单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27130 篇文献，本页显示第 25121 - 25140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25121 | 2024-08-09 |
Progress and applications of single-cell sequencing techniques
2020-06, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2020.104198
PMID:31958516
|
综述 | 本文主要总结了单细胞测序技术的方法及其应用领域 | NA | NA | 总结单细胞测序技术的方法和应用领域，为其未来在临床上的应用提供潜在参考 | 单细胞测序技术的方法及其在胚胎和器官发育、免疫系统、癌症进展、寄生虫和传染病以及干细胞研究、抗体筛选和治疗研究开发等领域的应用 | NA | NA | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组 | NA |
| 25122 | 2024-08-09 |
Surfactant Expression Defines an Inflamed Subtype of Lung Adenocarcinoma Brain Metastases that Correlates with Prolonged Survival
2020-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-2184
PMID:31953311
|
研究论文 | 研究通过量化肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）并分析其与肺腺癌脑转移的关系，揭示了表面活性剂代谢相关基因表达与免疫微环境及患者生存期的关联 | 首次发现表面活性剂代谢相关基因（SFTPA1, SFTPB, NAPSA）的高表达与肺腺癌脑转移的炎症亚型相关，这种亚型具有高密度的TIL和较长的生存期 | 研究样本量有限，且仅分析了部分患者的转录组数据 | 深入理解免疫系统与脑转移之间的相互作用，为这种致命疾病提供新的治疗选择 | 肺腺癌脑转移患者的肿瘤浸润淋巴细胞及表面活性剂代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81例肺腺癌脑转移患者，其中63例进行了转录组分析 |
| 25123 | 2024-08-09 |
Enhancing Hematopoiesis from Murine Embryonic Stem Cells through MLL1-Induced Activation of a Rac/Rho/Integrin Signaling Axis
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.12.009
PMID:31951812
|
研究论文 | 本文开发了一种可诱导MLL1的胚胎干细胞系统，并展示了在胚胎干细胞分化过程中诱导野生型MLL1能够选择性地增加胚胎体和胚胎中造血潜能的过渡性c-Kit/Cd41群体 | 本文首次展示了MLL1通过增强Rac/Rho/整合素信号状态，而非增加Hox或其他经典MLL1靶点，来促进造血承诺 | 由于缺乏生理模型系统，MLL1蛋白是否限制HSC发育尚不清楚 | 研究MLL1在造血干细胞发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎干细胞和造血干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 涉及小鼠胚胎干细胞和造血干细胞群体 |
| 25124 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Trypanosoma brucei from tsetse salivary glands unveils metacyclogenesis and identifies potential transmission blocking antigens
2020-02-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914423117
PMID:31964820
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从感染的采采蝇唾液腺中收集的2,045个寄生虫样本中，揭示了非洲锥虫的metacyclogenesis过程及其潜在的阻断传播抗原 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细揭示了非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并识别了可能的阻断传播抗原 | 需要进一步研究Fam10家族蛋白作为潜在的锥虫传播阻断疫苗抗原 | 深入理解非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并寻找阻断传播的潜在抗原 | 非洲锥虫及其在采采蝇唾液腺中的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2,045个寄生虫样本 |
| 25125 | 2024-08-09 |
Single-cell RNAseq analysis of testicular germ and somatic cell development during the perinatal period
2020-02-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.183251
PMID:31964773
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠围产期睾丸生殖细胞和体细胞的发育过程 | 研究首次识别了三个时间上不同的ProSG细胞亚群，包括一个迁移细胞群，其转录组与先前定义的T1-和T2-ProSG阶段不同 | NA | 研究睾丸生殖细胞和体细胞在围产期的发育过程 | 小鼠围产期的ProSG细胞及其后代和睾丸体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25126 | 2024-08-09 |
Tracking the important role of JUNB in hepatocellular carcinoma by single-cell sequencing analysis
2020-Feb, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2019.11235
PMID:31966074
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了JUNB在肝细胞癌（HCC）中的重要作用 | 首次揭示了JunB原癌基因在HCC的免疫反应和进展中的作用 | 研究仅基于一个HCC肿瘤样本和两个HCC细胞系，样本量较小 | 旨在揭示HCC发展和进展的潜在机制 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞和免疫反应 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 一个HCC肿瘤样本，两个HCC细胞系和正常外周血单个核细胞 |
| 25127 | 2024-08-09 |
Chromosome segregation error during early cleavage in mouse pre-implantation embryo does not necessarily cause developmental failure after blastocyst stage
2020-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-57817-x
PMID:31965014
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单个囊胚移植评估了早期卵裂阶段染色体分离错误与发育之间的关系 | 首次展示了早期染色体分离错误导致的微核形成并不一定会导致囊胚阶段后的发育失败 | 研究仅限于体外受精获得的鼠胚胎，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期卵裂阶段染色体分离错误对胚胎发育的影响 | 鼠的早期植入前胚胎 | NA | NA | 活细胞成像，单细胞测序 | NA | 图像，序列数据 | 使用了通过体外受精获得的鼠胚胎进行实验 |
| 25128 | 2024-08-09 |
Memory B Cell Activation, Broad Anti-influenza Antibodies, and Bystander Activation Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-01-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.12.063
PMID:31968262
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学、纵向抗体谱系测序和抗体结合测量，研究了流感疫苗接种后的抗体反应的分子和细胞特征 | 揭示了记忆B细胞激活的程序，包括CD11c和T-bet表达，与克隆扩增和分化为效应功能相关，并发现了流感疫苗接种引发的非特异性旁观者抗体激活 | NA | 探讨抗体记忆反应中转录程序、细胞增殖和抗原特异性抗体产生的协调机制 | 记忆B细胞的激活、抗体克隆的广谱性和旁观者激活 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 25129 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies
2020-01, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2019.11.010
PMID:31952776
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤功能异质性 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤内部结构，预测该技术将在多个研究领域广泛应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症治疗中的应用 | 肿瘤内部复杂性和功能异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 25130 | 2024-08-09 |
Visualization of Single Cell RNA-Seq Data Using t-SNE in R
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_8
PMID:31960377
|
研究论文 | 本文详细介绍了使用t-SNE和Seurat工具在R环境中对单细胞RNA测序数据进行可视化的过程 | 采用t-SNE这一非线性降维技术，相较于早期的PCA方法，在单细胞RNA测序数据可视化方面具有优势 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-SNE | 基因表达数据 | NA |
| 25131 | 2024-08-09 |
Use of SuperCT for Enhanced Characterization of Single-Cell Transcriptomic Profiles
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_9
PMID:31960378
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于监督学习的新方法，用于增强单细胞转录组特征的表征 | 提出了一种基于监督学习的新方法，用于解决单细胞转录组技术中细胞身份识别的问题 | NA | 深入理解异质性组织中的细胞身份 | 单细胞转录组特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习 | 转录组数据 | 多种已知细胞类型的单细胞转录组数据 |
| 25132 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics identifies spatially dysregulated expression of GRM3 and USP47 in amyotrophic lateral sclerosis
2020-08, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12597
PMID:31925813
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，分析了携带C9orf72六核苷酸重复扩展的ALS患者死后皮质组织的转录组，以识别可能解释ALS发病机制中不同细胞类型和脑区差异脆弱性的失调转录本 | 本研究首次描述了在携带C9orf72六核苷酸重复扩展的ALS患者死后皮质组织中应用空间转录组学技术 | NA | 旨在通过空间解析的RNA测序技术，识别与ALS发病机制中不同细胞类型和脑区差异脆弱性相关的失调转录本 | ALS患者的死后皮质组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 包括多个死后脑区和脊髓组织，来自扩展的C9orf72、散发性ALS(sALS)和SOD1 ALS病例 |
| 25133 | 2024-08-09 |
BEM: Mining Coregulation Patterns in Transcriptomics via Boolean Matrix Factorization
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz977
PMID:31913438
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的布尔矩阵分解算法（BEM），通过期望最大化方法挖掘转录组数据中的共调控模式 | BEM算法更符合转录组共调控的分子机制，并且能够处理包含超过一亿数据点的大规模矩阵 | NA | 分析转录组数据中的共调控模式，揭示肿瘤信号扰动状态和亚型分类 | 转录组数据，包括批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 布尔矩阵分解（BMF） | 期望最大化（EM） | 转录组数据 | 超过100万个数据点 |
| 25134 | 2024-08-09 |
The emergence and promise of single-cell temporal-omics approaches
2020-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2019.12.005
PMID:31918114
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞时间组学方法的兴起及其在生物复杂系统中的应用潜力 | 介绍了新的单细胞分析方法，这些方法能够在测量转录组的同时捕捉到谱系信息或过去的分子事件 | NA | 强调单细胞领域的发展，描述用于研究的创新工具包，并考虑时间组学方法在疾病进展研究中的潜在影响 | 单细胞转录组数据及其在胚胎发育、疾病进展和刺激响应中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25135 | 2024-08-09 |
In vitro characterization of the human segmentation clock
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1885-9
PMID:31915384
|
研究论文 | 本文通过体外培养的人类前体脊索中胚层细胞研究了人类分割时钟的特征 | 首次在人类细胞中证实了与小鼠相似的分割时钟振荡器，并揭示了FGF信号通路在调节振荡周期和相位中的新作用 | NA | 探讨人类是否存在与小鼠类似的分割时钟振荡器 | 人类前体脊索中胚层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 人类和小鼠的前体脊索中胚层细胞 |
| 25136 | 2024-08-09 |
Dynamics of human monocytes and airway macrophages during healthy aging and after transplant
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191236
PMID:31917836
|
研究论文 | 研究人类肺部气道巨噬细胞（AMs）在健康衰老和移植后的发育过程 | 首次详细描述了人类肺部气道巨噬细胞在不同年龄段的发育变化，并探讨了移植后的来源 | 研究仅限于健康志愿者和肺移植受者，未涉及疾病状态下的情况 | 探究人类肺部气道巨噬细胞在健康衰老和移植后的发育过程及其对疾病的影响 | 人类单核细胞和气道巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 包括婴儿/儿童（2-12岁）、成熟期（20-50岁）和老年（>50岁）的健康志愿者以及性别不匹配的肺移植受者 |
| 25137 | 2024-08-09 |
Deciphering the functional heterogeneity of skin fibroblasts using single-cell RNA sequencing
2020-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201902001RR
PMID:31930613
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析皮肤成纤维细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了皮肤成纤维细胞的异质性，并识别出DPP4成纤维细胞作为人体皮肤中主要细胞外基质（ECM）生成细胞 | 研究仅限于皮肤成纤维细胞，未涉及其他细胞类型 | 填补关于人类皮肤成纤维细胞多样性的知识空白 | 皮肤成纤维细胞及其亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个皮肤成纤维细胞样本 |
| 25138 | 2024-08-09 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0392-8
PMID:31932730
|
研究论文 | 本研究结合微阵列空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺导管腺癌中的组织结构 | 引入了一种多模态交叉分析方法，用于精确注释不同组织区域的细胞组成 | NA | 研究胰腺导管腺癌中细胞亚群的空间组织和相互作用 | 胰腺导管腺癌中的细胞亚群及其空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个胰腺肿瘤样本 |
| 25139 | 2024-08-09 |
Using single-cell RNA sequencing to unravel cell lineage relationships in the respiratory tract
2020-02-28, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20191010
PMID:31922198
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了呼吸道的细胞谱系关系 | 结合单细胞RNA测序与谱系推断算法，独立建立了小鼠和人类细胞谱系关系的全面图谱，并发现了新的中间细胞群体和分化动态 | NA | 研究呼吸道的细胞谱系关系 | 呼吸道的伪层状上皮细胞及其在再生过程中的谱系关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及小鼠和人类样本 |
| 25140 | 2024-08-09 |
Precursors for Nonlymphoid-Tissue Treg Cells Reside in Secondary Lymphoid Organs and Are Programmed by the Transcription Factor BATF
2020-02-18, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.12.002
PMID:31924477
|
研究论文 | 本研究通过使用转录因子核因子、白细胞介素3调控（Nfil3）报告鼠和单细胞RNA测序（scRNA-seq），识别了非淋巴组织Treg细胞的两个前体阶段，并揭示了这些前体细胞在非淋巴组织Treg细胞表型重编程中的分子机制。 | 首次识别了非淋巴组织Treg细胞的两个前体阶段，并揭示了转录因子Batf在非淋巴组织Treg细胞表型重编程中的驱动作用。 | NA | 理解非淋巴组织Treg细胞的组织发育程序，以利用其再生特性进行治疗。 | 非淋巴组织Treg细胞的前体阶段及其分子机制。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用Nfil3报告鼠进行研究 |