单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 24901 - 24920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24901 | 2024-08-09 |
Reprogramming roadmap reveals route to human induced trophoblast stem cells
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2734-6
PMID:32939092
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学重建了人类皮肤成纤维细胞的重编程轨迹，揭示了从体细胞到诱导多能干细胞及诱导滋养层干细胞的重编程过程。 | 本文首次揭示了重编程过程中滋养层细胞特异性调控程序的作用，并成功诱导出与天然滋养层干细胞分子和功能相似的诱导滋养层干细胞。 | NA | 探讨人类体细胞重编程为多能干细胞及滋养层干细胞的分子机制。 | 人类皮肤成纤维细胞的重编程过程及诱导滋养层干细胞的生成。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24902 | 2024-08-09 |
Endosialin defines human stem Leydig cells with regenerative potential
2020-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaa174
PMID:32951040
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研究论文 | 本文研究了内皮素作为人类干细胞莱迪细胞（SLCs）的特异性标记物，并探讨了其在体外和体内分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | 内皮素被证明是人类SLCs的特异性标记物，相比于PDGFRα和NGFR，具有更高的特异性 | 由于人类睾丸组织收集困难，样本量有限。内皮素对SLCs的功能需要在未来的研究中进一步阐明 | 确定内皮素是否为人类SLCs的特异性标记物，并研究其在体外和体内分化为功能性LCs的潜力 | 人类干细胞莱迪细胞（SLCs）及其分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | NA | NA | 单细胞测序分析，免疫荧光和流式细胞术 | NA | 细胞 | 四个人类供体的睾丸组织 |
| 24903 | 2024-08-09 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
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研究论文 | 研究利用肿瘤芯片平台探讨巨噬细胞在肿瘤进展中的作用 | 开发了一种微生理的肿瘤芯片设备，能够在三维体外微环境中高时空分辨率地捕捉细胞间动态 | 对TAMs如何影响肿瘤微环境的理解仍然有限，需要更多适当的3D体外模型 | 探究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤行为和临床结果中的作用 | 巨噬细胞亚型对肿瘤行为的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及人胰腺癌和结直肠癌细胞以及M1和M2极化巨噬细胞 |
| 24904 | 2024-08-09 |
p63 and Its Target Follistatin Maintain Salivary Gland Stem/Progenitor Cell Function through TGF-β/Activin Signaling
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101524
PMID:32932139
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研究论文 | 研究探讨了ΔNp63通过TGF-β/Activin信号通路及其靶点Follistatin维持唾液腺干细胞/祖细胞功能的分子机制 | 揭示了ΔNp63缺失导致唾液腺干细胞/祖细胞数量减少及分化偏斜，这一过程通过Follistatin依赖的TGF-β/Activin信号通路失调介导 | NA | 理解ΔNp63在指导唾液腺细胞命运选择中的作用 | 唾液腺干细胞/祖细胞及其分化功能 | NA | NA | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列, 蛋白质结合位点序列, 单细胞RNA序列 | ΔNp63缺失的成年小鼠及初级唾液细胞培养物 |
| 24905 | 2024-08-09 |
Genetic mapping of etiologic brain cell types for obesity
2020-09-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55851
PMID:32955435
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据和体重指数的全基因组关联研究数据，确定了与肥胖易感性相关的特定脑细胞类型。 | 开发了一种新的策略，将单细胞RNA测序数据与全基因组关联研究数据相结合，以识别与肥胖相关的特定脑细胞类型。 | NA | 旨在揭示导致肥胖的脑细胞类型。 | 研究对象包括来自17个老鼠器官的727种外周和神经系统细胞类型，以及超过457,000个人的体重指数全基因组关联研究数据。 | 遗传学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 727种细胞类型和超过457,000个个体 |
| 24906 | 2024-08-09 |
Glioblastoma cell differentiation trajectory predicts the immunotherapy response and overall survival of patients
2020-Sep-21, Aging
DOI:10.18632/aging.103695
PMID:32957084
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，分析了胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其与临床结果的相关性 | 识别了498个与胶质母细胞瘤细胞分化相关的基因，并发现这些基因与免疫调节和代谢途径显著相关，能够成功预测患者的总体生存率、免疫检查点表达和免疫治疗反应 | NA | 研究胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其临床相关性 | 胶质母细胞瘤细胞的分化状态及其临床相关性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 两个大型胶质母细胞瘤队列 |
| 24907 | 2024-08-09 |
Low-dose DNA demethylating therapy induces reprogramming of diverse cancer-related pathways at the single-cell level
2020-09-21, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-020-00937-y
PMID:32958049
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研究论文 | 本文探讨了低剂量DNA去甲基化药物在单细胞水平上对多种癌症相关通路的重新编程机制 | 研究揭示了低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上对特定癌症相关基因的完全去甲基化效果 | 研究主要集中在HCT116细胞系，可能需要进一步在其他细胞系或临床样本中验证 | 探索低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上的疗效机制 | HCT116细胞系在低剂量去甲基化药物处理后的表达谱和DNA甲基化状态 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了克隆的HCT116细胞进行分析 |
| 24908 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals clonal expansions of pro-inflammatory synovial CD8 T cells expressing tissue-homing receptors in psoriatic arthritis
2020-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18513-6
PMID:32958743
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了银屑病关节炎（PsA）患者关节中的白细胞，发现关节内记忆CD8 T细胞显著扩增并表达组织归巢受体 | 首次揭示了银屑病关节炎中促炎性滑膜CD8 T细胞的克隆扩增及其表达组织归巢受体的现象 | NA | 探究银屑病关节炎的免疫细胞组成和分子机制 | 银屑病关节炎患者的关节白细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个银屑病关节炎患者的关节和外周血样本 |
| 24909 | 2024-08-09 |
Transcriptome heterogeneity of porcine ear fibroblast and its potential influence on embryo development in nuclear transplantation
2020-Sep-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.20-190
PMID:32952124
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了来自同一来源的52个猪耳成纤维细胞的基因表达模式，探讨了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响。 | 首次在单细胞水平上分析了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响，并提供了分析精英供体细胞的有效方法。 | NA | 探讨供体细胞异质性对核移植胚胎发育效率的潜在影响。 | 猪耳成纤维细胞的基因表达模式及其对核移植效率的影响。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 52个猪耳成纤维细胞 |
| 24910 | 2024-08-09 |
EnClaSC: a novel ensemble approach for accurate and robust cell-type classification of single-cell transcriptomes
2020-Sep-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03679-z
PMID:32938367
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnClaSC的新型集成方法，用于单细胞转录组数据的准确和稳健的细胞类型分类 | EnClaSC不仅可以在特定数据集内部进行自投影和跨不同数据集的细胞类型分类，还能很好地适应不同的数据维度和数据稀疏性，并能进行跨物种分类 | NA | 开发一种新的计算方法，用于将新产生的单细胞RNA测序数据分类到已注释的标签上 | 单细胞转录组数据的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成学习方法 | 转录组数据 | NA |
| 24911 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq identifies unique transcriptional landscapes of human nucleus pulposus and annulus fibrosus cells
2020-09-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-72261-7
PMID:32943704
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了健康人椎间盘的转录组图谱，特别是核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞的独特转录景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了人类NP和AF细胞的遗传结构和差异表达基因，并识别了关键的转录因子 | 研究仅限于非退行性腰椎间盘的NP和AF细胞，可能无法完全代表所有椎间盘疾病的情况 | 阐明健康人椎间盘NP和AF细胞的分子途径和转录网络 | 人类椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞 | 数字病理学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从非退行性腰椎间盘中分离出的NP和AF细胞 |
| 24912 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing techniques from individual to multiomics analyses
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00499-2
PMID:32929221
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在个体和多组学层面的应用 | 介绍了多种单细胞组学方法及其应用，并探讨了多层数据集的计算整合方法 | NA | 旨在深入理解每个细胞的基本分子特征及其与疾病相关的分子特征 | 单细胞的基因组、表观基因组和转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 大量单细胞 |
| 24913 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics in cancer: computational challenges and opportunities
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0422-0
PMID:32929226
