单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 25021 - 25040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25021 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune escape and drug resistance mechanisms of mantle cell lymphoma
2020-08-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了套细胞淋巴瘤的免疫逃逸和药物抗性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了套细胞淋巴瘤中多种细胞亚群的免疫逃逸和药物抗性机制 | 研究仅基于单一患者样本，可能存在样本代表性不足的问题 | 探索套细胞淋巴瘤的免疫逃逸和药物抗性机制 | 套细胞淋巴瘤中的细胞亚群及其免疫逃逸和药物抗性相关基因 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约4000个骨髓细胞 |
| 25022 | 2024-08-09 |
Identification of hub genes in diabetic kidney disease via multiple-microarray analysis
2020-Aug, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-20-5171
PMID:32953797
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研究论文 | 本研究通过重新分析三个mRNA微阵列数据集，包括一个单细胞RNA测序数据集，旨在识别与糖尿病肾病相关的关键基因，并增进对糖尿病肾病发病机制的理解。 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集进行多微阵列分析，识别了17个关键基因，丰富了细胞水平上糖尿病肾病发病机制的理解，并为诊断和治疗提供了候选靶点。 | NA | 识别与糖尿病肾病相关的关键基因，增进对糖尿病肾病发病机制的理解。 | 糖尿病肾病的关键基因及其在发病机制中的作用。 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | mRNA微阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集：GSE131882, GSE30122, GSE30529 |
| 25023 | 2024-08-09 |
Percutaneous liver biopsy: another option of hepatic sample collection approach in single-cell sequencing studies?
2020-Aug, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm.2020.04.23
PMID:32953833
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25024 | 2024-08-09 |
Understanding Diseases from Single-Cell Sequencing and Methylation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_1
PMID:32949386
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review | 本书综述了单细胞测序和甲基化在疾病中的作用，并探讨了单细胞测序和甲基化的疾病特异性改变 | 本书强调了单细胞测序和甲基化方法在临床实践和应用中的重要性，以及其在非癌疾病中的潜在价值 | NA | 旨在应用单细胞测序和甲基化测量进行临床诊断和治疗，并理解这些参数的临床价值 | 单细胞测序和甲基化在疾病中的应用 | digital pathology | pulmonary disease | single-cell sequencing, methylation sequencing | NA | DNA, RNA | NA |
| 25025 | 2024-08-09 |
Methods for Single-Cell Isolation and Preparation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_2
PMID:32949387
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研究论文 | 本文综述了当前用于基于测序的下游分析的单细胞分离方法的最新技术，并讨论了它们的优缺点 | 介绍了多种单细胞分离方法，并允许转录组学与细胞电生理或形态学参数的相关性分析 | 需要仔细选择合适的方法以避免数据错误或偏差，可能导致误解 | 提供单细胞分离方法的广泛概述，并详细讨论关键参数 | 单细胞分离技术及其在测序基础下游分析中的应用 | 生命科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 25026 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of T cell Receptors: A Perspective on the Technological Development and Translational Application
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_3
PMID:32949388
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综述 | 本文综述了T细胞受体（TCR）的单细胞测序技术发展及其在自身免疫性疾病中的转化应用 | 介绍了单细胞测序技术在研究TCR库中的应用，改变了TCR库的调查和分析方式 | 在技术上仍存在挑战，如如何序列化TCR并提供与免疫系统中大量TCR库相关的概念性背景 | 探讨TCR的生物学特性、信号传导及其在自身免疫中的意义，并讨论单细胞测序平台在自身免疫性疾病中的应用 | T细胞受体（TCR）及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 25027 | 2024-08-09 |
Application of Single-Cell RNA Sequencing in Pancreatic Cancer and the Endocrine Pancreas
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_12
PMID:32949397
