单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 24881 - 24900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24881 | 2024-08-08 |
A model-based constrained deep learning clustering approach for spatially resolved single-cell data
2022-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276477.121
PMID:36198490
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为Deep Spatially constrained Single-cell Clustering (DSSC)的深度学习方法，用于对空间解析单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSSC是首个能够利用空间坐标和标记基因信息指导细胞/位点聚类的模型 | NA | 开发一种新的计算方法来充分利用空间解析单细胞RNA测序技术的潜力 | 空间解析单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 图形神经网络模型 | 深度嵌入聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 不同数据集，包括模拟数据和真实数据，涵盖多种细胞类型/组织结构和/或细胞类型/组织空间依赖性 | NA | NA | NA | NA |
| 24882 | 2024-08-08 |
Revealing the heterogeneity of CD4+ T cells through single-cell transcriptomics
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.010
PMID:36205449
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在分析CD4 T细胞表型和克隆型中的应用 | scRNA-seq能够从单个T细胞中获取配对的T细胞受体和转录组信息，并阐明CD4 T细胞与其环境中的其他细胞之间的相互作用 | scRNA-seq在分析CD4 T细胞时存在固有的挑战，尽管已有技术解决方案出现 | 探讨scRNA-seq在健康和疾病中对CD4 T细胞作用的进一步理解 | CD4 T细胞的表型和克隆型 | 基因表达研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 24883 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq keeps cells alive
2022-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01515-8
PMID:36207601
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24884 | 2024-08-08 |
SLC7A5 is a lung adenocarcinoma-specific prognostic biomarker and participates in forming immunosuppressive tumor microenvironment
2022-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e10866
PMID:36217463
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研究论文 | 研究确定了SLC7A5作为肺腺癌特异性预后氨基酸转运蛋白，并探讨了其在形成免疫抑制性肿瘤微环境中的作用 | 首次揭示SLC7A5在肺腺癌中的特异性预后价值及其在免疫抑制性肿瘤微环境形成中的作用 | NA | 探讨SLC7A5作为肺腺癌特异性预后生物标志物的潜力及其在肿瘤微环境中的作用 | SLC7A5在肺腺癌中的表达、预后价值及其对免疫细胞浸润和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习, 单细胞测序, 甲基化测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24885 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics Analysis Reveals that CCL17 and CCL22 are Robust Indicators of a Suppressive Immune Environment in Angioimmunoblastic T Cell Lymphoma (AITL)
2022-09-29, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2709270
PMID:36224014
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研究论文 | 本研究首次使用空间转录组学方法分析了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的免疫微环境，发现CCL17和CCL22是抑制性免疫环境的强指标 | 首次应用空间转录组学技术研究AITL的肿瘤免疫微环境，揭示了CCL17和CCL22在AITL中的上调现象 | 化疗方案CHOP诱导的完全缓解持续时间仍是一个问题 | 研究AITL的免疫微环境并探索潜在的治疗方法 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的免疫微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 24886 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2022-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.09.25.509426
PMID:36203548
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研究论文 | 本文利用数字空间转录组学技术研究了严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组特征 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染引起的独特心肌转录组编程，且这种编程独立于局部病毒负荷 | 研究样本量较小，且未涉及更大冠状动脉血管的转录组分析 | 探讨严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组变化 | 严重COVID-19患者的冠状动脉内皮细胞和心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 4例对照组和8例COVID-19患者的心脏组织 | NA | NA | NA | NA |
| 24887 | 2024-08-08 |
Analysis of antitumor immunity in mouse glioma microenvironment through intercellular communication
2022-Sep, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_852_22
PMID:36204889
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研究论文 | 本研究通过分析细胞间通讯，描绘了小鼠胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 描述了之前被低估的浸润性T细胞与脑细胞群之间的复杂通讯 | NA | 旨在通过分析细胞间通讯，描绘胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 小鼠胶质瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因组数据 | 新鲜的小鼠胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24888 | 2024-08-08 |
Spotlight on liver macrophages for halting injury and progression in nonalcoholic fatty liver disease
2022-08, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2132145
PMID:36205054
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中巨噬细胞的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 探讨了未来研究可能涉及的领域，如肠道微生物组、损伤相关分子模式（DAMPS）及其相关分子和通路，以及单细胞测序等高级分子生物学研究 | NA | 更新关于直接或间接影响NAFLD中巨噬细胞的药物研究，并讨论巨噬细胞生物标志物在监测疾病阶段和进展/逆转中的意义 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及其相关药物和生物标志物 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24889 | 2024-08-08 |
[scRNA-sequencing uncovers metabolism and CD52 as new targets in ibrutinib-surviving mantle cell lymphoma cells]
2022-Aug, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-022-01136-7
PMID:36222922
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后存活的外套细胞淋巴瘤细胞中的代谢变化和新靶点CD52 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后外套细胞淋巴瘤细胞的基因表达趋势和新的治疗靶点 | 研究仅使用了REC-1细胞系，可能无法完全代表所有外套细胞淋巴瘤细胞的反应 | 探索伊布替尼治疗外套细胞淋巴瘤后的细胞适应性和新的治疗靶点 | 外套细胞淋巴瘤细胞及其对伊布替尼治疗的反应 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用REC-1细胞系进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 24890 | 2024-08-08 |
[New insights into the bone marrow niche in multiple myeloma revealed by single-cell profiling technologies]
2022, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.63.1188
PMID:36198544
|
综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术揭示的多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术深入研究了多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | NA | 探讨多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 多发性骨髓瘤骨髓微环境中的非造血细胞和成熟造血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24891 | 2024-08-08 |
Identification of Diagnostic Genes and Effective Drugs Associated with Osteoporosis Treatment by Single-Cell RNA-Seq Analysis and Network Pharmacology
2022, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2022/6830635
PMID:36199280
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析和网络药理学方法，识别与骨质疏松治疗相关的诊断基因和有效药物 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别出与骨质疏松特定细胞亚群相关的关键基因和潜在药物 | 研究仅基于特定数据集和计算方法，实际临床应用的有效性和安全性需进一步验证 | 探索骨质疏松的诊断和治疗方法 | 骨质疏松相关的诊断基因和有效药物 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,577个细胞，识别出12个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 24892 | 2024-08-08 |
Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Revealed That the Pyroptosis of Glioma-Associated Macrophages Participates in Tumor Progression and Immunosuppression
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1803544
PMID:36199426
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡参与肿瘤进展和免疫抑制 | 首次阐明了胶质瘤中细胞焦亡与临床预后及免疫细胞浸润的关系，并发现了潜在的治疗靶点，如细胞焦亡抑制剂 | NA | 探索胶质瘤中细胞焦亡的作用及其对预后和免疫环境的影响 | 胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡及其在肿瘤进展和免疫抑制中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集，包括TCGA和CGGA队列，以及三个独立的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 24893 | 2024-08-08 |
Stability of scRNA-Seq Analysis Workflows is Susceptible to Preprocessing and is Mitigated by Regularized or Supervised Approaches
2022, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.1177/11769343221123050
PMID:36199555
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析工作流程的稳定性，特别是预处理步骤对其的影响，并探讨了正则化或监督方法如何缓解这一问题。 | 本文首次全面评估了scRNA-Seq分析工作流程在降维、聚类和轨迹推断中的稳健性，并引入了神经网络方法来评估模型复杂度对偏差/方差权衡的影响。 | 研究主要集中在公共数据库中的时间序列单细胞转录组数据，可能无法完全代表所有scRNA-Seq数据的情况。 | 旨在全面审查scRNA-Seq分析工作流程的稳健性，特别是在降维、聚类和轨迹推断方面。 | 单细胞RNA测序数据分析工作流程的稳定性及其对预处理步骤的敏感性。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | 超过6000次分析 | NA | NA | NA | NA |
| 24894 | 2024-08-08 |
Regulatory pattern of abnormal promoter CpG island methylation in the glioblastoma multiforme classification
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.989985
PMID:36199581
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研究论文 | 本研究探讨了启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的调控模式 | 首次构建了基于启动子CpG岛甲基化驱动基因的胶质母细胞瘤样本集群的多组学尺度图，并开发了胶质母细胞瘤的诊断图和预测模型 | NA | 研究启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的作用 | 胶质母细胞瘤的分类和诊断 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CpG岛甲基化测序 | NA | 甲基化谱、表达谱和单细胞测序数据 | 多个高注释公共临床队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 24895 | 2024-08-08 |
Versican enrichment predicts poor prognosis and response to adjuvant therapy and immunotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.960570
PMID:36203562
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研究论文 | 本文评估了胃癌（GC）患者中VCAN表达对预后及辅助治疗和免疫治疗反应的影响 | VCAN可作为预测胃癌患者对辅助化疗、辅助放化疗及免疫治疗反应的潜在指标 | NA | 研究VCAN表达在胃癌中的作用及其对治疗反应的预测价值 | 胃癌患者的VCAN表达及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1353名胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 24896 | 2024-08-08 |
Mechanism investigation and experiment validation of capsaicin on uterine corpus endometrial carcinoma
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.953874
PMID:36210802
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验操作，探讨辣椒素目标基因GATA1在子宫内膜癌治疗中的潜在机制，并开发疾病预后模型以验证该模型 | 本研究首次筛选出与预后相关的高风险基因GATA1，并通过Kaplan-Meier分析和ROC曲线验证了其作为独立预后因子的有效性 | NA | 探讨辣椒素在子宫内膜癌治疗中的作用机制并开发预后模型 | 辣椒素、GATA1基因、子宫内膜癌 | NA | 子宫内膜癌 | 生物信息学分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24897 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immune-related autophagy in spinal cord injury in rats
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.987344
PMID:36211348
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了大鼠脊髓损伤后免疫相关自噬的作用 | 首次全面评估了脊髓损伤部位的细胞类型，并筛选了免疫自噬相关因子的表达及信号通路 | NA | 探究脊髓损伤后的细胞组成变化、细胞发展轨迹及细胞间通讯 | 大鼠脊髓损伤部位的细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 几乎涵盖了所有脊髓损伤部位的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 24898 | 2024-08-08 |
A novel T-cell proliferation-associated regulator signature pre-operatively predicted the prognostic of bladder cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970949
PMID:36211359
|
研究论文 | 本研究通过收集膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息，利用LASSO Cox回归模型建立了一个多基因签名，用于预测膀胱癌的预后和分期 | 本研究首次建立了一个与T细胞增殖相关调节因子签名，用于膀胱癌的预后预测 | NA | 研究T细胞增殖及其免疫微环境，以改善膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息 | 数字病理学 | 膀胱癌 | LASSO Cox回归模型 | LASSO Cox回归模型 | mRNA表达谱 | TCGA队列和验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 24899 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of CSF reveals neuroprotective RAC1+ NK cells in Parkinson's disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992505
PMID:36211372
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者的脑脊液，揭示了神经保护性的RAC1+ NK细胞在帕金森病中的作用 | 首次在帕金森病患者中发现RAC1在NK细胞中显著上调，并探讨了RAC1 NK细胞在神经保护中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和公开的单细胞RNA测序数据，需要进一步的人体临床研究验证 | 探究NK细胞在帕金森病中的分子机制及其神经保护作用 | 帕金森病患者的脑脊液中的NK细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了公开的单细胞RNA测序数据（GSE141578），涉及帕金森病患者的脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24900 | 2024-08-08 |
Identification of immune cell infiltration and diagnostic biomarkers in unstable atherosclerotic plaques by integrated bioinformatics analysis and machine learning
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.956078
PMID:36211422
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和机器学习方法，识别了不稳定动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞浸润和诊断生物标志物。 | 本研究首次详细分析了不稳定斑块中免疫细胞的浸润情况，并发现了与斑块稳定性相关的关键基因和潜在治疗药物。 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，需要进一步的临床样本验证。 | 旨在探讨免疫细胞在不稳定斑块形成中的作用，并探索相关的诊断生物标志物。 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和相关基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 22种免疫细胞类型，来自公共GEO数据库的RNA测序和微阵列数据。 | NA | NA | NA | NA |