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当前共找到 39702 篇文献,本页显示第 2501 - 2520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2501 2026-04-29
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示多囊肾病囊肿微环境中的损伤细胞、标志基因和通讯模式 首次通过空间转录组学方法在组织原位解析多囊肾病囊肿微环境中的细胞组成、基因表达和细胞通讯模式,填补了传统单细胞测序缺乏空间信息的空白 文章未明确提及局限性 研究多囊肾病囊肿微环境的变化如何驱动囊肿形成 Pkd1缺陷小鼠和野生型小鼠的肾脏组织 空间转录组学 多囊肾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium空间基因表达平台
2502 2026-04-29
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了Hmx2和Dmrt2在肾脏集合管闰细胞亚型分化中的协调作用 首次阐明Hmx2和Dmrt2作为互斥转录因子分别调控B型和A型闰细胞分化,并发现Hmx3在两者缺失时补偿性表达 Dmrt2敲入未能修复Foxp1缺陷小鼠的闰细胞分化异常,提示可能存在尚未阐明的调控机制 探究Dmrt2和Hmx2在肾脏闰细胞亚型分化中的功能 小鼠肾脏远端肾单位特异条件性敲除和敲入模型 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 条件性基因敲除/敲入小鼠模型 单细胞转录组数据 小鼠及人类肾脏数据集 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序分析小鼠和人类肾脏数据集
2503 2026-04-29
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Mar-24, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
research paper 本文通过单细胞RNA测序技术,绘制了过敏性鼻炎合并哮喘患者气道的单细胞图谱,揭示了上下气道细胞组成和转录变化的相似性及炎症反应机制 首次对过敏性鼻炎合并哮喘患者多个不同微解剖区域的气道刷取样本进行单细胞RNA分析,发现了病变气道纤毛细胞结构损伤和上皮屏障破坏,并鉴定出GZMA-PARD3通路在体外破坏气道上皮屏障 仅纳入有限样本量,且为横断面研究、缺乏纵向随访数据 研究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下气道细胞种群分布和转录变化,探索慢性炎症条件下细胞图谱的异同 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻腔和支气管刷取细胞 machine learning asthma single-cell RNA-seq NA single-cell transcriptomic data 若干名过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻腔及支气管刷取样本 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
2504 2026-04-29
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
综述 本文综述了小麦穗发育过程中调控小穗数目的基因网络与分子机制,重点探讨了顶端分生组织向花序分生组织转变、小穗分生组织形成速率及终端小穗转化时间等关键过程 整合了近年空间转录组学、单细胞分析及多组学技术在小麦穗发育研究中的最新应用,系统梳理了促进小穗数增加的突变体(如超数小穗和分枝结构)及其育种应用进展 目前将超数小穗突变导入商业品种时面临育性和籽粒重量的权衡问题,且对多基因组合效应的田间验证研究仍有限 阐明小麦穗部小穗数目(SNS)的遗传调控网络及其对产量的影响机制 小麦穗部发育过程中的花序分生组织(IM)、小穗分生组织(SM)及终端小穗(TS) 植物遗传学与作物育种 NA 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多组学分析 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多组学 NA NA
2505 2026-04-29
Opioid-induced transcriptional reprogramming of cerebrospinal fluid immune cells drives neuroinflammation in SIV-infected rhesus macaques
2026-Feb-05, Research square
研究论文 利用单细胞转录组测序技术研究阿片类药物诱导的脑脊液免疫细胞转录重编程在SIV感染猕猴中驱动神经炎症的机制 首次在SIV/猕猴模型中整合纵向单细胞转录组分析,揭示慢性吗啡暴露如何将脑脊液单核细胞重编程为疾病相关小胶质细胞样状态,并影响免疫-胶质细胞对话和神经认知功能障碍 研究基于非人类灵长类动物模型,需进一步在人类样本中验证;未深入探讨具体分子机制和信号通路因果性 探索阿片类药物对HIV感染者神经认知障碍的加剧机制,特别是通过脑脊液免疫细胞的转录特征 吗啡和盐水处理的SIV感染、ART治疗恒河猴的脑脊液免疫细胞 单细胞转录组学 神经炎症与神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组表达数据 多只恒河猴,在基线、吗啡递增期、急性感染期和病毒血症抑制期纵向采样 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
2506 2026-04-29
Evaluating the Diagnostic Value and Molecular Mechanism of Energy Metabolism-Related Gene PEA15 in Sepsis
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过机器学习与单细胞RNA测序评估能量代谢相关基因PEA15在脓毒症中的诊断价值及分子机制 首次结合机器学习和单细胞RNA测序技术,鉴定能量代谢相关基因PEA15在脓毒症中的诊断潜力,并揭示其与免疫细胞浸润及核心基因网络的关系 未明确说明潜在局限性(如样本数量、验证队列不足等) 探索脓毒症中能量代谢相关基因的诊断价值及分子机制,为早期诊断和治疗提供新靶点 脓毒症患者基因表达数据及单细胞RNA测序样本 机器学习 脓毒症 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GSE65682和GSE95233数据集(具体样本数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2507 2026-04-29
Neutrophil-Specific Biomarker S100A2 Mediates Diabetic Foot Ulcer Through IL-17 Signaling Pathway and Potential Therapeutics
