生成,为阿尔茨海默病(AD)的发病机制提供了新的见解 | NA | 旨在揭示β淀粉样肽(Aβ)生成的新型分子调控机制 | 钙和整合素结合蛋白1(CIB1)及其对β淀粉样肽(Aβ)生成的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | CRISPR/Cas9 | NA | RNA-seq | 单细胞RNA-seq数据 |
25232 | 2024-08-09 |
MorphoSeq: Full Single-Cell Transcriptome Dynamics Up to Gastrulation in a Chordate
2020-05-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.055
PMID:32315617
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和光片成像数据重建了一个数字胚胎,捕捉到每个细胞在每个细胞分裂中的全基因组基因表达轨迹,直至在海鞘Phallusia mammillata中的原肠胚形成。 | 开发了一种计算框架,利用高覆盖率的单细胞RNA测序数据,无需先验知识即可将单个胚胎的细胞分类为细胞类型,并通过无偏倚的转录组数据分析映射每个细胞的物理位置和谱系历史。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术全面解析细胞多样性和发育轨迹,同时描绘胚胎的空间组织和精确的细胞构成。 | 海鞘Phallusia mammillata的胚胎发育过程,直至原肠胚形成。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 18个谱系 |
25233 | 2024-08-09 |
Patch-Seq Links Single-Cell Transcriptomes to Human Islet Dysfunction in Diabetes
2020-05-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.04.005
PMID:32302527
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research paper | 本文通过结合单细胞RNA测序和电生理测量(patch-seq),研究了糖尿病患者胰岛细胞的功能异常与基因表达变化之间的关系 | 首次将单细胞RNA测序与电生理测量相结合,直接关联胰岛细胞的生理功能与转录组 | NA | 探讨糖尿病患者胰岛细胞功能障碍与基因表达变化的关系 | 糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛细胞 | digital pathology | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从34名人类捐赠者的胰腺中收集了1,369个patch-seq细胞 |
25234 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Single-cell RNA-seq analysis software providers scramble to offer solutions
2020-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0510-7
PMID:32296150
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correction | 该文章是对先前发表论文的修正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
25235 | 2024-08-09 |
AntimiR-21 Prevents Myocardial Dysfunction in a Pig Model of Ischemia/Reperfusion Injury
2020-04-21, Journal of the American College of Cardiology
IF:21.7Q1
DOI:10.1016/j.jacc.2020.02.041
PMID:32299591
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研究论文 | 本研究测试了在猪心衰模型中通过局部导管输送antimiR-21的可行性和治疗效果,并评估其对心脏转录组特征和细胞组成的影响。 | 首次在大动物心衰模型中证明了miR-21抑制的可行性和治疗效果。 | NA | 测试在猪心衰模型中局部导管输送antimiR-21的可行性和治疗效果,并确定其对心脏转录组特征和细胞组成的影响。 | 猪心衰模型中的心脏功能和细胞组成。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 深度核糖核酸测序(RNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 实验涉及的猪样本数量未在摘要中明确提及。 |
25236 | 2024-08-09 |
Impacts of ciliary neurotrophic factor on the retinal transcriptome in a mouse model of photoreceptor degeneration
2020-04-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-63519-1
PMID:32313077
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研究论文 | 研究了睫状神经营养因子(CNTF)对视网膜转录组的影响,使用Rds/Prph2 (P216L)转基因小鼠模型进行高吞吐量RNA测序分析 | 揭示了CNTF在退化视网膜中的分子事件,并通过单细胞RNA测序数据识别了CNTF响应的细胞类型 | NA | 解析CNTF触发的分子事件在退化视网膜中的作用 | CNTF对视网膜转录组的影响 | 数字病理学 | 视网膜退化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用Rds/Prph2 (P216L)转基因小鼠作为临床前模型 |
25237 | 2024-08-09 |
Dysfunction of Hair Follicle Mesenchymal Progenitors Contributes to Age-Associated Hair Loss
2020-04-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.03.019
PMID:32315612
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研究论文 | 本文研究了皮肤老化过程中毛囊间充质前体细胞功能障碍对年龄相关性脱发的影响 | 通过激光消融和命运图谱技术,展示了毛囊真皮干细胞(hfDSCs)重建受损的真皮乳头并维持头发生长的能力,揭示了hfDSCs功能障碍可能触发诱导微环境的退化 | NA | 探讨毛囊间充质前体细胞在年龄相关性脱发中的作用 | 毛囊真皮干细胞(hfDSCs)及其在皮肤老化中的功能 | NA | 脱发 | 激光消融、命运图谱、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 跨越24个月的hfDSCs样本,以及老年hfDSCs的体内克隆分析 |
25238 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Myeloid-Targeted Therapies in Colon Cancer
2020-04-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.048
PMID:32302573
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的免疫和间质细胞,揭示了髓系靶向治疗在结直肠癌中的作用机制 | 首次详细分析了髓系细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其对髓系靶向免疫治疗的响应 | NA | 探讨髓系靶向治疗在结直肠癌中的作用机制 | 结直肠癌患者的免疫和间质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类和鼠类肿瘤样本 |
25239 | 2024-08-09 |
Automation of Spatial Transcriptomics library preparation to enable rapid and robust insights into spatial organization of tissues
2020-Apr-15, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-6631-z
PMID:32293264
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研究论文 | 本文介绍了一种自动化空间转录组学文库制备方法,通过集成Agilent Bravo自动化液体处理平台,提高了样本处理数量,减少了制备时间,并减少了批次效应。 | 本文采用Agilent Bravo自动化液体处理平台,相较于之前的Magnatrix 8000+自动化协议,提高了样本处理效率,减少了制备时间,并显著降低了技术变异性。 | NA | 开发一种快速且稳健的空间转录组学文库制备方法,以促进对组织空间结构的研究。 | 空间转录组学文库制备过程的自动化 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
25240 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies an effectorness gradient shaping the response of CD4+ T cells to cytokines
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15543-y
PMID:32286271
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研究论文 | 本文通过定量蛋白质组学、批量RNA测序和单细胞RNA测序研究了超过40,000个人类幼稚和记忆CD4 T细胞对细胞因子的反应 | 首次揭示了记忆T细胞对细胞因子的反应特性,并展示了T细胞从幼稚到中心记忆和效应记忆细胞的转录连续体 | NA | 研究CD4 T细胞对细胞因子的反应及其在炎症中的作用 | 人类幼稚和记忆CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过40,000个人类幼稚和记忆CD4 T细胞 |