单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 25141 - 25160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25141 | 2024-08-09 |
Advances and challenges in single-cell RNA-seq of microbial communities
2020-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2020.10.001
PMID:33160164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在微生物群落研究中的进展和挑战 | 探讨了如何将单细胞RNA测序技术扩展到高吞吐量，以研究数千种微生物 | 单细胞RNA测序技术在真菌、原生生物和细菌中的应用仍处于初级阶段 | 旨在整合哺乳动物和微生物的单细胞分析，以研究健康和疾病中的微生物群落 | 微生物群落的分子状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25142 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses identify dysfunctional CD16+ CD8 T cells in smokers
2020-07-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100054
PMID:33163982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了吸烟者和非吸烟者外周血中的免疫细胞，发现吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群增加，这些细胞表现出NK细胞样特征和免疫老化迹象 | 首次揭示吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群的增加及其与免疫老化的关联 | NA | 识别吸烟对免疫细胞的影响 | 吸烟者和非吸烟者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 吸烟者和非吸烟者的外周血样本 |
| 25143 | 2024-08-09 |
The identification and functional analysis of CD8+PD-1+CD161+ T cells in hepatocellular carcinoma
2020, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00133-4
PMID:33145436
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞免疫环境，分析了肝细胞癌（HCC）中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的分布、功能和进化轨迹 | 首次详细描述了CD8+PD-1+CD161+和CD8+PD-1+CD161- T细胞在肿瘤和非肿瘤组织中的差异分布及其免疫活性，为HCC免疫环境的异质性提供了新的见解 | NA | 探索肝细胞癌中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的功能和分布，为免疫治疗提供新的靶点 | 肝细胞癌（HCC）中的CD8+PD-1+CD161+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约20,000,000个免疫细胞来自15对HCC肿瘤和非肿瘤邻近组织及10份血液样本（包括5份HCC和5份健康对照） |
| 25144 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Immune Cell Repertoire of the Atlantic Cod Which Naturally Lacks the Major Histocompatibility Class II System
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.559555
PMID:33154745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了大西洋鳕鱼免疫组织（脾脏和外周血白细胞）中的细胞类型 | 首次揭示了大西洋鳕鱼中可能代表树突状细胞、自然杀伤样细胞和表达T辅助2细胞主转录因子的细胞亚群 | NA | 探究缺乏主要组织相容性II类系统的大西洋鳕鱼如何对抗细菌感染及产生免疫记忆的机制 | 大西洋鳕鱼的免疫细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 脾脏和外周血白细胞中的细胞 |
| 25145 | 2024-08-09 |
Identification of a novel cancer stem cell subpopulation that promotes progression of human fatal renal cell carcinoma by single-cell RNA-seq analysis
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.46645
PMID:33162821
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群促进人类致命性肾细胞癌的进展 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，鉴定并表征了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群在肾细胞癌的进展和转移中起关键作用 | 研究样本仅来自一对原发和转移部位的集合管肾细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 旨在描绘癌症干细胞介导的生物学特性的基线图谱，为肿瘤进化、抗肿瘤药物选择和药物抗性提供重要信息 | 癌症干细胞亚群及其在肾细胞癌进展中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15208个细胞 |
| 25146 | 2024-08-09 |
Characteristics of TCR Repertoire Associated With Successful Immune Checkpoint Therapy Responses
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587014
PMID:33163002
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综述 | 本文综述了TCR库如何影响免疫检查点疗法（ICT）的反应，以及ICT如何影响TCR库的多样性 | 探讨了网络分析氨基酸相似性在TCR序列中的应用，以及单细胞测序技术在识别关键T细胞克隆中的作用 | 讨论了当前用于表征和表示TCR库多样性的指标的优缺点 | 旨在理解免疫机制，识别预测ICT反应的生物标志物，并开发将非反应患者转化为反应患者的方法 | T细胞受体（TCR）库及其在ICT中的动态变化 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 25147 | 2024-08-09 |
Tissue disaggregation and isolation of specific cell types from transgenic Xenopus appendages for transcriptional analysis by FACS
2021-09, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.268
PMID:33137227
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研究论文 | 本文介绍了一种从转基因非洲爪蟾附肢中分离特定细胞类型并进行转录分析的方法 | 提出了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从复杂尾和肢芽组织中分离特定细胞群体的协议 | NA | 研究非洲爪蟾胚胎和蝌蚪中的细胞类型特异性转录分析 | 非洲爪蟾胚胎和蝌蚪的特定细胞类型 | 细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | NA |
| 25148 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic profile-based analysis of tissue differentiation in colorectal cancer
2021-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1811-5
PMID:33141303
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研究论文 | 本文开发了一种方法，利用正常胃肠道的单细胞转录组数据分析结直肠癌中的组织分化谱，并应用于281个肿瘤样本，识别出三种具有不同组织分化模式的结直肠癌亚型 | 本文首次直接测量了结直肠癌组织中的分化程度，并观察到分化状态与抗肿瘤免疫反应及患者预后密切相关 | NA | 研究结直肠癌进展中的组织分化状态变化 | 结直肠癌的组织分化状态及其与免疫反应和患者预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 281个肿瘤样本 |
| 25149 | 2024-08-09 |
scAPAtrap: identification and quantification of alternative polyadenylation sites from single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa273
PMID:33142319
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研究论文 | 提出了一种名为scAPAtrap的工具，用于从基于3'标签的单细胞RNA测序数据中识别和量化选择性多聚腺苷酸化位点 | scAPAtrap能够识别低读取覆盖率的精确多聚腺苷酸化位点，并且不依赖于先验基因组注释，有助于发现先前被忽视区域的新的多聚腺苷酸化位点 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞分辨率下识别和分析选择性多聚腺苷酸化位点 | 单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 不同实验技术和物种的单细胞RNA测序数据 |
| 25150 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Understandings Towards Pathogenesis and Treatment for Intrauterine Adhesion and Disruptive Insights from Single-Cell Analysis
2021-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-020-00343-y
PMID:33125685
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综述 | 本文综述了宫腔粘连的发病机制和治疗进展，并强调了单细胞分析在该领域的重要性 | 强调了单细胞RNA测序在揭示子宫细胞异质性和细胞间相互作用中的重要性 | 干细胞相关疗法的潜力虽大，但主要基于动物研究且研究设计不标准 | 总结和评估宫腔粘连的当前治疗进展和研究方法 | 宫腔粘连的发病机制和治疗方法 | NA | 妇科疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 110篇文章 |
| 25151 | 2024-08-09 |
A data-driven dimensionality-reduction algorithm for the exploration of patterns in biomedical data
2021-06, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-020-00635-3
PMID:33139824
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'特征增强嵌入机'（FEM）的数据驱动降维算法，用于探索生物医学数据中的模式 | 该算法能够学习数据结构和数据组件的固有特征，对数据进行去噪和组件分离，然后将数据投影到较低维度 | NA | 开发一种准确且广泛适用的数据驱动降维算法 | 生物医学数据中的模式探索 | 机器学习 | NA | 特征增强嵌入机（FEM） | NA | 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据、计算机断层扫描数据、脑电图数据和可穿戴生理传感器数据 | NA |
| 25152 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-020-00640-8
PMID:33116295
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术，分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类，揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 | 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群，以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 | NA | 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素，为人类肢体再生提供新见解。 | 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞样本 |
| 25153 | 2024-08-09 |
Reshaping the Immune Microenvironment by Oncolytic Herpes Simplex Virus in Murine Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021-02-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.10.027
PMID:33130310
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研究论文 | 本研究通过建立免疫活性同基因的胰腺导管腺癌模型，探讨了溶瘤单纯疱疹病毒-1（oHSV）对肿瘤微环境（TME）免疫细胞组成的影响 | oHSV通过下调肿瘤相关巨噬细胞（TAMs），尤其是抗炎性巨噬细胞，并增加肿瘤浸润淋巴细胞的比例，包括激活的细胞毒性CD8 T细胞和T辅助（Th）1细胞，从而重塑PDAC的TME，增强免疫活性 | NA | 研究oHSV在胰腺导管腺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | 涉及携带肿瘤的小鼠 |
| 25154 | 2024-08-09 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
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研究论文 | 介绍了一种基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序TransSynW，用于预测用户指定细胞群体的细胞转换转录因子（TFs） | TransSynW优先考虑预测转换TFs中的先驱因子，以促进细胞转换时常需的染色质开放，并预测标记基因以评估细胞转换实验的性能 | NA | 开发一种计算工具，帮助研究人员利用单细胞RNA测序数据生成所需的功能性细胞 | 细胞转换转录因子（TFs）和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25155 | 2024-08-09 |
Exploring cardiac macrophage heterogeneity in the healthy and diseased myocardium
2021-02, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2020.09.005
PMID:33128959
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研究论文 | 本文探讨了健康和病变心肌中心脏巨噬细胞的异质性，利用遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术，提供了一个概念框架来评估心脏巨噬细胞的复杂性。 | 本文采用了遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术，超越了传统的M1/M2分类，更细致地解析了巨噬细胞的异质性。 | 文章讨论了当前对心脏巨噬细胞多样性理解的局限性，特别是在缺血性损伤、高血压和心肌炎中的应用。 | 提供一个起点，帮助研究人员解析已知心脏巨噬细胞亚群的功能。 | 心脏巨噬细胞的异质性和其在健康及病变心肌中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25156 | 2024-08-09 |
ARHGAP36 regulates proliferation and migration in papillary thyroid carcinoma cells
2021-01, Journal of molecular endocrinology
IF:3.6Q2
DOI:10.1530/JME-20-0230
PMID:33112823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了甲状腺乳头状癌（PTC）患者原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织的细胞表达谱，发现ARHGAP36在恶性细胞中高表达，并调控其增殖和迁移 | 首次揭示ARHGAP36在甲状腺乳头状癌恶性细胞中的特异性表达，并证实其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量较小，需进一步扩大样本验证ARHGAP36的临床应用价值 | 探索甲状腺乳头状癌复发和转移的诊断标志物及治疗靶点 | 甲状腺乳头状癌患者的原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,805个单细胞样本 |
| 25157 | 2024-08-09 |
Combining Whole-Cell Patch-Clamp Recordings with Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0818-0_9
PMID:33119852
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研究论文 | 本文详细描述了如何结合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序技术来研究脑切片中的神经元 | 本文首次详细介绍了将全细胞膜片钳记录与单细胞RNA测序技术相结合的方法 | NA | 理解大脑功能及其组成细胞的特性 | 神经元的内在电特性及其在神经回路中的突触连接 | NA | NA | 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据, 转录组数据 | 脑切片中的神经元 |
| 25158 | 2024-08-09 |
Toxicity in hematopoietic stem cells from bone marrow and peripheral blood in mice after benzene exposure: Single-cell transcriptome sequencing analysis
2021-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2020.111490
PMID:33120278
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研究论文 | 本研究使用Smart-seq2单细胞转录组测序技术，分析了苯暴露后小鼠骨髓和外周血造血干细胞的转录组变化 | 首次报道了苯暴露后造血干细胞的转录组特征，并通过加权基因共表达网络分析揭示了关键的生物学途径 | NA | 探究苯暴露对造血干细胞的毒性作用及其分子机制 | 小鼠骨髓和外周血中的造血干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了苯处理的C57B/6雄性小鼠的骨髓和外周血造血干细胞样本 |
| 25159 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor-infiltrating B cells reveals their clinical implications in non-small cell lung cancer
2021-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.13719
PMID:33124202
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25160 | 2024-08-09 |
New insights into macrophage heterogeneity in rheumatoid arthritis
2021-01, Joint bone spine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jbspin.2020.105091
PMID:33130232
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中巨噬细胞异质性的最新研究进展 | 应用单细胞RNA测序技术深入研究了巨噬细胞亚群及其在人和小鼠滑膜关节组织中的潜在功能 | NA | 旨在识别可能放大炎症反应或促进组织稳态恢复的滑膜巨噬细胞亚群 | 类风湿性关节炎中的巨噬细胞亚群及其功能 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |