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当前共找到 37368 篇文献,本页显示第 2481 - 2500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2481 2026-02-11
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomics with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Feb-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补,以提升数据质量和分析效果 spRefine首次结合基因组语言模型,以无参考框架对空间转录组数据进行联合去噪和插补,显著提高了数据整合的鲁棒性,并支持模型预训练和新生物信号发现 未在摘要中明确提及具体限制 解决空间转录组数据分析中高噪声和基因测量缺失的问题,提升数据质量和下游应用准确性 空间转录组数据 数字病理学 老年疾病 空间转录组学 深度学习框架(基于基因组语言模型) 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2482 2026-02-11
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2026-Feb-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)如何调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞活化,并发现Müller胶质细胞是视网膜中LXB4的重要来源,为青光眼治疗提供了新靶点 首次揭示Müller胶质细胞作为视网膜中LXB4的内源性来源,并证明LXB4通过下调IL-6和STAT3抑制TRPV4诱导的胶质增生,为靶向TRPV4-脂氧素通路治疗青光眼提供了新策略 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,尚未在人类临床样本中验证,且具体信号转导机制需进一步阐明 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞活化,以及Müller胶质细胞是否参与脂氧素通路 小鼠Müller胶质细胞 神经科学 青光眼 转录组学、流式细胞术、免疫染色、qPCR、Western blotting、脂质组学、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、脂质组学数据、单细胞RNA测序数据 小鼠模型及体外培养的Müller胶质细胞 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
2483 2026-02-11
BRD4 Induces Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via the Wnt/β-catenin Pathway
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究探讨了BRD4在食管鳞状细胞癌(ESCC)进展中的作用及其通过Wnt/β-catenin信号通路的分子机制 首次全面探索BRD4在ESCC中的功能,并利用单细胞转录组测序分析肿瘤微环境对BRD4过表达的影响 未明确BRD4在ESCC中的具体上游调控机制,且体内实验验证可能不足 阐明BRD4在ESCC进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 食管鳞状细胞癌细胞 癌症生物学 食管癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2484 2026-02-11
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2026-Feb, Spinal cord IF:2.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,探讨了没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,重点关注细胞类型特异性通路和免疫调节 采用整合的单细胞RNA测序、转录组学、孟德尔随机化和网络药理学方法,揭示了没食子酸甲酯通过调节星形胶质细胞-单核细胞-神经元串扰促进脊髓损伤恢复的新机制 研究基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏体内或体外实验验证,且样本来源于小鼠模型,可能限制对人类脊髓损伤的直接适用性 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,特别是通过细胞类型特异性通路和免疫调节的角度 脊髓损伤小鼠模型中的星形胶质细胞、单核细胞和神经元,以及相关的基因表达和通路 生物信息学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 转录组学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 NA 基因表达数据, GWAS汇总数据 NA NA 单细胞RNA测序, 转录组学 NA NA
2485 2026-02-11
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2026-Feb, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了肝细胞特异性MET缺失对乙酰氨基酚诱导的肝损伤的影响,揭示了MET通过抑制线粒体细胞死亡信号通路在限制肝毒性中的关键作用 首次在临床相关的乙酰氨基酚诱导肝损伤模型中系统研究MET的作用,并发现MET缺失通过增强JNK活化和线粒体氧化损伤加剧肝毒性 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展 阐明MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制 肝细胞特异性MET敲除小鼠及人类急性肝衰竭患者数据 分子生物学与病理学 肝损伤与急性肝衰竭 RNA测序、免疫印迹、单核RNA测序、空间转录组学 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、蛋白质数据、空间转录组数据 小鼠模型及已发表的人类单核RNA测序数据 NA RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
2486 2026-02-11
Integrated analysis identifies conserved transcription factors TCF12, E2F1, and TEAD4 with diagnostic and therapeutic value in osteoarthritis subchondral bone
2026-Feb, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合分析识别了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,并探讨了其诊断和治疗价值 首次在人类和动物模型中系统识别并验证了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,揭示了它们在骨重塑中的关键调控作用及其作为新型诊断标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,尚未进行深入的机制研究和临床试验 识别驱动骨关节炎进展的软骨下骨关键分子靶点和转录因子,并评估其诊断和治疗潜力 人类骨关节炎患者、大鼠骨关节炎模型和小鼠DMM模型的软骨下骨组织 生物信息学 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, qPCR NA 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 人类OA患者和大鼠OA模型的RNA-seq数据,以及人类OA和小鼠DMM模型的实验样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2487 2026-02-11
Tumor microenvironment-driven drug resistance in urologic cancers: mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb, Genes & genomics IF:1.6Q3
综述 本文综述了泌尿系统肿瘤微环境如何驱动对多种疗法的耐药性,并探讨了潜在的干预策略 系统性地总结了肿瘤微环境中不同组分(如CAFs、ECM、免疫抑制细胞、缺氧)在泌尿系统癌症中驱动耐药的具体机制,并整合了单细胞测序、空间转录组学等新兴技术带来的新机遇 NA 阐明肿瘤微环境在泌尿系统癌症治疗耐药中的作用机制,并探索克服耐药的治疗靶点 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌等泌尿系统癌症及其肿瘤微环境 肿瘤生物学 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌 NA NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2488 2026-02-11
LETIM Robustly Predicts Immune Checkpoint Blockade Efficacy for Liver Cancer Patients Using Multiple Immune-Related Genesets
2026-Feb, Journal of gastroenterology and hepatology IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,建立了用于评估免疫细胞状态的基因集,并基于此开发了能够预测肝癌患者免疫检查点阻断疗效的模型LETIM 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,建立了同时具有组内稳定性和组间变异性的免疫相关基因集,并构建了超越现有模型的跨队列通用预测模型LETIM 未在文中明确说明,但可能包括样本来源的局限性、模型在更广泛人群中的验证需求等 开发能够准确预测肝癌患者免疫检查点阻断治疗反应的模型 肝癌患者 生物信息学 肝癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 ExtraTrees 基因表达数据 多个大型肝癌测序队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2489 2026-02-11
USAG-1 and Regenerative Dentistry, Therapeutic Implications and Future Directions: Review of the Literature
2026-Feb, Clinical and experimental dental research IF:1.7Q3
综述 本文综述了子宫致敏相关基因1(USAG-1)在牙齿再生中的作用及其作为治疗靶点的潜力 强调了USAG-1抑制通过激活BMP介导的形态发生促进牙齿再生,并探讨了工程化单克隆抗体在临床前模型中的疗效 安全性、特异性、递送机制以及伦理问题仍是实现临床应用的主要挑战 评估USAG-1在牙齿组织修复和再生中的治疗潜力及未来方向 USAG-1基因及其在BMP和Wnt信号通路中的作用,涉及肾脏、牙龈和牙齿组织 再生牙科 先天性牙齿缺失 单细胞RNA测序,RNA-seq分析 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2490 2026-02-11
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种针对钙化动脉样本进行数字空间谱分析(Digital Spatial Profiling)的优化工作流程,旨在解决血管组织空间转录组学分析中的技术障碍 开发了一种针对钙化动脉的逐步工作流程,能够在脱钙等苛刻处理后同时保持组织形态和RNA完整性,并详细描述了组织微阵列(TMA)构建和ROI选择策略 该协议主要针对人类胫动脉晚期病变样本进行优化,可能不直接适用于所有类型的血管组织或疾病阶段 为血管生物学研究提供可靠的空间转录组学数据生成方法,以研究健康和病变血管中特定层次的转录活动 人类胫动脉(特别是伴有晚期病变的钙化动脉样本) 空间转录组学 心血管疾病 空间转录组学,组织微阵列(TMA)构建,组织学染色 NA 空间转录组数据,组织图像 NA NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP)
2491 2026-02-11
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了PURE-seq技术,整合FACS和PIP-seq,用于超稀有细胞的单细胞基因组学研究 PURE-seq技术通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,最小化处理步骤并减少细胞损失,实现了对超稀有细胞(如稀有度1/1,000,000)的高效捕获和测序 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及技术适用范围或样本类型限制 开发一种简单且高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中成本高和稀有细胞群体稀释的问题 超稀有细胞,包括转移性黑色素瘤患者血液中的循环肿瘤细胞,以及年轻、中年和老年小鼠的造血干细胞和祖细胞 单细胞基因组学 黑色素瘤 单细胞转录组学,FACS分选,PIP-seq NA 单细胞基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但提到1小时分选可捕获数十个目标细胞 NA 单细胞RNA-seq PURE-seq PURE-seq整合FACS和PIP-seq,用于直接分选和测序超稀有细胞
2492 2026-02-11
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了卵巢激素缺乏会通过转录组和代谢改变加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,系统阐明了木材烟雾暴露如何特异性重编程骨髓巨噬细胞的代谢和免疫功能,并提出了免疫-代谢解耦的新机制 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涵盖其他激素缺乏状态或更广泛的生理变化;功能验证主要在骨髓来源巨噬细胞中进行,体内复杂微环境的相互作用有待进一步探索 探究卵巢激素缺乏是否以及如何增加个体对木材烟雾诱导的免疫功能障碍的易感性 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞,特别是骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 单细胞组学 免疫功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2493 2026-02-11
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
研究论文 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和机器学习模型,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习方法,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用公开数据集,需要进一步实验验证 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间调控机制 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及人类数据集GSE243981 数字病理学 肝病 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 基因表达数据, 空间转录组数据 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠肝组织 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx空间转录组学平台
2494 2026-02-11
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
共识 本文介绍了中国多发性骨髓瘤遗传学检测共识(2026版)的更新内容,旨在规范检测流程、统一高风险遗传学异常的解读与报告,并讨论将新兴分子标志物纳入风险分层 基于最新证据对2019年共识进行修订,重点关注检测工作流程的优化、高风险遗传学异常解读与报告的标准化,并探讨将新兴分子标志物(如全基因组测序和单细胞测序发现的标志物)整合到风险分层框架中 共识性文件主要基于现有证据和专家意见,可能未涵盖所有最新技术或临床场景,且其实施效果需在实际临床应用中进一步验证 制定和更新中国多发性骨髓瘤遗传学检测的标准化共识,以促进精准医疗并改善高风险患者的识别与管理 多发性骨髓瘤患者及其遗传学异常 临床医学与遗传学 多发性骨髓瘤 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 NA 遗传学数据 NA NA NA NA NA
2495 2026-02-11
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为TrajLens的可视化分析系统,用于构建跨样本的细胞发育轨迹 首次提出基于GNN的模型来预测跨样本细胞发育轨迹,并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视化分析系统 未在摘要中明确说明 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 GNN 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2496 2026-02-11
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文探讨了使用大型语言模型分析领域文献中可视化使用情况的潜力,并以单细胞转录组学中的高维数据可视化为案例进行研究 提出了结合图像处理、传统NLP方法和LLM的人机协同工作流程,用于大规模分析领域文献中的可视化使用情况,并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 研究仅针对单细胞转录组学领域的高维数据可视化,分析结果可能无法直接推广到其他领域 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定使用之间差距方面的潜力 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 自然语言处理 NA 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 LLM 文本、图像 1,203篇论文,包含2,056个高维可视化 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2497 2026-02-11
Unveiling Endothelial Cell Expression Profiles in FEVR: Identification of Key Genes Associated With Pathological Neovascularisation in a FZD4M105V Mouse Model
2026 Jan-Feb, Clinical & experimental ophthalmology
研究论文 本研究通过建立FZD4M105V小鼠模型,揭示了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中内皮细胞的表达谱,并鉴定了与病理性新生血管相关的关键基因 首次利用CRISPR/Cas9技术构建FZD4M105V小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了病理性内皮细胞簇和尖端细胞的独特转录谱,鉴定了四个新的候选生物标志物 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全覆盖所有内皮细胞亚群 阐明家族性渗出性玻璃体视网膜病变中病理性新生血管的分子机制 FZD4M105V突变小鼠的视网膜内皮细胞 数字病理学 视网膜血管疾病 CRISPR/Cas9基因编辑、流式细胞分选、单细胞RNA测序 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和单细胞测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2498 2026-02-11
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025-Dec-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)与炎症性肠病(IBD)患者胃肠道中MRGPRX2阳性肥大细胞的增加及其与疾病活动的关联 首次在HαT和IBD背景下,通过多平台方法(空间转录组学、质谱流式细胞术)系统揭示了胃肠道肥大细胞丰度增加、活化标志物(CD203c、LAMP-1、SIGLEC8)上调以及MRGPRX2表达增强的现象 样本量相对较小(空间转录组学n=8,质谱流式细胞术n=14),且研究主要基于观察性关联,尚未明确MRGPRX2介导的肥大细胞活化在HαT相关胃肠道症状中的直接因果机制 探究HαT是否通过改变肥大细胞受体MRGPRX2的表达及活化状态,影响IBD的胃肠道病理过程 HαT患者、非HαT的IBD患者以及健康对照者的胃肠道组织样本 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 共分析873份样本(854份生物库IBD样本用于基因分型,8份结肠组织用于空间转录组学,14份小肠活检用于质谱流式细胞术) NA 空间转录组学, 质谱流式细胞术 NA NA
2499 2026-02-11
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-12, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究构建了一个基于NOTCH相关基因的预后风险模型(NOTCH评分),用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存、免疫浸润和治疗反应 首次整合NOTCH信号通路相关基因构建预后模型,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗反应及药物敏感性的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在单细胞和蛋白水平的验证样本量有限 开发头颈部鳞状细胞癌的预后预测工具并探索其与肿瘤微环境及治疗反应的关联 头颈部鳞状细胞癌患者 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2500 2026-02-11
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾病进展中的关键调控作用 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾病进展中的作用机制 生物信息学和临床队列的样本量有限 识别慢性肾病的新型诊断生物标志物和治疗靶点 慢性肾病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 生物信息学 慢性肾病 单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 64名慢性肾病患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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