单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 25181 - 25200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25181 | 2024-08-09 |
Benchmarking single-cell RNA-sequencing protocols for cell atlas projects
2020-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0469-4
PMID:32518403
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研究论文 | 本研究通过多中心研究比较了13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议，评估了它们在全面描述细胞类型和状态方面的能力 | 首次系统性地评估了不同单细胞RNA测序协议在构建细胞图谱项目中的性能差异 | 研究仅限于13种常用协议，未涵盖所有可能的单细胞RNA测序技术 | 评估不同单细胞RNA测序协议在细胞图谱项目中的适用性和性能 | 13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了异质性参考样本资源 |
| 25182 | 2024-08-09 |
An in vitro model of early anteroposterior organization during human development
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2383-9
PMID:32528178
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研究论文 | 本文展示了人类胚胎干细胞可以生成三维多细胞聚集体（gastruloids），这些聚集体在不需要额外胚外组织的情况下，能够分化形成三个胚层的衍生物，并沿前后轴延长，显示出基因表达的模式 | 首次使用人类胚胎干细胞生成gastruloids，为研究人类早期发育中的轴向组织提供了可操作的模型系统 | NA | 揭示和研究人类早期发育中轴向组织特有的调控过程 | 人类胚胎干细胞生成的gastruloids | 发育生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 72小时的人类gastruloids |
| 25183 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response to severe COVID-19
2020-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.04.17.20069930
PMID:32511639
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了7名确诊COVID-19患者和6名健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了COVID-19患者外周免疫细胞表型的显著重构 | 首次详细描绘了严重COVID-19患者外周免疫反应的细胞图谱，包括异质性干扰素刺激基因签名、HLA II类下调及新型B细胞衍生粒细胞的出现 | NA | 深入理解COVID-19的病理生理机制 | COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 7名COVID-19患者和6名健康对照者 |
| 25184 | 2024-08-09 |
POFUT1 is dispensable for structure, function and survival of mouse podocytes
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:32509213
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研究论文 | 研究探讨了POFUT1基因在鼠足细胞结构、功能和存活中的必要性 | 通过单细胞RNA测序确定了POFUT1在鼠足细胞中的非必要性，并提出了预测POFUT1在其他细胞类型中必要性的可行性 | NA | 研究POFUT1基因在鼠足细胞中的作用及其非必要性的原因 | 鼠足细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 条件性敲除小鼠与野生型对照 |
| 25185 | 2024-08-09 |
Analysis of Gene Signatures of Tumor Microenvironment Yields Insight Into Mechanisms of Resistance to Immunotherapy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00348
PMID:32528935
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，对肿瘤微环境进行分类，并识别出特定表型的基因，以揭示免疫治疗抵抗的潜在机制 | 通过单细胞RNA测序技术，首次将肿瘤微环境分为免疫治疗响应和非响应的炎症型，并识别出特定表型的基因，为理解免疫治疗抵抗机制提供了新视角 | 研究主要集中在肿瘤微环境的基因表达分析，未涉及临床试验验证潜在药物的效果 | 旨在揭示肿瘤微环境中免疫治疗抵抗的机制，并探索提高免疫治疗效果的潜在药物 | 肿瘤微环境中的基因表达模式及其与免疫治疗响应的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25186 | 2024-08-09 |
Effect of intra- and inter-tumoral heterogeneity on molecular characteristics of primary IDH-wild type glioblastoma revealed by single-cell analysis
2020-09, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13396
PMID:32488994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了IDH野生型原发性胶质母细胞瘤细胞的分子特征受肿瘤内和肿瘤间异质性的影响 | 研究首次详细分析了IDH野生型胶质母细胞瘤的肿瘤内和肿瘤间异质性对其分子特征的影响，并探讨了细胞间的通信机制 | 研究主要依赖于数据库中的数据，可能存在样本选择偏倚；且未涉及所有可能的细胞亚型和分子机制 | 揭示肿瘤内和肿瘤间异质性对IDH野生型胶质母细胞瘤细胞分子特征的影响 | IDH野生型胶质母细胞瘤细胞的分子特征及其异质性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 25187 | 2024-08-09 |
Early cleavage of preimplantation embryos is regulated by tRNAGln-TTG-derived small RNAs present in mature spermatozoa
2020-08-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA120.013003
PMID:32487749
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研究论文 | 本研究探讨了精子中的tRNA衍生小RNA（tsRNAs）在早期胚胎发育中的作用，特别是在猪模型中，这些tsRNAs如何影响胚胎早期的分裂过程。 | 首次揭示了特定tsRNA组（Gln-TTGs）在猪早期胚胎分裂中的功能，这些tsRNAs可能通过调节细胞周期相关基因和逆转座子来影响胚胎发育。 | NA | 阐明精子中的tRNA衍生小RNA在早期胚胎发育中的具体作用。 | 猪的早期胚胎发育过程。 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 25188 | 2024-08-09 |
Single-cell technologies in hepatology: new insights into liver biology and disease pathogenesis
2020-08, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-020-0304-x
PMID:32483353
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在肝病学中的应用，探讨了这些技术如何增进我们对健康和疾病中细胞多样性和功能的理解 | 单细胞转录组技术提供了对肝细胞、内皮细胞和肝星状细胞的代谢区化以及肝脏再生机制的新见解，并揭示了肝纤维化等疾病状态下的关键病理生理变化 | NA | 探讨单细胞转录组技术在肝病学中的应用，以深入理解疾病发病机制并识别新的治疗靶点 | 肝病学中的细胞多样性和功能，特别是肝细胞、内皮细胞、肝星状细胞和肝癌中的细胞和分子功能 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 涉及全球约8.44亿肝病患者 |
| 25189 | 2024-08-09 |
Cell population characterization and discovery using single-cell technologies in endocrine systems
2020-08, Journal of molecular endocrinology
IF:3.6Q2
DOI:10.1530/JME-19-0276
PMID:32485670
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研究论文 | 本文利用单细胞技术研究内分泌系统的细胞群体特征和发现 | 介绍了单细胞技术在多组学和空间转录组学方面的最新进展，特别是在内分泌系统中的应用 | 某些技术仍在优化中 | 探索内分泌器官的胚胎发育、稀有细胞类型的特征及疾病机制 | 内分泌器官，特别是下丘脑、垂体、胰腺和生殖器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多个内分泌器官的细胞 |
| 25190 | 2024-08-09 |
Urethral luminal epithelia are castration-insensitive cells of the proximal prostate
2020-08, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24020
PMID:32497356
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠前列腺和尿道中所有上皮细胞的转录组特征，并验证了尿道上皮细胞群的存在及其在前列腺增生中的潜在作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠前列腺和尿道的上皮细胞，并发现了尿道上皮细胞在前列腺增生中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，客观识别前列腺和尿道上皮细胞的亚型，并探讨其在前列腺增生中的作用。 | 小鼠前列腺和尿道的上皮细胞。 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 25191 | 2024-08-09 |
Discovery of New Targets to Control Metastasis in Pancreatic Cancer by Single-cell Transcriptomics Analysis of Circulating Tumor Cells
2020-08, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-19-1166
PMID:32499301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析循环肿瘤细胞，发现胰腺癌转移的新治疗靶点 | 开发了高度转移性的胰腺癌患者来源的异种移植（PDX）小鼠模型，并通过单细胞RNA测序识别了改变的信号传导和代谢途径以及潜在的治疗靶点 | NA | 研究胰腺癌转移的机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌的转移过程和循环肿瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | PDX小鼠模型 |
| 25192 | 2024-08-09 |
Endogenous CCN family member WISP1 inhibits trauma-induced heterotopic ossification
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.135432
PMID:32484792
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析了CCN家族成员在创伤诱导异位骨化中的表达模式，特别是Wisp1的作用。 | 首次揭示了CCN家族成员Wisp1在创伤诱导异位骨化中的表达模式及其对异位骨化的抑制作用。 | NA | 研究CCN家族成员在创伤诱导异位骨化中的表达和功能。 | CCN家族成员Wisp1在创伤诱导异位骨化中的表达和作用。 | 生物医学 | 异位骨化 | RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠模型和人类样本 |
| 25193 | 2024-08-09 |
CReSCENT: CanceR Single Cell ExpressioN Toolkit
2020-07-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa437
PMID:32479601
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研究论文 | CReSCENT是一个直观且可扩展的网络平台，集成了容器化的管道执行引擎，用于标准化分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | CReSCENT使用公共数据集和预配置的管道，使计算生物学非专家也能访问，并允许用户进行优化、比较和重新分析特定实验 | NA | 开发一个用户友好的平台，用于标准化分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 25194 | 2024-08-09 |
Host-Viral Infection Maps Reveal Signatures of Severe COVID-19 Patients
2020-06-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.05.006
PMID:32479746
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Viral-Track的计算方法，用于全局扫描未映射的单细胞RNA测序数据，以检测病毒RNA，并实现感染细胞与旁观细胞的转录细胞分类。 | Viral-Track方法能够系统地检测多种感染模型中的病毒，包括乙型肝炎病毒，并以无监督方式进行。 | NA | 揭示严重COVID-19患者与病毒相互作用的机制。 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 严重和轻度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本 |
| 25195 | 2024-08-09 |
The Number of Transcription Factors at an Enhancer Determines Switch-like Gene Expression
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107724
PMID:32492432
|
研究论文 | 本文研究了转录因子NF-κB在超级增强子（SEs）和典型增强子（TEs）中的作用机制，以及它们如何影响基因表达的阈值和分级响应 | 首次展示了超级增强子的活性与染色质开放和丰富的NF-κB结合同时相关，导致B细胞受体（BCR）激活时基因表达的更高倍数变化和阈值表达 | NA | 探究NF-κB在超级增强子和典型增强子中的选择性参与机制及其对基因表达的影响 | 小鼠原代B淋巴细胞中的超级增强子和典型增强子 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 25196 | 2024-08-09 |
Acute Myeloid Leukemia iPSCs Reveal a Role for RUNX1 in the Maintenance of Human Leukemia Stem Cells
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107688
PMID:32492433
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研究论文 | 本文报道了从急性髓系白血病（AML）患者中获得的遗传克隆诱导多能干细胞（iPSCs），这些细胞具有极高的移植潜力，并在造血分化后产生表型层次结构。通过命运追踪实验、异种移植和单细胞转录组学，研究人员鉴定出一种可通过体外粘附生长前瞻性分离的细胞亚群（iLSC），这些细胞位于该层次结构的顶端，并具有白血病干细胞（LSCs）的标志性特征。 | 本文通过整合iLSC转录组和染色质景观的研究，得出了一个预测患者生存的LSC基因特征，并揭示了跨AML基因型的LSCs对RUNX1转录因子的依赖性。 | NA | 研究旨在揭示白血病干细胞的特性和潜在的治疗靶点。 | 急性髓系白血病患者的诱导多能干细胞及其分化后的细胞亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从单个AML患者中获得的遗传克隆iPSCs |
| 25197 | 2024-08-09 |
No evidence of severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 in semen of males recovering from coronavirus disease 2019
2020-06, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2020.04.024
PMID:32482249
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研究论文 | 研究描述了从COVID-19康复的男性患者精液中检测严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的情况，并探讨了睾丸中血管紧张素转换酶2（ACE2）和跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）的表达模式 | 首次在单细胞转录组数据集上分析了人类睾丸中ACE2和TMPRSS2的稀疏表达，几乎没有重叠的基因表达 | 未评估精液质量，且SARS-CoV-2对男性生殖功能的长期影响仍未知 | 研究COVID-19康复男性精液中SARS-CoV-2的存在及睾丸中ACE2和TMPRSS2的表达 | 34名通过咽拭子样本确诊COVID-19的中国成年男性 | NA | COVID-19 | qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 34名成年男性 |
| 25198 | 2024-08-09 |
Model-based analysis of sample index hopping reveals its widespread artifacts in multiplexed single-cell RNA-sequencing
2020-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16522-z
PMID:32483174
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研究论文 | 本文介绍了一种统计模型，用于估计多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃率，并进行概率推断以确定跳跃读取的真实样本来源 | 本文提出了一种新的统计模型，用于准确估计和校正多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃问题 | NA | 研究目的是分析多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃现象，并提出一种方法来校正由此产生的数据错误 | 多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃现象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | RNA测序数据 | 多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 25199 | 2024-08-09 |
Hair-bearing human skin generated entirely from pluripotent stem cells
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2352-3
PMID:32494013
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研究论文 | 本文报道了一种从人类多能干细胞生成复杂皮肤的类器官培养系统 | 首次成功从多能干细胞中生成了包含表皮、富含脂肪的真皮和带有皮脂腺的色素毛发 follicles 的类器官皮肤 | NA | 重建带有附属物的皮肤，用于未来的皮肤发育研究、疾病模型和重建手术 | 人类多能干细胞生成的皮肤类器官 | 生物工程 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA |
| 25200 | 2024-08-09 |
Notch signalling drives synovial fibroblast identity and arthritis pathology
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2222-z
PMID:32499639
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研究论文 | 本文研究了NOTCH3信号在类风湿性关节炎中驱动滑膜成纤维细胞分化和扩张的分子机制 | 首次揭示了NOTCH3信号在滑膜成纤维细胞分化和扩张中的关键作用，并证明了其在类风湿性关节炎病理过程中的重要性 | NA | 探讨NOTCH3信号在类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞分化和扩张的分子机制 | 滑膜成纤维细胞和NOTCH3信号 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和滑膜组织类器官 | NA | RNA | NA |