单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24941 2024-08-09
Single Cell Technologies Define New Therapeutic Avenues for Huntington's Disease
2020-09-09, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 使用两种独立的单细胞转录组技术,Lee等人对亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元的转录变化进行了分类 首次使用单细胞转录组技术详细描述了亨廷顿病中纹状体神经元的转录变化 NA 探索亨廷顿病的新治疗途径 亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元 数字病理学 亨廷顿病 单细胞转录组技术 NA 转录组数据 NA
24942 2024-08-09
Single-cell transcriptome maps of myeloid blood cell lineages in Drosophila
2020-09-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇淋巴腺中发育中的血细胞的异质性,并发现了新的血细胞类型 发现了先前未描述的血细胞类型,包括脂肪血细胞、干细胞样前血细胞和中间前血细胞,并揭示了血细胞在正常发育中的发展轨迹及在受到黄蜂侵扰后扁平细胞谱系的形成 NA 深入了解果蝇淋巴腺中血细胞发育和细胞免疫反应的分子机制 果蝇淋巴腺中的血细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 具体样本数量未在摘要中提及
24943 2024-08-09
Tempora: Cell trajectory inference using time-series single-cell RNA sequencing data
2020-09, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Tempora的新型细胞轨迹推断方法,该方法利用时间序列单细胞RNA测序数据中的时间信息来排序细胞 Tempora方法结合了时间和生物途径信息来指导基于scRNA-seq的轨迹推断,提高了基因表达信号的强度、处理速度和推断轨迹的可解释性 NA 开发一种新的细胞轨迹推断方法,以提高在时间序列scRNA-seq数据中细胞排序的准确性和速度 时间序列单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹推断 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 时间序列数据 涉及三个不同组织发育时间序列数据集
24944 2024-08-09
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文展示了通过在成熟人内皮细胞中短暂重新激活胚胎特异性ETS变体转录因子2(ETV2),并在无血清的三维LEC基质中培养,使这些细胞恢复为可适应的、具有血管生成能力的细胞,能够形成可灌注和可塑的血管网络。 通过ETV2的重新激活,使成熟内皮细胞恢复到胚胎状态,能够在三维基质中自我组装成稳定的、多层和分支的血管网络,并能与宿主循环系统功能性吻合。 NA 研究内皮细胞在器官发生和肿瘤发生中的适应性,并开发一种新的生理平台‘Organ-On-VascularNet’,用于血管化和器官修复。 成熟人内皮细胞的适应性和血管生成能力。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和表观遗传学分析 NA 细胞 涉及人胰腺胰岛、去细胞化的大鼠肠道和人结肠器官样品。
24945 2024-08-09
Single-cell transcriptome analysis reveals cell lineage specification in temporal-spatial patterns in human cortical development
2020-08, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组测序分析了人类胚胎和胎儿期大脑皮质四个脑叶和脑桥的细胞谱系特化过程 发现了先前未知的短暂性神经前体细胞亚型及其分子特征,并阐明了人类深层、上层和成熟神经元的神经发生路径及分子调控机制 NA 揭示人类皮质发育中的细胞谱系特化和分子调控机制 人类胚胎和胎儿期大脑皮质的神经前体细胞、神经元和胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 涉及人类胚胎和胎儿期大脑皮质四个脑叶和脑桥的多个样本
24946 2024-08-09
Single-cell transcriptomics identifies multiple pathways underlying antitumor function of TCR- and CD8αβ-engineered human CD4+ T cells
2020-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞的抗肿瘤功能及其转录基础。 本研究首次揭示了TCR8表达在CD4 T细胞中增强抗肿瘤功能的分子特征,为开发新型免疫疗法提供了理论基础。 NA 探究表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞的抗肿瘤功能及其转录基础。 表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞及其在肿瘤挑战后的功能变化。 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及人类CD4和CD8 T细胞,具体数量未在摘要中明确。
24947 2024-08-09
In Vivo Generation of Lung and Thyroid Tissues from Embryonic Stem Cells Using Blastocyst Complementation
2021-02-15, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本文通过胚胎互补技术,利用胚胎干细胞在体内生成肺和甲状腺组织 首次通过定向分化胚胎干细胞生成包含气道、肺泡、血管和基质的肺功能组织 技术挑战限制了生成高度分化的细胞以维持肺功能 探索胚胎干细胞在体内生成肺组织的能力 胚胎干细胞和缺乏肺组织的胚胎 NA NA 胚胎互补技术 NA 单细胞RNA测序 使用了正常的小鼠胚胎干细胞和缺乏肺组织的胚胎
24948 2024-08-09
Effects of vitrification and cryostorage duration on single-cell RNA-Seq profiling of vitrified-thawed human metaphase II oocytes
2021-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
研究论文 研究玻璃化和冷冻储存时间对人类中期II期卵母细胞单细胞RNA-Seq分析的影响 首次探讨了玻璃化程序和相关冷冻储存时间对人类中期II期卵母细胞转录组的影响 样本量较小,仅涉及四名女性,可能影响结果的普遍性 探究玻璃化程序及其冷冻储存时间对人类卵母细胞转录组的影响 人类中期II期卵母细胞 NA NA 单细胞RNA-Seq NA RNA-Seq数据 共分析了3个新鲜卵母细胞和13个存活下来的玻璃化解冻卵母细胞
24949 2024-08-09
Reading the heart at single-cell resolution
2020-11, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本文重点介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在心脏研究中的应用,特别是心肌细胞的样本和数据处理步骤 单细胞转录组学领域的快速发展提高了我们对器官系统在空前分辨率下的研究能力 尽管通用的scRNA-seq流程协议已经建立,但心脏研究仍需要定制的样本准备、质量控制和数据解释 探讨scRNA-seq在心脏研究中的应用,提高数据质量 心肌细胞的样本和数据处理 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24950 2024-08-09
Monocyte recruitment and fate specification after myocardial infarction
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
综述 本文综述了单核细胞在心肌梗死后炎症反应中的关键作用及其招募和命运调控的最新研究进展 利用单细胞转录组学和质谱流式细胞术识别了具有功能相关性的较小、转录上不同的簇,并探讨了单核细胞在缺血损伤后的时空动态及其与其他免疫细胞的相互作用 NA 旨在探讨单核细胞在心肌梗死后的功能异质性、招募和命运调控机制,以及针对单核细胞治疗缺血性心脏病的潜在疗法 单核细胞在心肌梗死后的功能和动态变化 NA 心血管疾病 单细胞转录组学, 质谱流式细胞术 NA 转录组数据 NA
24951 2024-08-09
Single-cell transcriptomic analysis identifies extensive heterogeneity in the cellular composition of mouse Achilles tendons
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠跟腱细胞组成的异质性 发现了11种不同类型的细胞,包括三种先前未描述的腱成纤维细胞,并提供了证据支持周细胞可能是成年腱成纤维细胞的前体细胞 NA 探索小鼠跟腱细胞组成的异质性及其在组织稳态和疾病中的生物学基础 小鼠跟腱细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
24952 2024-08-09
Aging impairs alveolar epithelial type II cell function in acute lung injury
2020-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 研究探讨了年龄对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 首次揭示了老年小鼠在急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞的衰老迹象和功能障碍 研究仅限于小鼠模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探讨年龄增长对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 肺泡上皮II型细胞在不同年龄小鼠中的功能 NA 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 年轻(3个月)和老年(18个月)小鼠
24953 2024-08-09
Epigenetic pathways and plasticity in brain tumors
2020-11, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本文总结了在三种主要脑肿瘤(胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤)中活跃的表观遗传途径,并比较了这些肿瘤的单细胞RNA测序分析,以识别治疗这些肿瘤起源细胞的共同表观遗传途径。 探讨了通过靶向表观遗传途径与标准治疗方案结合来对抗脑肿瘤细胞的可塑性,并讨论了使用多组学方法治疗这些和其他脑肿瘤的可能组合疗法。 本文的焦点集中在三种肿瘤类型上,并未涵盖所有脑肿瘤,可能存在其他脑肿瘤具有类似的机制。 研究脑肿瘤的表观遗传途径和细胞可塑性,以开发更有效的治疗方法。 胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤。 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及三种主要脑肿瘤类型
24954 2024-08-09
Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-10-13, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究利用血浆蛋白质组学和单细胞转录组学技术,优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的候选蛋白 结合大规模人类血浆蛋白质组学与无偏倚心脏单细胞分辨率转录组学,优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的蛋白候选物 NA 旨在通过分析血浆蛋白和基因表达,发现新的生物标志物和药物靶点候选物 心肌梗死后心力衰竭相关的血浆蛋白及其基因表达 数字病理学 心血管疾病 基于适配体的亲和捕获血浆蛋白质组学 NA 蛋白质组学数据 新西兰队列包括181名心肌梗死后患者和250名无事件患者,新加坡队列包括223名心肌梗死后患者
24955 2024-08-09
Massively parallel and time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq
2020-10, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scNT-seq的新方法,用于从单个细胞中大规模并行分析新转录和预存的mRNA scNT-seq方法通过滴液微流控技术,高效地标记新转录的mRNA,并能同时分析新旧转录组 NA 揭示时间分辨的转录因子活性和细胞状态轨迹,以及在特定细胞状态下RNA生物合成和降解的速率 单个细胞中的新转录和预存mRNA 基因组学 NA scNT-seq NA RNA序列 约55,000个单细胞
24956 2024-08-09
Two Tales of Single-Cell RNA Sequencing: Gene Expression and Alternative Splicing in Mouse Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
24957 2024-08-09
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1
研究论文 本文介绍了T细胞受体(TCR)的批量和单细胞测序技术,讨论了基于共享结构基序的TCR谱系聚类和特异性预测的计算工具,并回顾了谱系多样性和收敛性分析的主要指数。 本文介绍了新的计算工具,用于分析T细胞受体的多样性和特异性,这些工具可能成为个性化免疫治疗的潜在生物标志物。 NA 探讨T细胞受体谱系的复杂性和多样性,以及这些特性在健康和疾病中的应用。 T细胞受体的多样性和特异性。 生物信息学 NA 高通量批量和单细胞测序技术 NA 基因组数据 NA
24958 2024-08-09
Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文通过比较表观基因组学和单细胞测序研究了两种相关硬骨鱼的再生能力差异及其遗传机制 发现了几个再生响应增强子(RREs),包括一个已知的脊椎动物再生效应子上游的元素,并揭示了其在再生中的作用 该增强子在哺乳动物中存在且响应损伤,但无法在鱼类中恢复再生能力 探讨脊椎动物再生能力差异的遗传机制 两种相关硬骨鱼的再生能力 NA NA 比较表观基因组学,单细胞测序 NA 基因组数据 两种相关硬骨鱼
24959 2024-08-09
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文研究了在正常和病理伤口修复过程中,表观遗传调控对PGE2通路的影响,以及其对巨噬细胞表型的调节作用 首次揭示了TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子超甲基化,增加COX-2/PGE2的产生,以及MLL1上调cPLA2表达并驱动COX-2/PGE2的过程 NA 探讨表观遗传调控在正常和病理伤口修复中对巨噬细胞表型和功能的影响 人类和小鼠的伤口巨噬细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 人类和小鼠的伤口组织
24960 2024-08-09
Hematopoiesis in High Definition: Combining State and Fate Mapping
2020-09-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文结合谱系追踪和单细胞测序方法,同时分析克隆和转录轨迹,以深入了解造血过程中的组织和决策机制 本文通过同时考虑克隆和转录轨迹,提供了对造血组织和决策机制的关键新见解 NA 探索造血过程中的组织和决策机制 造血过程 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA
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