单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28174 篇文献，本页显示第 24861 - 24880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24861 | 2024-08-09 |
Supervised Adversarial Alignment of Single-Cell RNA-seq Data
2021-05, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2020.0439
PMID:33470876
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研究论文 | 本文开发了一种领域对抗神经网络模型，用于学习单细胞RNA测序数据的降维表示，以克服批次效应 | 提出了一种监督对抗神经网络模型，该模型同时优化细胞类型分配的准确性和无法区分批次（领域），从而有效克服批次效应 | NA | 克服单细胞RNA测序数据分析中的批次效应 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 领域对抗神经网络 | 基因表达数据 | 多个不同数据集 |
| 24862 | 2024-08-09 |
Corrigendum to: Inferring microenvironmental regulation of gene expression from single-cell RNA sequencing data using scMLnet with an application to COVID-19
2021-03-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab015
PMID:33448287
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24863 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Vascular Cells in Early Stage Murine Abdominal Aortic Aneurysm-Brief Report
2021-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315607
PMID:33472403
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠腹主动脉瘤早期血管细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了小鼠腹主动脉瘤中不同细胞类型的转录组特征 | NA | 阐明腹主动脉瘤中细胞和分子层面的异质性 | 小鼠腹主动脉瘤组织中的血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉瘤组织 |
| 24864 | 2024-08-09 |
SUSCC: Secondary Construction of Feature Space based on UMAP for Rapid and Accurate Clustering Large-scale Single Cell RNA-seq Data
2021-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-020-00411-6
PMID:33475958
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研究论文 | 本文提出了一种基于UMAP的特征空间二次构建方法，用于快速准确地对大规模单细胞RNA测序数据进行聚类 | 采用UMAP进行特征空间的二次构建，提高了聚类速度和准确性 | NA | 设计一种更快速和更准确的聚类方法，以应对大规模单细胞RNA测序数据的挑战 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | UMAP | k-means算法, k-nearest neighbor算法 | 基因表达矩阵 | 大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 24865 | 2024-08-09 |
Traumatic Brain Injury Causes Chronic Cortical Inflammation and Neuronal Dysfunction Mediated by Microglia
2021-02-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2469-20.2020
PMID:33452227
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研究论文 | 研究探讨了创伤性脑损伤（TBI）后微胶质细胞在慢性皮质炎症和神经元功能障碍中的作用 | 通过使用CSF1R拮抗剂PLX5622耗竭微胶质细胞，研究了其在TBI后不同时间点的神经病理学和炎症反应中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类 | 确定微胶质细胞在创伤性脑损伤后神经病理学中的贡献 | 研究对象包括小鼠的微胶质细胞、神经元和其他胶质细胞 | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 研究使用了雄性小鼠 |
| 24866 | 2024-08-09 |
High-Dimensional Immune Monitoring for Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapies
2021-02, Current hematologic malignancy reports
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11899-020-00602-4
PMID:33449291
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研究论文 | 本文综述了基于R语言的高维流式细胞术数据分析管道，主要应用于嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法 | 近年来，已有的用于分析复杂高维数据的工具，如单细胞RNA测序（scRNAseq），已成功移植到细胞术研究中，提供了动态且用户友好的探索空间 | 现有的环境如Cytobank、FlowJo和FCS Express提供的工具要么价格昂贵，要么对无经验用户来说相当复杂 | 综述高维流式细胞术实验方法，并介绍用于CAR T细胞疗法的差异分析的R语言管道 | 高维流式细胞术数据和CAR T细胞疗法 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术 | NA | 高维数据 | NA |
| 24867 | 2024-08-09 |
Does tissue imprinting restrict macrophage plasticity?
2021-02, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00849-2
PMID:33462453
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research paper | 本文讨论了近期研究，这些研究通过结合命运图谱、单细胞转录组学和表观遗传学，详细分析了单个巨噬细胞亚群对肺部损伤的反应，并呼吁调整巨噬细胞可塑性概念 | 提出长时间组织定居会关闭巨噬细胞的大部分可塑性，并推测这种受限的可塑性是进化过程中为了保护组织稳态而选择的 | NA | 探讨巨噬细胞的可塑性及其在组织稳态中的作用 | 巨噬细胞及其在肺部损伤中的反应 | NA | NA | 命运图谱、单细胞转录组学、表观遗传学 | NA | NA | NA |
| 24868 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2021-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03110-w
PMID:33469225
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24869 | 2024-08-09 |
Vitamin D sufficiency enhances differentiation of patient-derived prostate epithelial organoids
2021-Jan-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101974
PMID:33458620
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研究论文 | 研究探讨了维生素D充足对患者来源的前列腺上皮类器官分化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证了维生素D充足通过抑制Wnt信号通路和下调DKK3促进前列腺上皮类器官的生长和分化 | NA | 研究维生素D对前列腺上皮分化的调控作用 | 患者来源的前列腺上皮类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 类器官, 组织切片 | 未具体说明样本数量 |
| 24870 | 2024-08-09 |
Comparison of induced neurons reveals slower structural and functional maturation in humans than in apes
2021-01-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59323
PMID:33470930
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研究论文 | 通过表达转录因子神经调节蛋白2（NGN2）从黑猩猩、倭黑猩猩和人类干细胞中生成诱导兴奋性神经元（iNeurons），并比较了这些神经元在结构和功能成熟上的差异 | 首次通过单细胞RNA测序和电生理分析，揭示了人类神经元在结构和功能成熟上比黑猩猩和倭黑猩猩神经元发展得更慢 | 研究仅限于实验室条件下生成的诱导神经元，可能与自然条件下成熟的神经元存在差异 | 探究人类与黑猩猩、倭黑猩猩神经元在结构和功能成熟上的差异 | 黑猩猩、倭黑猩猩和人类的诱导兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 黑猩猩、倭黑猩猩和人类的干细胞 |
| 24871 | 2024-08-09 |
Early T follicular helper cell activity accelerates hepatitis C virus-specific B cell expansion
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140590
PMID:33463551
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研究论文 | 研究分析了早期T滤泡辅助细胞活性如何加速丙型肝炎病毒特异性B细胞的扩张，并探讨了这一过程与病毒自发清除的关系 | 首次详细描述了早期T滤泡辅助细胞活性对丙型肝炎病毒特异性B细胞扩张的影响，并揭示了这一过程与病毒自发清除的可能关联 | 研究主要集中在急性感染后的早期阶段，对于长期慢性感染的影响分析较少 | 探讨早期T滤泡辅助细胞活性对丙型肝炎病毒特异性B细胞扩张的影响及其与病毒清除的关系 | 丙型肝炎病毒特异性记忆B细胞及T滤泡辅助细胞 | NA | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个自发清除急性丙型肝炎病毒感染或进展为慢性感染的受试者 |
| 24872 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the intra-tumor heterogeneity and identifies MLXIPL as a biomarker in the cellular trajectory of hepatocellular carcinoma
2021-Jan-18, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00403-5
PMID:33462196
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌（HCC）肿瘤及癌旁组织的基因表达，揭示了HCC的细胞异质性，并发现MLXIPL可能作为HCC的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了HCC的基因表达特征，并识别出HCC组织中的异质性亚克隆，发现MLXIPL在HCC中的上调与不良生存率相关 | NA | 探索肝细胞癌的基因表达特征及细胞异质性，寻找潜在的治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）肿瘤及癌旁组织的单细胞基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自人类HCC肿瘤和癌旁组织的单细胞 |
| 24873 | 2024-08-09 |
Bi-fated tendon-to-bone attachment cells are regulated by shared enhancers and KLF transcription factors
2021-01-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55361
PMID:33448926
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研究论文 | 本文研究了小鼠肌腱与骨附着细胞的双重命运，揭示了这些细胞在共享增强子和Krüppel样因子（KLFs）调控下激活软骨细胞和肌腱细胞转录组的现象。 | 通过高通量批量和单细胞RNA测序，结合ATAC测序和表观基因组分析，验证了附着细胞中数百个软骨生成和肌生成基因的表达，并确认了这些细胞共享可访问的基因间染色质区域。 | NA | 探讨肌腱与骨附着细胞的双重命运及其调控机制。 | 小鼠肌腱与骨附着细胞。 | 生物学 | NA | RNA测序, ATAC测序, 单分子ISH, 表观基因组分析 | NA | RNA, 染色质可访问性 | NA |
| 24874 | 2024-08-09 |
Myocyte-specific enhancer factor 2c triggers transdifferentiation of adipose tissue-derived stromal cells into spontaneously beating cardiomyocyte-like cells
2021-01-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-80848-3
PMID:33452355
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研究论文 | 研究通过简单的培养协议，使成年小鼠腹股沟脂肪组织来源的间质血管部分（Ad-SVF）可重复地向自发跳动的心肌细胞样细胞（跳动CMs）转化，并鉴定了关键的转录因子Mef2c在转化中的作用 | 首次鉴定出Mef2c是Ad-SVF向跳动CMs转化的关键基因，并展示了通过基因修饰的Ad-SVF细胞在心脏再生疗法中的应用潜力 | NA | 探讨脂肪组织来源的间质细胞向心肌细胞样细胞的转化机制及其在心脏再生疗法中的应用 | 成年小鼠腹股沟脂肪组织来源的间质血管部分（Ad-SVF）及其转化后的心肌细胞样细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 491个差异表达的转录因子 |
| 24875 | 2024-08-09 |
Multiregion single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of the immune microenvironment of colorectal cancer
2021-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.253
PMID:33463049
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研究论文 | 本研究利用两种单细胞RNA测序技术（Smart-seq2和DNBelab C4），对18名结直肠癌（CRC）患者原发肿瘤和肝转移瘤中的15,115个免疫和非免疫细胞进行了图谱分析 | 发现了早期和晚期CRC肿瘤中B细胞的不同特征，以及IgA IGLC2浆细胞与CRC不良预后的关联，揭示了B细胞和髓系细胞信号之间的显著相互作用 | NA | 深入了解结直肠癌中的免疫浸润情况，并为未来的CRC免疫治疗研究提供新视角 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移瘤中的免疫和非免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 18名结直肠癌患者 |
| 24876 | 2024-08-09 |
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.610903
PMID:33469537
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中抗血管生成的作用，探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境（TME），识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 | 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益，原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 | 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识，探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 24877 | 2024-08-09 |
Single-cell ATAC-Seq reveals cell type-specific transcriptional regulation and unique chromatin accessibility in human spermatogenesis
2022-02-03, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab006
PMID:33438010
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研究论文 | 本文通过单细胞ATAC-Seq技术分析了来自3名正常男性的5376个睾丸细胞，揭示了人类精子发生过程中细胞类型特异性的转录调控和独特的染色质可及性 | 首次在单细胞水平上揭示了人类精子发生过程中不同阶段的染色质可及性和转录因子结合位点的特异性模式 | NA | 深入理解人类精子发生过程中的转录调控机制 | 人类睾丸细胞中的染色质可及性和转录因子结合位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-Seq | NA | 基因组数据 | 5376个睾丸细胞 |
| 24878 | 2024-08-09 |
Placental growth factor promotes tumour desmoplasia and treatment resistance in intrahepatic cholangiocarcinoma
2022-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-322493
PMID:33431577
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研究论文 | 本研究探讨了胎盘生长因子（PlGF）在肝内胆管癌（ICC）进展中的作用，特别是在肿瘤间质化和治疗抵抗方面。 | 首次揭示了PlGF在ICC中的表达与疾病进展的相关性，并证明了PlGF阻断可以改善ICC的治疗效果。 | 研究主要基于小鼠模型和体外3-D共培养系统，可能需要进一步的人体临床试验来验证结果。 | 确定PlGF在肝内胆管癌进展中的作用及其对治疗效果的影响。 | 肝内胆管癌患者样本、ICC细胞、癌相关成纤维细胞（CAFs）和小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括ICC患者样本和小鼠模型 |
| 24879 | 2024-08-09 |
Invasive growth associated with cold-inducible RNA-binding protein expression drives recurrence of surgically resected brain metastases
2021-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab002
PMID:33433612
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研究论文 | 本文探讨了手术切除的脑转移瘤复发的原因，提出癌细胞侵入邻近脑组织是导致局部复发和总体生存期缩短的重要因素，并通过单细胞RNA测序等方法验证了这一假设。 | 首次证实冷诱导RNA结合蛋白（CIRBP）在侵入性癌细胞中的过表达，并证明其在脑转移瘤侵入性生长中的作用。 | NA | 探究手术切除的脑转移瘤复发的原因及其生物学机制。 | 手术切除的脑转移瘤及其邻近脑组织。 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 164个手术切除的脑转移瘤样本，超过15,000个细胞 |
| 24880 | 2024-08-09 |
scASK: A Novel Ensemble Framework for Classifying Cell Types Based on Single-cell RNA-seq Data
2021-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3050963
PMID:33434139
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASK的新型集成框架，用于基于单细胞RNA测序数据进行细胞类型分类 | scASK框架包含三个创新模块：DAS（数据自适应切片）、MCS（元分类器选择）和EMS（集成模式切换），这些模块有助于scASK在分类之外实现偏差-方差权衡 | NA | 旨在解决当前计算分析在大规模数据上性能不佳且对初始数据敏感的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成框架 | RNA测序数据 | 使用了13个真实的单细胞RNA测序数据集进行性能评估 |