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析糖尿病足溃疡的免疫微环境,发现中性粒细胞特异性生物标志物S100A2及其通过IL-17信号通路的作用机制和潜在治疗药物 首次鉴定出S100A2作为与IL-17信号通路关联的中性粒细胞特异性生物标志物,填补了糖尿病足溃疡发病机制中特定基因-免疫细胞相互作用的空白 主要基于公开数据库的生物信息学分析,缺乏大规模临床样本验证,药物预测需要进一步的实验验证 探索糖尿病足溃疡的免疫微环境特征及其中性粒细胞特异性生物标志物的作用机制,寻找潜在治疗策略 糖尿病足溃疡患者与糖尿病足部皮肤样本的免疫细胞和基因表达数据 生物信息学 糖尿病足溃疡 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量实时聚合酶链反应 加权基因共表达网络分析, CIBERSORT, Seurat 基因表达数据 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
2508 2026-04-29
Exploring Centrosome Amplification-Associated Biomarkers in Osteoarthritis Through Bioinformatics and Experimental Approaches
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过生物信息学和实验方法探索骨关节炎中与中心体扩增相关的生物标志物 首次将中心体扩增相关基因与骨关节炎联系起来,通过整合差异表达分析、WGCNA、孟德尔随机化、ROC曲线及单细胞RNA测序等多种方法,鉴定出PLK2和SUN2两个潜在生物标志物,并构建了高预测准确度的列线图模型 未明确说明 识别骨关节炎中中心体扩增相关基因作为潜在生物标志物 骨关节炎患者的转录组数据和临床标本 生物信息学 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
2509 2026-04-29
CPEB1 drives ferroptosis-neuroinflammation crosstalk in temporal lobe epilepsy via the SIRT1-NRF2 acetylation axis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 CPEB1通过SIRT1-NRF2乙酰化轴驱动颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症的交互作用 首次揭示CPEB1通过调节SIRT1-NRF2乙酰化轴促进铁死亡-神经炎症交互作用在颞叶癫痫中的机制 未明确说明,但研究主要基于模型验证,可能需更多临床验证 探究CPEB1在颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症交互作用中的分子机制 人类颞叶癫痫患者和海马组织、小鼠模型(KA/PTZ诱导)及体外谷氨酸诱导的神经元损伤模型 神经科学 颞叶癫痫 单细胞转录组学、批量RNA测序、生物信息学分析、腺相关病毒(AAV)介导的过表达与敲低、药物调控 NA 转录组数据 人类颞叶癫痫患者组织样本及小鼠模型(数量未具体说明) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
2510 2026-04-29
Machine learning meets psoriasis: identifying key lactylation biomarkers as potential targets for diagnosis and therapies
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过机器学习识别银屑病中与乳酰化相关的关键生物标志物,为诊断和治疗提供潜在靶点 首次将机器学习算法(随机森林和LASSO回归)与乳酰化基因结合,鉴定出MPHOSPH6、ENO1、MKI67和FABP5作为银屑病诊断和治疗的新型生物标志物,并通过孟德尔随机化分析揭示了其因果关联 研究主要基于公开数据库分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的验证 识别银屑病中与乳酰化相关的生物标志物,探索其在诊断和治疗中的潜在价值 银屑病患者和健康对照的基因表达数据、小鼠银屑病模型 机器学习 银屑病 NA 随机森林、LASSO回归 基因表达数据、单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
2511 2026-04-29
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体,导致常见色素性疾病和光老化 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集,并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 未提及具体局限性 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 数字病理学 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 NA 图像, 文本 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2512 2026-04-29
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international IF:4.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 首次通过多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)联合分析,系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化,并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 尚未说明具体局限性 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞,以及人脑样本中的星形胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 APP/PS1和WT小鼠在5个时间点(2、4、6、9、12月龄)的星形胶质细胞样本;人脑单细胞核RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA NA
2513 2026-04-29
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international IF:4.4Q1
综述 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 利用单细胞测序和体内成像等新技术,揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 NA 综合OPC多模式功能的现有证据,评估非成髓鞘贡献,并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 少突胶质前体细胞(OPCs)及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 数字病理学 多发性硬化症、脑缺血 单细胞测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2514 2026-04-29
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷的机制 首次揭示β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失后,巨噬细胞通过代谢适应从免疫监视转向免疫抑制,并证明巨噬细胞谷氨酰胺合成酶条件性删除可减轻肿瘤负荷 研究主要基于小鼠模型和TCGA数据分析,人类患者样本的验证可能有限 研究β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤发展的影响 β-连环蛋白突变肝细胞癌患者和小鼠模型 机器学习 肝癌 单细胞空间转录组学 条件性基因敲除小鼠模型 转录组数据 TCGA数据库包含CTNNB1突变肝癌患者样本 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
2515 2026-04-29
Comparative transcriptomics reveals shifts in cortical architecture at the metatherian/eutherian transition
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过比较转录组学揭示有袋类/真兽类过渡期皮层结构的演变 首次利用单核RNA测序和空间转录组学比较有袋类与真兽类哺乳动物初级视皮层的细胞类型和层状结构,揭示皮层柱在进化中的重塑特征 仅比较两个物种(小鼠和一种有袋类),样本代表性有限;未直接验证功能差异 探究有袋类与真兽类哺乳动物分叉后皮层柱细胞类型特异性组织的变化 有袋类动物(具体物种未提及)和小鼠的初级视皮层 神经科学 NA 单核RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 两种哺乳动物物种(有袋类和小鼠)的初级视皮层样本 10x Genomics, Illumina 单核RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台
2516 2026-04-29
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
研究论文 提出scTWAS统计方法,利用单细胞数据进行细胞类型特异性转录组关联研究 创新采用潜变量模型和矩估计方法,解决单细胞数据的高噪声、高稀疏性和技术变异,实现细胞类型特异性TWAS分析 未在正文中明确说明,推测可能依赖于基因型数据的可用性和单细胞数据的质量 开发一种能够利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性转录组关联研究的统计方法 血液和脑组织中的细胞类型,以及29种血液性状、3种免疫相关疾病和阿尔茨海默病 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 潜变量模型 基因表达数据 未在标题和摘要中明确提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2517 2026-04-29
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,结肠中存在类似胸腺未成熟和中间前体状态的iNKT细胞群,并且CD1d+杯状细胞通过形成抗原通道扩增这些细胞以限制结肠炎 颠覆了结肠iNKT细胞在断奶后固定不变的经典观点,首次证明成年结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞亚群,并揭示杯状细胞作为非传统抗原呈递细胞调控iNKT细胞扩增的新机制 未明确说明 探究结肠iNKT细胞的异质性及其在结肠炎中的调控机制 人类和小鼠结肠中的iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 单细胞转录组学 结肠炎 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 人类和小鼠结肠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
2518 2026-04-29
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols IF:1.3Q4
协议 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应,实现基因表达预测 NA 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 单细胞基因表达数据及剂量响应 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 变分自编码器(VAE) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2519 2026-04-29
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠,揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 首次发现化学能量(ATP)在形态发生过程中呈现空间模式,并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制,可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 未明确说明研究的局限 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 生物信息学 NA 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 计算模型 图像、转录组数据 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 NA 空间转录组学 NA NA
2520 2026-04-29
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学方法,整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学,揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 首次采用多组学整合分析(空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组)系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用,并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 NA 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 数字病理学 原发性硬化性胆管炎 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 MERSCOPE MERSCOPE空间转录组平台
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