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在癌症研究中的计算挑战与机遇 | 探讨了单细胞转录组学数据在癌症研究中的新兴计算分析方法及其应用 | 讨论了未来计算方法学发展的挑战与机遇 | 旨在揭示驱动癌症发展、发病机制和临床结果的细胞类型和状态 | 单细胞转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24914 | 2024-08-09 |
Malignant cell-specific CXCL14 promotes tumor lymphocyte infiltration in oral cavity squamous cell carcinoma
2020-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001048
PMID:32958684
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研究论文 | 研究CXCL14在口腔鳞状细胞癌中通过促进淋巴细胞浸润抑制肿瘤生长的机制 | 发现CXCL14在恶性细胞中的表达与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的增加和肿瘤生长的抑制相关，表明CXCL14可能通过免疫介导的机制抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要在人体中进一步验证 | 探讨CXCL14介导的口腔鳞状细胞癌肿瘤生长抑制的潜在机制 | 口腔鳞状细胞癌中的恶性细胞和淋巴细胞浸润 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自口腔鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据，以及C57BL/6小鼠模型 |
| 24915 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune escape and drug resistance mechanisms of mantle cell lymphoma
2020-08-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了套细胞淋巴瘤的免疫逃逸和药物抗性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了套细胞淋巴瘤中多种细胞亚群的免疫逃逸和药物抗性机制 | 研究仅基于单一患者样本，可能存在样本代表性不足的问题 | 探索套细胞淋巴瘤的免疫逃逸和药物抗性机制 | 套细胞淋巴瘤中的细胞亚群及其免疫逃逸和药物抗性相关基因 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约4000个骨髓细胞 |
| 24916 | 2024-08-09 |
Identification of hub genes in diabetic kidney disease via multiple-microarray analysis
2020-Aug, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-20-5171
PMID:32953797
|
研究论文 | 本研究通过重新分析三个mRNA微阵列数据集，包括一个单细胞RNA测序数据集，旨在识别与糖尿病肾病相关的关键基因，并增进对糖尿病肾病发病机制的理解。 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集进行多微阵列分析，识别了17个关键基因，丰富了细胞水平上糖尿病肾病发病机制的理解，并为诊断和治疗提供了候选靶点。 | NA | 识别与糖尿病肾病相关的关键基因，增进对糖尿病肾病发病机制的理解。 | 糖尿病肾病的关键基因及其在发病机制中的作用。 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | mRNA微阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集：GSE131882, GSE30122, GSE30529 |
| 24917 | 2024-08-09 |
Percutaneous liver biopsy: another option of hepatic sample collection approach in single-cell sequencing studies?
2020-Aug, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm.2020.04.23
PMID:32953833
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24918 | 2024-08-09 |
Understanding Diseases from Single-Cell Sequencing and Methylation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_1
PMID:32949386
|
review | 本书综述了单细胞测序和甲基化在疾病中的作用，并探讨了单细胞测序和甲基化的疾病特异性改变 | 本书强调了单细胞测序和甲基化方法在临床实践和应用中的重要性，以及其在非癌疾病中的潜在价值 | NA | 旨在应用单细胞测序和甲基化测量进行临床诊断和治疗，并理解这些参数的临床价值 | 单细胞测序和甲基化在疾病中的应用 | digital pathology | pulmonary disease | single-cell sequencing, methylation sequencing | NA | DNA, RNA | NA |
| 24919 | 2024-08-09 |
Methods for Single-Cell Isolation and Preparation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_2
PMID:32949387
|
研究论文 | 本文综述了当前用于基于测序的下游分析的单细胞分离方法的最新技术，并讨论了它们的优缺点 | 介绍了多种单细胞分离方法，并允许转录组学与细胞电生理或形态学参数的相关性分析 | 需要仔细选择合适的方法以避免数据错误或偏差，可能导致误解 | 提供单细胞分离方法的广泛概述，并详细讨论关键参数 | 单细胞分离技术及其在测序基础下游分析中的应用 | 生命科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 24920 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of T cell Receptors: A Perspective on the Technological Development and Translational Application
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_3
PMID:32949388
|
综述 | 本文综述了T细胞受体（TCR）的单细胞测序技术发展及其在自身免疫性疾病中的转化应用 | 介绍了单细胞测序技术在研究TCR库中的应用，改变了TCR库的调查和分析方式 | 在技术上仍存在挑战，如如何序列化TCR并提供与免疫系统中大量TCR库相关的概念性背景 | 探讨TCR的生物学特性、信号传导及其在自身免疫中的意义，并讨论单细胞测序平台在自身免疫性疾病中的应用 | T细胞受体（TCR）及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |