单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 24821 - 24840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24821 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE，利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态，并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具，以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 |
| 24822 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
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研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性，并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识，特别关注头部感觉神经节，强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术，近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 24823 | 2024-08-09 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了kappa阿片受体（KOR）及其内源性激动剂dynorphins在调节痒感和疼痛中的作用 | 介绍了KOR及其受体影响细胞和神经回路的最新发现，并重新分析了单细胞测序数据，展示了这些分子的表达谱 | 仅考虑了KOR与来自prodynorphin基因的肽和其他亲和力较低的阿片肽的相互作用 | 探讨kappa阿片系统在特定解剖位置中的作用及其在神经系统中的相互联系 | kappa阿片受体及其内源性激动剂dynorphins在痒感和疼痛调节中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 24824 | 2024-08-09 |
Evaluating single-cell cluster stability using the Jaccard similarity index
2021-08-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa956
PMID:33165513
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研究论文 | 本文介绍了一套工具，通过子采样方法评估单细胞聚类的稳定性，以指导参数选择和辅助生物学解释 | 提出了使用Jaccard相似性指数来评估单细胞聚类稳定性的方法，并开发了相应的R包和Snakemake工作流程 | 未提及 | 旨在提高单细胞RNA测序实验中聚类结果的稳定性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24825 | 2024-08-09 |
CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa269
PMID:33147626
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellTalkDB的手动 curated 数据库，该数据库包含了人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | CellTalkDB数据库不仅包含了2033对小鼠的配体-受体相互作用，还额外包含了377对人类的配体-受体相互作用，相比于现有的SingleCellSignalR资源，提供了更全面的数据 | NA | 构建一个全面的手动 curated 数据库，以帮助进一步推断和理解基于配体-受体相互作用的细胞间通信 | 人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据库 | 3398对人类配体-受体相互作用和2033对小鼠配体-受体相互作用 |
| 24826 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of murine mural cells reveals cellular heterogeneity
2021-Jul, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1823-2
PMID:33165809
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞数据集GSE109774，展示了小鼠壁细胞（MCs）的转录异质性 | 首次详细研究了壁细胞的转录异质性，并通过重新聚类识别了五个不同的亚群 | NA | 揭示壁细胞的转录异质性及其在组织中的分布和相互作用 | 小鼠壁细胞（MCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开数据集GSE109774 |
| 24827 | 2024-08-09 |
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data
2021-05-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa919
PMID:33151294
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研究论文 | 介绍了一种名为ILoReg的R包，用于通过单细胞RNA测序数据进行高分辨率的细胞群体识别 | ILoReg通过概率特征提取步骤和迭代聚类投影（ICP）算法，提高了对具有细微差异的细胞群体的识别能力 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞群体的识别分辨率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 迭代聚类投影（ICP） | 转录组数据 | NA |
| 24828 | 2024-08-09 |
The Whey Acidic Protein WFDC12 Is Specifically Expressed in Terminally Differentiated Keratinocytes and Regulates Epidermal Serine Protease Activity
2021-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.09.025
PMID:33157095
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研究论文 | 本研究探讨了WFDC12蛋白在表皮角质形成细胞终末分化中的表达及其对表皮丝氨酸蛋白酶活性的调控作用 | 首次发现WFDC12在表皮角质形成细胞终末分化阶段的特异性表达，并揭示了其在调控角质层蛋白酶活性中的作用 | NA | 研究WFDC蛋白家族成员在表皮稳态中的作用 | WFDC12蛋白在人类表皮中的表达及其功能 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，免疫金-电子显微镜 | NA | RNA | 涉及银屑病、特应性皮炎、Darier病和Netherton综合征患者的皮肤样本 |
| 24829 | 2024-08-09 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
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研究论文 | 本研究探讨了哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎（RA）中的促分解特性及其机制 | 发现了嗜酸性粒细胞的一个新亚型——调节性嗜酸性粒细胞（rEos），其在关节炎的缓解中起关键作用 | NA | 研究哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎中的促分解作用及其机制 | 嗜酸性粒细胞、类风湿性关节炎、哮喘 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠模型和人类RA患者的样本 |
| 24830 | 2024-08-09 |
Targeting fibroblast growth factor 23-responsive pathways uncovers controlling genes in kidney mineral metabolism
2021-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.10.024
PMID:33159963
|
研究论文 | 本研究通过基因阵列和单细胞RNA测序技术，探索了FGF23响应途径中的调控基因，特别是在肾脏矿物质代谢中的作用 | 发现HBEGF作为FGF23下游调控基因的新角色，并通过靶向共同信号途径发挥作用 | NA | 识别可作为控制FGF23介导的矿物质代谢目标的新基因 | FGF23响应途径中的调控基因及肾脏矿物质代谢 | NA | NA | 基因阵列，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 野生型小鼠肾脏样本 |
| 24831 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24832 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 |
| 24833 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞（IPCs） | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞，并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 |
| 24834 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
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研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库，该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络（GRNs），并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库，用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 |
| 24835 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理，揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段，有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用，并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究，以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 24836 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
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research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析，探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变，增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24837 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24838 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0810-4_9
PMID:33165847
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研究论文 | 本文详细介绍了两种用于血液细胞单细胞RNA测序（scRNA-Seq）的方法：Smart-Seq2（基于板）和10× Genomics（基于液滴）。 | scRNA-Seq技术的发展为血液学领域带来了进步，增进了我们对正常和恶性造血过程的理解。 | 不同的scRNA-Seq方法各有优缺点，需要在实验设计时加以考虑。 | 探索和优化用于血液细胞的单细胞RNA测序技术。 | 血液细胞的转录状态。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA | NA |
| 24839 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
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研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链（NfL）和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1（CHI3L1）与多发性硬化症（MS）患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系，并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系，以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者（复发缓解型MS和进行性MS）及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者（42名复发缓解型MS和89名进行性MS）及42名匹配的健康对照 |
| 24840 | 2024-08-09 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
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研究论文 | 本文探讨了表皮干细胞的基因表达时空调控及其在再生医学中的应用 | 引入了单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度和细胞熵等技术，揭示了表皮干细胞的高度异质性和可塑性 | 分离表皮干细胞与其后代仍然是一个挑战 | 探索表皮干细胞的可塑性及其在再生医学中的应用 | 表皮干细胞及其亚群角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |