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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的相互作用及调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱,揭示原始卵泡组装过程中的细胞异质性和双向调控机制 | 研究局限于鸡模型,调控机制在其它物种中的普适性需要进一步验证 | 解析鸡原始卵泡组装的分子调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | 鸡卵巢关键发育阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2482 | 2025-11-25 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类系统及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统整合了基于基因表达谱、免疫组化和深度学习图像分析的CMS分类方法,并探讨了单细胞测序解决肿瘤内异质性的新策略 | 肿瘤内异质性和技术障碍限制了临床应用的广泛采纳 | 评估CMS分类在结直肠癌预后预测和治疗指导中的价值 | 结直肠癌分子亚型及其临床特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析,免疫组化,单细胞RNA测序,深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2483 | 2025-11-25 |
PBMCpedia: a harmonized PBMC scRNA-seq database with unified mapping and enhanced celltype annotation
2025-Nov-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1245
PMID:41277528
|
研究论文 | 本研究构建了一个统一处理与注释的PBMC单细胞RNA测序数据库PBMCpedia | 通过标准化流程统一处理24项公开研究的519个样本,提供跨疾病、细胞类型、性别和年龄组的元数据感知比较 | 仅包含公开可用数据,未涉及新样本采集 | 解决PBMC单细胞转录组研究中数据整合困难的问题 | 外周血单个核细胞(PBMC) | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病,传染病,神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体/B细胞受体谱数据,表面蛋白测量数据 | 519个样本(超过430万个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2484 | 2025-11-25 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2025-Nov-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术,探索宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络及苦参碱的治疗潜力 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术系统揭示宫颈癌代谢-免疫相互作用网络,并发现苦参碱通过调控钙信号通路和炎症相关基因发挥抗肿瘤作用 | 苦参碱的确切作用机制尚未完全明确,研究结果主要基于生物信息学分析和初步体外实验 | 探索宫颈癌的分子机制及苦参碱的治疗潜力,为宫颈癌治疗提供新的研究方向 | 宫颈癌组织样本及相关基因数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,空间转录组,生物信息学分析,分子对接 | CIBERSORT算法,ESTIMATE算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从TCGA数据库筛选758个差异基因,其中453个与宫颈癌靶点重叠,发现20个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |
| 2485 | 2025-11-25 |
Azvudine remodels the local immunosuppressive microenvironment and exhibits sustained anti-tumor effects in combination with anti-PD-1 therapies
2025-Nov-24, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-025-1164-0
PMID:41284146
|
研究论文 | 本研究探讨阿兹夫定单用或联合抗PD-1疗法对肿瘤微环境的免疫调节作用及抗肿瘤效果 | 首次揭示阿兹夫定通过诱导免疫原性细胞死亡和重塑免疫抑制微环境增强抗PD-1疗法的协同抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型,需进一步临床验证在不同肿瘤类型中的转化潜力 | 评估阿兹夫定在肿瘤免疫治疗中的免疫调节机制和联合治疗潜力 | 免疫健全小鼠建立的同系肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫学检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 免疫健全小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2486 | 2025-11-25 |
Prognostic and Immunological Significance of TIPARP in Pancreatic Cancer
2025-Nov-24, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09546-2
PMID:41284141
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研究论文 | 本研究探讨了TIPARP在胰腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 首次系统揭示TIPARP在胰腺癌中的独立预后价值、免疫调节功能及其通过PI3K-Akt信号通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证主要在体外进行,缺乏体内动物模型验证 | 阐明TIPARP在胰腺癌中的临床意义和生物学功能 | 胰腺导管腺癌(PAAD)患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫浸润分析,孟德尔随机化分析,体外功能实验,通路富集分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据,临床数据,单细胞转录组数据 | TCGA-PAAD数据库178例,GTEx数据库171例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2487 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性及功能特征 | 首次在结肠癌中系统鉴定SPP1+巨噬细胞亚型,揭示其通过代谢重编程和基质互作促进肿瘤进展的新机制 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞亚群的功能异质性 | 结肠癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析、转录因子网络分析、细胞通讯分析、计算机模拟基因敲除 | 单细胞转录组数据 | 3例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2488 | 2025-11-25 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
|
研究论文 | 本研究开发了一种多酶纳米催化剂系统,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 首次设计单原子纳米酶Co-SAE表面修饰胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin,同时靶向胰腺腺泡细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于实验模型验证,尚未进行临床试验 | 开发新型纳米催化疗法治疗急性胰腺炎 | 胰腺腺泡细胞和急性胰腺炎动物模型 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、生化指标 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2489 | 2025-11-25 |
Midkine-Mediated Microglia Activation after Renal Injury Promotes Cognitive Impairment Following Ischemic Renal Injury
2025-Nov-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507832
PMID:41276912
|
研究论文 | 本研究探讨了肾脏损伤后上调的midkine通过激活小胶质细胞导致认知功能障碍的机制 | 首次揭示了MDK-LRP1轴在肾脏缺血损伤后认知功能障碍中的关键介导作用 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索缺血性肾损伤后认知功能障碍的分子机制 | 小鼠模型中的肾脏组织和海马体 | 神经科学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,配体-受体相互作用分析,shRNA腺病毒 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2490 | 2025-11-25 |
Sympathovagal crosstalk: Y2-receptor blockade enhances vagal effects which in turn reduce NPY levels via muscarinic receptor activation
2025-Nov-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf180
PMID:41052902
|
研究论文 | 本研究通过体内外实验揭示了迷走神经刺激通过M2受体机制降低神经肽Y水平,且Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 首次在体内证实迷走神经激活通过突触前交感M2受体机制降低间质NPY水平,并发现Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体验证 | 探究迷走神经刺激降低神经肽Y的机制及Y2受体阻断对自主神经平衡的调节作用 | 大鼠星状神经节细胞、猪模型 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、场刺激、实时间质NPY水平检测 | 动物模型 | 基因表达数据、电生理数据、血流动力学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2491 | 2025-11-25 |
Dynamic transcriptional immune landscape in response to NK-cell therapy combined with gemcitabine plus S-1 in advanced pancreatic cancer: a phase 1b/2 trial
2025-Nov-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02488-1
PMID:41266303
|
研究论文 | 评估异体NK细胞疗法联合吉西他滨和S-1治疗晚期胰腺癌的安全性、有效性及动态免疫应答特征 | 首次在人体试验中通过纵向单细胞RNA测序揭示NK细胞疗法联合化疗的动态免疫景观变化 | 样本量较小(24例患者),需进一步临床验证 | 探索NK细胞联合化疗治疗晚期胰腺癌的免疫机制和临床效果 | 晚期胰腺癌患者 | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体Vβ组库测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据 | 24例患者,19对配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量TCR测序 | NA | NA |
| 2492 | 2025-11-25 |
Tripotent Lgr5 stem cells in the posterior tongue generate lingual, taste, and salivary gland lineages
2025-Nov-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65140-0
PMID:41271704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠舌后部轮廓乳头和叶状乳头中Lgr5阳性干细胞具有生成味蕾、唾液腺和非味觉舌表面上皮的三向分化潜能 | 首次发现舌后部Lgr5阳性干细胞具有三向分化能力,能够共同生成味觉感受单元中的味蕾和唾液腺细胞 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索舌后部味蕾与唾液腺的发育关系及干细胞起源 | 小鼠舌后部轮廓乳头和叶状乳头组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠舌后部组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2493 | 2025-11-25 |
Integrated analysis reveals survival-related genes promoting cholangiocarcinoma progression via G2/M cell cycle, with validation of cyclin B1 in tumor proliferation
2025-Nov-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25299-4
PMID:41272097
|
研究论文 | 通过整合分析发现促进胆管癌进展的生存相关基因及其在G2/M细胞周期中的作用,并验证了cyclin B1在肿瘤增殖中的功能 | 首次定义了促进胆管癌进展的G2/M期基因模块并绘制了其单细胞动态图谱,揭示了CCNB1作为治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系模型 | 识别驱动胆管癌进展的生存相关基因并解析其调控网络 | 胆管癌患者样本和HuCCT1/RBE细胞系 | 生物信息学 | 胆管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | limma, WGCNA, PPI分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA-CHOL和GEO队列的批量转录组数据,GSE138709单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2494 | 2025-11-25 |
Towards the Generation of a Laser Capture Microdissection-Based Human Hair Follicle Transcriptome Atlas
2025-Nov-21, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.006
PMID:41275906
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研究论文 | 本研究利用激光捕获显微切割结合RNA测序技术,构建了人类生长期毛囊八个不同区域的转录组图谱 | 首次系统性地揭示了人类生长期毛囊各区域的转录组特征,发现了新的区域特异性标志物,并构建了目前尚不可用的毛囊转录组图谱 | 研究仅针对生长期VI毛囊,未涵盖其他毛囊周期阶段 | 构建人类毛囊不同区域的转录组图谱,为毛囊疾病治疗提供基础 | 人类生长期VI毛囊的八个特定区域 | 转录组学 | 毛囊疾病 | 激光捕获显微切割, RNA测序, 原位杂交 | PCA, CellChat分析 | 转录组数据 | 人类毛囊八个区域的组织样本 | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 2495 | 2025-11-25 |
Epigenetic conservation infers that colorectal cancer progenitors retain the phenotypic plasticity of normal colon
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24703-3
PMID:41266495
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和DNA甲基化分析探讨结直肠癌前体细胞是否保留正常结肠的表型可塑性 | 提出定量可塑性信号框架,将表观遗传变异性与基因表达变异性相关联 | 仅分析两个结直肠癌样本,样本量有限 | 研究结直肠癌进展过程中是否保留正常结肠的表型可塑性 | 结直肠癌组织和正常结肠组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 2个结直肠癌样本和多个外部单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2496 | 2025-11-25 |
Machine learning-enhanced discovery of a basement membrane-related gene signature in glioblastoma via single-cell and Spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06918-0
PMID:41267067
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学结合机器学习方法,构建了胶质母细胞瘤中基底膜相关基因特征的风险模型 | 首次通过机器学习组合方法构建基底膜相关基因特征风险模型,并利用单细胞和空间转录组学验证其在胶质母细胞瘤中的表达特征 | 研究样本数量有限,仅包含四个队列的胶质母细胞瘤患者数据 | 探索胶质母细胞瘤与基底膜之间的分子关联,建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 二元分类机器学习 | 基因表达数据 | 四个患者队列,包含来自17名患者的42个独立验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2497 | 2025-11-25 |
Immune cell-specific gene expression and its causal role in osteoporosis and bone mineral density: Insights from single-cell eQTL and GWAS data integration
2025-Nov-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045869
PMID:41239652
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研究论文 | 通过整合单细胞eQTL和GWAS数据,系统研究免疫细胞特异性基因表达与骨质疏松症风险的因果关系 | 首次在免疫细胞亚型水平上探索基因表达与骨质疏松症的因果关联,识别出7个关键基因 | 研究结果需要进一步实验验证,样本量可能限制统计功效 | 探究免疫细胞特异性基因表达在骨质疏松症发病机制中的因果作用 | 骨质疏松症患者和骨矿物质密度相关数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, Steiger方向性检验, 共定位分析 | 基因组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2498 | 2025-11-25 |
Disease duration impacts intestinal gene expression profiles in Crohn's disease but not in ulcerative colitis
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf179
PMID:41063393
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研究论文 | 本研究探讨疾病持续时间对克罗恩病和溃疡性结肠炎患者肠道基因表达谱的影响差异 | 首次系统比较疾病持续时间对两种主要炎症性肠病肠道转录组的不同影响,并识别出与疾病持续时间相关的共享基因特征和通路 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 理解克罗恩病和溃疡性结肠炎中疾病持续时间相关的肠道转录组变化 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠道组织 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | RNA测序,单细胞RNA测序,差异表达分析,通路分析 | NA | 基因表达数据 | MSCCR队列:498例CD患者和421例UC患者;SPARC IBD队列:777例CD患者和440例UC患者;单细胞RNA测序:18例CD患者 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2499 | 2025-11-25 |
Lateral plate mesoderm directs human amnion and ventral skin organoid formation
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.685987
PMID:41278640
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研究论文 | 本研究通过调控细胞组成和信号环境,成功构建了模拟腹侧皮肤和人类羊膜组织的类器官模型 | 首次利用侧板中胚层祖细胞生成腹侧皮肤类器官,并通过信号调控将其重编程为羊膜样组织 | NA | 研究人类胚胎-胚外界面发育过程,为先天性皮肤和羊膜疾病提供新见解 | 人类皮肤类器官和羊膜样组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2500 | 2025-11-25 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
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研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变GBM微环境中嘌呤代谢促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床疗效仍需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序,核RNA测序 | NA | 代谢组数据,基因表达数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,核RNA测序 | NA | NA |