单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 25021 - 25040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25021 | 2024-08-09 |
Isolation of high-yield and -quality RNA from human precision-cut lung slices for RNA-sequencing and computational integration with larger patient cohorts
2021-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00401.2020
PMID:33112185
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研究论文 | 本研究介绍了一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的新方法，适用于RNA测序和计算分析。 | 提出了一种从少量组织中提取高质量RNA的新方法，适用于疾病组织如特发性肺纤维化，并展示了其适用于RNA-seq分析和计算管道。 | NA | 开发一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的方法，以支持下一代测序技术在非偏倚和高通量分析中的应用。 | 人类精确切割肺切片中的高质量RNA提取。 | 数字病理学 | 肺疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 少量组织，包括疾病组织如特发性肺纤维化 |
| 25022 | 2024-08-09 |
Tumor Fibroblast-Derived FGF2 Regulates Expression of SPRY1 in Esophageal Tumor-Infiltrating T Cells and Plays a Role in T-cell Exhaustion
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1542
PMID:33093168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现食管癌中的T细胞比以往认识的更为异质性，并揭示了肿瘤相关成纤维细胞衍生的FGF2通过调节SPRY1表达在CD8 T细胞功能障碍中的作用 | 首次报道了FGF2在食管癌中通过调节SPRY1表达影响CD8 T细胞功能障碍的分子机制 | NA | 探讨食管癌中T细胞功能障碍的分子机制 | 食管癌中的T细胞及肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25023 | 2024-08-09 |
Cell-Type Transcriptome Atlas of Human Aortic Valves Reveal Cell Heterogeneity and Endothelial to Mesenchymal Transition Involved in Calcific Aortic Valve Disease
2020-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314789
PMID:33086873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类主动脉瓣的细胞类型转录组图谱，揭示了钙化性主动脉瓣疾病中的细胞异质性和内皮细胞向间充质细胞的转变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了健康和钙化性主动脉瓣疾病中的细胞亚型，并发现了在疾病中特异表达的新型瓣膜衍生基质细胞 | 研究仅限于6个不同的人类主动脉瓣样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 旨在构建健康和钙化性主动脉瓣疾病的人类主动脉瓣细胞图谱，以深入了解钙化性主动脉瓣疾病的细胞起源和复杂的细胞病理分化过程 | 人类主动脉瓣细胞在健康和钙化性主动脉瓣疾病中的异质性和分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 34,632个细胞来自6个不同的人类主动脉瓣叶 |
| 25024 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis identified lung progenitor cells in COVID-19 patients
2020-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12931
PMID:33094537
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液，揭示了肺祖细胞在严重SARS-CoV-2感染后肺修复中的作用 | 首次发现TM4SF1+和KRT5+肺祖细胞在严重COVID-19患者中的显著扩张，并证实这些祖细胞在肺泡细胞再生和上皮屏障重建中的关键作用 | NA | 旨在揭示严重SARS-CoV-2感染后肺修复的可能机制 | COVID-19患者的肺祖细胞及其在肺修复中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 25025 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals that CD9 Is a Negative Marker of Glucose-Responsive Pancreatic β-like Cells Derived from Human Pluripotent Stem Cells
2020-11-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.09.009
PMID:33096048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现CD9是人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | 首次确定CD9作为人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | NA | 寻找并验证人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的特定细胞表面标记物 | 人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25026 | 2024-08-09 |
RNA editing in cancer impacts mRNA abundance in immune response pathways
2020-10-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02171-4
PMID:33106178
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研究论文 | 本文通过综合分析上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征，揭示了RNA编辑在癌症中的广泛差异及其对mRNA丰度的调控机制 | 发现了上皮和间质肿瘤间不同的编辑模式，并揭示了RNA编辑通过调控mRNA丰度影响免疫反应途径的新机制 | 主要集中在非编码区域的肿瘤相关位点的功能相关性仍未知 | 研究RNA编辑在癌症中的作用及其对免疫反应途径的影响 | 上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析, 单细胞RNA测序, ADAR扰动实验 | NA | RNA序列 | 涉及七种癌症类型的数据 |
| 25027 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics Reveals Genes Associated with Dysregulated Mitochondrial Functions and Stress Signaling in Alzheimer Disease
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101556
PMID:33083725
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了与阿尔茨海默病中失调的线粒体功能和应激信号相关的基因 | 首次在阿尔茨海默病的小鼠模型中，通过空间转录组学技术识别出在海马体和嗅球中空间下调的基因Bok，该基因与线粒体生理和细胞死亡相关 | NA | 旨在同时发现海马体和嗅球结构层中可能与阿尔茨海默病早期海马体突触缺陷和嗅觉功能障碍相关的新的和已知的分子靶点 | 阿尔茨海默病小鼠模型的海马体和嗅球 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类阿尔茨海默病脑组织 |
| 25028 | 2024-08-09 |
Neural crest lineage analysis: from past to future trajectory
2020-10-23, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193193
PMID:33097550
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综述 | 本文从历史角度回顾了神经嵴细胞谱系追踪的主要发现，并讨论了先进技术如何改进谱系追踪研究以及如何应用于多能性问题 | 结合新兴的分子和成像工具，如单细胞转录组学、单分子荧光杂交和高分辨率成像，扩展了神经嵴细胞谱系研究的范畴，超越了发育阶段，涵盖了再生和癌症起始 | NA | 回顾神经嵴细胞谱系追踪的历史发展，并探讨新技术如何推动该领域的研究 | 神经嵴细胞的谱系追踪及其在发育、再生和癌症起始中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学、单分子荧光杂交、高分辨率成像 | NA | NA | NA |
| 25029 | 2024-08-09 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术，鉴定了健康个体血液中包括GM-CSF产生细胞在内的八种抗原经验性CD45RACD4 T细胞群体，并研究了这些细胞在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的作用。 | 首次详细研究了GM-CSF产生T细胞的身份，并发现这些细胞在自身免疫性脑脊髓炎模型中通过T-bet表达增强其致脑炎性。 | NA | 探讨GM-CSF产生T细胞在自身免疫性疾病中的作用及其分子机制。 | GM-CSF产生T细胞及其在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，高维单细胞质谱流式技术 | NA | 细胞数据 | 健康个体血液样本及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 |
| 25030 | 2024-08-09 |
Gene expression and functional deficits underlie TREM2-knockout microglia responses in human models of Alzheimer's disease
2020-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19227-5
PMID:33097708
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研究论文 | 研究通过CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的人类小胶质细胞，探讨TREM2在阿尔茨海默病中的作用 | 首次结合转录组学和功能分析，以及在阿尔茨海默病小鼠模型中研究TREM2缺失对人类小胶质细胞的影响 | NA | 探究TREM2在人类小胶质细胞中的正常和疾病相关功能 | TREM2敲除的人类小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的小胶质细胞 |
| 25031 | 2024-08-09 |
Characterization of rare spindle and root cell transcriptional profiles in the stria vascularis of the adult mouse cochlea
2020-10-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75238-8
PMID:33093630
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术，分析了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型（如纺锤细胞和根细胞）的转录组特征 | 首次详细描述了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型的转录组特征，并鉴定了这些细胞的新型特异性标记物 | 研究主要集中在成年小鼠耳蜗血管纹的稀有细胞类型，未涉及其他细胞类型或不同发育阶段的细胞 | 探讨耳蜗血管纹稀有细胞类型的转录组特征及其在听力维持中的功能作用 | 成年小鼠耳蜗血管纹中的稀有细胞类型，包括纺锤细胞和根细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗血管纹样本 |
| 25032 | 2024-08-09 |
Identification of a dysfunctional microglial population in human Alzheimer's disease cortex using novel single-cell histology image analysis
2020-10-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-020-01047-9
PMID:33081847
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research paper | 本研究通过新型单细胞组织学图像分析，鉴定了阿尔茨海默病（AD）患者大脑皮层中功能障碍的微胶质细胞群体 | 首次在人类脑组织中通过解剖学上下文验证了与AD病理相关的微胶质细胞群体，并使用高吞吐量的免疫组织化学数据支持了微胶质功能障碍假说 | NA | 鉴定和验证阿尔茨海默病中与病理相关的微胶质细胞群体 | 阿尔茨海默病患者的大脑皮层微胶质细胞 | digital pathology | 阿尔茨海默病 | 荧光免疫组织化学 | NA | image | 正常组和AD组各8个中间颞回样本 |
| 25033 | 2024-08-09 |
Deep immunophenotyping at the single-cell level identifies a combination of anti-IL-17 and checkpoint blockade as an effective treatment in a preclinical model of data-guided personalized immunotherapy
2020-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001358
PMID:33093158
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研究论文 | 本文通过深度免疫表型分析，识别出在一种临床前模型中，抗IL-17和免疫检查点阻断联合治疗的有效性 | 开发了一种垂直流阵列芯片（VFAC）用于靶向单细胞RNA测序，以识别T细胞的独特亚型，并发现IL-17产生细胞在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于临床前模型，需要进一步的临床试验验证 | 验证个性化免疫治疗策略的可行性，通过深度免疫表型分析指导治疗 | 胃癌细胞系YTN2和YTN16在C57BL/6小鼠中的免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA | 使用YTN2和YTN16胃癌细胞系在C57BL/6小鼠中进行实验 |
| 25034 | 2024-08-09 |
Iterative point set registration for aligning scRNA-seq data
2020-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007939
PMID:33108369
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研究论文 | 本文开发了一种名为Single Cell Iterative Point set Registration (SCIPR)的方法，用于对齐和整合来自不同技术和平台的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据 | SCIPR方法能够使用原始表达空间进行对齐，并能推广到新的数据，这是现有方法所未能实现的 | NA | 开发一种新的方法来对齐和整合不同来源的scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-Seq数据集 |
| 25035 | 2024-08-09 |
Single-Cell Isolation from Regenerating Murine Muscles for RNA-Sequencing Analysis
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100051
PMID:33111097
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）无偏评估再生小鼠骨骼肌的完整协议 | 该协议专注于从肌肉中分离单核细胞进行后续的scRNA-seq分析，并可修改以评估其他感兴趣组织的细胞群 | NA | 开发一种用于无偏评估再生小鼠骨骼肌的scRNA-seq分析方法 | 再生小鼠骨骼肌中的单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 |
| 25036 | 2024-08-09 |
Protocol for Identification and Removal of Doublets with DoubletDecon
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100085
PMID:33111118
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研究论文 | 本文介绍了使用DoubletDecon工具识别和移除单细胞RNA测序数据中的多重捕获（doublets）的方法 | 开发了DoubletDecon工具，通过解卷积和独特基因表达分析来识别和移除doublets | NA | 解决单细胞RNA测序数据中多重捕获对细胞群体和标记基因识别的干扰问题 | 单细胞RNA测序数据中的多重捕获 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25037 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Lymph Node Stroma
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100021
PMID:33111075
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研究论文 | 本文提供了一种用于单细胞RNA测序的细胞准备协议，以表征人淋巴结中基质的异质性 | 利用单细胞技术全面无偏地表征基质细胞的异质性 | NA | 表征人淋巴结中基质细胞的异质性 | 人淋巴结中的基质细胞 | 单细胞技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25038 | 2024-08-09 |
Protocol to Prepare Single-Cell Suspensions from Mouse Vagal Sensory Ganglia for Transcriptomic Studies
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100030
PMID:33111081
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研究论文 | 本文提供了一种从鼠类迷走神经感觉神经节中提取并制备高质量单细胞悬液的详细协议，适用于转录组学研究 | 该协议可有效应用于其他外周和中枢神经元群体，仅需少量修改 | NA | 提供一种有效的单细胞悬液制备方法，用于迷走神经感觉神经元的转录组学研究 | 鼠类迷走神经感觉神经节 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 25039 | 2024-08-09 |
Endothelial, pericyte and tumor cell expression in glioblastoma identifies fibroblast activation protein (FAP) as an excellent target for immunotherapy
2020, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1191
PMID:33082953
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研究论文 | 本研究验证了纤维母细胞活化蛋白（FAP）作为胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点的有效性 | 首次详细研究了FAP在胶质母细胞瘤中的表达情况，并发现其在肿瘤血管中的高表达 | NA | 验证FAP作为胶质母细胞瘤免疫治疗的新靶点 | 胶质母细胞瘤组织及正常脑组织 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫染色、流式细胞术、单细胞转录组学（scRNAseq） | NA | 组织样本、细胞培养 | 大量胶质母细胞瘤组织及正常脑组织样本 |
| 25040 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome atlas of lung adenocarcinoma featured with ground glass nodules
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00200-x
PMID:33083004
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术比较了磨玻璃结节型肺腺癌（GGN-ADC）与实性腺癌（SADC）的细胞特征 | 首次提供了磨玻璃结节型肺腺癌的单细胞转录组图谱，并发现了GGN-ADC中细胞增殖信号通路的下调以及基质细胞在GGN-ADC和SADC中的不同作用 | 研究样本量较小，仅包括五名GGN-ADC患者和五名SADC患者 | 深入分析磨玻璃结节型肺腺癌的细胞表型，为肺癌的预防和治疗提供见解 | 磨玻璃结节型肺腺癌和实性腺癌的细胞特征 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 60,459个细胞，来自五名GGN-ADC患者和五名SADC患者 |