单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 25041 - 25060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25041 | 2024-08-09 |
A robust semi-supervised NMF model for single cell RNA-seq data
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.10091
PMID:33088619
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研究论文 | 本文提出了一种鲁棒的半监督非负矩阵分解（rssNMF）模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 首次将先验知识（如细胞标记基因）引入到单细胞RNA测序数据的聚类分析中 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 十二个带有真实标签的单细胞RNA测序数据集 |
| 25042 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics: a novel precision medicine technique in nephrology
2021-05, The Korean journal of internal medicine
DOI:10.3904/kjim.2020.415
PMID:33076636
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术及其在肾脏学领域中的单细胞转录组学研究，并讨论了基于单细胞分析的精准医学在肾脏学中的未来展望 | 单细胞分析技术能够克服传统批量水平转录组学方法的局限，区分疾病发展的主要自主反应和次要非自主细胞反应 | NA | 探讨单细胞分析技术在肾脏学中的应用及其在精准医学中的未来前景 | 肾脏疾病的机制及相关的生物标志物和通路 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25043 | 2024-08-09 |
Angiogenesis after acute myocardial infarction
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa287
PMID:33063086
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研究论文 | 本文探讨了急性心肌梗死后血管生成机制及其潜在治疗策略 | 利用细胞系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了心肌梗死区域新生毛细血管结构的形成机制，并发现具有干细胞特性的组织驻留内皮细胞在心肌梗死后血管生成中的作用 | 目前对心肌梗死后细胞间通讯的复杂性理解尚处于初级阶段，且临床转化需要谨慎选择适合的患者 | 研究急性心肌梗死后血管生成的机制，并探索其治疗潜力 | 急性心肌梗死后的血管生成过程及参与的细胞类型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 细胞系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型，包括内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 |
| 25044 | 2024-08-09 |
Cell populations in neonatal rat peripheral nerves identified by single-cell transcriptomics
2021-03, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23928
PMID:33079428
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术，研究了新生大鼠外周神经中的细胞群体多样性，特别是施万细胞的异质性 | 首次通过高覆盖率的单细胞测序技术，对新生大鼠的外周神经和背根神经节中的细胞群体进行了分类，并揭示了施万细胞的亚型及其基因特征和功能富集 | NA | 探究新生大鼠外周神经中细胞群体的多样性和复杂性 | 新生大鼠的坐骨神经和背根神经节中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自新生（1天龄）大鼠的坐骨神经和背根神经节样本 |
| 25045 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes are immune modulatory cells
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137377
PMID:33079726
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研究论文 | 本文研究了肺巨核细胞（MkL）的免疫调节功能 | 首次发现肺巨核细胞具有类似于抗原呈递细胞的基因表达模式，并能内化和处理抗原蛋白及细菌病原体 | NA | 探讨肺巨核细胞的免疫功能 | 肺巨核细胞（MkL）及其免疫调节作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25046 | 2024-08-09 |
The cellular basis of distinct thirst modalities
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2821-8
PMID:33057193
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了大脑中终板旁器官在感知不同类型口渴刺激中的细胞基础 | 首次揭示了大脑中特定神经元类型在不同口渴状态中的作用 | NA | 探究大脑中不同口渴状态的细胞基础 | 大脑中的终板旁器官和神经元类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种兴奋性和抑制性神经元类型 |
| 25047 | 2024-08-09 |
MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments
2020-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-00979-3
PMID:33077966
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MARS的元学习方法，用于在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释已知及新型细胞类型 | MARS通过跨多个数据集转移潜在细胞表示来克服细胞类型的异质性，并能发现以前未见过的细胞类型 | NA | 开发一种方法以在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释新型细胞类型 | 异质单细胞RNA测序数据中的新型细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 数据集 | 大量小鼠细胞图谱 |
| 25048 | 2024-08-09 |
A new lymphoid-primed progenitor marked by Dach1 downregulation identified with single cell multi-omics
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0799-x
PMID:33077975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了Dach1及其相关基因在淋巴样前体细胞中的表达模式，并利用Dach1-GFP报告鼠模型，鉴定了一类具有淋巴样潜能的新型前体细胞——淋巴样前体细胞（LPPs）。 | 本文首次鉴定了一种新型淋巴样前体细胞（LPPs），并定义了淋巴样发育在造血过程中的早期分支点。 | NA | 研究淋巴样前体细胞的鉴定及其在造血过程中的作用。 | 淋巴样前体细胞（LPPs）及其在造血过程中的作用。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25049 | 2024-08-09 |
Visualizing HIF-1α mRNA in a Subpopulation of Bone Marrow-Derived Cells to Predict Retinal Neovascularization
2020-11-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.0c00662
PMID:33080135
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研究论文 | 本文描述了一种新的混合纳米颗粒的合成，用于在小鼠新生血管化模型中选择性地可视化微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA | 开发了一种新的混合纳米颗粒，能够选择性地在特定组织微胶质细胞/巨噬细胞中可视化HIF-1α mRNA，用于预测新生血管化的发生和进展 | NA | 研究微胶质细胞/巨噬细胞在新生血管化中的调控作用，并开发一种新的方法来预测新生血管化的发生和进展 | 微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA表达 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 25050 | 2024-08-09 |
Leveraging Uncertainty in Machine Learning Accelerates Biological Discovery and Design
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.09.007
PMID:33065027
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研究论文 | 本文展示了利用基于高斯过程的不确定性预测在生物发现中的广泛应用 | 通过量化预测不确定性，算法能够更好地处理超出训练数据分布的新现象 | NA | 加速生物发现和设计 | 化合物库中的化合物及其对不同激酶和结核分枝杆菌细胞生长的抑制作用 | 机器学习 | NA | 高斯过程 | NA | 化合物 | 72个化合物用于训练模型，10,833个化合物用于预测 |
| 25051 | 2024-08-09 |
Cell-type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2825-4
PMID:33057195
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研究论文 | 研究了人类皮质发育过程中特定细胞类型的三维表观基因组特征 | 开发了CRISPRview技术，整合免疫染色、CRISPR干扰、RNAscope和图像分析，验证了细胞类型特异性的顺式调控元件 | NA | 揭示发育中人类皮质中细胞类型特异性的基因表达模式，并增进对基因调控和谱系特化的理解 | 放射状胶质细胞、中间前体细胞、兴奋性神经元和抑制性神经元 | 表观遗传学 | NA | CRISPR干扰、RNAscope、图像分析 | NA | 基因组数据 | 来自中孕期人类皮质样本的多种细胞类型 |
| 25052 | 2024-08-09 |
PREIMPLANTATION GENETIC TESTING: Single-cell technologies at the forefront of PGT and embryo research
2020-11, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0102
PMID:33065545
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞技术在胚胎植入前遗传测试（PGT）和胚胎研究中的应用 | 介绍了高吞吐量技术如DNA微阵列和大规模并行测序的发展，使得单细胞基因组研究从评估少数位点扩展到全面筛查所有24条染色体 | NA | 研究单细胞技术在胚胎发育和遗传疾病检测中的应用 | 胚胎的染色体镶嵌现象及其对胚胎发育的影响 | 遗传学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 25053 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2840-5
PMID:33067604
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25054 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics uncover distinct innate and adaptive cell subsets during tissue homeostasis and regeneration
2020-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0720-131R
PMID:33070367
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示组织稳态和再生过程中不同免疫细胞亚群中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）提供了一种前所未有的方法，无需依赖先验的细胞特异性标记即可揭示细胞多样性 | NA | 探讨scRNA-Seq如何促进免疫细胞的表征，包括巨噬细胞、固有淋巴细胞和T、B淋巴细胞，以及发现免疫细胞异质性、识别新亚群和追踪不同免疫细胞在组织稳态、修复和再生中的发育轨迹 | 免疫细胞在组织修复和再生中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25055 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Engineered Cardiac Tissues From Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Abnormal Developmental Trajectory and Intrinsic Contractile Defects in Hypoplastic Right Heart Syndrome
2020-10-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.016528
PMID:33059525
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和表型分析，比较了来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型，揭示了肺动脉闭锁伴完整室间隔（PAIVS）中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 首次揭示了PAIVS中心肌细胞发育和功能的内在异常，排除了次要解剖缺陷的影响 | NA | 理解PAIVS中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 3名PAIVS患者和3名健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 |
| 25056 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Parkinson's Disease Human In Vitro Models Reveals Dopamine Neuron-Specific Stress Responses
2020-10-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108263
PMID:33053338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了帕金森病人类体外模型中多巴胺神经元对细胞毒性和遗传应激的基因表达动态 | 首次进行了最大规模的单细胞转录组学研究，揭示了多巴胺神经元亚型的转录特征和应激敏感性差异 | NA | 阐明帕金森病中多巴胺神经元在细胞毒性和遗传应激下的基因表达动态 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个神经元亚型 |
| 25057 | 2024-08-09 |
Identification of oncolytic vaccinia restriction factors in canine high-grade mammary tumor cells using single-cell transcriptomics
2020-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008660
PMID:33075093
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，分析了犬高级别乳腺肿瘤细胞中溶瘤痘病毒的限制因子，特别是DDIT4基因的作用 | 首次揭示了DDIT4基因在溶瘤痘病毒治疗中的潜在抗性标记作用，并展示了单细胞转录组学在识别影响病毒复制的细胞因子方面的应用 | NA | 探讨溶瘤痘病毒在犬乳腺肿瘤细胞中的效力和潜在的抗性因子 | 犬高级别乳腺肿瘤细胞，特别是三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的三阴性乳腺癌细胞样本，分别感染或未感染痘病毒 |
| 25058 | 2024-08-09 |
Cell Development Deficiency and Gene Expression Dysregulation of Trisomy 21 Retina Revealed by Single-Nucleus RNA Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.564057
PMID:33072724
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术揭示了唐氏综合症（T21）视网膜的细胞发育缺陷和基因表达失调 | 首次提供了人类T21视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了细胞组成的多样性和异质性以及异常的细胞构成 | NA | 评估染色体非整倍性对视网膜发育的影响 | 唐氏综合症（T21）视网膜的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个T21胎儿的视网膜样本 |
| 25059 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering by Low-Rank Subspace Ensemble Framework
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3029187
PMID:33026977
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研究论文 | 本文提出了一种低秩子空间集成聚类框架（LRSEC）用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | LRSEC框架通过低秩子空间捕获数据的全局结构，相比单一聚类模型具有更好的聚类性能 | NA | 分析scRNA-seq数据，揭示细胞的异质性和多样性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 低秩模型 | 基因表达数据 | 七个小数据集和一个大数据集 |
| 25060 | 2024-08-09 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 研究炎症性肠病中IL-23表达的调控机制，并探讨其在个性化治疗中的应用 | 识别了IL-10和IL-1作为单核细胞IL-23产生的关键调节因子，并区分了稳态和超炎症相关的IL-23产生 | NA | 探讨IL-23在炎症性肠病中的调控机制，为个性化治疗提供依据 | 人类单核细胞和外周血单核细胞中的IL-23表达 | NA | 炎症性肠病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核细胞样本 |