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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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25201 | 2024-08-09 |
Deciphering human macrophage development at single-cell resolution
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2316-7
PMID:32499656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了人类胚胎发育过程中巨噬细胞的起源和特化过程 | 首次在单细胞分辨率下详细描述了人类胚胎巨噬细胞的发育过程,包括不同解剖部位的巨噬细胞亚群及其特化轨迹 | 研究主要集中在胚胎阶段的巨噬细胞,对成年巨噬细胞的比较分析有限 | 揭示人类胚胎巨噬细胞的发育动态,为未来研究人类组织驻留巨噬细胞的发育和功能提供参考 | 人类胚胎中的CD45造血细胞,特别是卵黄囊来源的髓系偏向前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卡内基阶段11到23的人类胚胎中分离的CD45造血细胞 |
25202 | 2024-08-09 |
A single-cell view on alga-virus interactions reveals sequential transcriptional programs and infection states
2020-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba4137
PMID:32490206
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了微藻与其巨型病毒相互作用中的连续转录程序和感染状态 | 利用单细胞RNA测序技术,首次详细揭示了巨型病毒在微藻细胞中的转录轨迹和基因表达顺序 | NA | 探索巨型病毒在微藻中的复制策略和转录组调控 | 全球分布的微藻及其特定巨型病毒 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个微藻细胞及其病毒感染细胞 |
25203 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies novel cell types in Drosophila blood
2020-04-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2020.02.004
PMID:32487456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术在果蝇血液中发现了两种新型细胞类型:thanacytes和primocytes,并揭示了果蝇血液系统的复杂性 | 首次在果蝇血液中发现两种新型细胞类型thanacytes和primocytes,并识别出四种新的浆细胞亚型,扩展了果蝇作为人类血液系统模型在发育和疾病中的应用 | NA | 深入理解果蝇血液系统的复杂性,并探索其在人类血液系统模型中的应用 | 果蝇的循环血液细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
25204 | 2024-08-09 |
MFCNV: A New Method to Detect Copy Number Variations From Next-Generation Sequencing Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00434
PMID:32499814
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法MFCNV,用于从下一代测序数据中准确检测拷贝数变异 | MFCNV方法全面考虑了基因组中相邻位置间的内在相关性,计算每个基因组bin的读取深度、GC含量偏差、碱基质量和相关性值,并通过训练神经网络算法来预测拷贝数变异 | NA | 开发一种新的方法来提高从下一代测序数据中检测拷贝数变异的准确性 | 拷贝数变异在肿瘤基因组中的检测 | 数字病理学 | 肿瘤 | NGS | 神经网络 | 测序数据 | 使用模拟和真实测序数据进行测试 |
25205 | 2024-08-09 |
Heterogeneity and chimerism of endothelial cells revealed by single-cell transcriptome in orthotopic liver tumors
2020-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-020-09727-9
PMID:32440964
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了原位肝肿瘤中内皮细胞的异质性和嵌合现象 | 首次详细描述了肝肿瘤内皮细胞的基因表达特征,并发现宿主器官而非肿瘤起源是内皮细胞表型的主要决定因素 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究肝肿瘤中肝间质细胞的变化及其对肿瘤内皮细胞的影响 | 肝肿瘤中的内皮细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型的肝肿瘤及邻近正常组织中的内皮细胞 |
25206 | 2024-08-09 |
Systematic analysis of ACE2 and TMPRSS2 expression in salivary glands reveals underlying transmission mechanism caused by SARS-CoV-2
2020-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.26045
PMID:32441816
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研究论文 | 本研究通过公开数据库分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达,探讨了SARS-CoV-2可能通过唾液腺传播的机制 | 首次系统分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达,并推测SARS-CoV-2可能通过唾液腺进入人体 | 研究未涉及SARS-CoV-2在唾液腺中的具体感染过程和机制 | 评估唾液腺中ACE2/TMPRSS2的表达,探讨SARS-CoV-2的传播机制 | 唾液腺中的ACE2和TMPRSS2表达 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠的下颌下唾液腺和腮腺样本 |
25207 | 2024-08-09 |
Distinct immune evasion in APOBEC-enriched, HPV-negative HNSCC
2020-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33123
PMID:32468570
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研究论文 | 研究分析了APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的免疫逃避机制 | 识别了APOBEC富集的HPV阴性HNSCC亚组,该亚组显示出更高的T细胞炎症和免疫检查点表达,可能介导对免疫治疗的反应 | 研究样本量相对较小,需要进一步的大规模验证 | 探索头颈部鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集496例,验证集10例,单细胞基因表达数据17例HPV阴性HNSCC |
25208 | 2024-08-09 |
Prokaryotic single-cell RNA sequencing by in situ combinatorial indexing
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0729-6
PMID:32451472
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PETRI-seq的低成本、高通量的原核单细胞RNA测序技术,该技术通过原位组合索引技术克服了原核细胞mRNA含量极低、缺乏mRNA多聚腺苷酸化和细胞壁厚等技术障碍 | PETRI-seq技术能够高效地捕获革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组,具有高纯度和低偏差,为区分不同生长阶段的细胞状态提供了强有力的工具 | NA | 开发一种适用于原核细胞的单细胞RNA测序技术,以研究原核生物的转录异质性 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数万个细胞 |
25209 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling reveals sex diversity in human renal proximal tubules
2020-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.144790
PMID:32439376
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人类肾脏近端小管中的性别多样性基因表达差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类肾脏近端小管中的性别偏倚基因表达,并发现了跨物种的共同和特异性基因表达差异 | NA | 旨在理解人类男性和女性肾脏近端小管中的基因表达差异 | 人类男性和女性肾脏近端小管的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
25210 | 2024-08-09 |
Epithelial cell dysfunction, a major driver of asthma development
2020-08, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14421
PMID:32460363
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综述 | 本文综述了气道上皮屏障功能障碍在哮喘发病机制中的作用及上皮细胞功能障碍的调控新见解 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)研究哮喘中的气道上皮细胞提供了新的见解 | 尚未明确上皮易感基因表达如何转化为对哮喘环境风险因素的功能性改变反应的机制 | 探讨气道上皮屏障异常在哮喘致敏和发病机制中的关键作用,并寻找哮喘干预的新靶点 | 气道上皮细胞及其在哮喘中的功能和调控机制 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
25211 | 2024-08-09 |
Odorant Receptor Inhibition Is Fundamental to Odor Encoding
2020-07-06, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2020.04.086
PMID:32470365
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研究论文 | 研究探讨了气味受体抑制在气味编码中的作用及其在嗅觉系统中的普遍性和影响 | 首次详细研究了气味受体拮抗作用在嗅觉系统检测层中对神经表征的影响,并通过数学模型验证了这种竞争性受体结合的普遍性 | 研究主要集中在体外实验和数学模型分析,可能需要进一步的体内实验验证 | 探究气味受体抑制在嗅觉编码中的作用及其普遍性和影响 | 气味受体、嗅觉感觉神经元和相关化合物 | NA | NA | 钙成像显微镜、单细胞转录组学 | 数学模型 | 图像 | 36种测试的气味化合物,约800种与香水相关的气味化合物,10种来自Olfr740基因家族的气味受体 |
25212 | 2024-08-09 |
Unifying developmental programs for embryonic and postembryonic neurogenesis in the zebrafish retina
2020-06-19, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.185660
PMID:32467236
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼视网膜在四个不同发育阶段的约20,000个细胞,揭示了胚胎和胚后视网膜发生遵循相同的发育程序。 | 首次揭示了斑马鱼胚胎和胚后视网膜发生遵循相同的发育程序,并通过单细胞RNA测序技术详细描述了不同发育状态及其基因表达模式。 | 研究主要集中在斑马鱼视网膜的发育,可能不完全适用于其他物种或组织类型。 | 探讨斑马鱼视网膜胚胎和胚后发生的发育程序是否一致。 | 斑马鱼视网膜的胚胎和胚后发育过程及其基因表达模式。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20,000个斑马鱼视网膜细胞 |
25213 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.05.001
PMID:32445619
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肿瘤浸润性NK细胞的转录组,发现抑制转录因子HIF-1α可以增强NK细胞的抗肿瘤活性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HIF-1α抑制对NK细胞功能的激活作用,并发现IL-18在其中的关键作用 | NA | 探索增强肿瘤免疫疗法中免疫细胞功能的策略 | 肿瘤浸润性NK细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类肿瘤浸润性NK细胞 |
25214 | 2024-08-09 |
Molecular taxonomy of human ocular outflow tissues defined by single-cell transcriptomics
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2001896117
PMID:32439707
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,生成了人类传统流出组织细胞图谱,并识别了12种不同的细胞类型 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了人类眼流出组织的分子分类,并识别了两种不同的表达模式(肌成纤维细胞样和成纤维细胞样) | NA | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人类眼流出组织的细胞和分子分类 | 人类眼流出组织的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8只人眼捐赠者的8,758个细胞 |
25215 | 2024-08-09 |
Forward genetic analysis using OCT screening identifies Sfxn3 mutations leading to progressive outer retinal degeneration in mice
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921224117
PMID:32457148
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研究论文 | 本文通过正向遗传分析结合光学相干断层扫描(OCT)筛选,在老鼠中发现了导致渐进性外视网膜退化的Sfxn3基因突变 | 首次揭示了Sfxn3基因在视网膜功能中的未知作用,并展示了其在多个视网膜细胞类型中的表达 | NA | 通过正向遗传学方法发现与视网膜疾病相关的基因 | 老鼠视网膜中的Sfxn3基因及其突变 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 光学相干断层扫描(OCT)、CRISPR/Cas9技术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 11个突变基因,多个老鼠品系 |
25216 | 2024-08-09 |
Putative regulators for the continuum of erythroid differentiation revealed by single-cell transcriptome of human BM and UCB cells
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915085117
PMID:32457162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从成人骨髓和脐带血中分离出的终末期红细胞的转录组,揭示了红细胞分化过程中的潜在调控因子 | 首次在单细胞分辨率下记录了人类终末期红细胞的转录组,区分了早期和晚期多染性红细胞以及不同发育阶段的正染性红细胞 | NA | 旨在理解伴随人类红细胞生成过程的动态发育变化 | 成人骨髓和脐带血中的终末期红细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 从成人骨髓和脐带血中分离出的CD34CD235a阳性细胞 |
25217 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics: New Insights in Heart Research
2020-05-26, Circulation
IF:35.5Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
25218 | 2024-08-09 |
Myeloma cells shift osteoblastogenesis to adipogenesis by inhibiting the ubiquitin ligase MURF1 in mesenchymal stem cells
2020-05-26, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aay8203
PMID:32457115
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研究论文 | 研究揭示了多发性骨髓瘤细胞通过抑制间充质干细胞中的泛素连接酶MURF1,促进脂肪生成并抑制骨形成的过程 | 首次揭示了多发性骨髓瘤细胞与间充质干细胞相互作用,通过激活PKCβ1信号和抑制MURF1介导的泛素化,稳定PPARγ2蛋白,从而促进脂肪生成并抑制骨形成 | 研究主要集中在体外和动物模型中,需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探讨多发性骨髓瘤细胞如何影响间充质干细胞的分化,以及这种影响对骨形成的影响 | 多发性骨髓瘤细胞和间充质干细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,体外共培养,皮下注射 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠模型 |
25219 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics reveals opioid usage evokes widespread suppression of antiviral gene program
2020-05-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16159-y
PMID:32457298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了慢性阿片类药物使用对免疫系统的广泛抑制作用,特别是对天然单核细胞和多种免疫细胞中抗病毒基因程序的抑制。 | 首次系统性地描述了阿片类药物如何影响免疫系统,特别是在单细胞水平上揭示了抗病毒基因程序的广泛抑制。 | 研究主要集中在体外实验和特定细胞类型的分析,可能需要进一步的体内研究来验证这些发现。 | 旨在无偏见地理解阿片类药物对免疫系统的调节作用。 | 研究对象包括阿片类药物依赖者和对照组的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 研究未明确提及样本数量 |
25220 | 2024-08-09 |
Characterization of radioresistant epithelial stem cell heterogeneity in the damaged mouse intestine
2020-05-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-64987-1
PMID:32444673
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞qRT-PCR分析,揭示了在损伤小肠中Lgr5表达细胞衍生物中存在的放射抵抗性肠干细胞(ISCs)及其在肠上皮再生中的作用 | 首次发现Lgr5表达细胞衍生物中的放射抵抗性肠干细胞在损伤小肠上皮再生中的关键作用,并通过单细胞RNA测序揭示了CD81表达与ISC和增殖相关基因表达的相关性 | NA | 研究损伤小肠中放射抵抗性上皮干细胞的异质性及其在肠上皮再生中的作用 | 小鼠损伤小肠中的放射抵抗性上皮干细胞 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞qRT-PCR分析,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |