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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2501 | 2026-02-11 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.673801
PMID:41000836
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性,并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 | 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源,并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中得到验证 | 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症,以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 | 小鼠Müller胶质细胞(原代和永生化细胞系)、小鼠视网膜组织 | 神经科学 | 青光眼 | RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 | NA | 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2502 | 2026-02-11 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 | 开发了首个基于基因组语言模型的无参考框架,能够同时处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题,并提高了空间衰老时钟估计的准确性 | 未明确说明框架的计算复杂度或对特定数据类型的适用性限制 | 解决空间转录组数据分析中的高噪声和基因测量缺失问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架、基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2503 | 2026-02-11 |
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70053
PMID:40159808
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研究论文 | 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 | 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 | 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 | 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 | 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2504 | 2026-02-11 |
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70050
PMID:40192736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 | 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 | 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 | 小鼠的脾脏和骨髓细胞 | 单细胞组学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习程序 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2505 | 2026-02-11 |
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70082
PMID:40285422
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研究论文 | 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 | 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 | 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 | 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2506 | 2026-02-11 |
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14476
PMID:39737748
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞转录组图谱揭示了阿尔茨海默病中显著的性别依赖性分子特征 | 首次通过大规模单细胞转录组学系统揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子景观,识别了性别特异性的基因表达模式、通路改变和细胞间通讯变化 | 研究仅基于人类前额叶皮层样本,可能无法完全反映其他脑区或疾病阶段的性别差异 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 | 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大规模样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2507 | 2026-02-11 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示了TCF21缺失导致Foxd1+基质祖细胞亚群耗竭,并发现突变肾脏中表达血管内皮标记物Endomucin的新型细胞簇 | 研究主要聚焦于胚胎期E14.5阶段,未涵盖肾脏发育全过程;单细胞测序样本量相对有限 | 阐明TCF21转录因子在肾脏发育过程中调控基质祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎期E14.5肾脏中的Foxd1+基质祖细胞及其分化后代 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫染色 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 32,461个GFP+细胞(来自E14.5胚胎肾脏) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2508 | 2026-02-11 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
|
研究论文 | 本文开发了PURE-seq技术,用于高效富集和测序稀有细胞,并应用于小鼠长期造血干细胞的研究,识别出Egr1作为衰老背景下造血过程的潜在主调控因子 | 开发了PURE-seq技术,通过直接FACS加载细胞到PIP-seq反应中,减少处理步骤和细胞损失,实现了对稀有细胞(如1/1,000,000稀有度)的可扩展测序 | NA | 开发一种可扩展的稀有细胞测序方法,并研究小鼠长期造血干细胞在造血衰老中的转录组变化 | 小鼠长期造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2509 | 2026-02-11 |
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553751
PMID:37662327
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在艰难梭菌感染(CDI)中加剧肠道上皮细胞损伤的作用,并首次通过单细胞转录组学图谱识别了OLFM4+中性粒细胞的致病角色 | 首次建立了CDI后骨髓、血液和结肠中性粒细胞的转录组学图谱,并发现OLFM4作为关键标志物与感染严重程度相关 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限,且OLFM4的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究中性粒细胞在CDI中的功能角色及其对肠道上皮损伤的影响 | 中性粒细胞(特别是OLFM4+亚型)、肠道上皮细胞、CDI感染的小鼠模型和人类样本 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 包括小鼠模型和人类样本,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2510 | 2026-02-10 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学数据和机器学习方法,识别了四个内皮细胞相关生物标志物(ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST),这些标志物连接了动脉粥样硬化进展与免疫微环境失调 | 首次结合高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和机器学习(LASSO回归、SVM-RFE)从单细胞数据中筛选内皮细胞特异性诊断标志物,并探索其与免疫细胞浸润的关联及潜在治疗药物的结合能力 | 研究基于生物信息学分析,缺乏体内或体外实验验证;样本来源和数量未明确说明;药物结合预测仅通过分子对接模拟,需实验验证 | 识别动脉粥样硬化的内皮细胞相关诊断生物标志物,并阐明其与免疫微环境失调的关联 | 动脉粥样硬化患者的内皮细胞及免疫微环境 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、差异表达分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、CIBERSORT算法、分子对接模拟 | LASSO回归、SVM-RFE | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2511 | 2026-02-10 |
Cutting-Edge Technologies to Decode Tumor Microenvironment in Multiple Myeloma
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70171
PMID:41655245
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综述 | 本文综述了利用单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术和先进成像等技术解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境的最新进展 | 整合了多种前沿技术来高分辨率映射肿瘤微环境,并强调人工智能在数据整合和预测中的应用,以推动精准医疗 | 技术复杂性高、资源需求大且缺乏稳健的标准化,限制了其立即的临床应用 | 解析多发性骨髓瘤的肿瘤微环境以推动精准医疗发展 | 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术、先进成像、机器学习 | 机器学习 | 单细胞数据、批量数据、空间数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 2512 | 2026-02-10 |
PTEN variant and genetic backgrounds combine to modify cerebellar neuronal differentiation in autism spectrum disorder
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf185
PMID:41370235
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研究论文 | 本研究利用人源iPSC系和小脑类器官模型,探究PTEN基因变异及其遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑神经元的分化 | 首次在人类小脑类器官模型中,结合等基因iPSC系和单细胞RNA测序,揭示了PTEN p.Ile135Leu变异在不同遗传背景下对小脑细胞类型特异性分化和浦肯野细胞电活动的差异影响 | 研究主要关注分化22周前的早期发育阶段,未涵盖小脑成熟的后期过程;类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的细胞相互作用和环路形成 | 探究PTEN基因变异与遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑的分化、发育和神经元网络活动 | 携带PTEN p.Ile135Leu变异或PTEN敲除的等基因人诱导多能干细胞系及其衍生的小脑类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,小脑类器官培养,电生理记录 | 类器官模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了等基因iPSC系(包括对照、PTEN变异、PTEN敲除及PTEN校正的患者来源系) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2513 | 2026-02-10 |
scACAN: An Adaptive Learning Framework Aggregating Local Graph Structure Context for Rare Cell Type Identification
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02735
PMID:41572727
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scACAN的自适应图构建框架,用于增强单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别能力 | scACAN通过聚合局部图结构上下文信息设计正样本选择策略,结合自适应采样和基于聚类结果的迭代优化,有效提升了主要和稀有细胞类型的识别性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型分布不均和稀有细胞群体识别困难的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型,特别是稀有细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自适应图构建框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2514 | 2026-02-10 |
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520744
PMID:41655216
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综述 | 本文综述了空间蛋白质组学在癌症研究中的整合应用,包括其演变、关键进展及未来方向 | 整合空间蛋白质组学与其他数据模态(如空间转录组学、代谢组学),利用AI驱动框架揭示肿瘤异质性和微环境动态变化,并探索低丰度“暗蛋白质组” | 面临分辨率、标准化和数据复杂性等挑战 | 推动癌症诊断、个性化免疫治疗和药物开发的突破 | 肿瘤组织及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学、AI分析 | 传统机器学习算法、AI驱动框架(如KRONOS、HEIST) | 蛋白质、RNA、代谢物等多模态空间数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 2515 | 2026-02-10 |
A Comprehensive Benchmarking Study on Computational Tools for Cross-omics Label Transfer from Single-cell RNA to ATAC Data
2026-Feb-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag026
PMID:41655240
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研究论文 | 本研究对27种用于从单细胞RNA数据向ATAC数据跨组学标签转移的计算工具进行了全面基准测试 | 首次系统评估多种跨组学标签转移方法,特别关注scRNA-seq到scATAC-seq的数据转换,并识别了最佳性能工具 | 研究可能受限于所选数据集和评估指标,未涵盖所有潜在应用场景 | 评估和比较计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移中的性能 | 人类和小鼠组织的单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习, 分类器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2516 | 2026-02-10 |
Engineered TIGIT-Blockade Membrane Vesicles Synergize with Microwave Ablation to Mediate Liver Metastases Eradication
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202522918
PMID:41655262
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研究论文 | 本研究开发了一种工程化膜囊泡(Bev@TPNVs),联合微波消融治疗肝转移,旨在清除术后残留肿瘤细胞并抑制复发 | 首次利用单细胞RNA测序揭示微波消融后坏死过渡区的免疫抑制微环境特征,并创新性地设计了靶向CD155髓系细胞、封装贝伐珠单抗并融合TIGIT表达膜与血小板膜的工程囊泡,实现了对过渡区残留肿瘤细胞的精准靶向与免疫微环境重塑 | 研究基于实验性肝转移模型,尚未进行临床验证;长期疗效与安全性需进一步评估;囊泡的大规模制备与稳定性可能面临挑战 | 开发一种联合微波消融的新型免疫治疗策略,以消除肝转移术后残留肿瘤细胞并防止复发 | 肝转移小鼠模型、微波消融后的坏死过渡区微环境、CD155+髓系细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 肝转移癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 实验性肝转移小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2517 | 2026-02-10 |
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04104-y
PMID:41656235
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研究论文 | 本研究从脂肪酸代谢角度探索了椎间盘退变的新机制,并开发了一种基于中药配方的自组装纳米颗粒,通过靶向ACOT13调节AMPK/ACC通路,改善代谢紊乱和线粒体功能,从而抑制细胞焦亡并缓解椎间盘退变 | 首次从脂肪酸代谢角度揭示ACOT13在椎间盘退变中的关键作用,并创新性地开发了基于中药配方的自组装纳米颗粒作为治疗策略 | NA | 探究椎间盘退变的病理机制并开发新的治疗策略 | 椎间盘髓核细胞 | NA | 椎间盘退变 | 单细胞测序、多组学分析、分子动力学模拟 | NA | 临床样本、分子模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2518 | 2026-02-10 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2026-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108485
PMID:41649260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示了十三线地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 | 发现了视锥细胞不仅来源于早期神经源性祖细胞,还来源于晚期神经源性祖细胞,这一扩展的生成期由转录因子表达的异时性转变驱动 | 研究主要聚焦于十三线地松鼠这一特定物种,其发现是否普遍适用于其他视锥细胞优势物种尚需进一步验证 | 探究视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 | 十三线地松鼠的视网膜发育过程 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2519 | 2026-02-10 |
Divergent stem cell mechanisms govern the primary body axis and appendage regeneration in the axolotl
2026-Feb-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5697
PMID:41650255
|
研究论文 | 本研究探讨了蝾螈尾部与肢体再生过程中肌肉干细胞(MuSCs)命运决定机制的差异,揭示了TGF-β信号通路在调控干细胞多能性中的关键作用 | 首次发现蝾螈尾部再生时肌肉干细胞会重编程为胚胎样中胚层状态并获得多谱系分化潜能,而肢体再生时则保持谱系特异性,并证明TGF-β信号水平是决定其命运的关键内在因素 | 研究主要基于蝾螈模型,哺乳动物中是否存在类似机制仍需验证;TGF-β信号下游的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究器官再生的基本机制,比较脊椎动物主躯干轴与附肢再生过程中干细胞行为的差异 | 墨西哥钝口螈(蝾螈)的尾部与肢体再生过程 | 再生生物学 | 组织损伤与再生 | 单细胞RNA测序、遗传操作(组成型激活TGF-β受体过表达)、交叉移植实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多个发育与再生阶段的蝾螈组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2520 | 2026-02-10 |
Mesothelial cells promote peritoneal invasion and metastasis of ascites-derived ovarian cancer cells through spheroid formation
2026-Feb-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5944
PMID:41650261
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研究论文 | 本研究探讨了间皮细胞如何通过促进卵巢癌细胞形成球状体来增强其腹膜侵袭和转移能力 | 揭示了间皮细胞在卵巢癌腹膜转移中的关键作用,特别是通过形成聚集性癌-间皮球状体(ACMSs)来启动侵袭过程 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析,缺乏体内模型的验证,且样本来源和数量未明确说明 | 探究卵巢癌细胞与腹膜转移前非恶性细胞(特别是间皮细胞)之间的相互作用机制 | 上皮性卵巢癌(EOC)细胞和腹水中的间皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学/免疫荧光染色、多光子显微镜观察 | NA | 图像、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |