单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 25001 - 25020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25001 | 2024-08-09 |
NPC1 silent variant induces skipping of exon 11 (p.V562V) and unfolded protein response was found in a specific Niemann-Pick type C patient
2020-11, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1451
PMID:32931663
|
研究论文 | 研究了Niemann-Pick病C型（NPC）患者中NPC1基因的静默变异对蛋白质功能的影响 | 首次证明了NPC1基因的静默多态性（p.V562V）是NPC的致病变异，并发现UPR在特定NPC患者中上调 | NA | 探究NPC1基因变异对NPC病的影响及其分子机制 | Niemann-Pick病C型患者及其NPC1基因变异 | 数字病理学 | 神经内脏疾病 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（MARS-Seq） | NA | 基因组数据 | 两个无关家庭的NPC患者 |
| 25002 | 2024-08-09 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
|
研究论文 | 本研究使用细胞条形码分析方法，追踪化疗介导选择压力下数百个患者来源的急性淋巴细胞白血病克隆的体内竞争动态 | 首次展示了化疗在药物依赖性方式下减少克隆多样性，并发现化疗介导的选择导致白血病克隆在解剖部位的分布更加不对称 | 研究主要集中在化疗对克隆动态的影响，未来需要结合单细胞测序技术进行更深入的分析 | 探索化疗对急性淋巴细胞白血病克隆动态的影响，并寻找预防复发的潜在目标 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病细胞及其克隆 | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条形码分析 | NA | 细胞 | 使用Nod/Scid/Il2Rγ (NSG)小鼠移植了条形码标记的患者来源或SupB15急性淋巴细胞白血病细胞，并在九个解剖位置进行纵向评估 |
| 25003 | 2024-08-09 |
SpaGE: Spatial Gene Enhancement using scRNA-seq
2020-10-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa740
PMID:32955565
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaGE的方法，该方法通过整合空间和单细胞RNA测序数据集，预测空间配置中的全转录组表达。 | SpaGE方法能够解决单细胞RNA测序缺乏空间定位的问题，并且能够预测新的空间基因模式。 | NA | 开发一种方法，将空间和单细胞RNA测序数据集整合，以预测空间配置中的全转录组表达。 | 单细胞RNA测序数据及其空间定位。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了五个数据集对进行验证。 |
| 25004 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Tocilizumab-treated peripheral blood mononuclear cells as an in vitro model of inflammation
2020-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.11.281782
PMID:32935096
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了托珠单抗治疗前后外周血单个核细胞的表达变化，以此构建体外炎症模型，探讨托珠单抗对COVID-19相关细胞因子风暴的影响 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上展示了托珠单抗治疗后炎症相关基因和生物途径的表达减少 | 研究仅限于体外模型和特定人群（肾移植受者），需要进一步的临床试验验证 | 探讨托珠单抗在治疗COVID-19中的作用及其对细胞因子风暴的影响 | 托珠单抗治疗前后的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25005 | 2024-08-09 |
Transcription factor expression defines subclasses of developing projection neurons highly similar to single-cell RNA-seq subtypes
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008013117
PMID:32948690
|
研究论文 | 本文研究了在小鼠大脑发育过程中，从胚胎第13天到出生后第5天，两类具有不同形态和功能特征的投射神经元的基因表达和染色质可及性，以识别分化神经元细胞命运的转录网络 | 本文通过深度测序识别了具有密集亚类特异性调控和亚类富集转录因子结合基序的转录因子组，并描述了定义每个亚类的转录因子相邻长非编码RNA | NA | 旨在理解大脑皮层中细胞类型多样化的机制及其与功能的关系 | 小鼠大脑中两类投射神经元的基因表达和染色质可及性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠大脑中分离的单细胞 |
| 25006 | 2024-08-09 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
|
研究论文 | 本研究通过基于适配体的蛋白质组学方法，分析了22名接受侵入性采样个体的动脉到肾静脉的蛋白质梯度，发现testican-2是一个由足细胞衍生的肾脏健康标志物 | 首次发现testican-2作为足细胞衍生的肾脏健康标志物，并展示了其在临床上的应用潜力 | NA | 探究肾脏健康相关的生物标志物 | testican-2在肾脏健康中的作用 | NA | NA | 基于适配体的蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 22名个体，Jackson Heart Study中的1928名非洲裔美国人，Framingham Heart Study中的1621名白人 |
| 25007 | 2024-08-09 |
Reprogramming roadmap reveals route to human induced trophoblast stem cells
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2734-6
PMID:32939092
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学重建了人类皮肤成纤维细胞的重编程轨迹，揭示了从体细胞到诱导多能干细胞及诱导滋养层干细胞的重编程过程。 | 本文首次揭示了重编程过程中滋养层细胞特异性调控程序的作用，并成功诱导出与天然滋养层干细胞分子和功能相似的诱导滋养层干细胞。 | NA | 探讨人类体细胞重编程为多能干细胞及滋养层干细胞的分子机制。 | 人类皮肤成纤维细胞的重编程过程及诱导滋养层干细胞的生成。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25008 | 2024-08-09 |
Endosialin defines human stem Leydig cells with regenerative potential
2020-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaa174
PMID:32951040
|
研究论文 | 本文研究了内皮素作为人类干细胞莱迪细胞（SLCs）的特异性标记物，并探讨了其在体外和体内分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | 内皮素被证明是人类SLCs的特异性标记物，相比于PDGFRα和NGFR，具有更高的特异性 | 由于人类睾丸组织收集困难，样本量有限。内皮素对SLCs的功能需要在未来的研究中进一步阐明 | 确定内皮素是否为人类SLCs的特异性标记物，并研究其在体外和体内分化为功能性LCs的潜力 | 人类干细胞莱迪细胞（SLCs）及其分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | NA | NA | 单细胞测序分析，免疫荧光和流式细胞术 | NA | 细胞 | 四个人类供体的睾丸组织 |
| 25009 | 2024-08-09 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
|
研究论文 | 研究利用肿瘤芯片平台探讨巨噬细胞在肿瘤进展中的作用 | 开发了一种微生理的肿瘤芯片设备，能够在三维体外微环境中高时空分辨率地捕捉细胞间动态 | 对TAMs如何影响肿瘤微环境的理解仍然有限，需要更多适当的3D体外模型 | 探究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤行为和临床结果中的作用 | 巨噬细胞亚型对肿瘤行为的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及人胰腺癌和结直肠癌细胞以及M1和M2极化巨噬细胞 |
| 25010 | 2024-08-09 |
p63 and Its Target Follistatin Maintain Salivary Gland Stem/Progenitor Cell Function through TGF-β/Activin Signaling
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101524
PMID:32932139
|
研究论文 | 研究探讨了ΔNp63通过TGF-β/Activin信号通路及其靶点Follistatin维持唾液腺干细胞/祖细胞功能的分子机制 | 揭示了ΔNp63缺失导致唾液腺干细胞/祖细胞数量减少及分化偏斜，这一过程通过Follistatin依赖的TGF-β/Activin信号通路失调介导 | NA | 理解ΔNp63在指导唾液腺细胞命运选择中的作用 | 唾液腺干细胞/祖细胞及其分化功能 | NA | NA | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列, 蛋白质结合位点序列, 单细胞RNA序列 | ΔNp63缺失的成年小鼠及初级唾液细胞培养物 |
| 25011 | 2024-08-09 |
Genetic mapping of etiologic brain cell types for obesity
2020-09-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55851
PMID:32955435
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据和体重指数的全基因组关联研究数据，确定了与肥胖易感性相关的特定脑细胞类型。 | 开发了一种新的策略，将单细胞RNA测序数据与全基因组关联研究数据相结合，以识别与肥胖相关的特定脑细胞类型。 | NA | 旨在揭示导致肥胖的脑细胞类型。 | 研究对象包括来自17个老鼠器官的727种外周和神经系统细胞类型，以及超过457,000个人的体重指数全基因组关联研究数据。 | 遗传学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 727种细胞类型和超过457,000个个体 |
| 25012 | 2024-08-09 |
Glioblastoma cell differentiation trajectory predicts the immunotherapy response and overall survival of patients
2020-Sep-21, Aging
DOI:10.18632/aging.103695
PMID:32957084
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，分析了胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其与临床结果的相关性 | 识别了498个与胶质母细胞瘤细胞分化相关的基因，并发现这些基因与免疫调节和代谢途径显著相关，能够成功预测患者的总体生存率、免疫检查点表达和免疫治疗反应 | NA | 研究胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其临床相关性 | 胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其临床相关性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 两个大型胶质母细胞瘤队列 |
| 25013 | 2024-08-09 |
Low-dose DNA demethylating therapy induces reprogramming of diverse cancer-related pathways at the single-cell level
2020-09-21, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-020-00937-y
PMID:32958049
|
研究论文 | 本文探讨了低剂量DNA去甲基化药物在单细胞水平上对多种癌症相关通路的重新编程机制 | 研究揭示了低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上对特定癌症相关基因的完全去甲基化效果 | 研究主要集中在HCT116细胞系，可能需要进一步在其他细胞系或临床样本中验证 | 探索低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上的疗效机制 | HCT116细胞系在低剂量去甲基化药物处理后的表达谱和DNA甲基化状态 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了克隆的HCT116细胞进行分析 |
| 25014 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals clonal expansions of pro-inflammatory synovial CD8 T cells expressing tissue-homing receptors in psoriatic arthritis
2020-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18513-6
PMID:32958743
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了银屑病关节炎（PsA）患者关节中的白细胞，发现关节内记忆CD8 T细胞显著扩增并表达组织归巢受体 | 首次揭示了银屑病关节炎中促炎性滑膜CD8 T细胞的克隆扩增及其表达组织归巢受体的现象 | NA | 探究银屑病关节炎的免疫细胞组成和分子机制 | 银屑病关节炎患者的关节白细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个银屑病关节炎患者的关节和外周血样本 |
| 25015 | 2024-08-09 |
Transcriptome heterogeneity of porcine ear fibroblast and its potential influence on embryo development in nuclear transplantation
2020-Sep-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.20-190
PMID:32952124
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了来自同一来源的52个猪耳成纤维细胞的基因表达模式，探讨了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响。 | 首次在单细胞水平上分析了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响，并提供了分析精英供体细胞的有效方法。 | NA | 探讨供体细胞异质性对核移植胚胎发育效率的潜在影响。 | 猪耳成纤维细胞的基因表达模式及其对核移植效率的影响。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 52个猪耳成纤维细胞 |
| 25016 | 2024-08-09 |
EnClaSC: a novel ensemble approach for accurate and robust cell-type classification of single-cell transcriptomes
2020-Sep-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03679-z
PMID:32938367
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnClaSC的新型集成方法，用于单细胞转录组数据的准确和稳健的细胞类型分类 | EnClaSC不仅可以在特定数据集内部进行自投影和跨不同数据集的细胞类型分类，还能很好地适应不同的数据维度和数据稀疏性，并能进行跨物种分类 | NA | 开发一种新的计算方法，用于将新产生的单细胞RNA测序数据分类到已注释的标签上 | 单细胞转录组数据的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成学习方法 | 转录组数据 | NA |
| 25017 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq identifies unique transcriptional landscapes of human nucleus pulposus and annulus fibrosus cells
2020-09-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-72261-7
PMID:32943704
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了健康人椎间盘的转录组图谱，特别是核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞的独特转录景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了人类NP和AF细胞的遗传结构和差异表达基因，并识别了关键的转录因子 | 研究仅限于非退行性腰椎间盘的NP和AF细胞，可能无法完全代表所有椎间盘疾病的情况 | 阐明健康人椎间盘NP和AF细胞的分子途径和转录网络 | 人类椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞 | 数字病理学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从非退行性腰椎间盘中分离出的NP和AF细胞 |
| 25018 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing techniques from individual to multiomics analyses
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00499-2
PMID:32929221
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在个体和多组学层面的应用 | 介绍了多种单细胞组学方法及其应用，并探讨了多层数据集的计算整合方法 | NA | 旨在深入理解每个细胞的基本分子特征及其与疾病相关的分子特征 | 单细胞的基因组、表观基因组和转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 大量单细胞 |
| 25019 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics in cancer: computational challenges and opportunities
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0422-0
PMID:32929226
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在癌症研究中的计算挑战与机遇 | 探讨了单细胞转录组学数据在癌症研究中的新兴计算分析方法及其应用 | 讨论了未来计算方法学发展的挑战与机遇 | 旨在揭示驱动癌症发展、发病机制和临床结果的细胞类型和状态 | 单细胞转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25020 | 2024-08-09 |
Malignant cell-specific CXCL14 promotes tumor lymphocyte infiltration in oral cavity squamous cell carcinoma
2020-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001048
PMID:32958684
|
研究论文 | 研究CXCL14在口腔鳞状细胞癌中通过促进淋巴细胞浸润抑制肿瘤生长的机制 | 发现CXCL14在恶性细胞中的表达与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的增加和肿瘤生长的抑制相关，表明CXCL14可能通过免疫介导的机制抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要在人体中进一步验证 | 探讨CXCL14介导的口腔鳞状细胞癌肿瘤生长抑制的潜在机制 | 口腔鳞状细胞癌中的恶性细胞和淋巴细胞浸润 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自口腔鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据，以及C57BL/6小鼠模型 |