单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 34313 篇文献，本页显示第 2501 - 2520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2501 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例，ICB队列4例，验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2502 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
|
研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体，发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限，功能验证实验主要在细胞水平进行，需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2503 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
|
研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征，识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性，发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限（8例肿瘤活检），仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2504 | 2025-11-16 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
|
研究论文 | 开发了一种基于基因编辑的空间谱系追踪技术PEtracer，用于在体研究细胞状态和谱系动态 | 首次将基因编辑技术与空间转录组分析结合，实现高分辨率空间映射的细胞谱系追踪 | NA | 研究发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态 | 小鼠肿瘤转移模型中的细胞 | 空间生物学 | 肿瘤转移 | 基因编辑, 空间转录组 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组, 多模态成像 | NA | MERFISH空间转录组分析 |
| 2505 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术，绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合，揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质，并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞，样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 2506 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制，发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 2507 | 2025-11-16 |
Unlocking novel T cell-based immunotherapy for hepatocellular carcinoma through neoantigen-driven T cell receptor isolation
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334148
PMID:39832892
|
研究论文 | 本研究通过分离肝细胞癌患者中对新抗原反应的T细胞及其T细胞受体，探索基于T细胞的免疫治疗新策略 | 首次系统分析肝细胞癌微环境中新抗原反应性T细胞的功能特征，并发现肝灌洗液和淋巴结是反应性T细胞的重要来源 | 研究样本量较小（7名患者），需要在更大队列中验证结果 | 评估晚期肝细胞癌患者的T细胞反应，识别可用于免疫治疗的T细胞群体 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织、肝灌洗液和肝引流淋巴结 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，生物信息学分析 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，测序数据 | 7名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2508 | 2025-11-16 |
Upregulated haptoglobin in classical monocytes serves as a diagnostic and immunological biomarker in myocardial infarction: a cross-sectional multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707912
PMID:41229424
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现结合珠蛋白(HP)在心肌梗死中显著上调，特别是在经典单核细胞中高表达，具有诊断价值 | 首次发现HP在心肌梗死患者经典单核细胞中特异性高表达，并证实其作为诊断生物标志物的价值 | 横断面研究设计，无法确定因果关系；样本量有限 | 寻找心肌梗死的可靠诊断生物标志物并了解其在免疫微环境中的作用 | 心肌梗死患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，qPCR，蛋白质组学，生物信息学分析 | WGCNA，免疫细胞浸润分析 | 基因表达数据，蛋白质组数据，临床样本 | 多个GEO数据集(GSE141512，GSE95368，GSE269269)和TCGA数据，外加独立验证队列(GSE66360等) | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 2509 | 2025-11-16 |
Uterine NK Cell Polarization Associates with Chronic Endometritis and Predisposition to Recurrent Implantation Failure
2025, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S554069
PMID:41230044
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了子宫自然杀伤细胞极化与慢性子宫内膜炎及复发性种植失败的关联机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别出两种功能不同的uNK细胞亚型，并建立了基于uNK2/uNK3特征比值的诊断模型 | 需要在前瞻性临床队列和功能实验中进一步验证临床效用 | 探究子宫内膜免疫微环境中uNK细胞极化与生殖健康障碍的关联机制 | 子宫内膜免疫细胞，特别是子宫自然杀伤细胞亚型 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 51例子宫内膜样本（18例CE患者和33例正常对照） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 2510 | 2025-11-16 |
Single-cell transcriptomics reveals the brain evolution of web-building spiders
2023-12, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02238-y
PMID:37919396
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结网蜘蛛大脑进化机制 | 首次构建结网蜘蛛大脑单细胞图谱，发现蘑菇体样神经元中正选择基因与学习记忆行为的关联 | 仅分析一种结网蜘蛛物种，未涵盖所有蜘蛛多样性 | 探究蜘蛛神经系统如何进化以适应结网捕食策略 | 结网蜘蛛(Hylyphantes graminicola)和两种原始穴居蜘蛛 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,基因组测序,基因富集分析,RNA干扰实验 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 超过30,000个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 2511 | 2025-11-16 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-11-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
|
研究论文 | 通过小鼠牙龈单细胞转录组图谱发现新型成纤维细胞亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫 | 首次识别出AG成纤维细胞亚群及其与中性粒细胞、ILC3细胞形成的免疫轴机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明牙周炎中口腔屏障免疫异常启动机制 | 小鼠牙周炎模型的牙龈组织细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠牙周炎模型牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2512 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing unravels the transcriptional network underlying zebrafish retina regeneration
2023-11-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86507
PMID:37988404
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示斑马鱼视网膜再生过程中穆勒胶质细胞的转录网络和命运决定机制 | 发现了损伤诱导的穆勒胶质细胞分化轨迹，识别出具有穆勒胶质细胞和祖细胞混合身份特征的细胞群体 | 研究仅限于斑马鱼模型，未直接验证在人类视网膜疾病中的适用性 | 研究穆勒胶质细胞反应性与祖细胞产生和神经元分化的分子机制 | 斑马鱼视网膜中的穆勒胶质细胞、祖细胞和再生后代细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未损伤和光损伤视网膜样本中的穆勒胶质细胞、祖细胞及再生后代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2513 | 2025-11-16 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas: An activated fibroblast subpopulation guides oral barrier immunity in periodontitis
2023-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.13.536751
PMID:37546811
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建小鼠牙龈细胞图谱，发现一种激活的成纤维细胞亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫反应 | 首次识别出AG成纤维细胞亚群，并揭示其通过AG成纤维细胞-中性粒细胞-ILC3轴启动牙龈炎症的新机制 | 研究基于小鼠模型，人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制 | 小鼠牙龈组织细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠牙周炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2514 | 2025-11-16 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
|
研究论文 | 本研究通过开发小鼠模型，在单细胞分辨率下探究了拉伸如何通过调控表皮干细胞和基底祖细胞的活性来介导皮肤扩张 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸诱导皮肤扩张的机制，结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究基于小鼠模型，在人类皮肤中的适用性需要进一步验证 | 阐明机械力在体内对表皮细胞行为的影响机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、克隆分析、定量建模、转录组分析、染色质分析 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2515 | 2025-11-15 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
|
综述 | 本章全面概述口腔免疫系统的组成与功能，强调其在维持共生微生物耐受与病原体防御中的双重作用 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术在口腔免疫研究中的应用前景 | NA | 阐明口腔免疫机制在健康与炎症状态下的作用及其与全身免疫的关联 | 口腔免疫系统组分（上皮屏障、唾液抗菌因子、免疫细胞）及共生微生物 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2516 | 2025-11-15 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
|
综述 | 本文系统探讨种植体周围炎的炎症介质特征及其从病理机制到治疗靶点的转化价值 | 整合基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示种植体周围炎特有的细胞互作网络与炎症通路 | 未明确说明纳入研究的样本规模与实验方法的具体局限性 | 阐明种植体周围炎的发病机制并探索精准医疗策略 | 种植体周围炎相关的炎症介质与分子标志物 | 数字病理学 | 牙科种植体疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因多态性分析 | NA | 唾液样本, 种植体周沟液, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2517 | 2025-11-15 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肠道微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控结肠上皮细胞身份和功能的机制 | 发现了微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控具有吸收和分泌双重特征的非常规隐窝间杯状细胞的新机制 | NA | 阐明微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 小鼠结肠上皮细胞和人类样本 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用无菌小鼠、抗生素处理小鼠和定植实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2518 | 2025-11-15 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
|
研究论文 | 本研究揭示低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的分子机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路，并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步在体实验验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA测序、平行板流动腔系统 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2519 | 2025-11-15 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
|
研究论文 | 本研究探讨P4HB在肝细胞癌中的表达及其通过UCA1促进恶性进展的作用机制 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1的相互作用机制，揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为 | NA | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌细胞和患者血清样本 | 癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，ROC分析，体外和体内功能实验 | NA | 单细胞测序数据，血清蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2520 | 2025-11-15 |
YWHAG mediated epithelial-mesenchymal transition facilitates tumor progression and metastatic spread in non-small cell lung cancer
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112139
PMID:40962000
|
研究论文 | 本研究揭示YWHAG通过LRRK2/PI3K/AKT轴促进非小细胞肺癌的上皮-间质转化和转移 | 首次阐明YWHAG通过调控LRRK2/PI3K/AKT信号轴驱动非小细胞肺癌EMT和转移的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明YWHAG在非小细胞肺癌进展中的功能和机制作用 | 非小细胞肺癌细胞系(NCI-H292, A549)、TCGA数据库、单细胞RNA测序数据、基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 生物发光成像 | 基因敲除小鼠模型, 原位肿瘤模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据, 影像数据 | TCGA泛癌数据集、2个NSCLC单细胞数据集(GSE117570 & GSE148071)、公共NSCLC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |