单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2481	2025-03-12	FK506-binding proteins: Emerging target and therapeutic opportunity in multiple tumors 2025-Mar-08, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141914 PMID:40064252	综述	本文总结了FK506结合蛋白（FKBP）家族在不同类型肿瘤中的双重功能，并探讨其作为潜在诊断和预后生物标志物的可能性	总结了FKBP家族成员在不同肿瘤中的双重功能，并提出了结合单细胞测序技术解析FKBP异构体空间分布的未来研究方向	需要进一步结合单细胞测序技术进行临床验证，以促进从分子机制到精准治疗的转化	探讨FKBP家族在肿瘤中的作用及其作为诊断和预后生物标志物的潜力	FK506结合蛋白（FKBP）家族	肿瘤学	多种肿瘤	单细胞测序	NA	NA	NA
2482	2025-03-14	Nuclear receptor 4A1 facilitates complete Freund's adjuvant-induced inflammatory pain in rats by promoting ferroptosis in spinal glial cells 2025-Mar, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.12.152 PMID:39722371	研究论文	本研究探讨了核受体4A1（NR4A1）在完全弗氏佐剂（CFA）诱导的炎症性疼痛中的作用，发现NR4A1通过促进脊髓胶质细胞的铁死亡来加剧疼痛	首次揭示了NR4A1在CFA诱导的炎症性疼痛中通过促进铁死亡的机制，并发现MAPK3是NR4A1的靶蛋白	研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨炎症性疼痛中铁死亡发生的分子机制	大鼠脊髓胶质细胞（星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞）	神经科学	炎症性疼痛	RNA测序（bulk和单细胞RNA测序）、Western blotting、免疫染色、蛋白质组学分析、染色质免疫共沉淀、双荧光素酶报告基因检测	NA	RNA测序数据、蛋白质数据	CFA处理的大鼠
2483	2025-03-14	Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies 2025-Mar-01, JAMA neurology IF:20.4Q1 DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763 PMID:39836414	研究论文	本文描述了一种与vimentin IgG自身抗体相关的未知脑膜脑脊髓炎综合征	首次识别出针对星形胶质细胞中间丝蛋白vimentin的自身抗体，并描述了其相关的脑膜脑脊髓炎综合征	样本量较小（14名患者），且为回顾性研究，可能存在选择偏倚	表征一种与星形胶质细胞自身抗体相关的未知脑膜脑脊髓炎综合征	患有未表征的中枢神经系统自身免疫性疾病的患者	神经免疫学	脑膜脑脊髓炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq），基于细胞和组织的检测	NA	脑脊液（CSF）细胞，磁共振成像（MRI）数据	14名患者（10名女性，中位年龄33岁）
2484	2025-03-14	Primed Mesenchymal Stem Cells by IFN-γ and IL-1β Ameliorate Acute Respiratory Distress Syndrome through Enhancing Homing Effect and Immunomodulation 2025-Mar-01, Biomolecules & therapeutics IF:3.0Q2 DOI:10.4062/biomolther.2025.004 PMID:39973472	研究论文	本研究探讨了通过IFN-γ和IL-1β预处理的间充质干细胞（MSCs）在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的治疗潜力及其机制	研究发现，IFN-γ和IL-1β预处理的MSCs相比未处理的MSCs，在抑制T细胞活性和调节巨噬细胞炎症反应方面表现出更强的效果，并揭示了其通过调节NFκB和TNF-α信号通路增强疗效的机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索预处理的MSCs在ARDS中的治疗潜力及其作用机制	间充质干细胞（MSCs）和LPS诱导的ARDS小鼠模型	细胞治疗	急性呼吸窘迫综合征	RNA测序、混合淋巴细胞反应（MLR）实验、空间转录组学分析	NA	基因表达数据、细胞实验数据	LPS诱导的ARDS小鼠模型
2485	2025-03-14	Deciphering Precursor Cell Dynamics in Esophageal Preneoplasia via Genetic Barcoding and Single-Cell Transcriptomics 2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.26.637920 PMID:40060545	研究论文	本文通过整合遗传条形码和单细胞RNA测序技术，揭示了食管癌前病变中前体细胞的动态变化	开发了一种结合遗传条形码和单细胞RNA测序的谱系追踪工具，并引入了eXamined Ridge (XR)评分来准确识别高可塑性细胞	未提及具体样本量，可能限制了结果的普适性	研究食管癌前病变中前体细胞的起源和谱系轨迹	食管癌前病变中的前体细胞	数字病理学	食管癌	遗传条形码，单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2486	2025-03-14	The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making 2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.17.638733 PMID:40027766	研究论文	本文研究了叉头转录因子FKH-7/FOXP在化学感应神经元中的作用，揭示了其在幼虫进入发育停滞的dauer阶段决策中的功能	首次描述了FKH-7/FOXP在化学感应神经元中的功能，并展示了人类FOXP1可以替代FKH-7的功能，同时通过单细胞转录组学发现了与自闭症相关的钙激活钾通道的下调表达	研究主要集中在特定神经元类型和发育阶段，可能无法全面反映FOXP1在其他神经元类型或发育阶段的功能	研究FKH-7/FOXP在化学感应神经元中的功能及其在发育决策中的作用	化学感应神经元和幼虫发育决策	神经科学	自闭症	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
2487	2025-03-14	General and individualized changes in T cell immunity during aging 2025-Feb-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkae033 PMID:40073079	研究论文	本文探讨了T细胞免疫在衰老过程中的普遍和个体化变化	利用单细胞测序技术，识别了新的T细胞亚群，并描述了T细胞转录组和TCR克隆型随年龄的变化	未提及具体的研究限制	研究T细胞免疫在衰老过程中的变化	T细胞亚群、转录组和TCR库	免疫学	老年疾病	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
2488	2025-03-14	Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research 2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology IF:3.4Q1 DOI:10.1007/s12298-025-01558-6 PMID:40070535	综述	本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源数据的方法	探讨了整合多源单细胞RNA测序和多模态数据的方法，以构建全面的细胞图谱并揭示基因调控机制	单细胞RNA测序实验无法全面捕获所有细胞和基因，单模态数据不足以解释细胞状态和系统性变化	总结单细胞转录组学整合方法的基本原理、应用价值及其在揭示生物变化中的作用	植物组织中的单细胞	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据、多模态数据	NA
2489	2025-03-14	Portable-CELLxGENE: standalone executables of CELLxGENE for easy installation 2025, GigaByte (Hong Kong, China) DOI:10.46471/gigabyte.151 PMID:40070474	研究论文	本文介绍了Portable-CELLxGENE，一个易于安装和运行的CELLxGENE独立版本，旨在为非生物信息学家提供便利	Portable-CELLxGENE通过图形界面简化了安装和运行过程，使非生物信息学家能够独立进行单细胞转录组数据分析	未提及具体的技术限制或性能问题	为非生物信息学家提供易于使用的单细胞转录组数据分析工具	单细胞转录组数据	生物信息学	NA	单细胞转录组分析	NA	单细胞转录组数据	NA
2490	2025-03-14	Cellular and molecular determinants mediating the dysregulated germinal center immune dynamics in systemic lupus erythematosus 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1530327 PMID:40070830	研究论文	本文通过空间转录组学和多路成像技术，研究了系统性红斑狼疮（SLE）患者淋巴结中的滤泡免疫景观和原位转录组特征	揭示了SLE滤泡中I型干扰素和浆细胞特征的显著增强，以及滤泡T细胞亚群受I型干扰素指纹影响的机制	研究主要依赖于空间转录组学和成像技术，可能忽略了其他潜在的分子机制	探讨SLE患者淋巴结中滤泡免疫动态的细胞和分子决定因素	系统性红斑狼疮（SLE）患者的淋巴结	免疫学	系统性红斑狼疮	空间转录组学，多路成像	NA	转录组数据，图像数据	SLE患者的淋巴结样本
2491	2025-03-14	Single-cell eQTL mapping in yeast reveals a tradeoff between growth and reproduction 2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.07.570640 PMID:38106186	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，在酵母中进行了表达数量性状位点（eQTL）的定位研究，揭示了生长与繁殖之间的权衡关系	开发了一种单细胞RNA测序的一体化方法，用于在单细胞水平上定位eQTL，并揭示了基因表达噪声的等位基因特异性效应	研究仅限于酵母，未涉及其他生物体或更复杂的多细胞系统	研究基因变异对基因表达及下游性状的影响	酵母单细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	超过100,000个单细胞，来自三个杂交系
2492	2025-03-14	Bone-marrow macrophage-derived GPNMB protein binds to orphan receptor GPR39 and plays a critical role in cardiac repair 2024-Nov, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-024-00555-4 PMID:39455836	研究论文	本文研究了糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B（GPNMB）在心肌梗死后的心脏修复中的作用	首次揭示了骨髓来源的巨噬细胞是损伤心脏中GPNMB的主要来源，并发现GPNMB通过GPR39信号通路在心脏修复中发挥关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨GPNMB在心肌梗死后的心脏损伤和功能中的作用	人类和小鼠的心脏组织	心血管疾病	心肌梗死	单细胞转录组学	遗传功能缺失模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
2493	2025-03-14	A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain 2024-Aug-19, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007 PMID:39106860	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和ATOH1 DNA结合分析，研究了小鼠后脑中Atoh1谱系神经元的发育过程，揭示了其命运决定和多样性的转录程序	首次提供了小鼠后脑Atoh1谱系神经元的高分辨率单细胞转录组图谱，并识别了特定脑干核的标志物	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种的验证	揭示Atoh1谱系神经元的命运决定机制及其多样性	小鼠后脑中的Atoh1谱系神经元	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序，ATOH1 DNA结合分析	NA	单细胞RNA测序数据	小鼠后脑Atoh1谱系神经元
2494	2025-03-14	Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis 2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.17.599411 PMID:38948715	研究论文	本文研究了特发性肺纤维化（IPF）中远端细支气管上皮细胞脱屑的机制，揭示了细胞连接成分的下调、上皮-间质转化特征的上升以及基底膜基质的失调	首次描述了IPF患者中远端细支气管上皮细胞脱屑的病理现象，并通过空间转录组学和空间蛋白质组学揭示了其机制	研究样本量未明确说明，且未涉及其他类型肺纤维化的比较	探讨特发性肺纤维化中远端细支气管上皮细胞脱屑的机制及其对疾病进展的影响	特发性肺纤维化患者和健康对照者的远端细支气管上皮细胞和基底膜	数字病理学	肺纤维化	空间转录组学、空间蛋白质组学	NA	转录组数据、蛋白质组数据	未明确说明
2495	2025-03-14	Single-Cell Analyses Offer Insights into the Different Remodeling Programs of Arteries and Veins 2024-05-07, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13100793 PMID:38786017	研究论文	本研究通过单细胞分析对比了人类外周动脉和静脉的细胞组成，揭示了它们在重塑潜力上的差异	首次在单细胞水平上对比了动脉和静脉的细胞组成和转录程序，揭示了它们在重塑潜力上的显著差异	研究样本量较小，仅包括30名器官捐赠者的上臂动脉和静脉	探讨动脉和静脉在闭塞性疾病和损伤反应中的生物学差异	人类外周动脉和静脉	单细胞分析	心血管疾病	单细胞RNA测序、蛋白质组学、流式细胞术、组织学	NA	RNA测序数据、蛋白质组数据、流式细胞数据、组织学数据	30名器官捐赠者的上臂动脉和静脉
2496	2025-03-14	Early cellular mechanisms of type I interferon-driven susceptibility to tuberculosis 2023-12-07, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2023.11.002 PMID:38029747	研究论文	本文探讨了I型干扰素在结核病易感性中的早期细胞机制	揭示了间质巨噬细胞和浆细胞样树突状细胞在结核分枝杆菌感染中的主导作用，并发现浆细胞样树突状细胞在人类结核肉芽肿附近定位	研究主要基于小鼠和非人灵长类动物模型，人类数据有限	研究结核病发病机制中的细胞机制	结核分枝杆菌感染的小鼠和非人灵长类动物	免疫学	结核病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	小鼠和非人灵长类动物
2497	2025-03-14	Osteosarcoma tumors maintain intra-tumoral transcriptional heterogeneity during bone and lung colonization 2023-04-27, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-023-01593-3 PMID:37106386	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了骨肉瘤肿瘤在骨和肺转移过程中维持肿瘤内转录异质性的机制	揭示了骨肉瘤肿瘤在骨和肺转移过程中如何维持肿瘤内转录异质性，并发现葡萄糖代谢的异质性特征	研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植模型，可能无法完全反映人体内肿瘤的复杂性	研究骨肉瘤肿瘤在骨和肺转移过程中维持肿瘤内转录异质性的机制	骨肉瘤肿瘤细胞	肿瘤生物学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	细胞系和患者来源的异种移植模型	单细胞RNA测序数据	47,977个细胞
2498	2025-03-14	Mucosal Vaccination with Cyclic Dinucleotide Adjuvants Induces Effective T Cell Homing and IL-17-Dependent Protection against Mycobacterium tuberculosis Infection 2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2100029 PMID:34965963	研究论文	本研究探讨了使用环状二核苷酸（CDN）作为佐剂的黏膜疫苗在抗结核感染中的机制和效果	揭示了CDN疫苗通过诱导CD4 T细胞归巢至肺实质并渗透到肺巨噬细胞病变中，以及通过IL-17和IFN-γ依赖的保护机制来对抗结核感染	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索CDN疫苗在抗结核感染中的保护机制	小鼠	免疫学	结核病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠样本
2499	2025-03-14	Targeting the TREM1-positive myeloid microenvironment in glioblastoma 2022 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2 DOI:10.1093/noajnl/vdac149 PMID:36249290	研究论文	本文研究了胶质母细胞瘤中髓系来源微环境的作用，并提供了抑制该微环境的药理学途径	首次揭示了TREM1+髓系微环境在胶质母细胞瘤异质性中的作用，并提出了通过抑制HuR二聚化来抑制该微环境的治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探索胶质母细胞瘤中髓系来源微环境的作用及其作为治疗靶点的潜力	胶质母细胞瘤及其髓系来源微环境	肿瘤学	胶质母细胞瘤	RNA-seq, 单细胞RNA-seq	小鼠胶质母细胞瘤模型	基因表达数据	五个PDX细胞系和两个免疫活性小鼠模型
2500	2025-03-13	Therapeutic potential of p-coumaric acid in alleviating renal fibrosis through inhibition of M2 macrophage infiltration and cellular communication 2025-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156507 PMID:39978279	研究论文	本研究探讨了p-香豆酸（p-CA）在缓解肾纤维化中的治疗潜力，特别是通过抑制M2巨噬细胞浸润和细胞间通讯	首次详细阐明了p-CA通过靶向M2巨噬细胞及其与肾小管上皮细胞的相互作用来减轻肾纤维化的机制	研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证p-CA在人体中的效果	评估p-CA在肾纤维化中的治疗潜力并阐明其作用机制	肾纤维化模型中的M2巨噬细胞和肾小管上皮细胞	生物医学	肾纤维化	液相色谱-串联质谱（LC-MS）、飞行时间细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、Western blot（WB）、实时定量PCR（qRT-PCR）、免疫组织化学（IHC）、免疫荧光（IF）	NA	代谢组学数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据	NA