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在胰腺癌和内分泌胰腺研究中的应用 | scRNA-seq技术能深入分析胰腺和胰腺癌中的细胞异质性，特别是在细胞类型特异性分子识别和癌细胞与间质微环境相互作用的检测方面 | NA | 综述scRNA-seq策略在胰腺转录组学和胰腺癌研究中的最新进展 | 胰腺癌和内分泌胰腺 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25028 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Genitourinary Malignancies
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_13
PMID:32949398
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研究论文 | 本文综述了单细胞测序（SCS）在泌尿生殖系统恶性肿瘤中的应用，包括其在肾细胞癌、膀胱癌和前列腺癌中的研究进展 | SCS技术革新了对肿瘤异质性、肿瘤微环境、免疫浸润、癌症干细胞（CSCs）、循环肿瘤细胞（CTCs）和克隆进化的理解 | NA | 探讨SCS技术在泌尿生殖系统恶性肿瘤中的应用及其未来发展 | 肾细胞癌、膀胱癌和前列腺癌 | 数字病理学 | 泌尿生殖系统恶性肿瘤 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 25029 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing in Human Disease: Renal, Pancreatic, and Viral Diseases
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_16
PMID:32949401
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综述 | 本章讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在探索病毒感染以及肾脏和胰腺疾病中的具体应用 | scRNA-seq技术已推进对肺部和心脏疾病、移植免疫学、癌症等多种疾病的研究 | 本综述并非详尽无遗 | 探讨scRNA-seq在人类疾病中的应用，特别是肾脏、胰腺和病毒性疾病 | 病毒感染、肾脏和胰腺疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病、胰腺疾病、病毒性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞表达模式 | NA |
| 25030 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Human Genital Infections
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_17
PMID:32949402
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用 | 单细胞测序技术为研究药物抗性克隆、细胞间变异、获得性药物抗性突变、病原体在不同感染阶段的转录多样性、识别稀有细胞类型以及研究生殖器感染病原体的不同细胞状态提供了新的可能性 | 本文讨论了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的局限性和挑战 | 探讨单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用及其局限性 | 人类生殖器感染及其相关病原体 | NA | 生殖器感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 25031 | 2024-08-09 |
Values of Single-Cell RNA Sequencing in Development of Cerebral Cortex
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_19
PMID:32949404
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究大脑皮层细胞复杂性、集群和特定功能中的应用 | 本文提出了将scRNA-seq扩展到单个神经元细胞的代谢谱，并整合转录组与分子和功能表型，以深入理解大脑发育和疾病发生的分子机制 | 大脑样本易受干扰和混杂因素影响，需要开发更先进的计算系统生物学方法来克服单细胞信号检测中的固有干扰和技术差异 | 研究单细胞RNA测序在理解大脑皮层发育和神经疾病发病机制中的应用 | 大脑皮层细胞的异质性和转录组变化 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 25032 | 2024-08-09 |
scTree: An R package to generate antibody-compatible classifiers from single-cell sequencing data
2020, Journal of open source software
DOI:10.21105/joss.02061
PMID:32954206
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研究论文 | 介绍了一个名为scTree的R包，用于从单细胞测序数据中生成抗体兼容的分类器 | scTree工具旨在为使用R编程语言和scRNA-seq分析程序的生物学家提供一组最小的基因，以便用于下游实验 | NA | 开发一个工具，帮助生物学家从单细胞测序数据中选择用于下游实验的最小基因集 | 单细胞RNA测序数据中的基因选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25033 | 2024-08-09 |
Sources of variation in cell-type RNA-Seq profiles
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239495
PMID:32956417
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研究论文 | 研究了影响细胞类型特异性RNA-Seq表达谱变异的因素 | 评估了不同归一化方法对变异的影响，并探讨了UMI-based单细胞RNA-Seq与bulk RNA-Seq之间的差异 | 技术变异和组织来源的差异对细胞类型比例解卷积有混杂效应 | 探究影响细胞类型特异性基因表达谱变异的主要因素 | bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据中的B细胞和T细胞 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 多个公开可用的bulk和单细胞RNA-Seq数据集 |
| 25034 | 2024-08-09 |
Human kidney organoids produce functional renin
2021-01, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.08.008
PMID:32918942
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研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官研究了肾素及其在肾脏中的作用 | 首次展示了人肾脏类器官能够产生功能性肾素，并探讨了其在再生医学中的应用潜力 | NA | 开发用于研究肾素调节及其对肾脏生理学意义的人类模型 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 再生医学 | NA | 单细胞测序、免疫组化、功能性检测 | NA | 细胞 | NA |
| 25035 | 2024-08-09 |
Investigating Inter- and Intrasample Diversity of Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0849-4_10
PMID:32926367
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研究论文 | 本文提供了一个实用指南，用于计算单细胞RNA测序数据集的样本间和样本内多样性指标 | 将统计学和生态学中常用的多样性指标应用于单细胞分辨率下样本异质性的量化和比较 | NA | 探讨肿瘤异质性的来源及其对不良结果的影响 | 单细胞RNA测序数据集的样本间和样本内多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个不同样本 |
| 25036 | 2024-08-09 |
L2,1-Extreme Learning Machine: An Efficient Robust Classifier for Tumor Classification
2020-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于L2,1范数的新型极端学习机方法，用于提高肿瘤分类的鲁棒性 | 引入L2,1范数在损失函数中以提高方法的鲁棒性，并减少噪声和异常值的影响 | NA | 提高极端学习机在肿瘤分类中的鲁棒性 | 癌症样本和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 极端学习机（ELM） | 基因表达数据 | 五个UCI数据集以及TCGA数据集和scRNA-seq数据集 |
| 25037 | 2024-08-09 |
The Stress-Like Cancer Cell State Is a Consistent Component of Tumorigenesis
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.018
PMID:32910905
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research paper | 本研究通过结合斑马鱼黑色素瘤模型、空间转录组学和人类样本，验证了肿瘤发生过程中存在一种应激样癌细胞状态 | 首次通过多种模型和方法验证了应激样癌细胞状态的存在，并发现其在肿瘤发生早期即已出现，且具有更高的肿瘤种植能力和药物抗性 | 研究主要集中在应激样癌细胞状态的验证和特性分析，未深入探讨其具体机制和治疗应用 | 验证肿瘤发生过程中应激样癌细胞状态的存在及其特性 | 应激样癌细胞状态及其在肿瘤发生中的作用 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括斑马鱼模型和人类样本 |
| 25038 | 2024-08-09 |
Spectacle: An interactive resource for ocular single-cell RNA sequencing data analysis
2020-11, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2020.108204
PMID:32910939
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研究论文 | 本文介绍了Spectacle，一个用于探索眼部单细胞RNA测序数据的交互式网络资源 | 开发了Spectacle系统，降低了非计算背景用户与丰富单细胞RNA测序研究交互的生物信息学门槛 | 分享单细胞RNA测序结果仍然是一个主要障碍，特别是对于没有计算背景的个人 | 解决分享单细胞RNA测序结果的难题，特别是为没有计算背景的用户提供便利 | 眼部单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Shiny框架 | 单细胞表达数据 | 五个预处理的眼部单细胞RNA测序数据集 |
| 25039 | 2024-08-09 |
Duodenal chemosensory system: enterocytes, enteroendocrine cells, and tuft cells
2020-11, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000000685
PMID:32925177
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综述 | 本文综述了胃十二指肠上皮中由肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞组成的腔内化学感应系统的最新进展，特别强调了化学感应如何影响黏膜保护反应和代谢综合征。 | 最近基于单细胞RNA测序的研究提供了详细的化学感应受体和其他生物活性分子的细胞类型特异性表达及细胞谱系信息，揭示了腔内化学感应不仅对肠道功能的局部或远程调节至关重要，还参与了代谢、能量平衡和食物摄入的系统性调节。 | NA | 总结腔内化学感应系统的最新理解，并探讨其在黏膜损伤、代谢障碍和异常内脏感觉治疗中的潜在分子靶点。 | 胃十二指肠上皮中的肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞。 | NA | 代谢障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 细胞类型特异性 |
| 25040 | 2024-08-09 |
A map of human breast cancer: new players in stromal-immune crosstalk
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020106368
PMID:32909627
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人乳腺癌中的间质细胞，并发现了新的间质间充质细胞亚群 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了乳腺癌中间质间充质细胞的新亚群及其独特的转录组特征、组织定位和相关的免疫微环境 | NA | 探索乳腺癌中间质-免疫相互作用的新参与者 | 人乳腺癌中的间质间充质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |